# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh05667.fasta.huge -Q ../query/KIAA1156.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1156, 348 aa vs ./tmplib.24314 library 1987157 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9937+/-0.00542; mu= 5.6978+/- 0.367 mean_var=109.7724+/-26.916, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 48 in 1/39 Lambda= 0.122413 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 2197 398.9 6e-112 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 1722 315.1 1.1e-86 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 1367 252.4 8.3e-68 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 1035 193.7 3.3e-50 KIAA0769 ( 746 res) hk05035 ( 746) 170 40.8 0.00027 >>KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061 aa) initn: 2184 init1: 2184 opt: 2197 Z-score: 2101.6 bits: 398.9 E(): 6e-112 Smith-Waterman score: 2197; 98.266% identity (98.844% similar) in 346 aa overlap (3-348:120-465) 10 20 30 KIAA11 TCDCVRIQAMSKEIGLQMHEELLKVTNELYTV : .:. :::::::::::::::::::::: KIAA04 HQTRRESRDHATLNDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTV 90 100 110 120 130 140 40 50 60 70 80 90 KIAA11 MKTYHMYHAESISAESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA04 MKTYHMYHAESISAESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKE 150 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 150 KIAA11 KRQAKYSENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA04 KRQAKYSENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRT 210 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 210 KIAA11 YLSAEYNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA04 YLSAEYNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVC 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 270 KIAA11 QVSAQQPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA04 QVSAQQPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQ 330 340 350 360 370 380 280 290 300 310 320 330 KIAA11 HSRSTESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA04 HSRSTESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLL 390 400 410 420 430 440 340 KIAA11 KQTLGEGERAECGTTR :::::::::::::::: KIAA04 KQTLGEGERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQ 450 460 470 480 490 500 >>KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051 aa) initn: 1716 init1: 1426 opt: 1722 Z-score: 1648.3 bits: 315.1 E(): 1.1e-86 Smith-Waterman score: 1722; 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