# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh03408.fasta.huge -Q ../query/KIAA1542.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. 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KIAA04 LLQHPGPPQPFGLPPQASQGQAPLGTSPAAAYPHTSLQLPASQSALQSQQPPREQPLPPA 850 860 870 880 890 900 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA15 TQE-PHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQEAARPEEVVSQTPLLRSRAL ::. : .. . : :: ... : :: : . .. : . KIAA04 PLAMPHIKPPPTTPIPQLP-----APQAHKHPPHLSG-----PSPFSMNANLPPPPALKP 910 920 930 940 950 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA15 VKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPL-HRPQKPREGAWDMEDVAP-------TGVRQAFS .. .. . : : . :: : .: : . ... : ::..:. KIAA04 LSSLSTHHPPSAHPPPLQLMPQSQPLPSSPAQP-PGLTQSQNLPPPPASHPPTGLHQVAP 960 970 980 990 1000 1010 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA15 ELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQFILQGSLPLVG . :: .: . : : : : . ::: :. :::. .. .. .: :: KIAA04 QPPFAQHPFVPGGPPPITPPTCPSTSTPPAGPGTSAQPPCSGAAASGGSIAGGSSCPL-- 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA15 CGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAA-SNSEEKT--PAPRLAAEKTKKEEYMKKLHMQ- :. :: : :: : : : : : .: :..... ... . . . KIAA04 ----PTVQIKEEALDDAEEPESPPPPPRSPSPEPTVVDTPSHASQSARFYKHLDRGYNSC 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA15 -ERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLVKAYVDK . . . :: . . .::: . :. : :.: :: . . : . : .. KIAA04 ARTDLYFMPLAGSKLAKKREEAIEKAK---REAEQKAREEREREKEKEK---------ER 1140 1150 1160 1170 1640 1650 KIAA15 YRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG :. .:... : . . ... :: KIAA04 EREREREREAERAAKASSSAHEGRLSDPQLSGPGHMRPSFEPPPTTIAAVPPYIGPDTPA 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1654 residues in 1 query sequences 1985851 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:07:23 2008 done: Thu Dec 18 15:07:24 2008 Total Scan time: 0.920 Total Display time: 0.330 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]