# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg03451.fasta.nr -Q ../query/KIAA1204.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1204, 1445 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7812145 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4736+/-0.000202; mu= 9.7534+/- 0.011 mean_var=128.7188+/-24.543, 0's: 43 Z-trim: 88 B-trim: 133 in 1/65 Lambda= 0.113045 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|121948919|sp|Q2M1Z3.1|CDGAP_HUMAN RecName: Full (1444) 9697 1594.0 0 gi|119599979|gb|EAW79573.1| Cdc42 GTPase-activatin (1444) 9692 1593.2 0 gi|114588649|ref|XP_001162142.1| PREDICTED: Cdc42 (1444) 9601 1578.4 0 gi|119879517|ref|XP_593520.3| PREDICTED: similar t (1451) 8068 1328.4 0 gi|74002653|ref|XP_856487.1| PREDICTED: similar to (1451) 7913 1303.1 0 gi|221039634|dbj|BAH11580.1| unnamed protein produ (1099) 6914 1140.1 0 gi|194222812|ref|XP_001502668.2| PREDICTED: simila (1452) 5640 932.4 0 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2.1e-53 gi|82201095|sp|Q6GPD0.1|RICS_XENLA RecName: Full=R (1940) 1171 203.6 1.1e-48 gi|73954831|ref|XP_546401.2| PREDICTED: similar to (1966) 1163 202.3 2.7e-48 gi|28569546|gb|AAO43677.1| rac GTPase activating p (1738) 1158 201.5 4.4e-48 gi|119588142|gb|EAW67738.1| Rho GTPase-activating (2061) 1159 201.7 4.4e-48 gi|205829172|sp|A7KAX9.1|RICS_HUMAN RecName: Full= (2087) 1159 201.7 4.5e-48 gi|109483229|ref|XP_236020.4| PREDICTED: similar t (2049) 1157 201.4 5.5e-48 gi|119588139|gb|EAW67735.1| Rho GTPase-activating ( 671) 1149 199.6 6e-48 gi|119588138|gb|EAW67734.1| Rho GTPase-activating ( 946) 1150 199.9 6.9e-48 gi|30268349|emb|CAD89974.1| hypothetical protein [ ( 954) 1150 199.9 7e-48 gi|119588136|gb|EAW67732.1| Rho GTPase-activating ( 994) 1150 200.0 7.2e-48 gi|28569544|gb|AAO43676.1| rac GTPase activating p (1740) 1151 200.3 9.7e-48 gi|206558298|sp|Q811P8.2|RICS_MOUSE RecName: Full= (2089) 1152 200.6 9.9e-48 gi|47227207|emb|CAG00569.1| unnamed protein produc ( 760) 1145 199.0 1e-47 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