# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj12973.fasta.nr -Q ../query/KIAA1614.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1614, 1208 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7818172 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3583+/-0.000201; mu= 10.3218+/- 0.011 mean_var=125.5113+/-23.608, 0's: 35 Z-trim: 52 B-trim: 14 in 1/65 Lambda= 0.114481 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119611495|gb|EAW91089.1| hCG24169, isoform CRA_ (1221) 8017 1336.3 0 gi|109019271|ref|XP_001111115.1| PREDICTED: hypoth (1182) 7271 1213.0 0 gi|193786887|dbj|BAG52210.1| unnamed protein produ ( 811) 5572 932.3 0 gi|194210373|ref|XP_001488925.2| PREDICTED: simila (1309) 5280 884.2 0 gi|21707619|gb|AAH34090.1| BC034090 protein [Mus m ( 858) 2749 466.0 4.1e-128 gi|148707459|gb|EDL39406.1| mCG8216 [Mus musculus] ( 938) 2704 458.6 7.6e-126 gi|149058354|gb|EDM09511.1| rCG46474 [Rattus norve ( 930) 2494 424.0 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.:.. gi|126 PN-PLLGPNSTQSPSQFRFRKENQRFPERRLSDSVLSQEANYFQENSTYSRP----RCHR 150 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 KIAA16 -IIHIPSPRTGRSYPFPDGVVTEADLDSTSLTSE-EVFVPRTALLGERWRAGDLEALGAG . . :: ..:. : . : .::. : : .: :.: :. ::::. ..: .. gi|126 DLAQKPSLENGKLGARAKHQVQAGALKEVSLALEQEEALPWTTLQGQLWRAGSWDSLKSS 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 KIAA16 SSVLSLSDRVERNRLLLQEMLNVSGQSPRKVGTPAWTPSWDTAAPERPVGDVDWASGTSL :. ::.:::::::::::: ..: : . .: : : .::. : :: :: ::.:: gi|126 SNSWSLNDRVERNRLLLQERKSLSECSSSSHNTVA----QDGTAPRLPGGDPDWDSGVSL 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 KIAA16 QDSGQNRTVGPNPEPVLSPRHEEATHLLQRARMKARTRPLRASHDIVPTITQGSRDGHRS ::: . :.. . . ::::::.:..:::.:::::.: ::::.:::::... :: gi|126 QDSDMCRALVSSQQLSLSPRHEQANQLLQQARMKAKTSPLRANHDIVPSMA------HRL 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 KIAA16 PARD--------PRTTPACR--DSLQNGHTSDSSSGESSGGHRPRRGPSPSHVRFEDESA :::: ::.: ::: : .: ::::::.: . .: .:: :::.:::::::: gi|126 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650 660 700 710 720 730 740 KIAA16 AQQHLPRADDVEVENEVKEGRGHTPEGTLFLREDAKP--PDLELKRVSLGPQWQPGPGLG : ...::. ...: . .::: :::.:: : : . .: . : : gi|126 ---H----NQIEVDYRLEEPKRIAPEGPLFLKEDHGPMLAITEAQSISKEDERTDMPHLL 670 680 690 700 710 750 760 770 780 790 KIAA16 S------HQPHPLDSRTPCRTAYATTAPMTPES----SGPGGQAQVTESHESLEIVSPSS . . :: :...: :.: :.: . .::::.::.. ..: :. . : gi|126 AIARQICKLTHPEDTQAP----YGTLNVMAPSQKLALTGPGGEAQISGNQELLKSTFP-- 720 730 740 750 760 770 800 810 820 830 840 850 KIAA16 LQQSHAEP------SAPHQAWQPTASFCPEGWAPTPPPSRKTTSPVSHRKAALAGLLRLG : . ..: :.:. : . : :.:::: .:..:: ::. :: : gi|126 LPPNFVNPPRRSSHSSPQLAKKSPECFTLGTWVPTPPTVKKASSPGPFRKTMLARSLGPD 780 790 800 810 820 830 860 870 880 890 900 KIAA16 DQTEPVG----IPRPPSRSAVLRTCELPPSQTQPSRPQVRHPLLALSTNNCNNSAPRGLQ .: .:.. .:: . . :: .::.::: ..: :.. : .. .. : gi|126 NQRDPTNSRQVFPRESDMGLGGRT--RVENQTSPSR--IKHQLMVPSKSDFSSIDLREQL 840 850 860 870 880 910 920 930 940 950 960 KIAA16 EPYGGAVHEGRVERGPCSREPEPPLENSRDGGPQGFLGSADVATINSTGITLSLSSEESE . ..:.. :.:: : .:. :.:.::: . : .....:::: .::..:. . gi|126 DIQRKEARENQREKGPGSLKPKASPEKSKDGGFWDIPELAVTSNLGSTGIEVSLTTEQPQ 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA16 SSKESEGSLQRTGSGSGGHVLSRASAGAGTGPGSPSAAPLDQNKKRSSSIASTLGLKKLF : ..: ..:.. .: ::. : ::. :: : . .:: :.: .: .::::.: gi|126 PSVDTEDKVQKAKPSSEKIVLKGESLEDPPGPNITSAIPANGSKKGSNS-SSGFGLKKFF 950 960 970 980 990 1000 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA16 SALGQSSRPKLGKSRSYSVEQLQPAPPGLTSQS-----------RAPSLQSLHPVSPSHQ : :::..: :::: : ::.::. . : .:: .:::::.:. : :::: gi|126 SFLGQTTRQKLGKFRCYSMEQIAQTSPEQPQQSLIHQILNSKLKKAPSLQALQLVPPSHQ 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA16 RRKAASFQNLHSLLSSKGDRSSLYLVAGP-GDHSAAGRPAKTSPRRALSVEDVGAPSLAR :::. :::::::. :..:: ::.. :....:.:.. . :..:::.:...:::.: gi|126 RRKVDFGQNLHSLLN-KAERSRQYLLGVERKDRASGGQPGSPT-RHSLSVDDISVPSLVR 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA16 TVGRLVEVFPDGTSQLQLQRSPGGTFGFCVASGNGRPDSGMPSPLPQPHGWGGLSKQGRA ::::.:.:::::::::.::: :.:::::::..:::::::: gi|126 TVGRVVQVFPDGTSQLELQRLPNGTFGFCVSTGNGRPDSGFYVQEIPHANMAKLYAGLLG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1200 KIAA16 FWLWSEAFLVFG gi|126 EGDEILEVNGAKVTGLGLSLVNEFLAHSENLSIRVLKQRSPQR 1190 1200 1210 1220 >>gi|73961009|ref|XP_853011.1| PREDICTED: hypothetical p (838 aa) initn: 2540 init1: 630 opt: 751 Z-score: 672.9 bits: 136.0 E(): 8.8e-29 Smith-Waterman score: 2183; 46.925% identity (57.242% similar) in 1008 aa overlap (251-1176:1-775) 230 240 250 260 270 280 KIAA16 LGPSSLQQSPIHGVTPGRPGGPGHCNKIIHIPSPRTGRSYPFPDGVVTEADLDSTSLTSE .:. : :::: . ::.. .:::. ::: : gi|739 MPNLRKGRSYTLQDGLIMGGDLDNLSLTCE 10 20 30 290 300 310 320 330 340 KIAA16 EVFVPRTALLGERWRAGDLEALGAGSSVLSLSDRVERNRLLLQEMLNVSGQSPRKVGTPA : :::: :::: :::::: :::.:.: :::::::::::::::::::: :. : .: gi|739 EDFVPRPALLGGLWRAGDLGALGTGGSPLSLSDRVERNRLLLQEMLNV-GERP--AGDVD 40 50 60 70 80 350 KIAA16 W----------------TPSWDTAA----------------PERPVGDV---------DW : .:: .... ::. : .: gi|739 WDSGISLQDSEQNRFCCSPSTNVSGQLAQRGGQGSGTTFRNPEQMSKAVALRLLPLCGSW 90 100 110 120 130 140 360 370 380 KIAA16 A-----------SGTSLQDSGQN-------------------RTVGPNPEPVLSPRHEEA . ::.. .: .: :: ::.:: ::: ::::: gi|739 TRKAAHAGFSRHSGAQCCESPSNPCYFLLIPPPPALACVQPCRTFGPKPESVLSHRHEEA 150 160 170 180 190 200 390 400 410 420 430 440 KIAA16 THLLQRARMKARTRPLRASHDIVPTITQGSRDGHRSPARDPRTTPACRDSLQNGHTSDSS ::::::::::::::::::::::::...:::: . ::: :::: ::: : ::::::::: gi|739 KHLLQRARMKARTRPLRASHDIVPTVARGSRDDRSSPAPDPRTPQACRGSPQNGHTSDSS 210 220 230 240 250 260 450 460 470 480 490 500 KIAA16 SGESSGGHRPRRGPSPSHVRFEDESAREAEFRHLERLQQRQRQVLSTVLQAADQGPLRSK :::::.:. :::: :::.:::::::::.:: :.::::::::: ::..:: ::. gi|739 SGESSSGRWPRRGASPSRVRFEDESARDAESRYLERLQQRQRP-------AASRGPPRSE 270 280 290 300 310 320 510 520 530 540 550 560 KIAA16 PDLADYINGAPRLRDAGQGTFHRLVGSLDRRGHPAPPAPGSERRCQACGSCIDDPRPAQG :::. : :. :. : :.. ::.: :.: . :::: : : :.:::: : ::: gi|739 PDLGRYGRGG-LARSDGAGALGRLLGRLERGAVPAPP-P---RTCRACGSRTDA--PAQ- 330 340 350 360 370 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