# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh12718.fasta.huge -Q ../query/KIAA1314.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1314, 681 aa vs ./tmplib.24314 library 1986824 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0457+/-0.00585; mu= 9.3193+/- 0.397 mean_var=110.4106+/-26.821, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 122 in 1/39 Lambda= 0.122059 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1723 ( 1554 res) pf00881 (1554) 294 63.2 2.1e-10 KIAA0053 ( 666 res) ha01417 ( 666) 265 57.7 3.9e-09 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 257 56.6 1.9e-08 KIAA0189 ( 1132 res) ha02928 (1132) 251 55.5 3.2e-08 KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086) 243 54.0 8.2e-08 KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944) 235 52.8 3.3e-07 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 232 52.2 3.9e-07 KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 219 50.0 2.2e-06 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 209 47.8 3.2e-06 KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 206 47.4 5.6e-06 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 205 47.2 6.9e-06 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 204 47.0 7.3e-06 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 200 46.5 1.6e-05 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 189 44.5 5.8e-05 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 184 43.6 0.00011 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 183 43.5 0.00014 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 177 42.4 0.00023 KIAA1688 ( 1094 res) fh26207 (1094) 155 38.5 0.0038 >>KIAA1723 ( 1554 res) pf00881 (1554 aa) initn: 278 init1: 137 opt: 294 Z-score: 278.6 bits: 63.2 E(): 2.1e-10 Smith-Waterman score: 306; 25.163% identity (59.804% similar) in 306 aa overlap (217-503:967-1260) 190 200 210 220 230 240 KIAA13 QDKEGSFAVPRSDSVAILETIPVLPVHSNGSPEPGQPVQNAISDDDFLEKNIPPEAEELS :: :..: : .. :. ... : . . . 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KIAA00 PILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAG-ERPSFDRDTDVHT-VASL 200 210 220 230 240 250 420 430 440 450 460 470 KIAA13 LKAFFRELPTSLFPVEYIPAFI--SLMERGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMT :: ..:.:: . : .:. . . . ..:.: : : .. :: : . . . KIAA00 LKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQ-QELMKQLSILPRDNYSLLSYICR 260 270 280 290 300 310 480 490 500 510 520 530 KIAA13 FFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSKHSDYEELLLANTAAH-IIRLMLKYQKI :.... : . :.::. :..::.. ::. ::: : .. .. . .. .:.. ... 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KIAA17 DLAEKDFTVNTVAGAM-KSFFSELPDPLVPYNMQ---IDLVE-AHKINDREQKLHALKEV 1310 1320 1330 1340 1350 1360 470 480 490 500 510 KIAA13 L---PDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSKHSDYEELLLA : : :... . ... .::: :.. : :. :.: . :.:. : : .. : . KIAA17 LKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLM--RPDFSTMDALTAT 1370 1380 1390 1400 1410 520 530 540 550 560 570 KIAA13 NTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSVRKLLRRKTLERETAS : ::.:... KIAA17 RTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPP 1420 1430 1440 1450 1460 1470 >>KIAA0189 ( 1132 res) ha02928 (1132 aa) initn: 180 init1: 67 opt: 251 Z-score: 239.5 bits: 55.5 E(): 3.2e-08 Smith-Waterman score: 268; 26.147% identity (60.550% similar) in 218 aa overlap (306-511:638-844) 280 290 300 310 320 KIAA13 LTKFNVQKTRFGLTEAGDLSAEDMKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQ------------LKR ::..::::.. . . ..: KIAA01 FQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWVWSMPKFMRR 610 620 630 640 650 660 330 340 350 360 370 380 KIAA13 NKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSG ::: .:. .:::: :. .: .: .: .:. .. .. . :.. :::: :: KIAA01 NKTPDYRGQH--VFGVP--PLIHVQRTGQP---LPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSG 670 680 690 700 710 720 390 400 410 420 430 440 KIAA13 CTAKVKQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLME ..... :. .. . :. .. . ..: .:: .::.:: .: . .:..... KIAA01 VKSRIQNLRQMNET--SPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQ 730 740 750 760 770 450 460 470 480 490 500 KIAA13 RGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLF :. . . : . .. ::: ::.. :.:. :.. ::. .:.:. :... .::..: KIAA01 LLPKDQ-WLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSD-IASAEENQMTAGNLAVCLAPSIF 780 790 800 810 820 830 510 520 530 540 550 560 KIAA13 FSRSKHSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSV ...: KIAA01 HLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQL 840 850 860 870 880 890 >>KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086 aa) initn: 168 init1: 67 opt: 243 Z-score: 232.2 bits: 54.0 E(): 8.2e-08 Smith-Waterman score: 243; 26.154% identity (57.308% similar) in 260 aa overlap (298-549:66-315) 270 280 290 300 310 320 KIAA13 EIKKEDYVLTKFNVQKTRFGLTEAGDLSAEDMKKIRHLSLIELTAFFD--AFGI--QLKR :.. .: : .: ::. . :. : : KIAA00 RAFGNWKTWWRTRVRTCILPQRVIDVSGMWDQRLVRLALLQHLRAFYGIKVKGVRGQCDR 40 50 60 70 80 90 330 340 350 360 370 380 KIAA13 NKTEKVKGRDNG-IFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLS . : . . .: :::::...: . . : ..: : ..:. ...::.:: : KIAA00 RRHETAATEIGGKIFGVPFNAL-PHSAVPEYG-HIPSFLVDACTSLEDH-IHTEGLFRKS 100 110 120 130 140 150 390 400 410 420 430 440 KIAA13 GCTAKVKQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLM : . ..: ....: . .. : . : .:: :::::: ..:.. :... . KIAA00 GSVIRLKALKNKVD--HGEGCLSSAPPC--DIAGLLKQFFRELPEPILPADLHEALLKAQ 160 170 180 190 200 450 460 470 480 490 500 KIAA13 ERGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNL . : . : .: :. : : . . . ...:. .: :.:.:. :.....:::: KIAA00 QLGTEEKN--KATLLLSCLLADHTVHVLRYFFNFLRNVSLRSSENKMDSSNLAVIFAPNL 210 220 230 240 250 260 510 520 530 540 550 KIAA13 FFSRSKH---SDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQ . . : :. : : :: ... .. : . . .::.:.. .. : KIAA00 LQTSEGHEKMSSNTEKKLRLQAA-VVQTLIDYASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCATP 270 280 290 300 310 320 560 570 580 590 600 610 KIAA13 LPSVRKLLRRKTLERETASPKTSKVLQKSPSARRMSDVPEGVIRVHAPLLSKVSMAIQLN KIAA00 SLEGFEEGEYETPGEYKRKRRQSVGDFVSGALNKFKPNRTPSITPQEERIAQLSESPVIL 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944 aa) initn: 212 init1: 105 opt: 235 Z-score: 221.2 bits: 52.8 E(): 3.3e-07 Smith-Waterman score: 235; 21.508% identity (52.235% similar) in 358 aa overlap (318-668:1112-1456) 290 300 310 320 330 340 KIAA13 LTEAGDLSAEDMKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQLKRNKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDG :: :: . : .: ::: :: KIAA14 SPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGV----RLDD 1090 1100 1110 1120 1130 350 360 370 380 390 400 KIAA13 DRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKVKQYREELD---AKFNADKF . .::... . ::: ::: ::.:. : .: .....:::. : .. . KIAA14 CPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDD 1140 1150 1160 1170 1180 1190 410 420 430 440 450 460 KIAA13 KWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLMERGPHVKVQFQALHLMVMALPD :: . . .::.:::.:: :: . :: .. . ....:. .. ::. KIAA14 KWRDL--NVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLD-RLKTLKRLIHDLPE 1200 1210 1220 1230 1240 1250 470 480 490 500 510 520 KIAA13 ANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSKHSDYEELLLANTAAH- . .. . : . .. : : ::.: :.. :..:.: :...... ... . KIAA14 HHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLV--RTSEDNMTHMVTHMPDQYK 1260 1270 1280 1290 1300 1310 530 540 550 560 570 580 KIAA13 IIRLMLKYQKILWKVPSFLITQ-VRRMNEATMLLKKQLPSVRKLLRRKTLERETASPKTS :.. ..... : . . ..: . . .. .:.. .:: .. : .:: KIAA14 IVETLIQHHD--WFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLL--TNIGRTGVSPGDV 1320 1330 1340 1350 1360 590 600 610 620 630 640 KIAA13 KVLQKSPSARRMSDVPEGVIRVHAPLLSKVSMAIQLNNQTKAKDILAKFQYENRI--LHW . : :.. .. : . :: . .: .. : :. . :... . . KIAA14 SDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFF 1370 1380 1390 1400 1410 1420 650 660 670 680 KIAA13 QRAALSFLNGKWVKKEREESTETNRSPKHVFLFTIGLDIST .. . .. .. ..:: .:. : KIAA14 KKENVEQCHNDTKEESKKESETLGRKQKIIIAKENSTRKDPSTTKDEKISLGKESTPSEE 1430 1440 1450 1460 1470 1480 >>KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445 aa) initn: 195 init1: 72 opt: 232 Z-score: 220.1 bits: 52.2 E(): 3.9e-07 Smith-Waterman score: 233; 26.510% identity (53.020% similar) in 298 aa overlap (321-601:1-278) 300 310 320 330 340 KIAA13 AGDLSAEDMKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQLKRNKTEKVKGRDNGI---FGVPLTVLLDG : .:: : : . .: :: :: :.. KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLES 10 20 30 350 360 370 380 390 400 KIAA13 DRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKVKQYREELDAKFNADKFK-- . : :: ::.. : .: :. .::.:::: :..... :.:. . : . KIAA12 S-----GQDVPYVLKSCAEFIETHGI-VDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREV 40 50 60 70 80 410 420 430 440 450 460 KIAA13 --WDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLMERGPHVKVQFQALHLMVMALP : : .. . : .:::::. :. : : . . :. . :. .. ... :: KIAA12 YLQDIHC---VGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPE-EGQLARIQNVIQELP 90 100 110 120 130 140 470 480 490 500 510 520 KIAA13 DANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSKHSDYEELLLANTAAH .. . . :. . .. . ::. : :.. : ::::. ::: . : . :: KIAA12 PSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLL--RSK--EIEATGCNGDAAF 150 160 170 180 190 530 540 550 560 570 KIAA13 IIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRM--NEATMLLK--KQLPSVRKL------LRRKTLE : .. :.. : :....: .. : : :. .. : ...: : : . KIAA12 ---LAVRVQQV---VIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPALSLPMKLVS 200 210 220 230 240 250 580 590 600 610 620 630 KIAA13 RETASPKTSKVLQKSPSARRMSDVPEGVIRVHAPLLSKVSMAIQLNNQTKAKDILAKFQY : :. .. . . . . :: ...:: : KIAA12 LEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIFN 260 270 280 290 300 310 >>KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770 aa) initn: 226 init1: 72 opt: 219 Z-score: 206.5 bits: 50.0 E(): 2.2e-06 Smith-Waterman score: 234; 24.299% identity (54.829% similar) in 321 aa overlap (286-602:2-299) 260 270 280 290 300 310 KIAA13 TEALKRNKLKKSEIKKEDYVLTKFNVQKTRFGLTEAGDLSAEDMKKI--RHLSLIE-LTA ::. . ::.. .. .: .:: : . 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KIAA14 -AQSPHTKMDVANLAKVFGPTIVAHAVPNPDPVTMLQDIKRQPKVVERLLSLPLEYWSQF 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 KIAA13 WKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSVRKLLRRKTLERETASPKTSKVLQKSPSARRMS : . : .. ..... . : :... .: ...:. . : :.::. .: KIAA14 MMVEQENIDPLHVIENSNAFSTPQTPDIKV-----SLLGPVTTPEHQ--LLKTPSSSSLS 490 500 510 520 530 600 610 620 630 640 650 KIAA13 DVPEGVIRVHAPLL-SKVSMAIQLNNQTKAKDILAKFQYENRILHWQRAALSFLNGKWVK . .... ..: . :: . : .:. : KIAA14 QRVRSTLTKNTPRFGSKSKSATNLGRQGNFFASPMLK 540 550 560 570 >>KIAA1501 ( 735 res) hh12863 (735 aa) initn: 181 init1: 103 opt: 206 Z-score: 199.2 bits: 47.4 E(): 5.6e-06 Smith-Waterman score: 207; 28.293% identity (60.000% similar) in 205 aa overlap (317-516:478-667) 290 300 310 320 330 340 KIAA13 GLTEAGDLSAEDMKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQL-KRNKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLL .::.. :.:: :. : ::: : KIAA15 FLKQSAARGLRTQDLPAGSKDDSAAAPKTPWGINIIKKNK--KAAPR---AFGVRLEECQ 450 460 470 480 490 500 350 360 370 380 390 400 KIAA13 DGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKVKQYREELD---AKFNAD . ... .:::.. . :: :::: ::.:. : .: :.. .:.:. . .: . 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