# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06359b.fasta.nr -Q ../query/KIAA1622.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1622, 892 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826074 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5362+/-0.000191; mu= 12.0682+/- 0.011 mean_var=84.7339+/-16.602, 0's: 34 Z-trim: 40 B-trim: 1342 in 1/65 Lambda= 0.139330 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114654602|ref|XP_522937.2| PREDICTED: HEAT-like (1109) 5401 1096.2 0 gi|148686877|gb|EDL18824.1| RIKEN cDNA 8430415E04, ( 894) 5268 1069.4 0 gi|81898369|sp|Q8C0Y0.1|PP4R4_MOUSE RecName: Full= ( 875) 5218 1059.3 0 gi|109730189|gb|AAI11888.1| RIKEN cDNA 8430415E04 ( 875) 5217 1059.1 0 gi|73964413|ref|XP_547959.2| PREDICTED: similar to ( 916) 5197 1055.1 0 gi|194225318|ref|XP_001495721.2| PREDICTED: simila ( 869) 5109 1037.4 0 gi|194038336|ref|XP_001926088.1| PREDICTED: simila ( 817) 5018 1019.1 0 gi|194038332|ref|XP_001928196.1| PREDICTED: simila ( 775) 4805 976.3 0 gi|109730187|gb|AAI13755.1| 8430415E04Rik protein ( 790) 4629 940.9 0 gi|12858102|dbj|BAB31199.1| unnamed protein produc ( 589) 3659 745.8 1.3e-212 gi|125846433|ref|XP_696336.2| PREDICTED: si:dkey-8 ( 870) 3320 677.8 5.6e-192 gi|148686878|gb|EDL18825.1| RIKEN cDNA 8430415E04, ( 819) 3180 649.6 1.6e-183 gi|149025413|gb|EDL81780.1| similar to RIKEN cDNA ( 821) 3169 647.4 7.3e-183 gi|194383454|dbj|BAG64698.1| unnamed protein produ ( 410) 2632 539.3 1.3e-150 gi|56207732|emb|CAI21252.1| novel protein [Danio r ( 599) 2275 467.6 7.2e-129 gi|210129485|gb|EEA77159.1| hypothetical protein B ( 672) 2260 464.6 6.3e-128 gi|156216066|gb|EDO37011.1| predicted protein [Nem ( 670) 2112 434.9 5.7e-119 gi|66513101|ref|XP_393531.2| PREDICTED: similar to ( 722) 1339 279.5 3.6e-72 gi|212518093|gb|EEB19885.1| conserved hypothetical (1328) 1342 280.3 3.8e-72 gi|198436120|ref|XP_002123617.1| PREDICTED: simila ( 972) 1104 232.4 7.5e-58 gi|210087740|gb|EEA36103.1| hypothetical protein B ( 435) 1041 219.5 2.6e-54 gi|47213357|emb|CAF92980.1| unnamed protein produc ( 867) 938 199.0 7.6e-48 gi|194676986|ref|XP_001790355.1| PREDICTED: simila ( 149) 602 130.9 4.2e-28 gi|158600508|gb|EDP37688.1| HEAT repeat family pro ( 825) 600 131.0 2.1e-27 gi|91079584|ref|XP_967410.1| PREDICTED: similar to ( 538) 542 119.2 4.8e-24 gi|215414829|emb|CAA91051.3| C. elegans protein F4 ( 945) 509 112.8 7.4e-22 gi|32563711|ref|NP_495884.2| hypothetical protein ( 986) 509 112.8 7.6e-22 gi|190588609|gb|EDV28631.1| hypothetical protein T ( 769) 494 109.7 5.1e-21 gi|193624684|ref|XP_001943387.1| PREDICTED: simila ( 477) 478 106.3 3.3e-20 gi|187036801|emb|CAP23466.1| Hypothetical protein (1033) 481 107.2 3.9e-20 gi|158271187|gb|EDO97013.1| flagellar associated p ( 765) 466 104.1 2.5e-19 gi|134062335|emb|CAM42193.1| hypothetical protein, ( 812) 426 96.0 6.9e-17 gi|68126602|emb|CAJ04012.1| hypothetical protein, ( 813) 416 94.0 2.8e-16 gi|162690542|gb|EDQ76908.1| predicted protein [Phy ( 932) 403 91.5 1.9e-15 gi|70882279|gb|EAN95257.1| hypothetical protein, c ( 792) 379 86.6 4.7e-14 gi|70833956|gb|EAN79458.1| hypothetical protein, c ( 786) 360 82.8 6.7e-13 gi|163778552|gb|EDQ92167.1| predicted protein [Mon ( 841) 296 69.9 5.2e-09 gi|124402665|emb|CAK68135.1| unnamed protein produ ( 469) 290 68.5 7.7e-09 gi|89308397|gb|EAS06385.1| hypothetical protein TT (1045) 257 62.2 1.4e-06 gi|215511054|gb|EEC20507.1| hypothetical protein I ( 156) 244 58.9 2e-06 gi|70871326|gb|EAN85495.1| hypothetical protein, c ( 275) 232 56.7 1.6e-05 gi|165988603|gb|EAL66723.2| protein phosphatase 4 ( 726) 229 56.4 5.3e-05 gi|60467546|gb|EAL65567.1| protein phosphatase 2A ( 584) 214 53.3 0.00036 gi|1408302|gb|AAB03670.1| phosphoprotein phosphata ( 584) 214 53.3 0.00036 gi|124427378|emb|CAK92156.1| unnamed protein produ ( 752) 214 53.4 0.00044 gi|116508675|gb|EAU91570.1| hypothetical protein C ( 836) 209 52.4 0.00096 gi|124420569|emb|CAK85473.1| unnamed protein produ ( 587) 206 51.7 0.0011 gi|89292181|gb|EAR90169.1| HEAT repeat family prot ( 648) 205 51.6 0.0014 gi|124402664|emb|CAK68134.1| unnamed protein produ ( 284) 199 50.1 0.0017 gi|116061645|emb|CAL52363.1| Protein phosphatase 2 ( 666) 196 49.8 0.0049 >>gi|114654602|ref|XP_522937.2| PREDICTED: HEAT-like rep (1109 aa) initn: 5427 init1: 5401 opt: 5401 Z-score: 5862.1 bits: 1096.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 5401; 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