# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj05982s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1582.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1582, 1740 aa vs ./tmplib.25089 library 1985765 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4763+/-0.0106; mu= -18.6044+/- 0.713 mean_var=467.5543+/-112.432, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.059314 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1460 ( 1400 res) fh17570 (1400) 2122 197.5 1.8e-50 KIAA1093 ( 1727 res) fh18956 (1727) 1058 106.5 5.3e-23 KIAA1819 ( 1173 res) hh00456 (1173) 273 39.2 0.0066 >>KIAA1460 ( 1400 res) fh17570 (1400 aa) initn: 2313 init1: 631 opt: 2122 Z-score: 998.2 bits: 197.5 E(): 1.8e-50 Smith-Waterman score: 3757; 45.382% identity (67.841% similar) in 1505 aa overlap (344-1737:8-1395) 320 330 340 350 360 370 KIAA15 GFSQGNGDTVNSALSAKQNGSSSAVQKEGSGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNNGVGNI ::..:.:: :. .:: :.: :. :. 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KIAA14 --SIKEP---QSRLRKWT---TVDSI-SVNTSLDQNSSKHGAISSGFRLE-------ESP 970 980 990 1000 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA15 YGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSS-INWPPEFHPGVPWKGLQNID . ::....: :::::: .. .: :::: :::: .::::::.:: :::: ::: KIAA14 FVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSP-----NGSSSVNWPPEFRPGEPWKGYPNID 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1460 1470 1480 1490 KIAA15 PENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKST------WSS--------- ::.:: :::::: .. .::: ...:.. ...:. :....: ::: KIAA14 PETDPYVTPGSVINNLSINT-VREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1500 1510 1520 1530 KIAA15 -------------------GPTSHTQASLSHELWKVP---RNSTAPTRPPPGLTNPKPS- .: : :..::.::::::: .: :::.:::::::. :: KIAA14 LSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPL 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA15 STWGASPL----GWTSS---YSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQH ::: ::: :: .: :. ::.:. ..::: ..::::.:::::::::::::::.:: KIAA14 STWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTLCMQH 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1590 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA15 GPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAEFAGEEEVNRFLAQGQ :::::::::: .:::.::::::::..:::::::::::::::::::::.:::..::.::.: KIAA14 GPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQ 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1650 1660 1670 1680 1690 1700 KIAA15 ALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLV-RSDAGHWNAPCLGGKGSSEL----LWGGVP .: :. .::: . ::: ::.. ::.. :.: .:::. :.: . ..: ::: .: KIAA14 SLTPSPGWQSLG-SSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWG-TP 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1710 1720 1730 1740 KIAA15 QYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL .::.:::::::..: : :.::.:....: : :.: KIAA14 HYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM 1370 1380 1390 1400 >>KIAA1093 ( 1727 res) fh18956 (1727 aa) initn: 1861 init1: 542 opt: 1058 Z-score: 504.9 bits: 106.5 E(): 5.3e-23 Smith-Waterman score: 2896; 36.129% identity (57.312% similar) in 1860 aa overlap (7-1739:192-1724) 10 20 30 KIAA15 SEANCSWDKVIIDRTDKEAWPSITGTETESASECTT :::::.: .: : :: :.. .:::.:: :: KIAA10 GGAAASNYANSTWGSGASSNNGTSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTT 170 180 190 200 210 220 40 50 60 70 80 90 KIAA15 DTDSASNCGSENSSM--ATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANS :..:::: :::.:.. .: : .:. . . ..::. . :. ..:. .:. ...... KIAA10 DNNSASNPGSEKSTLPGSTTSNKGKGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTE 230 240 250 260 270 280 100 110 120 130 140 150 KIAA15 NGSAARVWGVATGSSSGLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGINLNLNPNA :... : .::: : :: : .:.. :.:::. KIAA10 NNNGLGNWR------------NVSGQD-----RIGPG------------SGFS-NFNPNS 290 300 310 160 170 180 190 200 210 KIAA15 NPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLL-PQESTEPQ ::.:::.: .::: : . ..:.: .. ... :. :.: . KIAA10 NPSAWPALVQEGTSRKGA--------------LETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMEN 320 330 340 350 220 230 240 250 260 270 KIAA15 TSTSQNVSFSAQPQNLNTDGPNN--TNPMN-SSPNPINAMQTNGLPNWGMAVGMGAIIPP .... :: : : :::::.: :: .: ::::: :...:.: ::: KIAA10 AGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNP---MENKGMP-----FGMGL---- 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 KIAA15 HLQGLPGANGSSVSQVSGGSAEGISNSVWGLSPG----NPATGNSNSGFSQGNG----DT : . . .. :: .: : : . :: . : . ..:.:::: . .:: :. KIAA10 ---GNTSRSTDAPSQSTGDRKTG-SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDS 410 420 430 440 450 460 330 340 350 360 370 380 KIAA15 VNSALSAKQNGSSSAVQKEG--SGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGH ..: :..::.. .. : :..:. :: . ::.: :. .... .: : . KIAA10 WKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDN-KWGEG--NKMTSGVSQGEWKQ 470 480 490 500 510 390 400 410 420 430 KIAA15 PSRSTSNGVNGEWGKPPNQHSNSDINGKGSTG-WESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAA :. : . :::. : :: :: ::: :.. . : : :. . :.... KIAA10 PTGSDELKI-GEWSGP-NQ-PNS------STGAWDNQK-GHPLPENQ-GNAQAPCWGRSS 520 530 540 550 560 440 450 460 470 480 490 KIAA15 SSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRRDKGIIDQGHIQ--LPRNDLDPRVLSNT :: . :.: :: ::. ::. ...:. : :. .: : :.:::::::::: KIAA10 SSTGSEVGGQSTGS-NHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNT 570 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 550 KIAA15 GWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVS ::::: .::.:.:..:: :: : :.:.:::.: ::::..:::: .:. : ... : KIAA10 GWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAP---SQSNQMKS 630 640 650 660 670 680 560 570 580 590 600 610 KIAA15 GWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDSISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDK :: . . :.: : : :.. : :.: .... . :.:. .: KIAA10 GW-----GELSASTEWKD-----PKNTGGWNDYKNNNSSN----------WGGGRPDEKT 690 700 710 720 620 630 640 650 660 670 KIAA15 SPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWADSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSG .:.: :. :.: :: :.. : .::.: . : :. : :: :.:...... KIAA10 PSSWNENPS-KDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGW-------GEEVDQTKN-SNWESSASKPV 730 740 750 760 770 680 690 700 710 720 KIAA15 SGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLKPGPQQN--------WASK--------- :::.. .. . :::. :.. .: : : .: : : .. KIAA10 SGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQ 780 790 800 810 820 830 730 740 750 760 770 KIAA15 ---PQDNNVSNWGGA-----ASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKM :: . ..::: ..:. ....: .:: :. :: : .::::::: :: ::: KIAA10 PPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDE-EPSGWEEPSPQSISRKM 840 850 860 870 880 890 780 790 800 810 820 830 KIAA15 EIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPPHQ .:::::::::::..:: :.::.::.: KIAA10 DIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKN---------------------------------- 900 910 840 850 860 870 880 890 KIAA15 AGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGS :.: : : ::. :. : ... KIAA10 -----------------SQG-GPAPR----------EPNLPT-------------PMTSK 920 930 900 910 920 930 940 950 KIAA15 GWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWG-SGGDEMNLSTSQWEDEE-GDV . .: :::::.::: : : . .::.:: : : KIAA10 SASD-------------------------SKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGV 940 950 960 970 960 970 980 990 1000 KIAA15 WNNAASQESTSS--CSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAE ::...:: :.:: .:::.. :: .. ..: : ....: :. : ::...::. . . 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