# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj11118.fasta.huge -Q ../query/KIAA1607.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. 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KIAA09 RVRSR-LNGDNAGISV-LPGSTSDKIFFHHLDNLRPSLTPVKEL----------KEPVGQ 1010 1020 1030 1040 1050 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA16 IVSTEKTILAVERNKVLLPPLWNRTFSWGFDDFSCCLGSYGSDKVLMTFENLAAWGRCLC :: :.: :::::.::::.:: ::.::.::. :.:: ::.: :::.. ..: :. ::. :: KIAA09 IVCTDKGILAVEQNKVLIPPTWNKTFAWGYADLSCRLGTYESDKAMTVYECLSEWGQILC 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA16 AVCPSPTTIVTSGTSTVVCVWELSMTKGRPRGLRLRQALYGHTQAVTCLAASVTFSLLVS :.::.: ..:.::::::::::.. .: . . . :.::: :::..::: .::... ..:: KIAA09 AICPNPKLVITGGTSTVVCVWEMGTSKEKAKTVTLKQALLGHTDTVTCATASLAYHIIVS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA16 GSQDCTCILWDLDHLTHVTRLPAHREGISAITISDVSGTIVSCAGAHLSLWNVNGQPLAS ::.: :::.:::..:. .:.: .:: .::. :....: ::::::... .:..::.:..: KIAA09 GSRDRTCIIWDLNKLSFLTQLRGHRAPVSALCINELTGDIVSCAGTYIHVWSINGNPIVS 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA16 ITTAWGPEGAITCCCLMEGPAWDTSQIIITGSQDGMVRVWKTEDVKMSVPGRPAGE--EP ..: : : :::. : :::...:.:: .::.:: :. : ..:: :: : : KIAA09 VNTFTGRSQQIICCCMSEMNEWDTQNVIVTGHSDGVVRFWRME--FLQVPETPAPEPAEV 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA16 LAQ----PPSPRGHKWEKNLALSRELDV-SIALTGKPSKTSPAVTALAVSRNHTKLLVGD : . : . :.. . . . . : : ::. : . ..:. :. 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KIAA05 HDLMSGFWNACYDMLMSSGQRRQWERAQSRRAFQELVLEPAQRRAR-LEGLRYTAVLKQQ 1030 1040 1050 1060 1070 340 350 360 370 380 390 KIAA16 KCGNIKAANAWARIQEQLFGELGLWSQGEETKPCSPWELDWREGPARMRKRIKRLSPLEA . : :. . .:: . : :. . : :.:. : .::: .: : . KIAA05 ATQHSMALLHWGALWRQLASPCGAWALRD--TPIPRWKLSSAETYSRMR---LKLVPNHH 1080 1090 1100 1110 1120 1130 400 410 420 430 440 450 KIAA16 LSSGRHKESQDKNDHISQTNAENQDELTLREAEGEPDEVGVDCTQLTFFPALHESLHSED .. : :.. :..... .: .: : : . : :.:. .:: KIAA05 FDP--HLEASALRDNLGEVPLTPTEEASL------PLAVTKEAKVSTPPELLQEDQLGED 1140 1150 1160 1170 1180 460 470 480 490 500 510 KIAA16 FL-ELCRERQVI-LQELLDKEKVTQKFSLVIVQGHLVSEGVLLFGHQHFYICENFTLSPT : :: .. :.: .: .. . .:: : . : :.: :. : : . : KIAA05 ELAELETPMEAAELDEQREKLVLSAECQLVTVVA--VVPGLLEVTTQNVY----FYDGST 1190 1200 1210 1220 1230 1240 520 530 540 550 560 570 KIAA16 GDVYCTRHCLSNISDPFIFNLCSKDRSTDHYSCQCHSYADMRELRQARFLLQDIALEIFF : . .. :. :..::.. :: :. :::.:: KIAA05 ERVETEEGIGYDFRRPL---------------------AQLREVHLRRFNLRRSALELFF 1250 1260 1270 580 590 600 KIAA16 HNGYSKFLVF-------------------------YNNDRSKAFKSFCSFQPSLKGKATS . . :: : ... :..... . ..: .: .: KIAA05 IDQANYFLNFPCKVGTTPVSSPSQTPRPQPGPIPPHTQVRNQVYSWLLRLRPPSQGYLSS 1280 1290 1300 1310 1320 1330 610 620 630 640 650 660 KIAA16 EDTLNLRRYPGSDRIMLQKWQKRDISNFEYLMYLNTAAGRTCNDYMQYPVFPWVLADYTS .. .. : : . ::: .:.:::::::: ::: :::: :: ::::::::: ::.: KIAA05 RSPQEMLRASG----LTQKWVQREISNFEYLMQLNTIAGRTYNDLSQYPVFPWVLQDYVS 1340 1350 1360 1370 1380 1390 670 680 690 700 710 720 KIAA16 ETLNLANPKIFRDLSKPMGAQTKERKLKFIQRFKEVEKTEGDMTVQCHYYTHYSSAIIVA ::.:.:: .:::::::.:. . .. .... : : . . :: ::::.: : KIAA05 PTLDLSNPAVFRDLSKPIGVVNPKHAQLVREKYESFEDPAGTID-KFHYGTHYSNAAGVM 1400 1410 1420 1430 1440 1450 730 740 750 760 770 780 KIAA16 SYLVRMPPFTQAFCALQGGSFDVADRMFHSVKSTWESASRENMSDVRELTPEFFYLPEFL ::.:. :::. ::.: :: .::.:::: ..:. : :. .::.:: :::::.:.:: KIAA05 HYLIRVEPFTSLHVQLQSGRFDCSDRQFHSVAAAWQ-ARLESPADVKELIPEFFYFPDFL 1460 1470 1480 1490 1500 1510 790 800 810 820 830 840 KIAA16 TNCNGVEFGCMQ-DGTVLGDVQLPPWADGDPRKFISLHRKALESDFVSANLHHWIDLIFG : :: ..::.: . .::: :::::.. :. ::. ::.::::..:::.::.::::::: KIAA05 ENQNGFDLGCLQLTNEKVGDVVLPPWASS-PEDFIQQHRQALESEYVSAHLHEWIDLIFG 1520 1530 1540 1550 1560 1570 850 860 870 880 890 900 KIAA16 YKQQGPAAVDAVNIFHPYFYGDRMDLSSITDPLIKSTILGFVSNFGQVPKQLFTKPHPAR :::.:::: .:.:.:. : .::. .:: .... :..:::::.: ::. .:::.: KIAA05 YKQRGPAAEEALNVFYYCTYEGAVDLDHVTDERERKALEGIISNFGQTPCQLLKEPHPTR 1580 1590 1600 1610 1620 1630 910 920 930 940 950 KIAA16 TAAGKP---LPGKDVSTPVSLPGHPQPFFYSLQSLRP--SQVTVKD---MYLFSLGSESP .: . : :...: .: :. :. ..: :.: . : . ..: KIAA05 LSAEEAAHRLARLDTNSP--------SIFQHLDELKAFFAEV-VSDGVPLVLALVPHRQP 1640 1650 1660 1670 1680 960 970 980 990 1000 1010 KIAA16 KGAIGHIVSTEKTILAVERNKVLLPPLW---NRTFSWGFDDFSC--CLGSYGSDKVLMT- .. : . .. ...: . .: : .:..: :. :: .::. ....: KIAA05 HSFITQ--GSPDLLVTVSASGLLGTHSWLPYDRNISNYFS-FSKDPTMGSHKTQRLLSGP 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA16 -FENLAAWGRCLCAVCPSPTTIVTSGTSTVVCVWELSM-TKGRPRGLRLRQALYGHTQAV . .. :. : :: :. . ..: :. :. . . ::: : : : : ..: KIAA05 WVPGSGVSGQAL-AVAPDGKLLFSGGH------WDGSLRVTALPRGKLLSQ-LSCHLDVV 1750 1760 1770 1780 1790 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA16 TCLAASVTFSLLVSGSQDCTCILWDLDH---LT------HVTRLPAHREGISAITISDVS :::: .. :.:::.: ::..: : : :. : : .: ..: ..:: KIAA05 TCLALDTCGIYLISGSRDTTCMVWRLLHQGGLSVGLAPKPVQVLYGHGAAVSCVAISTEL 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA16 GTIVSCAGAHLSLWNVNGQPLASITTAWGPEGAITCCCLMEGPAWDTSQIIITGSQDGMV :: :.. . .. .....: : :: ... . .::.. .: KIAA05 DMAVS--GSEDGTVIIHTVRRGQFVAALRPLGATFPGPIFHLALGSEGQIVVQSSAWERP 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA16 RVWKTEDVKM-SVPGRPAGEEPLAQPPSPRGHKWEKNLALSRE-----LDVSIALTGKPS . : .... :: :. . :::. :. . : . . :... : . : KIAA05 GAQVTYSLHLYSVNGKLRASLPLAEQPTALTVTEDFVLLGTAQCALHILQLNTLLPAAPP 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1240 1250 1260 1270 KIAA16 -KTSPAVTALAVSRNHTKLLVGDERGRIFCWSADG . :. ..::.......::: : :.. KIAA05 LPMKVAIRSVAVTKERSHVLVGLEDGKLIVVVAGQPSEVRSSQFARKLWRSSRRISQVSS 1980 1990 2000 2010 2020 2030 >>KIAA1544 ( 1028 res) fh02556 (1028 aa) initn: 910 init1: 359 opt: 1140 Z-score: 1081.6 bits: 212.0 E(): 4e-55 Smith-Waterman score: 1140; 38.302% identity (63.085% similar) in 577 aa overlap (551-1103:291-841) 530 540 550 560 570 580 KIAA16 HCLSNISDPFIFNLCSKDRSTDHYSCQCHSYADMRELRQARFLLQDIALEIFFHNGYSKF ....: . . :.:::. :::.:. : : KIAA15 YFEVDEDDSAFKKIDTKVLAYTEGLHGKWMFSEIRAVFSRRYLLQNTALEVFMANRTS-- 270 280 290 300 310 590 600 610 620 630 KIAA16 LVFYNNDRSKAFKSFCSFQPSLKGKATSEDTLNLRR---------YPGSDRIMLQKWQKR :..: . . :. : . : .:: . :: : .:. : :.::.: KIAA15 -VMFNFPDQATVKKVVYSLPRV-GVGTSYGLPQARRISLATPRQLYKSSN--MTQRWQRR 320 330 340 350 360 370 640 650 660 670 680 690 KIAA16 DISNFEYLMYLNTAAGRTCNDYMQYPVFPWVLADYTSETLNLANPKIFRDLSKPMGAQTK .::::::::.::: :::: :: :::::::::..: :: :.:. : :::::::.:: . 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KIAA15 NLDSITDPVLREAMEAQIQNFGQTPSQLLIEPHPPRSSAMHLCFLP----QSPLMFKDQM 610 620 630 640 650 660 930 940 950 960 970 980 KIAA16 QPFFYSLQSLRPSQVTVKDMYLFSLGSESPKGAIGHIVS-TEKTILAVER--NKVLL--P : . .. ::. : . .: :. .: .:. : . ..::.: : : : KIAA15 QQDVIMVLKF-PSNSPVTHVAANTL----PHLTIPAVVTVTCSRLFAVNRWHNTVGLRGA 670 680 690 700 710 720 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA16 PLW--NRTFSWGFDDFSCCLGSYGSDKVLMTFENLAAWGRCLCAVCPSPTTIVTSGTSTV : . ... .. .. : .: .: .:. . . : : .::. . . KIAA15 PGYSLDQAHHLPIEMDPLIANNSGVNKRQIT--DLVDQSIQINAHC----FVVTADNRYI 730 740 750 760 770 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA16 -VC-VWELSMTKGRPRGLRLRQALYGHTQAVTCLAASVTF----SLLVSGSQDCTCILWD .: :. :. . .: : ..:: ..::::: : .. .::::.: : .:: KIAA15 LICGFWDKSFRVYSTETGKLTQIVFGHWDVVTCLARSESYIGGDCYIVSGSRDATLLLWY 780 790 800 810 820 830 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA16 LDHLTHVTRLPAHREGISAITISDVSGTIVSCAGAHLSLWNVNGQPLASITTAWGPEGAI . :. 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