# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg00908.fasta.huge -Q ../query/KIAA1194.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1194, 575 aa vs ./tmplib.24314 library 1986930 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4363+/-0.00435; mu= 16.2774+/- 0.297 mean_var=89.4099+/-22.504, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.135638 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 219 53.5 7.4e-08 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 217 53.5 1.5e-07 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 210 52.0 3.3e-07 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 204 50.4 4.6e-07 KIAA1674 ( 538 res) fg03838 ( 538) 197 49.0 1.1e-06 KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 ( 793) 179 45.7 1.6e-05 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 172 44.4 4.6e-05 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 166 42.9 7.5e-05 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 170 44.2 7.8e-05 KIAA0759 ( 673 res) hk04621 ( 673) 161 42.1 0.00017 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 160 42.0 0.00022 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 156 41.5 0.00052 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 146 39.2 0.0015 KIAA1185 ( 403 res) hg02311a ( 403) 139 37.5 0.0025 KIAA0975 ( 1528 res) hj06890 (1528) 141 38.6 0.0042 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 135 37.5 0.0099 >>KIAA1437 ( 811 res) hk07206 (811 aa) initn: 430 init1: 200 opt: 219 Z-score: 233.0 bits: 53.5 E(): 7.4e-08 Smith-Waterman score: 219; 38.095% identity (70.476% similar) in 105 aa overlap (57-161:674-778) 30 40 50 60 70 80 KIAA11 PDPRRMYTIMSSEEAANGKKSHWAELEISGKVRSLSASLWSLTHLTALHLSDNSLSRIPS :.... ..:. .: : :: :.:. .:. 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