# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg02554.fasta.huge -Q ../query/KIAA1666.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1666, 1003 aa vs ./tmplib.25089 library 1986502 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9336+/-0.00762; mu= 10.4776+/- 0.518 mean_var=216.9875+/-52.215, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.087068 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0612 ( 1810 res) hg00654s1 (1810) 627 92.5 5.2e-19 KIAA0318 ( 1106 res) hg00364 (1106) 372 60.2 1.7e-09 >>KIAA0612 ( 1810 res) hg00654s1 (1810 aa) initn: 1461 init1: 434 opt: 627 Z-score: 433.2 bits: 92.5 E(): 5.2e-19 Smith-Waterman score: 1153; 30.205% identity (49.707% similar) in 1364 aa overlap (21-996:439-1780) 10 20 30 40 KIAA16 RSARPPGPRVSRARCLPGLIAEQLLQQAARG-QDRQQQLQRDPQKALCDL : :::... . : : ..:... .. .. 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