# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj02381.fasta.huge -Q ../query/KIAA1362.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1362, 699 aa vs ./tmplib.24314 library 1986806 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1996+/-0.00671; mu= 10.6178+/- 0.453 mean_var=159.0627+/-39.484, 0's: 0 Z-trim: 28 B-trim: 77 in 1/39 Lambda= 0.101693 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055) 586 98.4 3.6e-21 KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609) 353 64.4 9.1e-11 KIAA0305 ( 1547 res) hg00042 (1547) 310 58.1 7e-09 KIAA0294 ( 1405 res) hf00223s1 (1405) 284 54.3 9.3e-08 KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621) 281 53.9 1.4e-07 KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284) 277 53.2 1.8e-07 KIAA0321 ( 1542 res) hg00426 (1542) 268 52.0 5e-07 KIAA1643 ( 993 res) hh10131(revised) ( 993) 264 51.1 5.7e-07 KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 ( 694) 258 50.1 8.4e-07 KIAA1537 ( 619 res) fj02581s1 ( 619) 245 48.1 2.9e-06 KIAA0371 ( 1203 res) hh00252 (1203) 243 48.2 5.5e-06 KIAA0993 ( 1556 res) bf03014 (1556) 237 47.4 1.2e-05 KIAA0424 ( 567 res) hh01267 ( 567) 230 45.8 1.3e-05 KIAA0647 ( 1195 res) hj03819s1 (1195) 220 44.8 5.6e-05 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 216 44.4 0.0001 KIAA1255 ( 1232 res) hh14633s1 (1232) 207 42.9 0.00022 KIAA1589 ( 816 res) fj08951 ( 816) 201 41.8 0.00031 KIAA0362 ( 1108 res) hh00083 (1108) 185 39.6 0.0019 KIAA0006 ( 773 res) ha01154 ( 773) 177 38.2 0.0034 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 182 39.6 0.0044 KIAA0521 ( 1050 res) hg01387 (1050) 174 38.0 0.0056 KIAA0915 ( 846 res) hk06275s1 ( 846) 172 37.6 0.006 >>KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055 aa) initn: 418 init1: 314 opt: 586 Z-score: 472.0 bits: 98.4 E(): 3.6e-21 Smith-Waterman score: 594; 28.157% identity (59.420% similar) in 483 aa overlap (126-578:455-928) 100 110 120 130 140 150 KIAA13 PFIMAIRKTQELEWQNSSSMEDADANVYEVEEPYEAPDGQ--LQLGPRHQHSSSGAS-QE . : : : :: :: . .: : . 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KIAA03 SKPQVD-------MRK---HVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSL 610 620 630 640 650 250 260 270 280 290 300 KIAA13 EDRILNQILYYLPQLYELNRDLLKELEERMLHWTEQQRIADIFVK---KGPYLKMYSTYI :.:..:: :.: : ....:..... : : ::... ..:. : ...::.:: KIAA03 VDEIFDQI----PELLEHHEQFLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYI 660 670 680 690 700 710 310 320 330 340 350 360 KIAA13 KEFDKNIALLDEQCKKNPGFAAVVREFEMSPCCANLALKHYLLKPVQRIPQYRLLLTDYL .: . . . :.: . : : . ::. ..:::::::.:.::. : : KIAA03 DNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKFL-EQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLL 720 730 740 750 760 770 370 380 390 400 410 KIAA13 KNLIEDAGDYRDTQDALAVVIEVANHANDTMKQGDNFQK----LMQIQYSLNGHHEIVQP :. :: :. .: . .::.. : ...... .. :..:. ..: ... : KIAA03 KHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAP 780 790 800 810 820 830 420 430 440 450 460 470 KIAA13 GRVFLKEGILMKLSRKV--MQPRMFFLFNDALLYTT-PVQSGMYKLNNMLSLAGMKVRKP : ::.. ..... . . . : .:::.: .. :: .:: . ..: :: KIAA03 LRRFLRQEMVIEV-KAIGGKKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSM-SLYTAASVID 840 850 860 870 880 480 490 500 510 520 KIAA13 TQEAYQNELKIESVERSFILSASSATERDEWLEAISRAIEEYA--------KKRITFCPS : :. :. . ..: .::.::.:.. .:::: :. . .. . : : KIAA03 TASKYKMLWKLPLEDADIIKGASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGF-PH 890 900 910 920 930 940 530 540 550 560 570 580 KIAA13 RSLDEADSENKEEVSPLGSKAPIWIPDTRATMCMICTSEFTLTWRRHHCRACGKIVCQAC .:::.: KIAA03 QSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLG 950 960 970 980 990 1000 >>KIAA0305 ( 1547 res) hg00042 (1547 aa) initn: 320 init1: 246 opt: 310 Z-score: 251.3 bits: 58.1 E(): 7e-09 Smith-Waterman score: 311; 30.597% identity (55.970% similar) in 268 aa overlap (451-682:624-879) 430 440 450 460 KIAA13 VFLKEGILMKLSRKVMQPRMFFLFNDALLYTTPVQSGM----YKLNNMLSLA-------- : :::.:. ...:.::.. KIAA03 IGESHGINIICETVDKQNTIENGLSLGEKSTIPVQQGLPTSKSEITNQLSVSDINSQSVG 600 610 620 630 640 650 470 480 490 500 510 520 KIAA13 GMKVRK----PTQEAYQNELKIESVERSFILSASSATERDEWLEAISRAIEEYAKKRITF : . .. :.. ...:. .: .. :.: . . :. ::. : ...: KIAA03 GARPKQLFSLPSRTRSSKDLNKPDVPDTIESEPSTA----DTVVPITCAIDSTADPQVSF 660 670 680 690 700 530 540 550 560 KIAA13 CPSRSLD-EADSEN-------KEEVSP---------LGSKAPIWIPDTRATMCMICTSEF : .: :..::. .:. : ::.: : :.::..: :: : .: KIAA03 N-SNYIDIESNSEGGSSFVTANEDSVPENTCKEGLVLGQKQPTWVPDSEAPNCMNCQVKF 710 720 730 740 750 760 570 580 590 600 610 620 KIAA13 TLTWRRHHCRACGKIVCQACSSNKYGLDYLKNQPARVCEHCFQELQKLDHQHSPRIGSP- :.: ::::::::::. : .: . : :.::... :::: :.. ..: : :. :: KIAA03 TFTKRRHHCRACGKVFCGVCCNRKCKLQYLEKE-ARVCVVCYETISK--AQAFERMMSPT 770 780 790 800 810 820 630 640 650 660 670 680 KIAA13 -GNHKSPSSALSSVLHSIPSGRKQKKIPA-ALKEVSANTEDSSMSGYLYRSKGNKKPWKH .: :: : .... :. . ..::. : ::: .. .. : :: .:. : KIAA03 GSNLKSNHSDECTTVQP-PQENQTSSIPSPATLPVSA-LKQPGVEGLC--SKEQKRVWFA 830 840 850 860 870 880 690 KIAA13 FWFVIKNKVLYTCCK KIAA03 DGILPNGEVADTTKLSSGSKRCSEDFSPLSPDVPMTVNTVDHSHSTTVEKPNNETGDITR 890 900 910 920 930 940 >>KIAA0294 ( 1405 res) hf00223s1 (1405 aa) initn: 200 init1: 125 opt: 284 Z-score: 231.1 bits: 54.3 E(): 9.3e-08 Smith-Waterman score: 292; 25.769% identity (58.462% similar) in 260 aa overlap (206-452:460-713) 180 190 200 210 220 230 KIAA13 DDVSSESSKGEPDPLEDKQDEDNGMKSKVHHIAKEIMSSEKVFVDVLKLLHIDFRDAVAH .: ...::: .::.:: . ... .. KIAA02 NLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLS- 430 440 450 460 470 480 240 250 260 270 280 290 KIAA13 ASRQLGKPVIEDRILNQILYYLPQLYELNRDLLKELEERMLHWTEQQRIADIFV---KKG .. :. .: :. ..: . .. . . . : :. .: . :.:.:: .:. KIAA02 ---EMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKS 490 500 510 520 530 540 300 310 320 330 340 350 KIAA13 PYLKMYSTYIKEFDKNIALLDEQCKKNPGFAAVVR-EFEMSPCCANLALKHYLLKPVQRI : :: :...:. .:.: . : .:.: .. : : :: .: ..::.::. KIAA02 MVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASP--DRTTLYSLMMKPIQRF 550 560 570 580 590 600 360 370 380 390 400 410 KIAA13 PQYRLLLTDYLKNLIEDAGDYRDTQDALAVVIEVANHANDTMKQGDNFQKLMQIQYSLNG ::. ::: :.::: . : : ::. . .:.. :. ...:. .. :: ..: KIAA02 PQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINE 610 620 630 640 650 660 420 430 440 450 460 KIAA13 HH--EIVQPG-RVFLKEGILMKL---SRKVM---QPRMFFLFNDALLYTTPVQSGMYKLN .. .... : : ... ... .: . . : :..::.:. .: KIAA02 RYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHDSR 670 680 690 700 710 720 470 480 490 500 510 520 KIAA13 NMLSLAGMKVRKPTQEAYQNELKIESVERSFILSASSATERDEWLEAISRAIEEYAKKRI KIAA02 VMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMGPG 730 740 750 760 770 780 >>KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621 aa) initn: 132 init1: 132 opt: 281 Z-score: 228.1 bits: 53.9 E(): 1.4e-07 Smith-Waterman score: 300; 25.429% identity (57.143% similar) in 350 aa overlap (207-516:15-355) 180 190 200 210 220 230 KIAA13 DVSSESSKGEPDPLEDKQDEDNGMKSKVHHIAKEIMSSEKVFVDVLKLLHIDFRDAV-AH . .::...:. .: .:..:. : . . KIAA14 AARESERQLRLRLCVLNEILGTERDYVGTLRFLQSAFLHRIRQN 10 20 30 40 240 250 260 270 280 290 KIAA13 ASRQLGKPVIEDRILNQILYY-LPQLYELNRDLLKELEERMLHWTEQQR--IADIFVKKG .. .. : . :. . ..:. . .. :...:.: :: :: :.. ....:.: KIAA14 VADSVEKGLTEENV--KVLFSNIEDILEVHKDFLAALE-YCLHPEPQSQHELGNVFLKFK 50 60 70 80 90 100 300 310 320 330 340 KIAA13 PYLKMYSTYIKEFDKNIALLDEQCKKNPGFAAVVREFEMSPC-------CANLALKHYLL . .: : .. .: . :: : .: : .:: : .: : ... :. ::: KIAA14 DKFCVYEEYCSNHEKALRLLVEL-NKIP----TVRAFLLS-CMLLGGRKTTDIPLEGYLL 110 120 130 140 150 350 360 370 380 390 400 KIAA13 KPVQRIPQYRLLLTDYLKNLIEDAGDYRDTQDALAVVIEVANHANDTMKQGDNFQKLMQI .:.::: .: ::: . : :. .:.:: .. : .. :.: .: .... : :. KIAA14 SPIQRICKYPLLLKELAKRTPGKHPDHPAVQSALQAMKTVCSNINETKRQMEKLEALEQL 160 170 180 190 200 210 410 420 430 440 450 KIAA13 QYSLNGHH--EIVQPGRVFLKEGILMKLSRKVMQPRMFFLFNDALLY------------- : ..: . .... .: .: :.:.: .: : ::::.. :.: KIAA14 QSHIEGWEGSNLTDICTQLLLQGTLLKISAGNIQERAFFLFDNLLVYCKRKSRVTGSKKS 220 230 240 250 260 270 460 470 480 490 KIAA13 ---TTPVQSGMYKLNNMLSLAGMKVRK---PTQEAYQNEL------KIESVERS--FILS : .....: . . .. :.:.. : . ..: ::... .. :. KIAA14 TKRTKSINGSLYIFRGRINTEVMEVENVEDGTADYHSNGYTVTNGWKIHNTAKNKWFVCM 280 290 300 310 320 330 500 510 520 530 540 550 KIAA13 ASSATERDEWLEAISRAIEEYAKKRITFCPSRSLDEADSENKEEVSPLGSKAPIWIPDTR :..: :...::.:: : :. KIAA14 AKTAEEKQKWLDAIIREREQRESLKLGMERDAYVMIAEKGEKLYHMMMNKKVNLIKDRRR 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284 aa) initn: 102 init1: 102 opt: 277 Z-score: 226.0 bits: 53.2 E(): 1.8e-07 Smith-Waterman score: 278; 22.289% identity (56.928% similar) in 332 aa overlap (167-489:280-595) 140 150 160 170 180 190 KIAA13 QLGPRHQHSSSGASQEEQNDLGLGDLPSDEEEIINSSDEDDVS----SESSKGEPDPLED ......:.:.:.. : :. : : KIAA16 QLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELG 250 260 270 280 290 300 200 210 220 230 240 250 KIAA13 KQDEDNGMKSKVH-HIAKEIMSSEKVFVDVLKLLHIDFRDAVAHASRQLGKPVIEDRILN . : . .. :. :: :..:: .:. :: . :.:. . .. .. : . KIAA16 PMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLM----EMEPKALSARKCQ 310 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 KIAA13 QILYYLPQLYELNRDLLKELEERMLHWTEQQRIADIFV---KKGPYLKMYSTYIKEFDKN ... . .. . . . : :. .: ..:.:.:: .:. : .:: :...: . KIAA16 VVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSA 370 380 390 400 410 420 310 320 330 340 350 360 KIAA13 IALLDEQCKKNPGFAAVVREFEMSPCCAN-LALKHYLLKPVQRIPQYRLLLTDYLKNLIE .... . : .:.: ... .. : . ..: ..::.::.::. ::: :.::: . KIAA16 MSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQV--CSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPR 430 440 450 460 470 480 370 380 390 400 410 420 KIAA13 DAGDYRDTQDALAVVIEVANHANDTMKQGDNFQKLMQIQYSLNGHHEIVQPGRVFLKEGI : . : ::. . .:.. :. . .:. ...:. :.. . . . .: : KIAA16 GHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNK----LLTSGQ 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 480 KIAA13 LMKLSRKVMQPRMFFLFNDALLYTTPVQSGMYKLNNMLSLAGMKVRKPTQEAYQNELKIE . : ... . ..: . .. ::.:: :... ::.. ....:.: KIAA16 RQLLLCETLTETV---YGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINF-KPAN--HRGQLEIS 540 550 560 570 580 590 490 500 510 520 530 540 KIAA13 SVERSFILSASSATERDEWLEAISRAIEEYAKKRITFCPSRSLDEADSENKEEVSPLGSK :. KIAA16 SLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKASASGQAQNKVYLG 600 610 620 630 640 650 >>KIAA0321 ( 1542 res) hg00426 (1542 aa) initn: 312 init1: 192 opt: 268 Z-score: 218.0 bits: 52.0 E(): 5e-07 Smith-Waterman score: 268; 36.036% identity (65.766% similar) in 111 aa overlap (537-644:797-906) 510 520 530 540 550 560 KIAA13 LEAISRAIEEYAKKRITFCPSRSLDEADSENKEEVSPLGSKA-PIWIPDTRATMCMICTS ..: : : : :.:: ..::.: KIAA03 SAEFSPAAPPGISSIHSPSLRERSFPPTQPSQEFVPPATPPARHQWVPDETESICMVCCR 770 780 790 800 810 820 570 580 590 600 610 620 KIAA13 E-FTLTWRRHHCRACGKIVCQACSSNKYGLDYLKNQPARVCEHCFQELQK-LDHQHSPRI : ::. :::::: ::..::..::..:. .. ...:::::..:.. .: . .. : . KIAA03 EHFTMFNRRHHCRRCGRLVCSSCSTKKMVVEGCRENPARVCDQCYSYCNKDVPEEPSEKP 830 840 850 860 870 880 630 640 650 660 670 680 KIAA13 GSPGNHKSPSSALSSVLHSIPSGRKQKKIPAALKEVSANTEDSSMSGYLYRSKGNKKPWK . . :: : : :.. .: KIAA03 EALDSSKSESPPYSFVVR-VPKADEVEWILDLKEEENELVRSEFYYEQAPSASLCIAILN 890 900 910 920 930 940 >>KIAA1643 ( 993 res) hh10131(revised) (993 aa) initn: 238 init1: 163 opt: 264 Z-score: 217.0 bits: 51.1 E(): 5.7e-07 Smith-Waterman score: 264; 28.205% identity (58.974% similar) in 156 aa overlap (457-609:828-979) 430 440 450 460 470 480 KIAA13 ILMKLSRKVMQPRMFFLFNDALLYTTPVQSGMYKLNNMLSLAGMKVRKPTQEAYQNELKI : . : . : . : : : ..:. KIAA16 SSDKMGPEAAPAATHAAPQATREKIRSRFHGSHDLIHRLFVCISGVADQLQTNYASDLR- 800 810 820 830 840 850 490 500 510 520 530 540 KIAA13 ESVERSF--ILSASSATERDEWLEAISRAIEEYAKKRITFCPSRSLDEADSENKEEVSPL :. ... ..... :. : :. ...... : . ..: ...:. .. : . . . KIAA16 -SILKTLFEVMATKPETDDKEKLRKVTQTLRSAALEDCALC-QETLSSSELAAKTRDGDF 860 870 880 890 900 910 550 560 570 580 590 600 KIAA13 GSKAPIWIPDTRATMCMICTSEFTLTWRRHHCRACGKIVCQACSSNKYGLD-YLKNQPAR : :.:: .: : . ::. :.::::.:::: :. :::.. : : . .:.: KIAA16 -EDPPEWVPDEACGFCTACKAPFTVIRRKHHCRSCGKIFCSRCSSHSAPLPRYGQVKPVR 920 930 940 950 960 970 610 620 630 640 650 660 KIAA13 VCEHCFQELQKLDHQHSPRIGSPGNHKSPSSALSSVLHSIPSGRKQKKIPAALKEVSANT :: ::. KIAA16 VCTHCYMFHVTPFYSDKAGL 980 990 >>KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 (694 aa) initn: 166 init1: 122 opt: 258 Z-score: 214.0 bits: 50.1 E(): 8.4e-07 Smith-Waterman score: 268; 22.193% identity (56.658% similar) in 383 aa overlap (158-516:263-631) 130 140 150 160 170 180 KIAA13 PYEAPDGQLQLGPRHQHSSSGASQEEQNDLGLGDLPSDEEEIINSSDE---DDVSSESSK : : .:.. .. ..:: ::. ... 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