# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj13419.fasta.nr -Q ../query/KIAA1615.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1615, 484 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7799493 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7893+/-0.000184; mu= 10.8094+/- 0.010 mean_var=75.0712+/-14.375, 0's: 37 Z-trim: 214 B-trim: 136 in 1/64 Lambda= 0.148026 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|186287284|ref|NP_066002.2| zinc finger protein ( 530) 3441 744.9 1.1e-212 gi|74762348|sp|Q6P280.1|ZN529_HUMAN RecName: Full= ( 530) 3439 744.5 1.5e-212 gi|114677084|ref|XP_512621.2| PREDICTED: zinc fing ( 818) 3397 735.7 1e-209 gi|10437560|dbj|BAB15068.1| unnamed protein produc ( 458) 3272 708.8 7.5e-202 gi|119910376|ref|XP_587640.3| PREDICTED: similar t ( 631) 2632 572.2 1.3e-160 gi|109124463|ref|XP_001103430.1| PREDICTED: zinc f (1194) 2158 471.3 6.1e-130 gi|73947807|ref|XP_541674.2| PREDICTED: similar to (2872) 2123 464.2 2e-127 gi|90085379|dbj|BAE91430.1| unnamed protein produc ( 246) 1638 359.6 5.4e-97 gi|149722053|ref|XP_001494018.1| PREDICTED: zinc f ( 688) 1632 358.7 2.7e-96 gi|71153480|sp|Q8TAQ5.1|ZN420_HUMAN RecName: Full= ( 688) 1630 358.3 3.6e-96 gi|109124478|ref|XP_001104516.1| PREDICTED: simila (1233) 1628 358.1 7.4e-96 gi|73947801|ref|XP_867605.1| PREDICTED: similar to ( 745) 1621 356.4 1.5e-95 gi|194215442|ref|XP_001497806.2| PREDICTED: zinc f ( 849) 1619 356.0 2.2e-95 gi|126324551|ref|XP_001367025.1| PREDICTED: simila ( 849) 1607 353.5 1.3e-94 gi|33417243|gb|AAH55817.1| Zfp420 protein [Mus mus ( 578) 1603 352.4 1.8e-94 gi|109461612|ref|XP_001078762.1| PREDICTED: simila (1321) 1603 352.8 3.2e-94 gi|109458488|ref|XP_574414.2| PREDICTED: similar t (1396) 1603 352.8 3.3e-94 gi|26337635|dbj|BAC32503.1| unnamed protein produc ( 578) 1598 351.4 3.7e-94 gi|109124730|ref|XP_001090901.1| PREDICTED: simila ( 811) 1588 349.4 2.1e-93 gi|109124728|ref|XP_001091019.1| PREDICTED: simila ( 837) 1588 349.4 2.1e-93 gi|126314668|ref|XP_001374905.1| PREDICTED: simila ( 779) 1587 349.2 2.3e-93 gi|119577335|gb|EAW56931.1| zinc finger protein 54 ( 810) 1587 349.2 2.4e-93 gi|119577334|gb|EAW56930.1| zinc finger protein 54 ( 836) 1587 349.2 2.4e-93 gi|74762448|sp|Q86UE3.1|ZN546_HUMAN RecName: Full= ( 836) 1586 349.0 2.8e-93 gi|114677267|ref|XP_524265.2| PREDICTED: zinc fing ( 836) 1585 348.8 3.3e-93 gi|126342482|ref|XP_001377265.1| PREDICTED: simila ( 864) 1583 348.3 4.5e-93 gi|90079633|dbj|BAE89496.1| unnamed protein produc ( 470) 1580 347.4 4.6e-93 gi|109125704|ref|XP_001113891.1| PREDICTED: simila ( 868) 1580 347.7 7e-93 gi|73947795|ref|XP_853558.1| PREDICTED: similar to (1186) 1581 348.0 7.6e-93 gi|114676858|ref|XP_512615.2| PREDICTED: zinc fing (1120) 1580 347.8 8.4e-93 gi|114676856|ref|XP_001163591.1| PREDICTED: zinc f (1238) 1580 347.9 9.1e-93 gi|73948425|ref|XP_541659.2| PREDICTED: similar to (1259) 1579 347.6 1.1e-92 gi|73947799|ref|XP_867596.1| PREDICTED: similar to (1751) 1568 345.4 6.8e-92 gi|73947805|ref|XP_867624.1| PREDICTED: similar to (1980) 1568 345.5 7.5e-92 gi|194675102|ref|XP_001790278.1| PREDICTED: simila ( 690) 1562 343.8 8.6e-92 gi|73947821|ref|XP_867681.1| PREDICTED: similar to ( 812) 1559 343.2 1.5e-91 gi|73947819|ref|XP_541675.2| PREDICTED: similar to ( 977) 1559 343.3 1.7e-91 gi|126328845|ref|XP_001374290.1| PREDICTED: simila (1010) 1559 343.3 1.8e-91 gi|126305385|ref|XP_001379817.1| PREDICTED: simila ( 882) 1557 342.8 2.1e-91 gi|126329733|ref|XP_001372099.1| PREDICTED: simila ( 762) 1554 342.1 3e-91 gi|73957061|ref|XP_862427.1| PREDICTED: similar to ( 657) 1553 341.8 3.1e-91 gi|149699799|ref|XP_001500699.1| PREDICTED: simila ( 694) 1550 341.2 5.1e-91 gi|55725641|emb|CAH89602.1| hypothetical protein [ ( 686) 1548 340.8 6.8e-91 gi|126323911|ref|XP_001377937.1| PREDICTED: simila ( 597) 1547 340.5 7.1e-91 gi|109124519|ref|XP_001113115.1| PREDICTED: zinc f ( 985) 1549 341.1 7.6e-91 gi|3540177|gb|AAC34327.1| F23269_2 [Homo sapiens] ( 607) 1545 340.1 9.7e-91 gi|218512102|sp|O75290.3|Z780A_HUMAN RecName: Full ( 641) 1545 340.1 1e-90 gi|217035156|ref|NP_001136049.1| zinc finger prote ( 642) 1545 340.1 1e-90 gi|21739260|emb|CAD38678.1| hypothetical protein [ ( 585) 1544 339.8 1.1e-90 gi|194386140|dbj|BAG59634.1| unnamed protein produ ( 585) 1544 339.8 1.1e-90 >>gi|186287284|ref|NP_066002.2| zinc finger protein 529 (530 aa) initn: 3441 init1: 3441 opt: 3441 Z-score: 3974.3 bits: 744.9 E(): 1.1e-212 Smith-Waterman score: 3441; 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