# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha06448.fasta.nr -Q ../query/KIAA1424.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1424, 1944 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7819445 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9577+/-0.000194; mu= 12.6063+/- 0.011 mean_var=102.5111+/-19.500, 0's: 36 Z-trim: 76 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.126674 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|74745129|sp|Q5T5U3.1|RHG21_HUMAN RecName: Full= (1957) 12749 2342.0 0 gi|203097003|ref|NP_065875.3| Rho GTPase activatin (1958) 12749 2342.0 0 gi|20514209|gb|AAM22955.1|AF480466_1 Rho-GTPase ac (1957) 12725 2337.7 0 gi|119606528|gb|EAW86122.1| Rho GTPase activating (1957) 12705 2334.0 0 gi|114629727|ref|XP_507699.2| PREDICTED: Rho GTPas (1957) 12679 2329.3 0 gi|109088434|ref|XP_001100413.1| PREDICTED: simila (1957) 12551 2305.9 0 gi|194227102|ref|XP_001496478.2| PREDICTED: Rho GT (1941) 11314 2079.8 0 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