# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg01973.fasta.nr -Q ../query/KIAA1199.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1199, 1013 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827031 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0317+/-0.000185; mu= 14.5894+/- 0.010 mean_var=71.0976+/-14.263, 0's: 37 Z-trim: 43 B-trim: 1478 in 1/67 Lambda= 0.152106 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|149057439|gb|EDM08762.1| rCG24762 [Rattus norve (1159) 5324 1178.3 0 gi|26331712|dbj|BAC29586.1| unnamed protein produc (1142) 5157 1141.7 0 gi|114624984|ref|XP_001141007.1| PREDICTED: transm (1383) 3077 685.3 5.6e-194 gi|119582923|gb|EAW62519.1| transmembrane protein (1191) 3076 685.0 5.8e-194 gi|74753330|sp|Q9UHN6.1|TMEM2_HUMAN RecName: Full= (1383) 3076 685.1 6.5e-194 gi|149633515|ref|XP_001505568.1| PREDICTED: simila (1339) 3072 684.2 1.2e-193 gi|73946811|ref|XP_541287.2| PREDICTED: similar to (1430) 3072 684.2 1.2e-193 gi|119922708|ref|XP_593521.3| PREDICTED: similar t (1383) 3069 683.5 1.9e-193 gi|49901411|gb|AAH76570.1| Transmembrane protein 2 (1383) 3057 680.9 1.2e-192 gi|81882895|sp|Q5FWI3.1|TMEM2_MOUSE RecName: Full= (1383) 3057 680.9 1.2e-192 gi|210118133|gb|EEA65866.1| hypothetical protein B (1088) 2923 651.4 6.9e-184 gi|210084178|gb|EEA32719.1| hypothetical protein B (1081) 2857 636.9 1.6e-179 gi|187957096|gb|AAI40774.1| TMEM2 protein [Homo sa (1320) 2846 634.6 9.8e-179 gi|210091990|gb|EEA40227.1| hypothetical protein B (1098) 2817 628.2 7e-177 gi|56541186|gb|AAH86772.1| 9930013L23Rik protein [ ( 423) 2771 617.7 3.7e-174 gi|210113701|gb|EEA61467.1| hypothetical protein B (1537) 2753 614.2 1.5e-172 gi|47215301|emb|CAG01606.1| unnamed protein produc (1530) 2739 611.2 1.3e-171 gi|210113710|gb|EEA61476.1| hypothetical protein B ( 803) 2678 597.5 8.4e-168 gi|210113702|gb|EEA61468.1| hypothetical protein B (1140) 2665 594.8 7.9e-167 gi|210101022|gb|EEA49092.1| hypothetical protein B (1233) 2657 593.1 2.8e-166 gi|210131902|gb|EEA79569.1| hypothetical protein B ( 783) 2640 589.2 2.7e-165 gi|34784936|gb|AAH56981.1| 9930013L23Rik protein [ ( 346) 2229 498.7 2e-138 gi|22761412|dbj|BAC11574.1| unnamed protein produc ( 745) 2031 455.5 4.4e-125 gi|18043951|gb|AAH19745.1| Tmem2 protein [Mus musc ( 741) 2029 455.1 5.9e-125 gi|210094112|gb|EEA42301.1| hypothetical protein B ( 507) 1785 401.4 5.8e-109 gi|148709644|gb|EDL41590.1| transmembrane protein (1371) 1691 381.1 2e-102 gi|210125454|gb|EEA73145.1| hypothetical protein B (1473) 1682 379.2 8.3e-102 gi|148841200|sp|A3KPQ7.1|TMEM2_DANRE RecName: Full (1378) 1672 377.0 3.6e-101 gi|149062586|gb|EDM13009.1| transmembrane protein (1371) 1670 376.5 4.9e-101 gi|210107262|gb|EEA55208.1| hypothetical protein B (1212) 1659 374.1 2.4e-100 gi|210106712|gb|EEA54682.1| hypothetical protein B (1279) 1648 371.7 1.3e-99 gi|210118202|gb|EEA65935.1| hypothetical protein B (1159) 1640 369.9 4.1e-99 gi|109111800|ref|XP_001091678.1| PREDICTED: simila (1350) 1480 334.8 1.7e-88 gi|60474731|gb|EAL72668.1| transmembrane protein [ (1032) 1471 332.8 5.5e-88 gi|210089796|gb|EEA38092.1| hypothetical protein B ( 689) 1467 331.8 7.4e-88 gi|148674915|gb|EDL06862.1| mCG144578 [Mus musculu ( 694) 1437 325.2 7.2e-86 gi|60465671|gb|EAL63750.1| hypothetical protein DD (1099) 1408 319.0 8.4e-84 gi|210113643|gb|EEA61409.1| hypothetical protein B (1031) 1393 315.6 7.8e-83 gi|210113712|gb|EEA61478.1| hypothetical protein B ( 418) 1376 311.6 5.2e-82 gi|210092010|gb|EEA40247.1| hypothetical protein B (1289) 1374 311.6 1.7e-81 gi|149057438|gb|EDM08761.1| rCG24625 [Rattus norve ( 206) 1251 283.9 5.5e-74 gi|210105968|gb|EEA53970.1| hypothetical protein B ( 665) 1243 282.6 4.5e-73 gi|210105966|gb|EEA53968.1| hypothetical protein B (1214) 1244 283.0 6.2e-73 gi|210113646|gb|EEA61412.1| hypothetical protein B (1220) 1226 279.1 9.6e-72 gi|210113652|gb|EEA61418.1| hypothetical protein B (1162) 1204 274.2 2.6e-70 gi|210118203|gb|EEA65936.1| hypothetical protein B (1213) 1198 272.9 6.7e-70 gi|210118201|gb|EEA65934.1| hypothetical protein B (1461) 1181 269.2 1e-68 gi|210096918|gb|EEA45054.1| hypothetical protein B (1155) 1095 250.3 4.1e-63 gi|210107407|gb|EEA55347.1| hypothetical protein B (1030) 1086 248.3 1.5e-62 gi|210113645|gb|EEA61411.1| hypothetical protein B (1074) 1080 247.0 3.8e-62 >>gi|149057439|gb|EDM08762.1| rCG24762 [Rattus norvegicu (1159 aa) initn: 5324 init1: 5324 opt: 5324 Z-score: 6304.7 bits: 1178.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 5324; 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