# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj09118.fasta.huge -Q ../query/KIAA1591.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1591, 1018 aa vs ./tmplib.25089 library 1986487 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9169+/-0.00504; mu= 15.5651+/- 0.343 mean_var=96.7608+/-23.108, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 9 in 1/39 Lambda= 0.130384 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1121 ( 1390 res) hh10147 (1390) 3327 637.5 3.7e-183 KIAA1032 ( 1702 res) ff09715 (1702) 147 39.4 0.0049 >>KIAA1121 ( 1390 res) hh10147 (1390 aa) initn: 5077 init1: 1685 opt: 3327 Z-score: 3380.2 bits: 637.5 E(): 3.7e-183 Smith-Waterman score: 5466; 75.760% identity (89.217% similar) in 1085 aa overlap (1-1017:309-1387) 10 20 30 KIAA15 QLYEMFQQILGIKKLEHQLLYNACQLDNAD :::::::.::::::.::::::::::::: : KIAA11 DAIYRGEEDPRKQQARMTASAASELILSKEQLYEMFQNILGIKKFEHQLLYNACQLDNPD 280 290 300 310 320 330 40 50 60 70 80 90 KIAA15 EQAAQIRRELDGRLQLADKMAKERKFPKFIAKDMENMYIEELRSSVNLLMANLESLPVSK :::::::::::::::.::..:.:::::::..:.:::::::::.::::::::::::.:::: KIAA11 EQAAQIRRELDGRLQMADQIARERKFPKFVSKEMENMYIEELKSSVNLLMANLESMPVSK 340 350 360 370 380 390 100 110 120 130 140 150 KIAA15 GGPEFKLQKLKRSQNSAFLDIGDENEIQLSKSDVVLSFTLEIVIMEVQGLKSVAPNRIVY :: ::::::::::.:....:.:.:.: :::::::::::.::.::::::::::.::::::: KIAA11 GG-EFKLQKLKRSHNASIIDMGEESENQLSKSDVVLSFSLEVVIMEVQGLKSLAPNRIVY 400 410 420 430 440 450 160 170 180 190 200 KIAA15 CTMEVEG-EKLQTDQAEASRPQWGTQGDFTTTHPRPVVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV ::::::: :::::::::::.: :::::::.::: :.::::::::::::::::::::::: KIAA11 CTMEVEGGEKLQTDQAEASKPTWGTQGDFSTTHALPAVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV 460 470 480 490 500 510 210 220 230 240 250 260 KIAA15 ILYPTSNSSKSAELHRMVVPKNSQDSDLKIKLAVRMDKPAHMKHSGYLYALGQKVWKRWK ::.:: :: :..: :.:.: :: :.::::::::::::: .:::::::.:.:..:::::: KIAA11 ILHPTPNSPKQSEWHKMTVSKNCPDQDLKIKLAVRMDKPQNMKHSGYLWAIGKNVWKRWK 520 530 540 550 560 570 270 280 290 300 310 320 KIAA15 KRYFVLVQVSQYTFAMCSYREKKSEPQELMQLEGYTVDYTDPHPGLQGGCMFFNAVKEGD ::.::::::::::::::::::::.:::::.::.:::::::::.:::.:: ::::::::: KIAA11 KRFFVLVQVSQYTFAMCSYREKKAEPQELLQLDGYTVDYTDPQPGLEGGRAFFNAVKEGD 580 590 600 610 620 630 330 340 350 360 370 380 KIAA15 TVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSYKPVPAIQTQKLNPKGGTL-HADA---QLYADRF ::::::::::::::::::::::::::.:::: :.:::: :::.. . :: :.:::: KIAA11 TVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSHKPVPPTQVQKLNAKGGNVPQLDAPISQFYADRA 640 650 660 670 680 690 390 400 410 420 430 440 KIAA15 QKHGMDEFISANPCKLDHAFLFRILQRQTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARYG ::::::::::.:::..::: ::...:: :::::::::::::::::::::::::::::: : KIAA11 QKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQRLTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARNG 700 710 720 730 740 750 450 460 470 480 490 500 KIAA15 VRGCHRHLCYLAELMEHSENGAVIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGIGTVSVEEKERFE ::::::::::: .:.:..::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: KIAA11 VRGCHRHLCYLRDLLERAENGAMIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGIGTVTVEEKERFE 760 770 780 790 800 810 510 520 530 540 550 560 KIAA15 EIKERLSSLLENQISHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIATPIPAEEVKKVVRK :::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::: :.:: KIAA11 EIKERLRVLLENQITHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIVTPVPQEEVKTVIRK 820 830 840 850 860 870 570 580 590 600 610 KIAA15 CLEKAALINYTRLTEYAKIEETMNQA-------SPARKLEEILHLAELCIEVLQQNEEHH :::.:::.::.::.:::::::....: .::.:::. ..:::: ::::::::::: KIAA11 CLEQAALVNYSRLSEYAKIEENQKDAENVGRLITPAKKLEDTIRLAELVIEVLQQNEEHH 880 890 900 910 920 930 620 630 640 650 660 670 KIAA15 AE-------AFAWWPDLLAEHAEKFWALFTVDMDTALEAQPQDSWDSFPLFQLLNNFLRN :: ::::: ::..:::: : .::.::::.:::.:: :.:::::::::::.:::. 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