# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04292.fasta.nr -Q ../query/KIAA1505.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1505, 693 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7813995 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1143+/-0.0002; mu= 7.5535+/- 0.011 mean_var=124.3111+/-23.896, 0's: 28 Z-trim: 100 B-trim: 83 in 1/65 Lambda= 0.115032 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|148671260|gb|EDL03207.1| mCG120103, isoform CRA ( 945) 3454 585.2 3.6e-164 gi|149046604|gb|EDL99429.1| hypothetical protein L ( 942) 3436 582.2 2.9e-163 gi|23271918|gb|AAH36053.1| Coiled-coil domain cont ( 955) 3420 579.5 1.8e-162 gi|158258419|dbj|BAF85180.1| unnamed protein produ ( 955) 3409 577.7 6.5e-162 gi|114614193|ref|XP_519167.2| PREDICTED: hypotheti ( 955) 3388 574.2 7.2e-161 gi|149704548|ref|XP_001488601.1| PREDICTED: coiled ( 956) 3090 524.8 5.6e-146 gi|194666113|ref|XP_001789375.1| PREDICTED: simila ( 956) 3088 524.4 7e-146 gi|73981971|ref|XP_852499.1| PREDICTED: similar to ( 956) 3071 521.6 5e-145 gi|109067706|ref|XP_001083560.1| PREDICTED: simila ( 850) 2916 495.8 2.5e-137 gi|81890512|sp|Q66H60.1|CC146_RAT RecName: Full=Co ( 974) 2837 482.8 2.5e-133 gi|149639263|ref|XP_001507522.1| PREDICTED: hypoth ( 927) 2570 438.4 5.2e-120 gi|9929955|dbj|BAB12134.1| hypothetical protein [M ( 385) 2408 411.2 3.5e-112 gi|20809550|gb|AAH29458.1| CCDC146 protein [Homo s ( 298) 1912 328.8 1.7e-87 gi|33187709|gb|AAP97709.1|AF461817_1 unknown [Homo ( 292) 1888 324.8 2.7e-86 gi|118082056|ref|XP_415968.2| PREDICTED: hypotheti ( 920) 1820 314.0 1.5e-82 gi|156228874|gb|EDO49671.1| predicted protein [Nem ( 948) 1719 297.2 1.7e-77 gi|198423466|ref|XP_002121618.1| PREDICTED: simila ( 955) 1704 294.7 9.7e-77 gi|221118597|ref|XP_002157591.1| PREDICTED: simila ( 831) 1598 277.1 1.7e-71 gi|210087571|gb|EEA35941.1| hypothetical protein B ( 384) 1260 220.7 7.8e-55 gi|55251195|emb|CAH68956.1| novel protein [Danio r ( 860) 1198 210.7 1.7e-51 gi|20219008|gb|AAM15771.1|AF394181_1 coiled-coil f ( 920) 1099 194.3 1.6e-46 gi|115638621|ref|XP_790755.2| PREDICTED: hypotheti ( 317) 1075 189.9 1.2e-45 gi|190584875|gb|EDV24944.1| hypothetical protein T ( 332) 1006 178.5 3.4e-42 gi|124420331|emb|CAK85235.1| unnamed protein produ ( 927) 993 176.7 3.2e-41 gi|124409957|emb|CAK75207.1| unnamed protein produ ( 923) 976 173.9 2.2e-40 gi|89304001|gb|EAS01989.1| hypothetical protein TT ( 914) 961 171.4 1.2e-39 gi|16551973|dbj|BAB71211.1| unnamed protein produc ( 450) 877 157.2 1.2e-35 gi|15208049|dbj|BAB63049.1| hypothetical protein [ ( 543) 864 155.1 6e-35 gi|210101383|gb|EEA49449.1| hypothetical protein B ( 712) 859 154.4 1.3e-34 gi|115634037|ref|XP_794541.2| PREDICTED: hypotheti ( 712) 854 153.6 2.3e-34 gi|121889118|gb|EAX94557.1| hypothetical protein T ( 921) 669 123.0 4.8e-25 gi|210101382|gb|EEA49448.1| hypothetical protein B ( 194) 645 118.3 2.6e-24 gi|89305175|gb|EAS03163.1| hypothetical protein TT ( 932) 651 120.0 3.9e-24 gi|47222064|emb|CAG12090.1| unnamed protein produc ( 196) 611 112.7 1.3e-22 gi|158283342|gb|EDP09093.1| flagellar associated p ( 868) 601 111.7 1.2e-21 gi|115312974|gb|AAI23996.1| LOC779580 protein [Xen ( 863) 589 109.7 4.6e-21 gi|183985634|gb|AAI66135.1| LOC779580 protein [Xen ( 871) 589 109.7 4.6e-21 gi|121897750|gb|EAY02861.1| hypothetical protein T ( 921) 587 109.4 6e-21 gi|198420385|ref|XP_002129786.1| PREDICTED: simila ( 872) 564 105.5 8.2e-20 gi|115681681|ref|XP_797536.2| PREDICTED: hypotheti ( 678) 562 105.1 8.6e-20 gi|146145878|gb|EAR92616.2| hypothetical protein T (1259) 564 105.7 1.1e-19 gi|126273437|ref|XP_001378361.1| PREDICTED: hypoth (1031) 555 104.1 2.6e-19 gi|47222065|emb|CAG12091.1| unnamed protein produc ( 578) 546 102.3 4.9e-19 gi|158283106|gb|EDP08857.1| flagellar associated p ( 863) 547 102.7 5.7e-19 gi|149634578|ref|XP_001512469.1| PREDICTED: hypoth ( 875) 545 102.4 7.3e-19 gi|163771235|gb|EDQ84904.1| predicted protein [Mon (5349) 556 105.0 7.3e-19 gi|121895371|gb|EAY00557.1| hypothetical protein T ( 919) 540 101.6 1.3e-18 gi|187955356|gb|AAI47531.1| Coiled-coil domain con ( 873) 530 99.9 4.1e-18 gi|124409813|emb|CAK75063.1| unnamed protein produ ( 863) 529 99.7 4.5e-18 gi|124429812|emb|CAK94602.1| unnamed protein produ ( 873) 522 98.5 1e-17 >>gi|148671260|gb|EDL03207.1| mCG120103, isoform CRA_a [ (945 aa) initn: 3454 init1: 3454 opt: 3454 Z-score: 3103.6 bits: 585.2 E(): 3.6e-164 Smith-Waterman score: 3454; 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78.657% identity (95.821% similar) in 670 aa overlap (24-693:273-942) 10 20 30 40 50 KIAA15 SQHGLKIRQVCVCVCVCVCIPYREMEKKKIVLEQEVKTLNDSLKKVENKVSAI : :::..::: :.: :.:::::.::::::. gi|149 QVGLKDDVVHHQSVPVQITKEIEKLTRRKIETEKKNVVLEFELKELSDSLKKLENKVSAL 250 260 270 280 290 300 60 70 80 90 100 110 KIAA15 VDEKENVIKEVEGKRALLEIKEREHNQLVKLLELARENEATSLTERGILDLNLRNSLIDK ..:....::::::::.:::.::::..::.:::::..::::.::.::::::.:::: :.:: gi|149 AEERDDTIKEVEGKRTLLEVKEREYGQLLKLLELTKENEASSLAERGILDINLRNCLMDK 310 320 330 340 350 360 120 130 140 150 160 170 KIAA15 QSYHDELSRKQREKERDFRNLRKMELLLKVSWDALRQTQALHQRLLLEKIISEMESKLVE :.:::::::::::::::::::.: ::::::: ::: :.:::.::::::. .:: :.:::: gi|149 QNYHDELSRKQREKERDFRNLKKTELLLKVSLDALSQAQALNQRLLLERSLSEAEAKLVE 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 230 KIAA15 QQLAEENKLLKEQENMKELVVNLLRMTQIKIDEKEQKSKDFLKAQQKYTNIVKEMKAKDL ::.:::::::::::.:.:.. :: ::::::..:::::.:::::.:..: .:.::.:.: : gi|149 QQIAEENKLLKEQETMREVLFNLGRMTQIKMEEKEQKAKDFLKSQRRYCDIIKEIKSKKL 430 440 450 460 470 480 240 250 260 270 280 290 KIAA15 EIRIHKKKKCEIYRRLREFAKLYDTIRNERNKFVNLLHKAHQKVNEIKERHKMSLNELEI :::...:.: ::.:::.::: :::.:::::::::::::::.::::::::: ::::::::: gi|149 EIRLYRKRKREIHRRLKEFAGLYDAIRNERNKFVNLLHKAYQKVNEIKERLKMSLNELEI 490 500 510 520 530 540 300 310 320 330 340 350 KIAA15 LRNSAVSQERKLQNSMLKHANNVTIRESMQNDVRKIVSKLQEMKEKKEAQLNNIDRLANT ::.:::::::::::.::::.::::::::::::: ::..:::::::::::::...::::. gi|149 LRSSAVSQERKLQNAMLKHSNNVTIRESMQNDVCKITAKLQEMKEKKEAQLTSMDRLASM 550 560 570 580 590 600 360 370 380 390 400 410 KIAA15 ITMIEEEMVQLRKRYEKAVQHRNESGVQLIEREEEICIFYEKINIQEKMKLNGEIEIHLL ::.::::::::::.::::::.::::::::::::::.::::::.:::.:.::. .::::.: gi|149 ITVIEEEMVQLRKKYEKAVQRRNESGVQLIEREEEVCIFYEKMNIQDKVKLHQDIEIHIL 610 620 630 640 650 660 420 430 440 450 460 470 KIAA15 EEKIQFLKMKIAEKQRQICVTQKLLPAKRSLDADLAVLQIQFSQCTDRIKDLEKQFVKPD ::::.:::.:.:::::::::::::.: :.::::.:::.:::::::.:::: ::: ::.:: gi|149 EEKIRFLKLKVAEKQRQICVTQKLVPIKKSLDANLAVVQIQFSQCADRIKALEKCFVNPD 670 680 690 700 710 720 480 490 500 510 520 530 KIAA15 GENRARFLPGKDLTEKEMIQKLDKLELQLAKKEEKLLEKDFIYEQVSRLTDRLCSKTQGC ..:.::.:::::::.:::.::: :::::::::::::::::::::::.::.:: .:::.: gi|149 CQGRVRFIPGKDLTEEEMIKKLDMLELQLAKKEEKLLEKDFIYEQVSQLTNRLKTKTQAC 730 740 750 760 770 780 540 550 560 570 580 590 KIAA15 KQDTLLLAKKMNGYQRRIKNATEKMMALVAELSMKQALTIELQKEVREKEDFIFTCNSRI :.::::::::::.::..::..:..::::::::::::::::::::::::::.:::.:.::: gi|149 KMDTLLLAKKMNSYQKKIKDVTQEMMALVAELSMKQALTIELQKEVREKEEFIFSCSSRI 790 800 810 820 830 840 600 610 620 630 640 650 KIAA15 EKGLPLNKEIEKEWLKVLRDEEMHALAIAEKSQEFLEADNRQLPNGVYTTAEQRPNAYIP :::::::.::::.::::::::::.:.: :::..:....: :::::::::::::::::::: gi|149 EKGLPLNREIEKDWLKVLRDEEMYAFATAEKTREYIDTDYRQLPNGVYTTAEQRPNAYIP 850 860 870 880 890 900 660 670 680 690 KIAA15 EADATLPLPKPYGALAPFKPSEPGANMRHIRKPVIKPVEI :.:::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.:: gi|149 ETDATLPLPKPYGALAPFKPSEPGANRRHIRKPIIKPIEI 910 920 930 940 >>gi|23271918|gb|AAH36053.1| Coiled-coil domain containi (955 aa) initn: 3386 init1: 3386 opt: 3420 Z-score: 3073.0 bits: 579.5 E(): 1.8e-162 Smith-Waterman score: 4140; 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