# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh12863.fasta.huge -Q ../query/KIAA1501.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1501, 735 aa vs ./tmplib.25089 library 1986770 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6390+/-0.00708; mu= 9.8796+/- 0.480 mean_var=196.0200+/-46.489, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.091606 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944) 1339 190.3 1.5e-48 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 406 66.6 1.4e-11 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 408 67.1 1.4e-11 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 393 64.9 4.5e-11 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 365 61.2 6e-10 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 360 60.5 8.7e-10 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 361 60.9 1e-09 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 354 59.6 1.4e-09 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 335 57.4 1e-08 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 325 55.6 1.6e-08 KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 318 55.3 6e-08 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 305 53.1 1.2e-07 KIAA0053 ( 666 res) ha01417 ( 666) 304 52.9 1.2e-07 KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 264 48.1 8e-06 KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086) 239 44.6 6.2e-05 KIAA1723 ( 1554 res) pf00881 (1554) 241 45.1 6.4e-05 KIAA0223 ( 1165 res) ha02995 (1165) 225 42.8 0.00023 KIAA0189 ( 1132 res) ha02928 (1132) 212 41.0 0.00075 KIAA1314 ( 681 res) fh12718 ( 681) 206 40.0 0.00095 KIAA0302 ( 2414 res) hf00409s2 (2414) 195 39.2 0.0056 KIAA0942 ( 537 res) hh04979s1 ( 537) 179 36.3 0.0098 >>KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944 aa) initn: 1878 init1: 1050 opt: 1339 Z-score: 963.4 bits: 190.3 E(): 1.5e-48 Smith-Waterman score: 1918; 48.605% identity (71.512% similar) in 681 aa overlap (75-726:716-1367) 50 60 70 80 90 100 KIAA15 SPASFPPEASEPPRVVRPEPSTRALEPPAEDRGDEVVLRQKPPTGRKVQLTPARQMN--L : . :.::.:::.::.. : :... : KIAA14 AGTSDLELPVSQRNQDLSLQEAETEQSDTLDNKEAVILREKPPSGRQTP-QPLRHQSYIL 690 700 710 720 730 740 110 120 130 140 150 KIAA15 GFGDESPEPEAS------GRGE----RLG-RKVAPLATTEDSLASIPFIDEPTSPSIDLQ . .:. ... .: : :. ::.. . :::::::::::::::::: . KIAA14 AVNDQETGSDTTCWLPNDARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHD 750 760 770 780 790 800 160 170 180 190 200 210 KIAA15 AKHVPASAVVSSAMNSAPVLGTSPSSPTFTFTL-GRHYSQDCSSIKAGRRSSYLLAITTE :.:::::.:.. ...: ..: : : . : :. :.: :. .. . :: KIAA14 IAHIPASAVISASTSQVPSIATVPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNS-KTE 810 820 830 840 850 860 220 230 240 250 260 270 KIAA15 RSKSCDDGLNTFRDEGRVLRRLPNRIPSLRMLRSFFTDGSLDSWGTSEDADAPSKRHSTS :::: :.::. .:..... . .. ::. .. :: .:::. :.. :.: KIAA14 RSKSYDEGLDDYREDAKLSFK---HVSSLKGIKI------ADSQKSSEDSG--SRKDSSS 870 880 890 900 910 280 290 300 310 320 330 KIAA15 DLSDATFSDIRREGWLYYKQILTKKGKKAGSGLRQWKRVYAALRARSLSLSKERREPGPA .. ::: .::::... ..: :::..:...: ::..:..::..:: : :..:: KIAA14 EV----FSDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTTP 920 930 940 950 960 340 350 360 370 380 390 KIAA15 AAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLVDISYSETKRRHVFRLTTADFCEYLFQAEDRDDMLGW . .: :. ...::.:::::::::..::::::.: :: :::::::::::.: KIAA14 S----------EEEQPISVNACLIDISYSETKRKNVFRLTTSD-CECLFQAEDRDDMLAW 970 980 990 1000 1010 400 410 420 430 440 KIAA15 IRAIRENSRAEGEDPGCANQALISKKLNDYRKVSHSSGPKADSSPKGS----RGLGGLKS :..:.:.: . :: : .:. :::.....: .. :.. . ..:. : . : : :: KIAA14 IKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNNL-MSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 450 460 470 480 490 KIAA15 EFLKQSAARGLRTQDLPAGSKDD-SAAAPKTPW--GI-NIIKKNKKAAPRA---FGVRLE : :: . .. :::: : : : :: .:..:. . : : :::::. 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KIAA14 DKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHH 1200 1210 1220 1230 1240 1250 620 630 640 650 660 670 KIAA15 YETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVET ::::::: .::::.:..::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.:::::: KIAA14 YETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVET 1260 1270 1280 1290 1300 1310 680 690 700 710 720 730 KIAA15 LIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDK---EPQAVPNIEYLLPNIGRT-VPPGDPGSADLLEI :::: ::::..: . : : .. . : ::::..:: ::::: : ::: KIAA14 LIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDS 1320 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA14 TKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFFKKENVEQC 1380 1390 1400 1410 1420 1430 >>KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051 aa) initn: 366 init1: 227 opt: 406 Z-score: 299.9 bits: 66.6 E(): 1.4e-11 Smith-Waterman score: 406; 33.019% identity (66.038% similar) in 212 aa overlap (495-702:470-678) 470 480 490 500 510 520 KIAA15 GSKDDSAAAPKTPWGINIIKKNKKAAPRAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEAR : : . . .: .:::: .: :... 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KIAA17 DGFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMD 1080 1090 1100 1110 1120 1130 420 430 440 450 460 KIAA15 SKKLNDYRKVSHSSGPKADSSPKGSRG-LGGLKSEFLKQS-----AARGLRTQDLPAGSK ...:. :::: : : . : ... .. : : : . .. : : KIAA17 TSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYK 1140 1150 1160 1170 1180 1190 470 480 490 500 KIAA15 DDSAAAP----KTPWGINIIK------KNKKAAPRA-----------FGVRLEECQPATE :.:. : . : ::.. :. : :: ::: : .: KIAA17 GDNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTV--VTP 1200 1210 1220 1230 1240 1250 510 520 530 540 550 560 KIAA15 NQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQ-DERWQDL .. .:... : . .:: :: . ::::: ::.. . :::.:... : ::. :. . KIAA17 EKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQ---DHNLDLAEKDFTV 1260 1270 1280 1290 1300 1310 570 580 590 600 610 620 KIAA15 NVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKF :.... .:::: .::.:: . :..::..:.: ......:..... .: . .:..:. KIAA17 NTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKY 1320 1330 1340 1350 1360 1370 630 640 650 660 670 680 KIAA15 LVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVETLIQHSD ...::. .. ... : : .::.. : :::.: . ..: : .: :.: .::. KIAA17 VISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTM-DALTATRTYQTIIELFIQQCP 1380 1390 1400 1410 1420 1430 690 700 710 720 730 KIAA15 WFFSDE---EDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSADLLEI .:: .. : : : : . :.:: . .: . : :. : : KIAA17 FFFYNRPITEPPGAR-P---SSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLL 1440 1450 1460 1470 1480 KIAA17 PSQLQAEHTL 1490 >>KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061 aa) initn: 329 init1: 207 opt: 393 Z-score: 290.6 bits: 64.9 E(): 4.5e-11 Smith-Waterman score: 393; 29.730% identity (66.667% similar) in 222 aa overlap (495-712:466-684) 470 480 490 500 510 520 KIAA15 GSKDDSAAAPKTPWGINIIKKNKKAAPRAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEAR : : . . .: .::.: .: : .. KIAA04 SNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLY 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 KIAA15 GLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLF ::.. ::.::::... :........:: : ..:. .:.: ....:: .:: : .::: KIAA04 GLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGE-DPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLF 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 KIAA15 TDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEP ....:.: . ..:. ::.. ..... :: ....: . :. ....:..: :.: KIAA04 PKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDP 560 570 580 590 600 610 650 660 670 680 690 700 KIAA15 RNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVETLIQHSDWFF-SDEEDKG---ERTPV :::. :::::.. . . : :. . ....:.: : . .: : .: .: :. . KIAA04 YNLAICFGPTLMHIPDGQ--DPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMA 620 630 640 650 660 670 710 720 730 KIAA15 GDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSADLLEI : .: :. : KIAA04 GGEEYCDSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGAS 680 690 700 710 720 730 >>KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095 aa) initn: 337 init1: 200 opt: 365 Z-score: 270.5 bits: 61.2 E(): 6e-10 Smith-Waterman score: 365; 32.105% identity (66.316% similar) in 190 aa overlap (507-695:525-711) 480 490 500 510 520 530 KIAA15 PWGINIIKKNKKAAPRAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPG .: .::.: .: :.. .::. ::.:: : KIAA04 HDLLQKTLGESQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSG 500 510 520 530 540 550 540 550 560 570 580 590 KIAA15 NNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEAN ... :..... ..:: : :. .:.. :...:: .:: : .::: : ..:.. KIAA04 SQVEVNDIKNAFERGE-DPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACV 560 570 580 590 600 610 600 610 620 630 640 650 KIAA15 RIEDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLV ... .:: .::.. :: ...: . :. ... ::.: :.: :::. :::.:. KIAA04 TMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLM 620 630 640 650 660 670 660 670 680 690 700 710 KIAA15 RTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVETLI-QHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLL . : . :.:. . ....:.: :: . : : .: .: KIAA04 SVPEGH--DQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGET 680 690 700 710 720 730 720 730 KIAA15 PNIGRTVPPGDPGSADLLEI KIAA04 TPVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWE 740 750 760 770 780 790 >>KIAA0131 ( 942 res) ha01235 (942 aa) initn: 335 init1: 224 opt: 360 Z-score: 267.6 bits: 60.5 E(): 8.7e-10 Smith-Waterman score: 360; 29.555% identity (61.943% similar) in 247 aa overlap (449-688:450-691) 420 430 440 450 460 470 KIAA15 DYRKVSHSSGPKADSSPKGSRGLGGLKSEFLKQSAARGLRTQD-LPAGSKDDSAAAPKTP : . :. . :. : :.:... .. : KIAA01 RQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVS-WTQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 KIAA15 WGINIIKKNKKAAP------RAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGI . ..:... : : :: .:. .. .: :::.: .: :... ::. :: KIAA01 YTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSS-GQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGI 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 KIAA15 YRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYND .:: : . :: ... ..:: : .. .::. ....:: .::.: ::: : ... KIAA01 FRVSGAQLRVSEIRDAFERGE-DPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGE 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 KIAA15 FIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVF .. ....: . ::.. . .:. ::. .:..: :. .:..:..: :.: :::. : KIAA01 LLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCF 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 KIAA15 GPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNI ::::. . . : :. . ..:.::: . : : KIAA01 GPTLLPVPAGQ--DPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCL 660 670 680 690 700 710 720 730 KIAA15 EYLLPNIGRTVPPGDPGSADLLEI KIAA01 GDAQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHER 720 730 740 750 760 770 >>KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445 aa) initn: 278 init1: 278 opt: 361 Z-score: 266.3 bits: 60.9 E(): 1e-09 Smith-Waterman score: 361; 31.132% identity (66.038% similar) in 212 aa overlap (484-690:10-219) 460 470 480 490 500 510 KIAA15 ARGLRTQDLPAGSKDDSAAAPKTPWGINIIKKNKKAAPRAFGVRLEECQPATENQRVPLI : ..:.: ::: : : .. .: :: . KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESS-GQDVPYV 10 20 30 520 530 540 550 560 570 KIAA15 VAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLK . .: ...:..:. ::::. : .. .. :..... .. ::.. ..:: : KIAA12 LKSCAEFIETHGI-VDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCK 40 50 60 70 80 90 580 590 600 610 620 630 KIAA15 SFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTI .::.::.::.: . :. : :: . .. ....:..:: .:.::..:. :: : KIAA12 LYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHI 100 110 120 130 140 150 640 650 660 670 680 KIAA15 ADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDM---VTHMPDRYK--IVETLIQHSDWFF :. : :..:. ::::::..:.:.:..: . : .. . : . ..: ...: : .: KIAA12 ASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIF 160 170 180 190 200 210 690 700 710 720 730 KIAA15 SDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSADLLEI .. KIAA12 NNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEI 220 230 240 250 260 270 >>KIAA0672 ( 824 res) hk02382 (824 aa) initn: 262 init1: 210 opt: 354 Z-score: 263.9 bits: 59.6 E(): 1.4e-09 Smith-Waterman score: 354; 29.851% identity (67.662% similar) in 201 aa overlap (493-691:258-454) 470 480 490 500 510 520 KIAA15 PAGSKDDSAAAPKTPWGINIIKKNKKAAPRAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVE .:: ::: . . .... . . :: .. KIAA06 QAEYHRKSLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPSFGKPLEE-HLTISGREIAFPIEACVTMLL 230 240 250 260 270 280 530 540 550 560 570 580 KIAA15 ARGLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEP :.. :..:: . . ...:. :. :.. : : ..:.. :::..:.:::: KIAA06 ECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQ---EYSADPHAIAGALKSYLRELPEP 290 300 310 320 330 340 590 600 610 620 630 640 KIAA15 LFTDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKM :.: . :...:.:. ... .....: . . :: ......:. :. ...... ::: KIAA06 LMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKM 350 360 370 380 390 400 650 660 670 680 690 700 KIAA15 EPRNLALVFGPTLVRT-SEDNMTDMVTHMPDRY-KIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPV : :.:.:.::.:. .: :.:.:.: . . :.: .:::.:::: : KIAA06 TPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNY 410 420 430 440 450 460 710 720 730 KIAA15 GDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSADLLEI KIAA06 GSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGV 470 480 490 500 510 520 >>KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281 aa) initn: 320 init1: 225 opt: 335 Z-score: 248.3 bits: 57.4 E(): 1e-08 Smith-Waterman score: 345; 25.703% identity (51.004% similar) in 498 aa overlap (215-693:515-976) 190 200 210 220 230 240 KIAA15 GRHYSQDCSSIKAGRRSSYLLAITTERSKSCDDGLNTFRDEGRVLRRLPNRIPSLRMLRS : :.: : . .. : . . :. 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