# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj02581s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1537.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1537, 619 aa vs ./tmplib.25089 library 1986886 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1455+/-0.0105; mu= -11.2560+/- 0.703 mean_var=523.8785+/-129.954, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.056035 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0871 ( 471 res) hk06991 ( 471) 1294 119.5 6.5e-28 KIAA1749 ( 1047 res) pj02119y1 (1047) 271 37.3 0.0081 KIAA0371 ( 1203 res) hh00252 (1203) 271 37.3 0.0087 >>KIAA0871 ( 471 res) hk06991 (471 aa) initn: 1374 init1: 1246 opt: 1294 Z-score: 593.0 bits: 119.5 E(): 6.5e-28 Smith-Waterman score: 1610; 62.871% identity (86.139% similar) in 404 aa overlap (14-414:58-447) 10 20 30 40 KIAA15 GLEVPRRPGARTGPATKDPT---AVERANLLNMAKLSIKGLIE :. .::. : :: ::.:::::::::::: KIAA08 IYLCKFRVSMDGEWLCLRELDDISLTPDPEPTHEDPNYLMANERMNLMNMAKLSIKGLIE 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 KIAA15 SALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEE :::..:::::::: ::::::::::::::::::..:.::. ::..:::::::::: ::: : KIAA08 SALNLGRTLDSDYAPLQQFFVVMEHCLKHGLKAKKTFLGQNKSFWGPLELVEKLVPEAAE 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 KIAA15 IGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEG : :::.::::::::.::.::::::::::::...:.. :: ...::::::: .:::::::: KIAA08 ITASVKDLPGLKTPVGRGRAWLRLALMQKKLSEYMKALINKKELLSEFYEPNALMMEEEG 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 KIAA15 AVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKN :.:.::::::::::::.:.:::::::::::::::::::. .. . : . ::.::::::: KIAA08 AIIAGLLVGLNVIDANFCMKGEDLDSQVGVIDFSMYLKDGNSSKGTEGDGQITAILDQKN 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 KIAA15 YVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILM :::::::.::.::..:...::.:::::::: ::::.:.: :: :::: .... :.. :: KIAA08 YVEELNRHLNATVNNLQAKVDALEKSNTKLTEELAVANNRIITLQEEMERVKEESSYIL- 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 KIAA15 KTQQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKH :.. . :..: . . .:::..:..:.::: :::.:: .:.::.. 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