# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh19068mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1632.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1632, 1457 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826915 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1865+/-0.000185; mu= 15.2193+/- 0.010 mean_var=74.7537+/-14.663, 0's: 29 Z-trim: 32 B-trim: 568 in 1/66 Lambda= 0.148340 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114672979|ref|XP_512111.2| PREDICTED: hypotheti (2581) 9521 2048.3 0 gi|149029476|gb|EDL84690.1| rCG41226, isoform CRA_ (1528) 7994 1721.3 0 gi|149029475|gb|EDL84689.1| rCG41226, isoform CRA_ (2575) 7994 1721.5 0 gi|148677493|gb|EDL09440.1| mCG125522, isoform CRA (1503) 7980 1718.3 0 gi|118103545|ref|XP_414693.2| PREDICTED: hypotheti (2580) 6802 1466.4 0 gi|149029474|gb|EDL84688.1| rCG41226, isoform CRA_ (2065) 5697 1229.8 0 gi|148677494|gb|EDL09441.1| mCG125522, isoform CRA (2065) 5665 1223.0 0 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