# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj06751.fasta.huge -Q ../query/KIAA1584.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1584, 995 aa vs ./tmplib.25089 library 1986510 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2955+/-0.00854; mu= 8.4114+/- 0.585 mean_var=307.8466+/-76.211, 0's: 0 Z-trim: 27 B-trim: 102 in 1/39 Lambda= 0.073098 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0461 ( 1355 res) hg00867 (1355) 1141 135.1 5.9e-32 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 243 40.3 0.0018 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 213 36.4 0.009 >>KIAA0461 ( 1355 res) hg00867 (1355 aa) initn: 1522 init1: 880 opt: 1141 Z-score: 665.5 bits: 135.1 E(): 5.9e-32 Smith-Waterman score: 1519; 37.124% identity (60.000% similar) in 765 aa overlap (59-751:91-803) 30 40 50 60 70 80 KIAA15 KMAELFMECEEEELEPWQKKVKEVEDDDDDEPIFVGEISSSKPAISNILNRVNPSSYSRG .:::. . . . : .: . . 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KIAA04 ------PRTV------PVSSNDTPPSALQEAA----------------PLTSSMDPLPVF 650 660 670 620 630 640 650 660 670 KIAA15 LASSNKKSKVNTALRNLRYRRGIHKCIECCSEIKDFANHFPTYVHCSFCRYNTSCSKAYV : ..: . :.:.. : . :.:: :: :: ::::::::::.:::.: ::.::. KIAA04 LYPPVQRSIQKRAVRKMSVM-GRQTCLECSFEIPDFPNHFPTYVHCSLCRYSTCCSRAYA 680 690 700 710 720 730 680 690 700 710 720 730 KIAA15 NHMMSFHSNRPSKRFCIFKKHSENLRGITLVCLNCDFLSDVSGLDNMATHLSQHKTHTCQ :::.. : : : .. . :.: . :: :.: .: :...:. : :: :: . .: . 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KIAA13 VYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKSQQ-STSMTPFG 20 30 40 50 60 70 210 220 230 240 250 KIAA15 NPKKPKPSESVSGANSSAVLPSVKSPSVTSSQAMLAK--GTNTS-----SNQSKNGTPFP : : :. : . . : : : .. :.. . : : : ..: ...: : KIAA13 RPATDLP-EASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTHQCSHATEHP 80 90 100 110 120 130 260 270 280 290 300 KIAA15 RACPKCNIHF----NLLDPLKNHMKYC---CPDMINNFLGLAKTEFSSTVNKNTTIDSEK : .: :: .: . ..: . :: .: .. . :...: :. 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