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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1204, 1445 aa vs ./tmplib.24314 library 1986060 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5134+/-0.0107; mu= -17.8095+/- 0.721 mean_var=525.3772+/-126.154, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.055955 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 1159 109.6 5.4e-24 KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 361 44.8 7.2e-05 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 343 43.4 0.00021 KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944) 341 43.6 0.00044 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 317 41.2 0.00086 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 312 40.9 0.0013 KIAA0053 ( 666 res) ha01417 ( 666) 296 39.5 0.0026 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 302 40.3 0.0032 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 285 38.5 0.0043 >>KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770 aa) initn: 1168 init1: 964 opt: 1159 Z-score: 522.6 bits: 109.6 E(): 5.4e-24 Smith-Waterman score: 1342; 28.803% identity (52.874% similar) in 1479 aa overlap (1-1367:32-1418) 10 20 KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAAS--AFGCDLTEYL .::.. .:::::..: . .::::: :.: KIAA07 FGIILSIDLKTCTTTRVSKKHGKLITFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHL 10 20 30 40 50 60 30 40 50 60 70 80 KIAA12 ESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQD .:: .:: ::.::. ::: .::::::::::::.:::::::.:: :.. ::::.: :.:: KIAA07 LNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQD 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 KIAA12 IHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLE :: :::::::::::::::::::.:::::..::: .: .: .:..:::.::: :::::: KIAA07 IHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLE 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 KIAA12 YLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEF .:.:::. .:.. : :::::.:::.::::::::::.::.. .: :::. ::.:.::.:: KIAA07 FLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEF 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 KIAA12 ILNHVDQIFNNGAPGSLENDE---NRPIMKSLTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLA-TNHP :::::: .:.. .... .:: ::: . . : ::..:::::::. : .: : KIAA07 ILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRP--KSLLVSSPST--KLLTLEEAQARTQAQVNSP 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 KIAA12 ARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKK-----WKSIFNLGRSGSDSK : . . : . :::..:.: .... ..: :: :.:.::::.:.: :: KIAA07 IVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSK 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 KIAA12 SKLSRNGSVFVRGQRLSVE----KATIRPAKSMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFF ::.:: : . . .... ..:.: ::: .:: :. . ..: : ... 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KIAA15 SDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSADLLEI 690 700 710 720 730 >>KIAA0672 ( 824 res) hk02382 (824 aa) initn: 291 init1: 218 opt: 343 Z-score: 170.8 bits: 43.4 E(): 0.00021 Smith-Waterman score: 377; 24.729% identity (53.610% similar) in 554 aa overlap (19-527:258-777) 10 20 30 40 KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIET .:: : :.: ::... . ...:. .. 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KIAA14 KLLSKDDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVD 1100 1110 1120 1130 1140 1150 50 60 70 80 90 KIAA12 SCAEFIETHGI-VDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLY : ...: .:. ::::. : .. :. ...:... . .. .:.. ..:: : . KIAA14 ICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSF 1160 1170 1180 1190 1200 1210 100 110 120 130 140 150 KIAA12 FRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIAS ::.::.::.: . : : :: . .: .. .:..:: ::.::..: :: .: KIAA14 FRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAE 1220 1230 1240 1250 1260 1270 160 170 180 190 200 210 KIAA12 FSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNN : :..:. ::::.:..:.:.:..: . : . : ..: ...: : .:.. KIAA14 NSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTH-----MVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTE 1280 1290 1300 1310 1320 220 230 240 250 260 KIAA12 -GAPGSLENDENRPIMKSLTLPALSLPMKLVS---LEEAQARSLATNHPARKE------R :: : . ... . : .: .. . .. . ... . ::. .... . KIAA14 EGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGK 1330 1340 1350 1360 1370 1380 270 280 290 300 310 320 KIAA12 RENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIF----NLGRSGSDSKSKLSRN . : .: . . . : .: . ::. . ..: :. . .:.: . ... KIAA14 DQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFFKKENVEQCHNDTKEESKKE 1390 1400 1410 1420 1430 1440 330 340 350 360 370 380 KIAA12 GSVFVRGQRLSVEKA-TIR--PAKSMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMH . .. : :.. . : . : :. . : :. :::. . . . : .. : KIAA14 SETLGRKQKIIIAKENSTRKDPSTTKDEKISL---GKESTPSEEPSP-------PHNSKH 1450 1460 1470 1480 1490 390 400 410 420 430 440 KIAA12 STGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGFDVSSDRSHLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDP . . :: .. . : . . . ...:: . : ..... .... . .: KIAA14 NKSPTLSCRFAILK-ESPRSLLAQKSSHLEETGSDSGTLLSTSSQASLARFSM-KKSTSP 1500 1510 1520 1530 1540 1550 450 460 470 480 490 500 KIAA12 ESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSV-FTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPLRVSA :.... ::. : ..:. . .:: . . ::. : ...: . . . : KIAA14 ETKHSEFLANVSTITSDYSTTSSATYLTSLDSSRLSPEVQ----SVAESKGDEADDERSE 1560 1570 1580 1590 1600 1610 510 520 530 540 550 KIAA12 VISTNSTPCRTPPK-ELQSLSS--LEEFSFHGS-ESGGWPEEEKPLGAETSAASVPKKAG .:: .. : .: . :. . . : :.:. . ... :.: : . .. KIAA14 LIS-EGRPVETDSESEFPVFPTALTSERLFRGKLQEVTKSSRRNSEGSELSCTEGSLTSS 1620 1630 1640 1650 1660 1670 560 570 580 590 600 610 KIAA12 LEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKV---VE :.. . . . .::. ::.. .:.. :. .::.. . :: : :. :: .. KIAA14 LDSRRQLFSSHKLIECDT-LSRKKSARF---KSDSGSLGDAK-NEKEA-PSLTKVFDVMK 1680 1690 1700 1710 1720 620 630 640 650 660 670 KIAA12 EGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSLP .:. .: . . : :: . KIAA14 KGKSTGSLLTPTRGESEKQEPTWKTKIADRLKLRPRAPADDMFGVGNHKVNAETAKRKSI 1730 1740 1750 1760 1770 1780 >>KIAA0621 ( 753 res) hg04539 (753 aa) initn: 337 init1: 177 opt: 317 Z-score: 159.9 bits: 41.2 E(): 0.00086 Smith-Waterman score: 329; 26.871% identity (62.585% similar) in 294 aa overlap (38-325:331-583) 10 20 30 40 50 60 KIAA12 KQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVD-GIYRLSGVTSNIQ ....: . .::.:: . :.::. ::.: .: KIAA06 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ 310 320 330 340 350 360 70 80 90 100 110 120 KIAA12 RLRQ-----EFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVS .: . . .:. :. : .:. . : : :.: ::.::. :.. ..: .:.. KIAA06 KLLSVLMDPKTASETETDICAE---WEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAK 370 380 390 400 410 130 140 150 160 170 180 KIAA12 HCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLR .:.....:......:: .. . :. :. :::..:. ... : . ::..:..:.::: KIAA06 LENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLR 420 430 440 450 460 470 190 200 210 220 230 240 KIAA12 SKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPA .: :.. ::.. .. :..:::..... ..::: :.: KIAA06 PQE-ETV-----AAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFN-------------------TVP- 480 490 500 510 250 260 270 280 290 300 KIAA12 LSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSK ..:. ..:. .. .: .. :. .:: :. :::::: .... : KIAA06 -DMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSER----------PL-TLFHTVQSTEKQEQRNSII 520 530 540 550 310 320 330 340 350 360 KIAA12 SKKWKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVEKATIRPAKSMDSLCSVPVEGKET ... .:. . : .:.:.:. : KIAA06 NSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRPNSLPPNPSPTSPLSPSWPMF 560 570 580 590 600 610 >>KIAA0131 ( 942 res) ha01235 (942 aa) initn: 282 init1: 209 opt: 312 Z-score: 156.5 bits: 40.9 E(): 0.0013 Smith-Waterman score: 322; 30.466% identity (59.140% similar) in 279 aa overlap (20-287:501-754) 10 20 30 40 KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETH :: :. ....:::: :: :..:: .::. . KIAA01 EQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLN 480 490 500 510 520 530 50 60 70 80 90 100 KIAA12 GIV-DGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLL :. .::.:.::. ....:. : . : :.. .:. :... ::::: : ::. KIAA01 GLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDP-LVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLF 540 550 560 570 580 110 120 130 140 150 160 KIAA12 TYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNV---IQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTN .: : : .. :. :...: . .:: .:.::. : :.:..:... KIAA01 PPDL---FGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENM 590 600 610 620 630 640 170 180 190 200 210 220 KIAA12 MHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFN--NGAPG : :::. ..:.:: . : . : . : ::.:.: .:. . :..: .. :: KIAA01 MDPYNLAVCFGPTLL---PVPA---GQDPVALQGRVNQLVQTLIV-QPDRVFPPLTSLPG 650 660 670 680 690 230 240 250 260 270 KIAA12 SLENDENRPIM-KSLTLPALSLPMKLVSLEEAQARSL-ATNHP---ARKERRENSLPEIV :.. : .. :. : : .:: .:: : :.: :. .:..: .: KIAA01 --------PVYEKCMAPPSAS------CLGDAQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVV 700 710 720 730 740 280 290 300 310 320 330 KIAA12 PPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVE .. . .: KIAA01 EAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQ 750 760 770 780 790 800 >>KIAA0053 ( 666 res) ha01417 (666 aa) initn: 223 init1: 85 opt: 296 Z-score: 151.4 bits: 39.5 E(): 0.0026 Smith-Waterman score: 296; 30.738% identity (59.016% similar) in 244 aa overlap (10-236:165-399) 10 20 30 KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAAS---AFGCDLTE---YLESSGQ :. :. :.. .:: : : : .. : KIAA00 IIPASWDQNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGP 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 KIAA12 D-VPYVLKSCAEFIETHG-IVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHC :: ....::::: :: .::.:: : . ...::. : . . :.. :.. :.: KIAA00 HLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDT---DVHT 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 KIAA12 VGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEA--VSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY :.:: :::.:.::.:.. . :: : ... : .... .. :: ..: : : KIAA00 VASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSY 260 270 280 290 300 310 150 160 170 180 190 200 KIAA12 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSK-EIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEF . : : .: . ..: . ::: : . ::.::: : :. : ..:.:. . KIAA00 ICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTP-----QIQRVMTMM 320 330 340 350 360 210 220 230 240 250 260 KIAA12 ILNHVDQIFNNG-----APGSLENDENR-PIMKSLTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLATN : .: . .: .. .: . .:: .. :. .: KIAA00 IRDH-EVLFPKSKDIPLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSD 370 380 390 400 410 420 270 280 290 300 310 320 KIAA12 HPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSKL KIAA00 TTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEI 430 440 450 460 470 480 >>KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499 aa) initn: 319 init1: 162 opt: 302 Z-score: 149.6 bits: 40.3 E(): 0.0032 Smith-Waterman score: 302; 29.208% identity (66.832% similar) in 202 aa overlap (20-219:1247-1438) 10 20 30 40 KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETH :: :: . . . .: .. : :.::. 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KIAA17 GLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDF--TVNTVAGAMKSFFSELPDPLV 1280 1290 1300 1310 1320 1330 110 120 130 140 150 160 KIAA12 TYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTN-MH :.. ..:: . .: .: ...:....: ......:.: :: .. : ..:.: : KIAA17 PYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKV-SHNNKVNLMT 1340 1350 1360 1370 1380 1390 170 180 190 200 210 220 KIAA12 ARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLEN ..::.. . :.:.: . :: . :.:. :..::..... .: : KIAA17 SENLSICFWPTLMRPDF-----STMDA-LTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG 1400 1410 1420 1430 1440 230 240 250 260 270 280 KIAA12 DENRPIMKSLTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHT KIAA17 ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL 1450 1460 1470 1480 1490 >>KIAA1478 ( 570 res) fj05212 (570 aa) initn: 195 init1: 165 opt: 285 Z-score: 147.5 bits: 38.5 E(): 0.0043 Smith-Waterman score: 294; 26.518% identity (58.147% similar) in 313 aa overlap (24-329:289-564) 10 20 30 40 50 KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVD :.... ... .: .. :.. :: .:... KIAA14 VVSHPECRDRCPLPCIPTLIGTPVKIGEGMLADFVSQTSPMIPSIVVHCVNEIEQRGLTE 260 270 280 290 300 310 60 70 80 90 100 110 KIAA12 -GIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYEL :.::.:: ....:...: . : .: .::: . :: : ..:.: .::::..: KIAA14 TGLYRISGCDRTVKELKEKFLRVKTVPLLSKV--DDIHAICSLLKDFLRNLKEPLLTFRL 320 330 340 350 360 370 120 130 140 150 160 170 KIAA12 YEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLA . : ::. :....: . ... ::: .. :: .:. :: ..:. : .:.: . ::: KIAA14 NRAFMEAAEITDEDNSIAAMYQAVGELPQANRDTLAFLMIHLQRVAQ-SPHTKMDVANLA 380 390 400 410 420 430 180 190 200 210 220 230 KIAA12 LVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLA--VRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDEN :..:... .. . : : . . .. : :.: .:. . ... :: . KIAA14 KVFGPTIV-AHAVP----NPDPVTMLQDIKRQPKVVERLLSLPLEYWSQFMMVEQENID- 440 450 460 470 480 240 250 260 270 280 290 KIAA12 RPIMKSLTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLE :.... :...: : : . . . : .. : : .:. KIAA14 --------------PLHVI--ENSNAFST----PQTPDIKVSLLGPVTTPE----HQLLK 490 500 510 520 300 310 320 330 340 KIAA12 LPDNKRKLSSKSKKWKSIF--NLGRSGSDSKS--KLSRNGSVFVRGQRLSVEKATIRPAK :.. :: :.. .: . : : :: ::: .:.:.:. : KIAA14 TPSS----SSLSQRVRSTLTKNTPRFGSKSKSATNLGRQGNFFASPMLK 530 540 550 560 570 350 360 370 380 390 400 KIAA12 SMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPP 1445 residues in 1 query sequences 1986060 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:59 2008 done: Thu Dec 18 15:13:00 2008 Total Scan time: 0.860 Total Display time: 0.380 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]