# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02042.fasta.huge -Q ../query/KIAA1502.ptfa ./tmplib.25089 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1502, 560 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1986945 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.7535+/-0.0047; mu= 20.4848+/- 0.321
 mean_var=72.3513+/-16.525, 0's: 0 Z-trim: 1  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.150783

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA0584  ( 738 res)   hj00933                     ( 738) 1938 431.2 1.3e-121


>>KIAA0584  ( 738 res)   hj00933                          (738 aa)
 initn: 1927 init1: 1543 opt: 1938  Z-score: 2275.2  bits: 431.2 E(): 1.3e-121
Smith-Waterman score: 1938;  54.361% identity (80.325% similar) in 493 aa overlap (67-558:202-694)

         40        50        60        70        80        90      
KIAA15 KVLVLWGQGCLGVQSCGCAPSAFFLPVPRCATDHNVDNTTEMLQEWLAAVGDDYAAVVWR
                                     :::::::::::...:::  :   :  : ::
KIAA05 LARNAAHTLPHFLGCLERLDYPKSRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVEWR
             180       190       200       210       220       230 

        100       110       120       130       140       150      
KIAA15 PEGEPRFYPDEEGPKHWTKERHQFLMELKQEALTFARNWGADYILFADTDNILTNNQTLR
       :  ::. :::: :::::   :   .:.:.: ::  ::.  .::::: :.::.::: ::: 
KIAA05 PMDEPESYPDEIGPKHWPTSRFAHVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTNPQTLN
             240       250       260       270       280       290 

        160       170       180       190       200       210      
KIAA15 LLMGQGLPVVAPMLDSQTYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVPMVHSTF
       ::....  .:::::.:.  ::::::::::.:.:.:: .:   .. .: ::: ::::::::
KIAA05 LLIAENKTIVAPMLESRGLYSNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTF
             300       310       320       330       340       350 

        220       230       240       250       260       270      
KIAA15 LASLRAEGADQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYGYMNVPVKSH
       : .:: :..:.:.::::: .::: ::::::::.. . ::.....::...:::. .:.: :
KIAA05 LIDLRKEASDKLTFYPPHQDYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPH
             360       370       380       390       400       410 

        280       290       300       310       320       330      
KIAA15 QGLEDERVNFIHLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLARRPDRRERM
       : :...  :.::. .::..: : :. : .:.   : :.:.::::.:.:.: :: :::.::
KIAA05 QTLQEDIENLIHVQIEAMIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLKRRKDRRDRM
             420       430       440       450       460       470 

        340       350       360       370       380       390      
KIAA15 LASLWEMEISGRVVDAVDGWMLNSSAIRNLGVDLLPGYQDPYSGRTLTKGEVGCFLSHYS
       : .:.:.::  ..:.::::  ::.: .. :....::::.::::.: ::.::.::::::::
KIAA05 LRTLYEQEIEVKIVEAVDGKALNTSQLKALNIEMLPGYRDPYSSRPLTRGEIGCFLSHYS
             480       490       500       510       520       530 

        400       410       420       430       440       450      
KIAA15 IWEEVVARGLARVLVFEDDVRFESNFRGRLERLMEDVEAEKLSWDLIYLGRKQVN-PEKE
       .:.::. : : ..::.::::::: .:. .: .::....  .:.:.:::.:::...  : :
KIAA05 VWKEVIDRELEKTLVIEDDVRFEHQFKKKLMKLMDNIDQAQLDWELIYIGRKRMQVKEPE
             540       550       560       570       580       590 

         460       470       480       490       500       510     
KIAA15 TAVEGLPGLVVAGYSYWTLAYALRLAGARKLLASQPLRRMLPVDEFLPIMFDQHPNEQYK
        :: .. .:: : ::::::.:.. : ::.::....:. .:::::::::.:...::  .::
KIAA05 KAVPNVANLVEADYSYWTLGYVISLEGAQKLVGANPFGKMLPVDEFLPVMYNKHPVAEYK
             600       610       620       630       640       650 

         520       530       540       550       560               
KIAA15 AHFWPRDLVAFSAQPLLAAPTHYAGDAEWLSDTETSSPWDDDSGR               
        ..  ::: ::::.:::  ::::.:.  .:::::::. ::...                 
KIAA05 EYYESRDLKAFSAEPLLIYPTHYTGQPGYLSDTETSTIWDNETVATDWDRTHAWKSRKQS
             660       670       680       690       700       710 

KIAA05 RIYSNAKNTEALPPPTSLDTVPSRDEL
             720       730        




560 residues in 1 query   sequences
1986945 residues in 2037 library sequences
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]