# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj06928.fasta.huge -Q ../query/KIAA1484.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1484, 700 aa vs ./tmplib.24314 library 1986805 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0560+/-0.00748; mu= 7.5734+/- 0.506 mean_var=228.3309+/-56.963, 0's: 0 Z-trim: 28 B-trim: 135 in 1/39 Lambda= 0.084877 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 1401 184.8 2.8e-47 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 372 59.1 3.4e-09 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 265 45.6 1.8e-05 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 261 45.3 3.2e-05 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 250 44.0 8.7e-05 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 237 42.3 0.00023 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 232 41.4 0.00026 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 232 41.4 0.00027 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 232 41.8 0.00038 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 219 40.4 0.0014 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 209 39.2 0.0035 >>KIAA1246 ( 832 res) hh00149a (832 aa) initn: 1623 init1: 670 opt: 1401 Z-score: 940.8 bits: 184.8 E(): 2.8e-47 Smith-Waterman score: 2002; 47.797% identity (70.895% similar) in 749 aa overlap (1-700:102-832) 10 20 30 KIAA14 LTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTI : ::: . :.::::::.:: :::::::: KIAA12 NLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTI 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 90 KIAA14 GQVAAGAFADLRALRALHLDSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDAFL ... .: ::..::.:::::::: . : :::: ::.:::..:::. . . ::. :: KIAA12 SHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFL 140 150 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 KIAA14 STVEDLDLSYNNLEALPWEAVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNR :.::::::::::..:::..: .::::. :.:::::.::::::::..:.::.:::.:::: KIAA12 LTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNR 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 KIAA14 LHKLPPDGLFLRSQGTG----PKPPTPLTVSFGGNPLHCNCELLWLRRLTREDDLETCAT :.::::: .: :::... : : ::. ::::::::::::::::::: :.::::::.. 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KIAA12 SRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKSPPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSA 430 440 450 460 470 480 380 390 400 410 420 430 KIAA14 PGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMIPSTSQTFLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDDGATALPATR : ..:::.::: : :. :.:::::.....:.::.:..: .:::::::..:: ::.: :: KIAA12 PRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNNLVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATN 490 500 510 520 530 540 440 450 460 470 480 490 KIAA14 VVGCVQFTTAGDPAPCRPLRAHFLGGTMIIAIGGVIVASVLVFIVLLMIRYKVYGDGDSR .:::.:: : .: :. .....::::::..:::.:::..:::::.::.:::: KIAA12 IVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGGIIVATLLVFIVILMVRYKV-----CN 550 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 KIAA14 RVKGSRSLPRVSHVCSQTNGAGTGA-AQAPA-LPAQ------------DHYEAL-REVES . :. ::.: :::::: ..::: : : : .: : .: KIAA12 HEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPPKVVVRNELLDFTASLARASDS 610 620 630 640 650 660 550 560 570 580 590 KIAA14 QAAPAVAV-EAKAM-----EAETASAEPEVVLGRSLGGSATSLCLLPSEETSGEESRAAV ... ... :: .. . .. .:. : : .:. : :: : ... .::. . KIAA12 SSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAFA-SLDLKSQRKEELLDSRTPA 670 680 690 700 710 720 600 610 620 630 640 KIAA14 GPRRSRSGALEPPTSAPPTLALVPGGAAAR---PRP-----QQRYSFD-GDY------GA : : . ..: .. : :. : .: :: : : .. .::: ::. :. KIAA12 G-RGAGTSARGHHSDREPLLG--PPAARARSLLPLPLEGKAKRSHSFDMGDFAAAAAGGV 730 740 750 760 770 780 650 660 670 680 690 700 KIAA14 LFQSHSYPRRARRTKRHRSTPHLDGAGGGAAGEDGDLGLGSARACLAFTSTEWMLESTV . ..: ::.. .:: :. : :..:: .: ::. .: :.::..:::: KIAA12 VPGGYSPPRKVSNIWTKRS---LSVNGMLLPFEESDL-VG-ARG--TFGSSEWVMESTV 790 800 810 820 830 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 351 init1: 108 opt: 372 Z-score: 257.0 bits: 59.1 E(): 3.4e-09 Smith-Waterman score: 448; 31.788% identity (57.285% similar) in 302 aa overlap (47-340:84-370) 20 30 40 50 60 70 KIAA14 MTSLVHLTLSRNTIGQVAAGAFADLRALRALHLDSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNN : : ::. :.. .: : :: :.:.:: KIAA02 PSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNN 60 70 80 90 100 110 80 90 100 110 120 130 KIAA14 QIRRVESAAFDAFLSTVEDLDLSYNNLEALPWEAVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFV ::.:. :.::. : ... : : :..... .: ...:. : : : :. . .: KIAA02 QIKRIPSGAFED-LENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQ 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 KIAA14 QLHKLVRLDMTSNRLHKLPPDGLFLRSQGTGPKPPTPLTVSFGGNPLHCNCELLWLRRLT .: :: :: . .::. .: : :: . . . . .: :::.::.::: : KIAA02 HLPKLERLFLHNNRITHLVP--------GTFNHLESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLL 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 KIAA14 RE-------DDLETCATPEHLTDRYFWSIPEEEFLCEPPLITRQAGGRALVVEGQAVSLR . . : :... : .: ::. :: : :: . : :. :..: . KIAA02 KTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITSEPQD-ADVTSGNTVYFT 230 240 250 260 270 280 250 260 270 280 290 300 KIAA14 CRAVGDPEPVVHWVAPDGRL-LGNSSRTRVRGDGTLDVTITTLRDSGTFTCIASNAAGEA ::: :.:.: . :. ...: . ..:: . :::: . : :.: . :.:.:.::: KIAA02 CRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGE- 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 KIAA14 TAPVEVCVVPLPLMAPPPAAPPPLTEPGSSDIATPGRPGANDSAAERRLVAAELTSNSVL :.. : : .. : : : . .: .... KIAA02 ---VKTQEVTLRYFGSP-ARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSATGHPPPRISWTRGDRT 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 KIAA14 IRWPAQRPVPGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMIPSTSQTFLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDD KIAA02 PLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATAFIIVQALPQFTVTPQD 400 410 420 430 440 450 >>KIAA1469 ( 662 res) fj01881 (662 aa) initn: 241 init1: 101 opt: 265 Z-score: 190.0 bits: 45.6 E(): 1.8e-05 Smith-Waterman score: 276; 24.115% identity (48.451% similar) in 452 aa overlap (1-447:148-515) 10 20 KIAA14 LTDNFIAAVRRRD--FANMTSLVHLTLSRN : :: ..:: .. : . . : : :::: KIAA14 YVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRN 120 130 140 150 160 170 30 40 50 60 70 80 KIAA14 TIGQVAAGAFADLRALRALHLDSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDA .. . : :... :.::.::.. . . .:.:: .:..:.: .: . .. . . KIAA14 HLSTIPWGLP---RTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNN-HGLGDKV 180 190 200 210 220 230 90 100 110 120 130 140 KIAA14 FLSTVE--DLDLSYNNLEALPWEAVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDM :.. :. .:.: :.: : : . : .:: : :. : :... ..: :..: :::: KIAA14 FFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPG--TNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDM 240 250 260 270 280 290 150 160 170 180 190 200 KIAA14 TSNRLHKLPPDGLFLRSQGTGPKPPTPLTVSFGGNPLHCNCELLWLRRLTREDDLETCAT ..: : .:: .:.: .. : : . .:: .:.:.. :.: KIAA14 SNNNLSNLP-QGIFDDLDNI-----TQLILR--NNPWYCGCKMKWVRD------------ 300 310 320 330 210 220 230 240 250 260 KIAA14 PEHLTDRYFWSIPEEEFLCEPPLITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVGDPEPVVHWVAPD .. :.: . . :.: : :.: :: : . : KIAA14 -------WLQSLPVK-----------------VNVRG----LMCQA---PEKVRGMAIKD 340 350 360 270 280 290 300 310 320 KIAA14 GRLLGNSSRTRVRGDGTLDVTITTLRDSGTFTCIASNAAGEATAPVEVCVVPLPLMAPPP :.. . .::: . : ..: :. : :. : KIAA14 -----------------LNAELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPD 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 KIAA14 AAPPPLTEPGSSDIATPGRPGANDSAAERRLVAAELTSNSVLIRWPAQRPVPGIRMYQVQ : ::. : : : : : ... .::... : : :. ..:. .. KIAA14 IKNPKLTK----DHQTTGSP----SRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLK 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 440 KIAA14 Y-NSSVDDSLVYRMIPSTSQTFLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDDGATALPATRVVGCVQFT .: . :.. .. . . .::. : : .:.. . .. . : : :.. KIAA14 LGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPV--CIETE 460 470 480 490 500 510 450 460 470 480 490 500 KIAA14 TAGDPAPCRPLRAHFLGGTMIIAIGGVIVASVLVFIVLLMIRYKVYGDGDSRRVKGSRSL :: KIAA14 TAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFS 520 530 540 550 560 570 >>KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) (966 aa) initn: 243 init1: 214 opt: 261 Z-score: 185.6 bits: 45.3 E(): 3.2e-05 Smith-Waterman score: 292; 30.303% identity (58.874% similar) in 231 aa overlap (1-225:424-620) 10 20 30 KIAA14 LTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTI ::.:.::.::: :: . :.: : :. : : KIAA09 DLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRI 400 410 420 430 440 450 40 50 60 70 80 90 KIAA14 GQVAAGAFADLRALRALHLDSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDAFL ... ::.:: :: :.:..::. .. . . :: .:..:.: : ::...:..:: KIAA09 SMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDP-- 460 470 480 490 500 510 100 110 120 130 140 150 KIAA14 STVEDLDLSYNNLEALPWEAVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNR .: ::. : :..::.. . :.: : :.::.. ::. KIAA09 ---------------VP--------NLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGL-TLLRLNLRSNH 520 530 540 160 170 180 190 200 KIAA14 LHKLPPDGLFLRSQGTGPKPPTPLTVSFGGNPLHCNCEL----LWLRRLTRED--DLETC . .:: .:.. . .. . ... :: :.:.. ::...: : : KIAA09 FTSLPVSGVLDQLKSL-------IQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVIC 550 560 570 580 590 600 210 220 230 240 250 260 KIAA14 ATPEHLTDRYFWSIPEEEFLCEPPLITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVGDPEPVVHWVA .:..... . :: . :.:: KIAA09 KAPKKFAETDMRSI-KSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSAVTPAVRLNSTGAPAS 610 620 630 640 650 >>KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073 aa) initn: 303 init1: 115 opt: 250 Z-score: 177.8 bits: 44.0 E(): 8.7e-05 Smith-Waterman score: 296; 25.707% identity (50.129% similar) in 389 aa overlap (1-326:230-616) 10 20 30 KIAA14 LTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTI : : : :. : .. :: : ..:: : KIAA08 SSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGI 200 210 220 230 240 250 40 50 60 70 80 90 KIAA14 GQVAAGAFADLRALRALHLDSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDAFL ... ::: : .. :.:. : :..: : :: :..: ...: :.:. :.. : KIAA08 SKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWE-FC 260 270 280 290 300 310 100 110 120 130 140 150 KIAA14 STVEDLDLSYNNLEALPWEAVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNR . . .::::::.: : : . :. :.: : . :::.:.: : .: ::. .:. KIAA08 QRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNE 320 330 340 350 360 370 160 170 KIAA14 LHKLPPD------GLF----LRSQGTGPKPPTP-------------------LTVS---- . : :: : ::. : : .... KIAA08 ISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAF 380 390 400 410 420 430 180 190 200 210 220 KIAA14 ---------FGGNPLHCNCELLWLRRLTREDDLE-----TCATPEHLTDRYFWSIPEEEF .. . : :.:.: :: . ..... .:: :: :. . . .. ..: KIAA08 SQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDF 440 450 460 470 480 490 230 240 250 260 270 KIAA14 LCEP---PLITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVGDPE-PVVHWVAPDGRLLGN-SSRTRV .:. : : : ....:. :.: : ::.. . :. :...: . .... : KIAA08 VCDDFLKPQI-RTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFV 500 510 520 530 540 550 280 290 300 310 320 KIAA14 R-----GDGTLDVTITTL-----RDSGTFTCIASNAAGEA-TAPVEVCVVPLPLMAPPPA : :.. ..: : : : . ::..: : . ... : .: . : KIAA08 RYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPM 560 570 580 590 600 610 330 340 350 360 370 380 KIAA14 APPPLTEPGSSDIATPGRPGANDSAAERRLVAAELTSNSVLIRWPAQRPVPGIRMYQVQY KIAA08 DLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIANVKIED 620 630 640 650 660 670 >>KIAA0644 ( 887 res) hj03618 (887 aa) initn: 156 init1: 122 opt: 237 Z-score: 170.1 bits: 42.3 E(): 0.00023 Smith-Waterman score: 257; 24.000% identity (46.727% similar) in 550 aa overlap (4-448:217-764) 10 20 30 KIAA14 LTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTIGQV : :. . : .: .. :::.: :. :..: . KIAA06 ELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGAL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA14 AAGAFADLRALRALHLDSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIR-RVESAAFDAFLST ..:: : : :::.:::. . . . ::.:: : :. :... .. :: : : . KIAA06 PDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRS 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 KIAA14 VEDLDLSYNNLEALPWEAVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIA---------------EGTFVQ . .: :: :.:. : . .. :. :.: : . :.: ::. .. KIAA06 LSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLS 310 320 330 340 350 360 140 150 160 170 KIAA14 ---------LHKLVRLDMTSNRLHKLPPDG---------LFLRSQG----TGP---KPPT ::.: ::...:.: : : : ::... .: :. KIAA06 QLPTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPA 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 KIAA14 PLTVSFGGNPLHCNCELLWLRRLT----REDDLET----CATPEHLTDRYFWSIPEEEFL ... :: :.:.: :.: . : : : : : .:. . .... KIAA06 LYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQ 430 440 450 460 470 480 230 240 250 260 KIAA14 ---C-EP-PLITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVG-----DPEPVVHW-------VAPDG : .: : . : : . : .: :.: .. :: :: KIAA06 NGSCADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDG 490 500 510 520 530 540 270 280 290 300 310 KIAA14 ---RLLGNSSRTRV--RGDGTLDVTITTLRDSG----TFTCIASNAAGEATAPVEVCVVP .:.:: : :. :: : . . .. .: .. . :. : . . : KIAA06 AARELVGNRSALRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEP 550 560 570 580 590 600 320 330 340 350 360 KIAA14 LPLMAPPPAAPPPLTEP---------GS--------SDIATPGRPGANDSAAERRLVAAE : : : .:: : .: :. :: .. : ..: ... . KIAA06 TPT-ASPGSAPSPAGDPWQRATKHRLGTEHQERAAQSDGGAGLPPLVSDPCDFNKFILCN 610 620 630 640 650 660 370 380 390 400 KIAA14 LT-----SNSVLIRWPAQ-----RPVPGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMI--PSTSQTFLV :: ..:. .:: .. ::. : : ... .. .. .:.. : .:.. . 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KIAA18 GNNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLNNNKLEILREDTFLG-LESLEYLQADYNYISAIEAG 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 KIAA14 AVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNRLHKLPPDGLFLRSQGTGPK : ... .:..: :. ::. . ..: .. :..::. .:::. .: :.. . : KIAA18 AFSKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVF-RFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIGGI--- 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 KIAA14 PPTPLTVSFGGNPLHCNCELL----WLRRLTREDDLETCATPEHLTDRYFWSIPEEEFLC . ... :: .:.:.:: :: .: .: :: .: . .. ... :: KIAA18 ----MEIQLEENPWNCTCDLLPLKAWLDTITVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQD-LC 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 KIAA14 EPPLITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVGDPEPVVHWVAPDGRLLGNSSRTRVRGDGTLD KIAA18 PRKSASDSSQRGSHADTHVQRLSPTMNPALNPTRAPKASRPPKMRNRPTPRVTVSKDRQS 270 280 290 300 310 320 >>KIAA0848 ( 988 res) hk05607 (988 aa) initn: 346 init1: 182 opt: 232 Z-score: 166.3 bits: 41.8 E(): 0.00038 Smith-Waterman score: 255; 27.083% identity (57.917% similar) in 240 aa overlap (10-235:404-632) 10 20 30 KIAA14 LTDNFIAAVRRRDFANMTSLV-------HLTLSRNTIGQ ..: : :.. :. .: :: : : . 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