# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj18457.fasta.huge -Q ../query/KIAA1710.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1710, 515 aa vs ./tmplib.25089 library 1986990 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9591+/-0.00528; mu= 13.1160+/- 0.358 mean_var=144.3335+/-38.759, 0's: 0 Z-trim: 79 B-trim: 163 in 2/38 Lambda= 0.106756 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 1627 263.1 6.4e-71 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 1624 262.4 7.4e-71 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 1618 261.3 1.3e-70 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 1597 258.4 1.6e-69 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 1583 256.2 6.5e-69 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 1549 251.0 2.5e-67 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 1545 250.1 3.2e-67 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 1538 249.1 7.2e-67 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 1536 248.7 7.9e-67 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 1533 248.4 1.3e-66 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 1528 247.5 1.9e-66 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 1523 246.5 2.9e-66 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 1521 246.3 3.6e-66 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 1513 245.3 1.1e-65 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 1511 244.9 1.2e-65 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 1510 244.7 1.3e-65 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 1461 237.1 2.4e-63 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 1455 236.4 5.4e-63 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 1448 235.1 9.6e-63 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 1444 234.7 1.8e-62 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 1441 234.0 2e-62 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 1430 232.4 6.9e-62 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 1429 232.5 9.4e-62 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 1416 230.2 3e-61 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 1403 228.1 1.1e-60 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 1373 223.8 3.6e-59 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 1343 219.0 7.1e-58 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 1297 212.0 1.1e-55 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 1287 210.4 3e-55 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 1284 209.8 3.6e-55 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 1270 207.6 1.6e-54 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 1253 205.1 1.1e-53 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 1141 188.2 2.2e-48 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 1126 185.8 1e-47 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 1063 175.9 7.1e-45 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 971 161.5 1.2e-40 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 932 155.7 8.5e-39 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 855 143.6 2.6e-35 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 802 135.8 9.8e-33 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 745 126.5 2.8e-30 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 701 120.0 3.9e-28 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 650 112.3 1e-25 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 636 110.2 4.8e-25 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 599 104.9 3.3e-23 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 594 104.1 5.8e-23 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 521 92.6 1.1e-19 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 521 92.9 1.4e-19 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 483 86.9 7.5e-18 KIAA1485 ( 1104 res) fj07037 (1104) 477 86.0 1.5e-17 KIAA0287 ( 1523 res) fg06332 (1523) 438 80.3 1.1e-15 >>KIAA1852 ( 948 res) fj01514 (948 aa) initn: 3206 init1: 1620 opt: 1627 Z-score: 1365.1 bits: 263.1 E(): 6.4e-71 Smith-Waterman score: 1627; 59.831% identity (82.584% similar) in 356 aa overlap (159-514:567-915) 130 140 150 160 170 180 KIAA17 ENAEENPESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHC : :: .: ::..::: . . :..: KIAA18 FGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQ-------HKKTHTGEKPYECDKC 540 550 560 570 580 190 200 210 220 230 240 KIAA17 GKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSF ::.: . : :..:..:::: .::.: .:::.:: .:::: :.: ::::.:: :::::::: KIAA18 GKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSF 590 600 610 620 630 640 250 260 270 280 290 300 KIAA17 GRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSS . .:::: :: :::::: .:.:::::: :::: :.: :.::::..:.:: :.: : KIAA18 NWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYS 650 660 670 680 690 700 310 320 330 340 350 360 KIAA17 HLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVR :..:.:::.: :::.:.:::..:: : :: : :.::::.::.:.:::: : . : :.. KIAA18 ALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRERSALTK 710 720 730 740 750 760 370 380 390 400 410 420 KIAA17 HRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKI :. :.: :::.::.::.. :...:::.:::::::::::::: ::::::.: ::..:..: KIAA18 HEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRI 770 780 790 800 810 820 430 440 450 460 470 480 KIAA17 HTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGE :::::::.::.: :::. : :: :.:::::::::.: .:::.:..::.::.: : :::: KIAA18 HTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNHTGE 830 840 850 860 870 880 490 500 510 KIAA17 KPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD :::.:..:::.: ..:.:: :.:.:. KIAA18 KPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHSEEKLN 890 900 910 920 930 940 >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 1619 init1: 1619 opt: 1624 Z-score: 1363.9 bits: 262.4 E(): 7.4e-71 Smith-Waterman score: 1624; 54.145% identity (80.570% similar) in 386 aa overlap (129-514:188-565) 100 110 120 130 140 150 KIAA17 DFEIRSENEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENPESEEGFESGDRSERQWGDLTAEE :... .:: : : :::: KIAA19 VSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPF--------QWGDTHYSC 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 KIAA17 WVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGK . . . ..:... . . : .:::.::. .... ::..::: :::.: :::: KIAA19 GECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGK 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 KIAA17 GFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCR .::... :.::::.:::.:::.:.::::::.... :.::: .::::.:..:.:::::: . KIAA19 SFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQ 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 KIAA17 LSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDL . ::.:::.:.::.::::::::: :.....: :::: ::.:.::::.:::. ::... : KIAA19 NGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTL 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 KIAA17 IKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQ .:.:::: ::::.: ::::.::... : :.:.::::.::.:.:::..::: ..:.::: KIAA19 TEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQ 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 KIAA17 RTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHT :.::::.:::: : : : .:::: ::..::::.::::::: .:: . : . :::.:: KIAA19 RSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHT 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 KIAA17 GEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD ::::.:: .:::.: :: .:. :.::::::.:::: :: ::: .::.:..:...:: KIAA19 GEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERP 510 520 530 540 550 560 KIAA19 YECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECG 570 580 590 600 610 620 >>KIAA1508 ( 573 res) hk06576 (573 aa) initn: 2660 init1: 1596 opt: 1618 Z-score: 1359.6 bits: 261.3 E(): 1.3e-70 Smith-Waterman score: 1618; 58.671% identity (85.838% similar) in 346 aa overlap (168-513:226-571) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 EEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISD . .: :...: : : ::.:::.::. . KIAA15 EKSVFIQHQRADSGERPYKCSECGKSFSQSSGFLRHRKAHGRTRTHECSECGKSFSRKTH 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 KIAA17 LNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQH :..::..:::.::: : ::::.: . : ::::::.:::::::.:.::::::..:..: .: KIAA15 LTQHQRVHTGERPYDCSECGKSFRQVSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSHSTNLYRH 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 310 KIAA17 QTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTH .. ::. .:..:.:::::: . ..:..: :.:.: .:::: ::::.:: . .: .::: : KIAA15 RSAHTSTRPYECSECGKSFSHSTNLFRHWRVHTGVRPYECSECGKAFSCNIYLIHHQRFH 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 KIAA17 TGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEK :::.:: :.:::..:...: ::.: :::::::::.:.:::: :::.: : ::::::: : KIAA15 TGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKVFSQSSGLFRHRRAHTKTK 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 KIAA17 PYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYEC ::.:.:: ..:: . :..:: .::::.::::..::::: :..::: :: .::.:.:::: KIAA15 PYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVHTGERPYECSVCGKSFIRKTHLIRHQTVHTNERPYEC 440 450 460 470 480 490 440 450 460 470 480 490 KIAA17 NECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECE .:: .:... : :..:.:.::::.:::: .:::.::....:: :. :::::.::::.:: KIAA15 DECGKSYSQSSALLQHRRVHTGERPYECRECGKSFTRKNHLIQHKTVHTGERPYECSECG 500 510 520 530 540 550 500 510 KIAA17 KSFSRSSALIKHKRVHTD ::::.::.:..:.::: KIAA15 KSFSQSSGLLRHRRVHVQ 560 570 >>KIAA0326 ( 927 res) hg00579 (927 aa) initn: 4691 init1: 1596 opt: 1597 Z-score: 1340.2 bits: 258.4 E(): 1.6e-69 Smith-Waterman score: 1628; 57.453% identity (81.843% similar) in 369 aa overlap (150-514:173-539) 120 130 140 150 160 170 KIAA17 FGTTSERPAENAEENPESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVH-- ::: ::. : : :. :... ... :. KIAA03 PLDHQIPLDPPAPEVVPTPSDWTKACEASWQWGALTT--WNSPPVVPANEPSLRELVQGR 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 230 KIAA17 -TGI-RYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTG .: . .::..:::.::: : : :::. :::.:: : ::::.:..::::.:::::::: KIAA03 PAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTG 210 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 KIAA17 ERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPY :.:: : .::: :. ::.:.::: ::::::.::.:: :.: . ..::.:::.:.::::: KIAA03 EKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPY 270 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 KIAA17 ECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDE .: :: ..: ::: : ::: ::::::::.: :::. :.. .:.:: ..:.::.::.: : KIAA03 KCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTE 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 KIAA17 CGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKS :::.: :.:.:..:.:.:::::::.: :::..:.. : :..::::: : :..: .:::. KIAA03 CGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKT 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 KIAA17 FSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQS :. :. :. ::. ::::.::.: :: .::. :.::.::: : ::.:: :..:::.: .: KIAA03 FTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMS 450 460 470 480 490 500 480 490 500 510 KIAA17 SNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD :.:: :::.:::::::.:..: ::: ::: ::.:.:.:: KIAA03 STLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLI 510 520 530 540 550 560 KIAA03 THVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTP 570 580 590 600 610 620 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 1583 init1: 1583 opt: 1583 Z-score: 1329.1 bits: 256.2 E(): 6.5e-69 Smith-Waterman score: 1583; 60.234% identity (81.287% similar) in 342 aa overlap (173-514:438-779) 150 160 170 180 190 200 KIAA17 SGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQ :..:::: . . :..::::::. :.: :: KIAA16 AIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQ 410 420 430 440 450 460 210 220 230 240 250 260 KIAA17 KTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHT ::: .:.:: ::.: :...:.: .:.: ::::.:: ::::::.:. : : ::.::. KIAA16 VIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHS 470 480 490 500 510 520 270 280 290 300 310 320 KIAA17 GEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKP ::::.:: :::::: . ::: .:. :::::::.:.:::: :...:.::.: :.:::::: KIAA16 GEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKP 530 540 550 560 570 580 330 340 350 360 370 380 KIAA17 YECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCN :.::.:::.::.::.: : .::::.:::: :::: : .:: :. ::: :::::::.:: KIAA16 YKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN 590 600 610 620 630 640 390 400 410 420 430 440 KIAA17 ECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWR :::. :: :.:. :. :::::::.:: ::: :...::: .::. :::::::.:::: . KIAA16 ECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGK 650 660 670 680 690 700 450 460 470 480 490 500 KIAA17 SFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSR .:. ::.: :: :::.:::.: .::: :::...: .:.:.:::::::.:::: :.: KIAA16 AFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRV 710 720 730 740 750 760 510 KIAA17 SSALIKHKRVHTD :.: : .:: KIAA16 RSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK 770 780 790 800 810 >>KIAA0065 ( 848 res) ha00946 (848 aa) initn: 2880 init1: 1549 opt: 1549 Z-score: 1300.6 bits: 251.0 E(): 2.5e-67 Smith-Waterman score: 1549; 59.130% identity (80.290% similar) in 345 aa overlap (170-514:437-781) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 GFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLN : .:...::: . . :. :::.: : :::. KIAA00 SNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLT 410 420 430 440 450 460 200 210 220 230 240 250 KIAA17 RHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQT .::.:::: .::.::::::.: .::: ::::::::.:..: ::::::...:.: ::: KIAA00 KHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQR 470 480 490 500 510 520 260 270 280 290 300 310 KIAA17 IHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTG :: :.: ..:: :::.: . : : .:: :.: ::::: ::::.: .: :. ::::::: KIAA00 IHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTG 530 540 550 560 570 580 320 330 340 350 360 370 KIAA17 EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY .::. : :::. ::..: : .:::.::::.::.: :::: : ..: :..: :.::::::: KIAA00 QKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPY 590 600 610 620 630 640 380 390 400 410 420 430 KIAA17 HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNE .:::::. : . :.:.:::: : :::::.:: :::.: ..: ::.::. :: ::::.::: KIAA00 ECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNE 650 660 670 680 690 700 440 450 460 470 480 490 KIAA17 CWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKS : .:: .: :: :.: ::::::::: .::: : ..:.: .:.:.::::: .:.:: : KIAA00 CGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKI 710 720 730 740 750 760 500 510 KIAA17 FSRSSALIKHKRVHTD : :.: : .:.: :: KIAA00 FYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQV 770 780 790 800 810 820 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 1545 init1: 1545 opt: 1545 Z-score: 1298.6 bits: 250.1 E(): 3.2e-67 Smith-Waterman score: 1545; 58.501% identity (77.810% similar) in 347 aa overlap (168-514:177-523) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 EEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISD .::. :.. ::: : . ::.:::::: . KIAA19 HQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYN 150 160 170 180 190 200 200 210 220 230 240 250 KIAA17 LNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQH . .::: :::.:::.: ::::.: :.:::.:::: :: ::: :.::::.: ..::. : KIAA19 VVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGH 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 KIAA17 QTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTH : :::::.:. :::::: : : ::.::..:.::.:. : :::: : : : :::.: KIAA19 QKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVH 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 KIAA17 TGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEK ::::::::::::. : :: ::.: .:::::.::.:.:::: : ..: :. :.:.::::: KIAA19 TGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEK 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 KIAA17 PYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYEC ::.::.::. : : .:::.:.::.::::. ::: : : : .::..::::.:.:: KIAA19 PYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFEC 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 KIAA17 NECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECE . : .:: :: : ::: ::::.:::: .::: : ..:: : :.: : ::. .::::: KIAA19 SICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECG 450 460 470 480 490 500 500 510 KIAA17 KSFSRSSALIKHKRVHTD . ::..: ::.:..::: KIAA19 RVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFR 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0798 ( 682 res) hk06584 (682 aa) initn: 2932 init1: 1529 opt: 1538 Z-score: 1292.3 bits: 249.1 E(): 7.2e-67 Smith-Waterman score: 1538; 59.420% identity (81.739% similar) in 345 aa overlap (169-513:333-677) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 EGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDL .:.::.. ::: . .:::.:::.:. : : KIAA07 KSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSML 310 320 330 340 350 360 200 210 220 230 240 250 KIAA17 NRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQ ::.::::..:: : ::::::. . ..: :::.::::.:: ::::::.: .:..:.:: KIAA07 IIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQ 370 380 390 400 410 420 260 270 280 290 300 310 KIAA17 TIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHT ::::::. :.::::.: : :.:: :::.:. :: : : ::::.:. .: : :::::: KIAA07 RTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHT 430 440 450 460 470 480 320 330 340 350 360 370 KIAA17 GEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKP ::::: :.:::.:: .: :: : :.::::.::.:.::::.: :: :. :.:.:::::: KIAA07 GEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKP 490 500 510 520 530 540 380 390 400 410 420 430 KIAA17 YHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECN : :::::..:. :.:: ::::::::::. :. :::.:. . .::.::.::: :: :. KIAA07 YICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICS 550 560 570 580 590 600 440 450 460 470 480 490 KIAA17 ECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEK :: :.:.....: :...::::::: : .::::::..: ::.:::.::::::. :.::.: KIAA07 ECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRK 610 620 630 640 650 660 500 510 KIAA17 SFSRSSALIKHKRVHTD .:: . :: :.:.: KIAA07 AFSSKRNLIVHQRTHNGNKP 670 680 >>KIAA0628 ( 540 res) hh01433 (540 aa) initn: 4509 init1: 1529 opt: 1536 Z-score: 1291.6 bits: 248.7 E(): 7.9e-67 Smith-Waterman score: 1536; 56.812% identity (81.159% similar) in 345 aa overlap (170-514:115-458) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 GFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLN ::...:. : . . :. :::.:. ::: KIAA06 VTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEG-EANPCDICGKTFTFNSDLV 90 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 KIAA17 RHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQT ::. .:.:..:: : .:::::..::::..::: ::::: : :: :::.: . : ::.:: KIAA06 RHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQR 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 KIAA17 IHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTG .:.:::: :: .:::.::. : ::.:::.:. :.:.::.::::.::.:: : .::: ::: KIAA06 VHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTG 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 KIAA17 EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY :.::::::::..: . :.::.::..:: . :.: :::: : . :::..:.: ::::.:. KIAA06 ERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPF 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 KIAA17 HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNE .:::::. : : :.:.:::: ::::.:: :: ::: ::..:.. ::.:::::: ::::: KIAA06 ECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNE 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 KIAA17 CWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKS : ..: : ::.::. ::::. ::: .:::.: :...: ::..:.:..:.:: .: :. KIAA06 CGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKA 390 400 410 420 430 440 500 510 KIAA17 FSRSSALIKHKRVHTD : .:: :. :. .:: KIAA06 FIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNST 450 460 470 480 490 500 >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 1533 init1: 1533 opt: 1533 Z-score: 1287.8 bits: 248.4 E(): 1.3e-66 Smith-Waterman score: 1533; 56.232% identity (82.899% similar) in 345 aa overlap (170-514:178-522) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 GFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLN :. :...:: . . :..:::.::: : :. KIAA13 SELTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLS 150 160 170 180 190 200 200 210 220 230 240 250 KIAA17 RHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQT .:.: :::..:::: ::::.: :: :. ::: :: :.::.:: :::::.. ..: ::: KIAA13 QHKKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQR 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 KIAA17 IHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTG :.:::::.::.::::.: :.: .::.::.:::::.:..:::.: .:.:. ::.::: KIAA13 IQTGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTE 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 KIAA17 EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY ::::.:::::..:.. . . : :.::::.:..:.:::: . .::.:. : :.::::::: KIAA13 EKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPY 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 KIAA17 HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNE .:::::. :.::.....::: :::::::.:: :::.: : : .:...:::::::.:.: KIAA13 ECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTE 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 KIAA17 CWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKS : ..: . :.:: ::: :: :::: : .::..: .:.: .:::.:::::::.::.::.. KIAA13 CGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERA 450 460 470 480 490 500 500 510 KIAA17 FSRSSALIKHKRVHTD :.. : .:...:: KIAA13 FTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNT 510 520 530 540 550 560 515 residues in 1 query sequences 1986990 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:13:53 2008 done: Thu Dec 18 15:13:53 2008 Total Scan time: 0.450 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]