# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh16155s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1549.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1549, 1865 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7817523 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4899+/-0.000197; mu= 10.3410+/- 0.011 mean_var=117.5830+/-22.481, 0's: 41 Z-trim: 71 B-trim: 2 in 1/65 Lambda= 0.118277 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|153792230|ref|NP_065961.1| hypothetical protein (1884) 12104 2077.9 0 gi|109068382|ref|XP_001107649.1| PREDICTED: simila (1885) 11560 1985.0 0 gi|119604305|gb|EAW83899.1| hCG1811076 [Homo sapie (1497) 9735 1673.5 0 gi|149255007|ref|XP_991947.2| PREDICTED: similar t (1904) 8169 1406.4 0 gi|94377272|ref|XP_979772.1| PREDICTED: hypothetic (1940) 8168 1406.2 0 gi|109471920|ref|XP_231616.4| PREDICTED: similar t (2042) 8019 1380.8 0 gi|51259788|gb|AAH79889.1| D630045J12Rik protein [ (1727) 7619 1312.5 0 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hypothetic (1724) 682 128.8 4.2e-26 gi|148695770|gb|EDL27717.1| mCG130686, isoform CRA (1357) 668 126.3 1.8e-25 gi|124358961|ref|NP_001028519.2| hypothetical prot (1414) 668 126.4 1.9e-25 gi|210106976|gb|EEA54932.1| hypothetical protein B (1252) 666 126.0 2.2e-25 gi|123123374|emb|CAM16661.1| novel protein [Mus mu (1677) 656 124.4 9e-25 gi|109470420|ref|XP_001079537.1| PREDICTED: hypoth (2128) 648 123.1 2.8e-24 gi|56403880|emb|CAI29725.1| hypothetical protein [ ( 758) 641 121.5 2.9e-24 gi|148695771|gb|EDL27718.1| mCG130686, isoform CRA (1025) 642 121.8 3.2e-24 gi|119936403|gb|ABM06121.1| hypothetical protein L ( 214) 607 115.3 6.1e-23 gi|149022794|gb|EDL79688.1| rCG26130, isoform CRA_ ( 566) 592 113.1 7.5e-22 gi|149022793|gb|EDL79687.1| rCG26130, isoform CRA_ ( 906) 592 113.2 1.1e-21 gi|26338728|dbj|BAC33035.1| unnamed protein produc ( 509) 487 95.1 1.7e-16 gi|115643124|ref|XP_001191767.1| PREDICTED: hypoth (1249) 443 87.9 6.2e-14 gi|187020927|emb|CAP39508.1| Hypothetical protein (2035) 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.:. .:. ..::: ::.::.: :..:.: : :: :: :: ::: gi|512 FLSSEARGALESWHSSPVPSFTDHPYVLSPESSLRPHTGCVSCVVSSFQQELARSLTEKD 160 170 180 190 200 210 380 390 400 410 420 430 KIAA15 VGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSSVVADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEIS .:::: ::: . .: : .: .::: .:.::.:: :: ::::: :::. .::: . . gi|512 MGSGDRLETLSTASVEASHVSPLSSVGTDLSELEE-PQEFNTLFPSRPVFSFSSRPVGLW 220 230 240 250 260 270 440 450 460 470 480 490 KIAA15 ETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHGRLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVI ..:. .: :::.:... ::: :.:::::.:.::: : : .::. : ::. . ::: gi|512 KASMDVSPEVDVSGIAITQVYPSHGRLSTPSSLDSTFG-FSVTSDLVMSSSMIHLLSSVI 280 290 300 310 320 330 500 510 520 530 540 550 KIAA15 TSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDPSVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALD : .:::::. ::.:.::. . ::..: :::::..:: :: .: : . :. :: gi|512 PSTHFDSSFSLTANQNSPSFPAGKPSLLTSPSLVPSAQSSAFSHGAPTSSLELQSGSRLD 340 350 360 370 380 390 560 570 580 590 600 610 KIAA15 FASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPASLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSS :.:.:.:::::..: : :. : ::: :: : : ::.:: ..:::.: .: .::: 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