# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh04221s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1225.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1225, 1371 aa vs ./tmplib.24314 library 1986134 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4448+/-0.0086; mu= 0.7987+/- 0.584 mean_var=270.2839+/-64.438, 0's: 0 Z-trim: 21 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.078012 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 1327 164.2 1.7e-40 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 502 70.8 7.9e-13 KIAA1365 ( 831 res) fj02517 ( 831) 457 65.9 3.4e-11 KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 ( 793) 299 48.1 7.3e-06 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 297 47.9 8.7e-06 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 295 47.9 1.4e-05 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 273 45.2 5.7e-05 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 232 40.5 0.0012 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 226 40.2 0.0031 >>KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630 aa) initn: 1127 init1: 1127 opt: 1327 Z-score: 818.7 bits: 164.2 E(): 1.7e-40 Smith-Waterman score: 1330; 39.052% identity (69.118% similar) in 612 aa overlap (9-614:2-589) 10 20 30 40 50 KIAA12 MTTKRSLFVRLVPC-RCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIE .. .: :: : : ..: ::::. ::.::. . ..:::: :::::.. KIAA01 MLKCIPLWRCNRH----VESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLR 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 KIAA12 ELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTI :::: .: .:.::.: ::.. :: .::...: :::::.: : :.::.:: ::.: : KIAA01 ELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEI 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA12 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT .. : ::.:.:::::.:: .:..: :::. :. ::.. : :..: :::::: :: :: . KIAA01 ADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPAS 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA12 MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSK .. :..::.::::.:.. .:..: : .:.:.:.: :.:. .: .:.:..:. ::::. KIAA01 LSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 KIAA12 NNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLI : .: . .. : :::::.: :..::. ::.::... ::.:.:.: . ..:: KIAA01 NRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCE 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 KIAA12 SVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLET .. :: . : . ::: :.:.::.: .. .:.:.:. ::::::. ..:: :..:.: . KIAA01 NLSELILTENLLMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 KIAA12 LPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQK :: :.. .:.:.... :::..:::..:.:. : :.::..::..:.. .: : :..: . KIAA01 LPPELAHTTELHVLDVAGNRLQSLPFALTHLN-LKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGE 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 KIAA12 MVLTNYMFPQQP--RTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDE---DKDEREAP ::: :..:::: ::. ... :.. . : . .:..: . :.: .:: KIAA01 KVLTCYLLPQQPPLSLEDA---GQQGSLSET-WSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAA 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 KIAA12 PREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDVGVK .. .:.: ::.:.::: : .... .: . . ::: : : :... .. . :. KIAA01 AEKRGLQRRATPHPSELKVMKRSIEG--RRSEACPCQPDSGSPL-PAEEEKRLSAESGL- 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 KIAA12 TSESTTTVKSKVDEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHDDV ::.. : :.: : . .: :. :: . : . : :. .. . : KIAA01 -SEDSRPSASTVSEAEPEGPSAEAQGGSQQEATTAGG------EEDAEEDYQEPTVH--- 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 KIAA12 FEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQN : :. : .:.. .. : .: KIAA01 FAEDALLPGDDR-EIEEGQPEAPWTLPGGRQRLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALL 580 590 600 610 620 >>KIAA0862 ( 584 res) hk06532 (584 aa) initn: 700 init1: 427 opt: 502 Z-score: 322.1 bits: 70.8 E(): 7.9e-13 Smith-Waterman score: 624; 29.659% identity (58.517% similar) in 499 aa overlap (11-460:96-584) 10 20 30 40 KIAA12 MTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKE : :: ::. :: :. :.. .:. KIAA08 VAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCR-----EENSMRLDLSKRSIHILPSS 70 80 90 100 110 120 50 60 70 80 90 100 KIAA12 IFTFEKTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVS : . . : :::: .:... :: .. .: :.: .:.::.:: :. :: .:: ::. KIAA08 IKELTQ-LTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLR 130 140 150 160 170 110 120 130 KIAA12 KNGIQEFP-----------------------ENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQL .: ..:.: ..::: . :... : :..:: ...: KIAA08 HNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGEL 180 190 200 210 220 230 140 150 160 170 180 190 KIAA12 LNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFT :: : . :: :: ..: :.. :.:..:.: :: :.. :..: :: : :... KIAA08 CNLITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLS 240 250 260 270 280 290 200 210 220 230 240 KIAA12 EVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIP-GFIGSLKQLTYLDVSKN---------------- .:. : . :.:.:. .. : .. .: ....:: .:. : ...: KIAA08 AIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTI 300 310 320 330 340 350 250 260 270 280 290 KIAA12 ---NIEM-----VEEGI-STCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYL :.: . :: : . :. : ...:.: .:: .:. ... :.. ::: . KIAA08 YSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKI 360 370 380 390 400 410 300 310 320 330 340 350 KIAA12 PDSIGGLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLF :....::.:.: : : : .. :: ..:.: .:: . ..: :..:: ::. :.. : KIAA08 PEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLV 420 430 440 450 460 470 360 370 380 390 400 410 KIAA12 LHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQK : .:.: :::. .: . .: ..:..: : .:: . :..: ..:.:: . .::. KIAA08 LTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLEL 480 490 500 510 520 530 420 430 440 450 460 470 KIAA12 ETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDER :. . : . : . . : .... . :: .. . : ::.: KIAA08 ALCSKLSIMSIENCPLSHLPP----QIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV 540 550 560 570 580 480 490 500 510 520 530 KIAA12 EAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDV >>KIAA1365 ( 831 res) fj02517 (831 aa) initn: 707 init1: 453 opt: 457 Z-score: 293.0 bits: 65.9 E(): 3.4e-11 Smith-Waterman score: 833; 32.137% identity (59.438% similar) in 641 aa overlap (802-1370:214-830) 780 790 800 810 820 KIAA12 TNDTFQPEIMERSKTQDIVLGTSFLSINSKEETEHLENGNKYPNLESVN---KVNGHSEE :. ::...... :. : . . . . . KIAA13 QNWTRTPSPFEDRTAFPSKLETTPTTSPLPERKEHIKESTEIPSPFSPGVPWEYHDSNPN 190 200 210 220 230 240 830 840 850 860 870 880 KIAA12 TSQSPNRTEPH---DSDCSVDLGISKSTEDLSP-QKSGPVGSVVKSHSITNMEIGGLKIY : : .. : .:. .: ..:::::: ::: .:. .. ::.:: ...:: :.: KIAA13 RSLSNVFSQIHCRPESSKGV-ISISKSTERLSPLMKDIKSNKFKKSQSIDEIDIGTYKVY 250 260 270 280 290 300 890 900 910 920 930 KIAA12 DILSDN---GPQQPSTTV---KITSAVDG-KNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLI .: .: : .. .. :. . : ... ::.:. .: :. : .... ... KIAA13 NIPLENYASGSDHLGSHERPDKMLGPEHGMSSMSRSQSVPMLDDEMLTYGSSKGPQQQKA 310 320 330 340 350 360 940 950 960 970 980 990 KIAA12 SGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPTSGPQSAPQIYGPPQYNIQYSSSAAVKDTLWHSKQN : :: ...::.. ::. ... : : . :.: .: .:. .:: . . KIAA13 SMTKKVYQFDQSFNPQGSVEVKAEKRIP---PPFQHNPEY-VQQASKNIAKDLI-----S 370 380 390 400 410 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA12 PQIDHASFPP--QLLPRSESTENQS------YAKHSANMNFSNH-NNVRANTAYHLHQRL :. . ..:: :.. :. . :.. .:...: .: . ... . : . . .:. KIAA13 PRA-YRGYPPMEQMFSFSQPSVNEDAVVNAQFASQGARAGFLRRADSLVSATEMAMFRRV 420 430 440 450 460 470 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA12 GPARHGEMWAISPNDRLIPAVTRSTIQRQSSVSSTASVNLGDPGSTRRAQIPEGDYLSYR . : . :.:: :. ..:::::. : : : .: : .. ::. KIAA13 N-----EPHELPPTDRYGRPPYRGGLDRQSSVTVTESQFL------KRNGRYEDEHPSYQ 480 490 500 510 520 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA12 EFHS-AGRTPPMMPGSQRPLSARTYSID--GPNASRPQSARPSINEIPERTMSVSDFNYS : .. :: : ..::::::.:: . : . .:: ::::.. . :. : :.: . KIAA13 EVKAQAGSFPVKNLTQRRPLSARSYSTESYGASQTRPVSARPTMAALLEKIPS--DYNLG 530 540 550 560 570 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA12 RTSPSKRPNARVGSEHS-LLDPPGKSKVPRDWREQVLRHIEAKKLEKMP------LSNGQ . . :. . .. . . . .:.: :::.:.::::::..:.. : :.::: KIAA13 NYGDKPSDNSDLKTRPTPVKGEESCGKMPADWRQQLLRHIEARRLDRTPSQQSNILDNGQ 580 590 600 610 620 630 1220 1230 1240 1250 KIAA12 M-----GQ----PLR----P-----QANYSQIHHPPQASVARHPSREQL-----IDYLML :: :: : . :.:. .. .: :::: :. . . KIAA13 EDVSPSGQWNPYPLGRRDVPPDTITKKAGSHIQTLMGSQSLQHRSREQQPYEGNINKVTI 640 650 660 670 680 690 1260 1270 1280 1290 KIAA12 KVAHQP-----PYTQPHCSPRQGHELAK-----------QEIRVRVEKDPELGFSISGGV . ..: : .: .:. :. : . ... ::.::.: ::::::::. KIAA13 QQFQSPLPIQIPSSQATRGPQPGRCLIQTKGQRSMDGYPEQFCVRIEKNPGLGFSISGGI 700 710 720 730 740 750 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA12 GGRGNPFRPDDDGIFVTRVQPEGPASKLLQPGDKIIQANGYSFINIEHGQAVSLLKTFQN .:.::::.:.: :::::::::.::::.::::::::.::::.::...:: .:: :::.::: KIAA13 SGQGNPFKPSDKGIFVTRVQPDGPASNLLQPGDKILQANGHSFVHMEHEKAVLLLKSFQN 760 770 780 790 800 810 1360 1370 KIAA12 TVELIIVREVSS ::.:.: ::.. KIAA13 TVDLVIQRELTV 820 830 >>KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 (793 aa) initn: 332 init1: 160 opt: 299 Z-score: 197.1 bits: 48.1 E(): 7.3e-06 Smith-Waterman score: 314; 22.744% identity (55.054% similar) in 554 aa overlap (209-742:148-681) 180 190 200 210 220 230 KIAA12 TMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVS :::: : :: .:.. . :.: KIAA10 GGFNLPLNRGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAA-----PGH--DLSDTVQADLS 120 130 140 150 160 170 240 250 260 270 280 290 KIAA12 KNNIEMVEEGISTCE--NLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIG :: ..:: . :. .:. : : : .. .::.: .:. .: :....::: :: . KIAA10 KN--RLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLC 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 KIAA12 GLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNK :: .. : : :.. .:: :::: .: . .. : . :: .::. :.. : .. : KIAA10 GL-PLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNY 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 410 KIAA12 LETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQ-SKPLIPLQKETDS :..::.:. :. .: ...: :.. .:. : ...:: .. : .: ..: : : : . KIAA10 LKVLPQELVDLPLVK-FDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSP--PAQICTKG 290 300 310 320 330 340 420 430 440 450 460 470 KIAA12 ETQKMVLTNYMFPQ--QPRTEDVMFISDNESFNPSLWE--EQRKQRAQVAFECDE-DKDE :. . .:. : : .: : ... : : : . :. :. .. . :. :: KIAA10 ---KVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTME--RPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRL 350 360 370 380 390 480 490 500 510 520 530 KIAA12 REAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKD . : . . .:. . ... . :::. .. . ....:. . . . KIAA10 SATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLS--PVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTN 400 410 420 430 440 450 540 550 560 570 580 KIAA12 VGVKTSESTTTVKSKVDEREKYMI-GNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASEN----L : . .. : . . .: .: ... ... . : .. . . .. : .. . KIAA10 SGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMI 460 470 480 490 500 510 590 600 610 620 630 640 KIAA12 KHIVNHDDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSD ... . :.... . ::.: . . :. . . . ::... . .:. . ... KIAA10 EQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQS 520 530 540 550 560 570 650 660 670 680 690 KIAA12 EVTHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSL------CSPVKQTH-IDINSKIRQE ..: .:: .. . . . : .:: .:.:. .: : .. . :: . ::.. KIAA10 DLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTNSTAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRK 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 KIAA12 DENFNSLLQNGDILNSSTEEKFKAHDKKDFNLPEYDLNVEERLVLIEKSVDSTATADDTH :.. . . : : : ..:. ..:.. .: : .:: KIAA10 MEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSP 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 KIAA12 KLDHINMNLNKLITNDTFQPEIMERSKTQDIVLGTSFLSINSKEETEHLENGNKYPNLES KIAA10 AVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAP 700 710 720 730 740 750 >>KIAA1437 ( 811 res) hk07206 (811 aa) initn: 455 init1: 274 opt: 297 Z-score: 195.8 bits: 47.9 E(): 8.7e-06 Smith-Waterman score: 399; 27.968% identity (60.950% similar) in 379 aa overlap (49-412:427-801) 20 30 40 50 60 70 KIAA12 GEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQSLHKLSLPD ..: : .. .: .:. :. :.: KIAA14 EVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQRLTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLEL 400 410 420 430 440 450 80 90 100 110 120 130 KIAA12 NDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQ-EFPENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQL .:.: :::.: .:.:: . ... . : : . : .. . . :...: . .: KIAA14 IPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSL 460 470 480 490 500 510 140 150 160 170 180 KIAA12 LNLTQLYL-------NDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRL-TQLERL .: .:.: :. .. . .. .: .:..:.:. : :. ::.... . ..:..: KIAA14 KTLEELHLTGNLSAENNRYI--VIDGLRELKRLKVLRLKSN-LSKLPQVVTDVGVHLQKL 520 530 540 550 560 570 190 200 210 220 230 240 KIAA12 DLGSNEFTE--VPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSKNNIEMVEE .. .:: :. : . :.....: :. . : :: : ::..: .:.. ::.. .:: KIAA14 SI-NNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEE 580 590 600 610 620 630 250 260 270 280 290 300 KIAA12 GIST--CENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLISVEELD :: . : : : : . .: ::.: :. : ...:.. .: .. ... :: KIAA14 IISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLD 640 650 660 670 680 690 310 320 330 340 350 360 KIAA12 CSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMG : :.. ::..:: : ::...: : .. ::::. . ... .: : .: :..:: ..: KIAA14 LSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVG 700 710 720 730 740 750 370 380 390 400 410 420 KIAA12 DMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTK--LQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKMVLT .. .: :.: :::. :: . . : . ... . .. . : : :: KIAA14 ELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA 760 770 780 790 800 810 430 440 450 460 470 480 KIAA12 NYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRY >>KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258 aa) initn: 233 init1: 157 opt: 295 Z-score: 192.3 bits: 47.9 E(): 1.4e-05 Smith-Waterman score: 398; 28.030% identity (58.838% similar) in 396 aa overlap (22-401:251-636) 10 20 30 40 50 KIAA12 MTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEEL . ..:.: : :::.::...: . . . : KIAA09 AGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLF-YSQDITYL 230 240 250 260 270 60 70 80 90 100 KIAA12 YLDANQIE-ELP---KQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEF : : .. : : :.. ..:. :.: : : .: . .. .: ::..: ::.... KIAA09 NLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDL 280 290 300 310 320 330 110 120 130 140 150 160 KIAA12 PENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILE : .: : : . . : .. ::. ...: .:..: .. . .: . .:: :. . KIAA09 PSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVV 340 350 360 370 380 390 170 180 190 200 210 220 KIAA12 LRENQLKMLP-KTMNRLTQLERLDLGSNEF-TEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGF . : :..: ..::.......:: :.. : : : :: . . . . :::: . KIAA09 MAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLD-- 400 410 420 430 440 450 230 240 250 260 270 280 KIAA12 IGSLKQLTYLDVSKNNI-EMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLP-ETIGSLKNITTLKI ..:: .: : ..:.. :.. :.: :. : ::: : . . :: .: : . KIAA09 LSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFS----LRTLYASSNRLTAVNVYPVPSL--LTFLDL 460 470 480 490 500 510 290 300 310 320 330 340 KIAA12 DENQLMYLPDSIGGLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGS ..: : .:: ..: :: :.: . .: : . .:: . ::..:.:: . KIAA09 SRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEH 520 530 540 550 560 570 350 360 370 380 390 KIAA12 WKNITVLFLHSNKLETLPE--------EMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTA . :: :. : : ::. ... ...:. .::: :.::..: .... ..: . KIAA09 IP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHT 580 590 600 610 620 630 400 410 420 430 440 450 KIAA12 MWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRK . .: KIAA09 LVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKT 640 650 660 670 680 690 >>KIAA0231 ( 823 res) fk16230 (823 aa) initn: 579 init1: 242 opt: 273 Z-score: 181.1 bits: 45.2 E(): 5.7e-05 Smith-Waterman score: 422; 29.219% identity (61.713% similar) in 397 aa overlap (17-393:399-793) 10 20 30 40 KIAA12 MTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVP-KEIFTFE : ... .. . :. .:.:. .. .: : KIAA02 ALREKSNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVE 370 380 390 400 410 420 50 60 70 80 90 KIAA12 KTLEELYLDA-NQIEE-------LPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLREL : .: .: ..:: :: ..:. .. ::: . ::.....:.::.:: KIAA02 KLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKEL 430 440 450 460 470 480 100 110 120 130 140 150 KIAA12 DVSKNG-IQEFPENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFL-EFLPA : ... . . : . : :.. . . ..:.: .: :: .:::. : : : . KIAA02 RVYHSSLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLST 490 500 510 520 530 540 160 170 180 190 200 KIAA12 ----NFGRLTKLQILELRENQLKMLPKTM-NRLTQLERLDLGSNEFTE--VPEVLEQLSG .: : .:. : :. ..:. .:... . : .:..:.: .:: .. : . :... . KIAA02 MQLEGFQDLKNLRTLYLK-SSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSL-DNEGSKLVVLNNLKKMVN 550 560 570 580 590 600 210 220 230 240 250 260 KIAA12 LKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSKNNIEMVEEGIST--CENLQDLLLSSNSLQ :: . . . : :: : ::..: ::. .::.. ::: :: .::. : : :.. KIAA02 LKSLELISCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIA 610 620 630 640 650 660 270 280 290 300 310 320 KIAA12 QLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRT .: ::.:.:. :..:.:.. :: .. ... :: :.:.. .: : :.::. KIAA02 YIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQY 670 680 690 700 710 720 330 340 350 360 370 380 KIAA12 FAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFS ::. .: ...:: . . :.. :.: .:.: .: ..:....: ..: : :..:: KIAA02 FAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPE 730 740 750 760 770 780 390 400 410 420 430 440 KIAA12 FTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFN . :.: KIAA02 LEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC 790 800 810 820 >>KIAA1580 ( 640 res) fj04979 (640 aa) initn: 62 init1: 62 opt: 232 Z-score: 157.4 bits: 40.5 E(): 0.0012 Smith-Waterman score: 243; 29.911% identity (62.946% similar) in 224 aa overlap (80-295:66-286) 50 60 70 80 90 100 KIAA12 ELYLDANQIEELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPE .: .: .:.. : : :.. .: :: . KIAA15 LVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKVICVRKNLREVPDGIST--NTRLLNLHENQIQIIKV 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 KIAA12 N-IKNCKVLTIVEASVNPISKLPDG-FSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPAN-FGRLTKLQIL : .:. . : :.. : : : . : :. : ::. : : : : .: . : :.::. : KIAA15 NSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIEIGAFNGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYLSKLKEL 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 KIAA12 ELRENQLKMLPK-TMNRLTQLERLDLGS-NEFTEVPE-VLEQLSGLKEFWMDANRLTFIP ::.: .. .:. ..::. .:.::::: .... . : ..: ::.:. . . : :: KIAA15 WLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCNLREIP 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 KIAA12 GFIGSLKQLTYLDVSKNNIEMVEEG-ISTCENLQDLLLSSNSLQQLPET-IGSLKNITTL . . : .: ::.: :.. .. : .. .:: : . ....: . .. . .:.... . KIAA15 N-LTPLIKLDELDLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEI 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 KIAA12 KIDENQLMYLPDSIGGLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEI .. .:.: :: .. KIAA15 NLAHNNLTLLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILWLSWWIKDMAPSNTACCARCNT 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369 aa) initn: 190 init1: 162 opt: 226 Z-score: 149.9 bits: 40.2 E(): 0.0031 Smith-Waterman score: 387; 27.020% identity (59.343% similar) in 396 aa overlap (40-408:338-728) 10 20 30 40 50 60 KIAA12 RLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQ :. : : :. : :. :.. ..: . . KIAA06 LFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTK-LKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIP 310 320 330 340 350 360 70 80 90 100 110 120 KIAA12 SLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTIVEASVNPISK .: .:.. : : ..::... . ::. . .. : .: .: ...: : :. . : : .. KIAA06 TLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTD 370 380 390 400 410 420 130 140 150 160 170 180 KIAA12 LPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPAN-FGRLTKLQILELRENQL-KMLPKTMNRLTQLE .:. . .: . .: .. .: : . . .. ... ..:: : . :.. .. : .. KIAA06 IPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVT 430 440 450 460 470 480 190 200 210 220 KIAA12 RLDLGSNEFTEVP-------EVLE----QL-----SG--LKEFWMDANRLTFIPGFIGSL .::: .:.. .. :::. :: : :: .. ..:.:. . . KIAA06 QLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVP- 490 500 510 520 530 540 230 240 250 260 270 280 KIAA12 KQLTYLDVSKNNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLM . :.:.:::.: .: : : . ..:. : .. :.. .:: . ... : .::: KIAA06 NYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLA 550 560 570 580 590 600 290 300 310 320 330 340 KIAA12 YLPDSIGGLISVEELDCSFNEVEALPSSI-GQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNIT ::. . ::: :: . :.. :: .. . .:: . :. : :..::: : .. . KIAA06 RLPERLERT-SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNS 610 620 630 640 650 660 350 360 370 380 390 400 KIAA12 VL---FLHSNKL--ETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFS-FTKLQQLTAMWLSDNQ .: .: .:.: . .: : .::..... :::...: : ..::..: . :: :. KIAA06 ILQELYLTNNSLTDKCVPLLTGH-PHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNK 670 680 690 700 710 720 410 420 430 440 450 460 KIAA12 SKPLIPLQKETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAF : :: KIAA06 LKA-IPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKL 730 740 750 760 770 780 1371 residues in 1 query sequences 1986134 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:13:49 2008 done: Thu Dec 18 15:13:50 2008 Total Scan time: 0.800 Total Display time: 0.310 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]