# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh22968s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1571.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1571, 1779 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826097 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6036+/-0.000188; mu= 13.6736+/- 0.011 mean_var=91.8355+/-17.847, 0's: 39 Z-trim: 48 B-trim: 32 in 1/66 Lambda= 0.133835 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|166228734|sp|Q9HCK1.3|ZDBF2_HUMAN RecName: Full (2354) 11829 2295.8 0 gi|109100750|ref|XP_001097564.1| PREDICTED: hypoth (2229) 7540 1467.6 0 gi|119590791|gb|EAW70385.1| hCG2012502 [Homo sapie ( 762) 5118 999.6 0 gi|34528117|dbj|BAC85454.1| unnamed protein produc ( 695) 4682 915.4 0 gi|194664858|ref|XP_001787346.1| PREDICTED: simila (2270) 4322 846.3 0 gi|74005640|ref|XP_545611.2| PREDICTED: hypothetic (2343) 4067 797.1 0 gi|194222514|ref|XP_001498419.2| PREDICTED: zinc f (2435) 3349 658.4 2.1e-185 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::::::::::::::::::::::::::::: :::: :::::::::::::::::::: ::: gi|109 EQLQEAVKKIDQWKEEVIGLKNKINEPSTSKLIHDSDVSVQSVADQPKVAIKHVNLENEN 1090 1100 1110 1120 1130 1140 570 580 590 600 610 620 KIAA15 HMYLEVKNSQYSCSEMNLDSGFLGQSIVNRPQITILEQEHIELEGKHNQCCGSEVSFDSD ::::::::::: :::::::: :: :::::::::::::..:::::::::: ::::.::::: gi|109 HMYLEVKNSQYRCSEMNLDSRFLVQSIVNRPQITILERDHIELEGKHNQRCGSEISFDSD 1150 1160 1170 1180 1190 1200 630 640 650 660 670 680 KIAA15 DPLQSVADRLRETVKEISLWKDEEVDTEDRRNEAKGFEIMYDSDVLQPVAGQPEEVVKEV ::::::::.::::::::::::::::: :: ::::::::::::: :::::::::: ::::: gi|109 DPLQSVADQLRETVKEISLWKDEEVDMEDSRNEAKGFEIMYDSAVLQPVAGQPEGVVKEV 1210 1220 1230 1240 1250 1260 690 700 710 720 730 740 KIAA15 SLWKEHVDLENKIVKPTDSRINFDSHEPLQSVTNKIPGANKEINLLREEHVCLDDKGYVP :::::::::::::::::...::::::::: :::::: :.::: ::::::.:::::::::: gi|109 SLWKEHVDLENKIVKPTNTKINFDSHEPLLSVTNKIQGVNKERNLLREERVCLDDKGYVP 1270 1280 1290 1300 1310 1320 750 760 770 780 790 800 KIAA15 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::::::::::::::: : : gi|109 SATANPPAKRPVPVRASCHITRRKKRSDESYHGRKRSPAGPVRAYDLRSSSCLQQCGRRM 2160 2170 2180 2190 2200 2210 1770 KIAA15 TRLANKLRGNEVK :::::::::::.: gi|109 TRLANKLRGNETK 2220 >>gi|119590791|gb|EAW70385.1| hCG2012502 [Homo sapiens] (762 aa) initn: 5118 init1: 5118 opt: 5118 Z-score: 5337.6 bits: 999.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5118; 100.000% identity (100.000% similar) in 762 aa overlap (1018-1779:1-762) 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA15 INTECIDIEDKSCDFFGSEVRCNCKASTPSMTNQCKETFKIINRKKDYIILGEPSCQSCG :::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 MTNQCKETFKIINRKKDYIILGEPSCQSCG 10 20 30 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA15 SEMNFNVDASDQSMTYESQGPDEKMVKYIDSEDKSCGYNGSKGKFNLEDTSHRTTHRLQK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 SEMNFNVDASDQSMTYESQGPDEKMVKYIDSEDKSCGYNGSKGKFNLEDTSHRTTHRLQK 40 50 60 70 80 90 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA15 AHKEASLRKDPRNAGLKGKSCQSSASAVDFGASSKSALHRRADKKKRSKLKHRDLEVSCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 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(571-1265:1-695) 550 560 570 580 590 600 KIAA15 LIHHPDVSVQSVADQPKVAIKHVNLGNENHMYLEVKNSQYSCSEMNLDSGFLGQSIVNRP :::::::::::::::::::::::::::::: gi|345 MYLEVKNSQYSCSEMNLDSGFLGQSIVNRP 10 20 30 610 620 630 640 650 660 KIAA15 QITILEQEHIELEGKHNQCCGSEVSFDSDDPLQSVADRLRETVKEISLWKDEEVDTEDRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|345 QITILEQEHIELEGKHNQCCGSEVSFDSDDPLQSVADRLRETVKEISLWKDEEVDTEDRR 40 50 60 70 80 90 670 680 690 700 710 720 KIAA15 NEAKGFEIMYDSDVLQPVAGQPEEVVKEVSLWKEHVDLENKIVKPTDSRINFDSHEPLQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|345 NEAKGFEIMYDSDVLQPVAGQPEEVVKEVSLWKEHVDLENKIVKPTDSRINFDSHEPLQS 100 110 120 130 140 150 730 740 750 760 770 780 KIAA15 VTNKIPGANKEINLLREEHVCLDDKGYVPSDSEIIYVSNIPLQSVIKQPHILEEEHASLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|345 VTNKIPGANKEINLLREEHVCLDDKGYVPSDSEIIYVSNIPLQSVIKQPHILEEEHASLE 160 170 180 190 200 210 790 800 810 820 830 840 KIAA15 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(2231 aa) initn: 1631 init1: 470 opt: 1608 Z-score: 1668.6 bits: 322.2 E(): 3.1e-84 Smith-Waterman score: 4200; 45.440% identity (67.890% similar) in 1853 aa overlap (6-1779:491-2231) 10 20 30 KIAA15 SSCSETSFDCDVSLESVVDHPQLTVKGRNLKGRQV .::. : ....::::. :. . .:: : gi|149 SSADETPAASRQQNPVRNTHANLVDENYGSSSFSSDS--DAALDHPQVPVQEGSPRGRAV 470 480 490 500 510 40 50 60 70 80 90 KIAA15 HLKHKKRKPSSAKAHLDCDVSLGTVADESQRAVEKINLLKEKNADLMDMNCESHGPEMGF . ....::::.:: . : :: ::: : :: ..::: ..::..: ::::::::::.:: gi|149 G-QGNEEQPSSAEAHPERDGSLETVAHELQRESQEINLPNQKNTSLGDMNCESHGPEVGF 520 530 540 550 560 570 100 110 120 130 140 150 KIAA15 QADAQL-ADQSQVAEIERQKVDVDLENKSVQSSRSSLSSDSPASLYHSAHDEPQEALDEV .::::: :::: : ..::.::::.::.:. :.:: :: :: :.::.:.:: : :: gi|149 HADAQLEADQSPVNP---EEVDLDLENQSVHSGISNLSFDSNAS-YQSANDQPQGAWGEV 580 590 600 610 620 630 160 170 180 190 200 210 KIAA15 NLKELNIDMEVRSYDCSSSELTFDSDPPLLSVTEQSHLDAEG-KERHIDLEDESCESDSS :: :::.::::.: ::::::::::: :::::::.: :: :: .: ..::::.: :.:: gi|149 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