# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj10713.fasta.nr -Q ../query/KIAA1604.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1604, 937 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7816707 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0552+/-0.000203; mu= 9.5828+/- 0.011 mean_var=136.9905+/-25.546, 0's: 24 Z-trim: 75 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.109579 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|75041856|sp|Q5RA93.1|NCM_PONAB RecName: Full=Nu ( 908) 5887 943.2 0 gi|109100244|ref|XP_001100012.1| PREDICTED: simila ( 907) 5771 924.8 0 gi|149730773|ref|XP_001501165.1| PREDICTED: simila ( 908) 5561 891.6 0 gi|74004927|ref|XP_545549.2| PREDICTED: similar to ( 908) 5544 888.9 0 gi|114582001|ref|XP_001157523.1| PREDICTED: hypoth ( 896) 5487 879.9 0 gi|119887434|ref|XP_001249355.1| PREDICTED: simila ( 900) 5316 852.9 0 gi|149022356|gb|EDL79250.1| rCG26274, isoform CRA_ ( 906) 5000 802.9 0 gi|62645317|ref|XP_342454.2| PREDICTED: similar to ( 902) 4977 799.3 0 gi|109478405|ref|XP_001055909.1| PREDICTED: simila ( 906) 4907 788.2 0 gi|123233660|emb|CAM19372.1| novel protein [Mus mu ( 903) 4890 785.6 0 gi|123233659|emb|CAM19371.1| novel protein [Mus mu ( 902) 4879 783.8 0 gi|74204863|dbj|BAE20931.1| unnamed protein produc ( 902) 4875 783.2 0 gi|74146346|dbj|BAE28941.1| unnamed protein produc ( 902) 4873 782.9 0 gi|148695285|gb|EDL27232.1| cDNA sequence BC003993 ( 909) 4871 782.6 0 gi|26337483|dbj|BAC32427.1| unnamed protein produc ( 902) 4869 782.2 0 gi|81876680|sp|Q8C5N3.1|NCM_MOUSE RecName: Full=Nu ( 908) 4860 780.8 0 gi|122890102|emb|CAM15053.1| novel protein contain ( 830) 4492 722.6 1.8e-205 gi|122890100|emb|CAM15051.1| novel protein contain ( 830) 4492 722.6 1.8e-205 gi|149022355|gb|EDL79249.1| rCG26274, isoform CRA_ ( 737) 4250 684.3 5.6e-194 gi|123233657|emb|CAM19369.1| novel protein [Mus mu ( 723) 4169 671.5 3.9e-190 gi|10439972|dbj|BAB15612.1| unnamed protein produc ( 632) 4149 668.2 3.2e-189 gi|109100252|ref|XP_001100189.1| PREDICTED: simila ( 631) 4024 648.5 2.9e-183 gi|158563904|sp|Q5ZKA3.2|NCM_CHICK RecName: Full=N ( 926) 3842 619.9 1.7e-174 gi|53131707|emb|CAG31840.1| hypothetical protein [ ( 854) 3678 593.9 1e-166 gi|123884382|sp|Q08C72.1|NCM_DANRE RecName: Full=N ( 985) 3659 591.0 9e-166 gi|169154621|emb|CAQ15309.1| novel protein (zgc:15 ( 983) 3629 586.2 2.4e-164 gi|10438214|dbj|BAB15197.1| unnamed protein produc ( 567) 3608 582.7 1.7e-163 gi|82177866|sp|Q52KN9.1|NCM_XENLA RecName: Full=Nu ( 803) 3545 572.9 2.1e-160 gi|13278349|gb|AAH03993.1| BC003993 protein [Mus m ( 629) 3347 541.4 4.7e-151 gi|210111591|gb|EEA59388.1| hypothetical protein B (1080) 2960 480.5 1.8e-132 gi|210111585|gb|EEA59382.1| hypothetical protein B (1342) 2864 465.5 7.5e-128 gi|157015167|gb|EAA12244.4| AGAP007874-PA [Anophel ( 971) 2849 462.9 3.1e-127 gi|47207808|emb|CAF93347.1| unnamed protein produc ( 790) 2833 460.3 1.6e-126 gi|190615307|gb|EDV30831.1| GF14847 [Drosophila an (1331) 2819 458.3 1e-125 gi|190657572|gb|EDV54785.1| GG21708 [Drosophila er (1323) 2794 454.4 1.6e-124 gi|74869383|sp|Q9VJ87.3|NCM_DROME RecName: Full=Nu (1330) 2792 454.1 2e-124 gi|194176673|gb|EDW90284.1| GE12732 [Drosophila ya (1303) 2791 453.9 2.2e-124 gi|194191797|gb|EDX05373.1| GD21833 [Drosophila si (1323) 2767 450.1 3.1e-123 gi|194134107|gb|EDW55623.1| GM17089 [Drosophila se (1325) 2755 448.2 1.2e-122 gi|198428958|ref|XP_002125724.1| PREDICTED: simila ( 915) 2729 443.9 1.6e-121 gi|108884014|gb|EAT48239.1| cell cycle control pro ( 845) 2722 442.8 3.2e-121 gi|193912687|gb|EDW11554.1| GI17204 [Drosophila mo (1273) 2715 441.9 9e-121 gi|194149258|gb|EDW64956.1| GJ19836 [Drosophila vi (1263) 2703 440.0 3.3e-120 gi|193904517|gb|EDW03384.1| GH10535 [Drosophila gr (1274) 2698 439.2 5.8e-120 gi|167871178|gb|EDS34561.1| pre-mRNA-splicing fact ( 864) 2678 435.8 4e-119 gi|159884151|gb|ABX00754.1| LD29132p [Drosophila m ( 893) 2675 435.4 5.7e-119 gi|19528255|gb|AAL90242.1| GH13383p [Drosophila me (1012) 2675 435.4 6.2e-119 gi|189237937|ref|XP_001811305.1| PREDICTED: simila ( 756) 2647 430.9 1.1e-117 gi|33086620|gb|AAP92622.1| Ac2-155 [Rattus norvegi ( 879) 2634 428.9 5e-117 gi|109478403|ref|XP_001055856.1| PREDICTED: simila ( 883) 2634 428.9 5e-117 >>gi|75041856|sp|Q5RA93.1|NCM_PONAB RecName: Full=Nucamp (908 aa) initn: 5887 init1: 5887 opt: 5887 Z-score: 5036.4 bits: 943.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 5887; 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