# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05505s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1112.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1112, 694 aa vs ./tmplib.24314 library 1986811 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5464+/-0.0061; mu= 15.0327+/- 0.415 mean_var=146.1964+/-36.808, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.106073 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0424 ( 567 res) hh01267 ( 567) 2045 324.7 1.5e-89 KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621) 640 110.3 1.4e-24 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 402 73.5 8.7e-14 KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055) 386 71.2 5.6e-13 KIAA0362 ( 1108 res) hh00083 (1108) 361 67.4 8.2e-12 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 355 66.7 2e-11 KIAA0294 ( 1405 res) hf00223s1 (1405) 274 54.2 9.6e-08 KIAA1362 ( 699 res) fj02381 ( 699) 258 51.3 3.5e-07 KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609) 250 50.6 1.3e-06 KIAA1010 ( 1315 res) hj05262(revised) (1315) 241 49.1 3e-06 KIAA2016 ( 1715 res) pf04366 (1715) 223 46.5 2.4e-05 KIAA0382 ( 1443 res) ef00443 (1443) 216 45.3 4.6e-05 KIAA0861 ( 982 res) hk06521 ( 982) 213 44.7 5e-05 KIAA0380 ( 1539 res) hh00518 (1539) 203 43.4 0.00019 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 204 43.9 0.00023 KIAA1909 ( 1287 res) ff10210 (1287) 177 39.3 0.0027 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 164 37.1 0.0089 >>KIAA0424 ( 567 res) hh01267 (567 aa) initn: 2052 init1: 1674 opt: 2045 Z-score: 1699.8 bits: 324.7 E(): 1.5e-89 Smith-Waterman score: 2045; 58.157% identity (80.422% similar) in 521 aa overlap (181-692:23-541) 160 170 180 190 200 210 KIAA11 PTGLNHMGWPEHTPGTAMPDGALDTAVCADEVGSEEDLYDDLHSSSHHYSHPGGGGEQLA :.:.:.. . : ...... : . . KIAA04 AVANSRFDFIPRATEKKKKSQTETGKERERTSFLTQGGKRFELQHGLAV-IC 10 20 30 40 50 220 230 240 250 260 270 KIAA11 INELISDGSVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPAS .. ::. :.: :::.:::::: ..::.:::::::.:.::.:..::::.. : ::::::: KIAA04 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS 60 70 80 90 100 110 280 290 300 310 320 KIAA11 FVRLRVNQDE-----PAD-DDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYI :::: :::.. :.: ... : :: : :. .::::.::::::.:::: :: KIAA04 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQN-RDQMRANVINEIMSTERHYI 120 130 140 150 160 170 330 340 350 360 370 380 KIAA11 KHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSE :::.::::::..::::: ::::.:::..:::::::::: : .::. ::...: . ::::: KIAA04 KHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSE 180 190 200 210 220 230 390 400 410 420 430 440 KIAA11 LGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFL .: :::::: : ::::::::: .::.:::.: : :.: .:::::::::.::::..:::: KIAA04 IGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFL 240 250 260 270 280 290 450 460 470 480 490 500 KIAA11 LTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQ ::::::::::::::::::::: .: :.. : ::: .:.::.: :::::::::::::::: KIAA04 LTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQ 300 310 320 330 340 350 510 520 530 540 550 560 KIAA11 WQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDV ::.:. ::::::.: :::::::.::.. . :: ...:::.:::::::.. :::::.:::. KIAA04 WQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDI 360 370 380 390 400 410 570 580 590 600 610 620 KIAA11 LYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKA ::::::.::: ::::.:::.: :..::.::::.:: : . ::. ..: :.: :::.: KIAA04 LYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRA 420 430 440 450 460 470 630 640 650 660 670 680 KIAA11 FAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASK---QQVTGKPKGRRTAAPPPRLPGPYPA : .::..:: :.. :: :.: :..:: ... : :. ... .. . :::. : . KIAA04 FREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQ 480 490 500 510 520 530 690 KIAA11 DIIPFSEPQSQAS ..: . ::: KIAA04 YLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK 540 550 560 >>KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621 aa) initn: 683 init1: 314 opt: 640 Z-score: 533.0 bits: 110.3 E(): 1.4e-24 Smith-Waterman score: 755; 36.386% identity (62.129% similar) in 404 aa overlap (301-672:2-401) 280 290 300 310 320 KIAA11 FVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMRTN--VINEILSTERDYIKHLR :. :. :.: :.::::.:::::. :: KIAA14 AARESERQLRLRLCVLNEILGTERDYVGTLR 10 20 30 330 340 350 360 370 380 KIAA11 DICEGYVRQCRKR-ADM----FSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLS . ..... :. :: ..::.....:.::::: . .: :. ::: .. : KIAA14 FLQSAFLHRIRQNVADSVEKGLTEENVKVLFSNIEDILEVHKDFLAALEYCLHPEPQSQH 40 50 60 70 80 90 390 400 410 420 430 440 KIAA11 ELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLL--QKMIDISLD ::: ::. . : .: :::.:: .: : .:.:. :. .: :: .: :: :. KIAA14 ELGNVFLKFKDKFCVYEEYCSNHEKALRLLVELNKIPTVRAFLLSCMLLGGRKTTDIPLE 100 110 120 130 140 150 450 460 470 480 490 500 KIAA11 GFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDK :.::.:.:.:::::: : :: : : .: : :..::.:::.: . ::: ::..:... KIAA14 GYLLSPIQRICKYPLLLKELAKRTPGKHPDHPAVQSALQAMKTVCSNINETKRQMEKLEA 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 KIAA11 IAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYCK----- . : :: :: ::: .: ..:. .: : ... .. :.: :::::. :.::: KIAA14 LEQLQSHIEGWEGSNLTDICTQLLLQGTLLKISA--GNIQERAFFLFDNLLVYCKRKSRV 220 230 240 250 260 560 570 580 590 600 KIAA11 ---KDLLRRD-----VLY-YKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLH---VSIKNAFRLHRGAT : .: :: ..::.. . .:: ..::: : : .. :....: : KIAA14 TGSKKSTKRTKSINGSLYIFRGRINTEVMEVENVEDGTA-DYHSNGYTVTNGWKIHNTAK 270 280 290 300 310 320 610 620 630 640 650 KIAA11 GDSHLLCTRKP-EQKQRWLKAFAREREQVQ-----LDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQ .. ..: : :.::.:: :. ::::: . ..... :.: .: . .:. KIAA14 -NKWFVCMAKTAEEKQKWLDAIIREREQRESLKLGMERDAYVMIAEKGEKLYHMMMNKKV 330 340 350 360 370 380 660 670 680 690 KIAA11 VTGKPKGRRTAAPPPRLPGPYPADIIPFSEPQSQAS : . :. .. : KIAA14 NLIKDRRRKLSTVPKCFLGNEFVAWLLEIGEISKTEEGVNLGQALLENGIIHHVSDKHQF 390 400 410 420 430 440 >>KIAA0142 ( 802 res) ha01169 (802 aa) initn: 303 init1: 131 opt: 402 Z-score: 339.4 bits: 73.5 E(): 8.7e-14 Smith-Waterman score: 511; 23.827% identity (57.411% similar) in 533 aa overlap (171-691:114-624) 150 160 170 180 190 KIAA11 RRSHPLSQSAPTGLNHMGWPEHTPGTAMPDGALDTAVCADEVGSEEDLYDDLHSSS-HHY : . .::: . . .:.: :.: : KIAA01 TFDANDLYQGQNFNKVLSSLVTLNKVTADIGLGSDSVCARPSSHRIKSFDSLGSQSLHTR 90 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 KIAA11 SHPGGGGEQLAINELISDGSVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIEVMDATNREWWWGR . :. ... .... . ..: .. ...::.:. ::::.: . . :: : KIAA01 TSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGT 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 KIAA11 VADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINEILST . ::::...:: ...:. .: .:. . : .. . . .. . :...:: : KIAA01 LNGRTGWFPSNYVREVKASEKPV---SPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILET 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 KIAA11 ERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRER : .: :.:. . :.: . .. .: .. ..::.:.: :. .:..::. . KIAA01 ENEYSKELQTVLSTYLRPL-QTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEE--CTKL 270 280 290 300 310 380 390 400 410 420 430 KIAA11 PHLSE-LGACFLEHQADFQ-IYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMID :. .. .:.:::. . ... .: :: :::.: .. ::. :. . : . .. KIAA01 PEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSA---VNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGI 320 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 KIAA11 ISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNV-AQLINERKRRL . : : : ... ::: : :: .. . : : .:.. .. :.::. :: . :::. KIAA01 LVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKE 380 390 400 410 420 430 500 510 520 530 540 550 KIAA11 ENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYCK ... ... .:..:::.:. . .. .: : . . . :.. :...:: . :.. . KIAA01 LELQILTE---AIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNE-RYLLLFPNVLLMLS 440 450 460 470 480 490 560 570 580 590 600 610 KIAA11 KDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPE . : . . :.:.: :. .. :::.... .:::.. :. . :. . . KIAA01 ASP-RMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENH------RNAFEIS-GSMIERILVSCNNQQ 500 510 520 530 540 620 630 640 650 660 670 KIAA11 QKQRWLKAFAREREQVQLDQET--GFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKGRRTAA---P . :.:.. . .. . ... . : :. . .. :.... .:: : : KIAA01 DLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLP 550 560 570 580 590 600 680 690 KIAA11 PPRLPGPYPADII---PFSEPQSQAS : : : : :. :.. KIAA01 HPSHHGT-PHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKL 610 620 630 640 650 660 >>KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055 aa) initn: 352 init1: 164 opt: 386 Z-score: 324.9 bits: 71.2 E(): 5.6e-13 Smith-Waterman score: 397; 26.741% identity (57.939% similar) in 359 aa overlap (281-622:501-845) 260 270 280 290 300 KIAA11 TNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADD-DAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMR ::.. ..:: . .. ::: . . . . KIAA07 PGLSTKSPQPSPSSRKSPLSLSPAFQVPLGPAEQGSSPLLSPVLSDAGGAGMDCEEPRHK 480 490 500 510 520 530 310 320 330 340 350 360 KIAA11 TN-------VINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYR ...:::.::: :.: : .. . :. . : . . .:.::. ::. KIAA07 RVPADEAYFIVKEILATERTYLKDL-EVITVWFRSAVVKEDAMPATLMTLLFSNIDPIYE 540 550 560 570 580 370 380 390 400 410 KIAA11 CQKAFVKALEQRFNR-ERP---HLS----ELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELS ...:.. .:::. : : : . ..: .:... ... .. : . : .. .:: KIAA07 FHRGFLREVEQRLALWEGPSKAHTKGSHQRIGDILLRNMRQLKEFTSYFQRHDEVLTELE 590 600 610 620 630 640 420 430 440 450 460 470 KIAA11 RLTKLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKD . :: : . :::. . :. ::: :.:.. .: : : .: . : :.:. : KIAA07 KATKRCKKLEAVYKEFELQKVCYLPLNTFLLKPIQRLLHYRLLLRRLCGHYSPGHHDYAD 650 660 670 680 690 700 480 490 500 510 520 530 KIAA11 VEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEG-EDLLVRSSELIYSGELTRV . ::.:. .:. ... ::::..:... : .: : :.:.. . :.: : : .. KIAA07 CHDALKAITEVTTTLQHILIRLENLQKLTELQ---RDLVGIENLIAPGREFIREGCLHKL 710 720 730 740 750 760 540 550 560 570 580 590 KIAA11 TQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSI :. ::::::::. .:.: .: . . . .: : ..:. : .. : . :. KIAA07 TKKGL--QQRMFFLFSDMLLYTSKGVAGTSHFRIRGLLPLQGMLV------EESDNEWSV 770 780 790 800 810 600 610 620 630 640 650 KIAA11 KNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLN . : .. :. . .. . .:..:. KIAA07 PHCFTIY--AAQKTIVVAASTRLEKEKWMLDLNSAIQAAKSGGDTAPALPGRTVCTRPPR 820 830 840 850 860 870 >>KIAA0362 ( 1108 res) hh00083 (1108 aa) initn: 391 init1: 112 opt: 361 Z-score: 304.0 bits: 67.4 E(): 8.2e-12 Smith-Waterman score: 378; 26.379% identity (57.314% similar) in 417 aa overlap (297-692:634-1023) 270 280 290 300 310 320 KIAA11 FPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDGGA-EAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIK :.: : . : .: .:..:.:.::: :.. KIAA03 SENSSSEGGALRRGPYRRAKSEMSESRQGRGSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVE 610 620 630 640 650 660 330 340 350 360 370 KIAA11 HLRDICEGYVRQCRK--RADMFS---EEQLRTIFGNIEDIYRCQ-KAFVKALEQRFNRER .: . :::. . . : ..: ... ..:::.:.::. . . :.. ::. . KIAA03 ELLCVLEGYAAEMDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENY--TDC 670 680 690 700 710 720 380 390 400 410 420 430 KIAA11 PHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMID-- :.: .: ::::.. ::::: .::.:.: . : . . ::. : :. .: KIAA03 PEL--VGRCFLERMEDFQIYEKYCQNKPRS----ESLWRQCSDCPFFQEC---QRKLDHK 730 740 750 760 770 440 450 460 470 480 490 KIAA11 ISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLE .:::..:: :::.: :: : : :.:::.. . . .:.. :: .. .. . .:. . . KIAA03 LSLDSYLLKPVQRITKYQLLLKEMLKYSR-NCEGAEDLQEALSSILGILKAVNDSMHLI- 780 790 800 810 820 830 500 510 520 530 540 550 KIAA11 NIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGEL---TRVTQ-PQAKSQQRMFFLFDHQLI :. ..... : :. ::...: ... . :.: . . : .:: .:: .. .. KIAA03 ---AITGYDGNLGDL-GK-LLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVL 840 850 860 870 880 560 570 580 590 600 KIAA11 YCKK-----DLLRRDVLY-YKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDS .::: . .. : :: :.: .. ... : . :.. .: . KIAA03 FCKKREENGEGYEKAPSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKK--------FEIWYNAREEV 890 900 910 920 930 610 620 630 640 650 660 KIAA11 HLLCTRKPEQKQRWLKAFARE-REQVQLDQETGFSITELQRKQAM-LNASKQQVTGKPKG ... . :: : :.. . . :.: .:.. . :...:.. : : . .. .. KIAA03 YIVQAPTPEIKAAWVNEIRKVLTSQLQACREAS-QHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNS 940 950 960 970 980 990 670 680 690 KIAA11 RRTAAPPPRLPGPYPADIIPFSEPQSQAS : : : . : : .. KIAA03 RNIKKLEERKTDPLSLEGYVSSAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINS 1000 1010 1020 1030 1040 1050 >>KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676 aa) initn: 497 init1: 132 opt: 355 Z-score: 297.1 bits: 66.7 E(): 2e-11 Smith-Waterman score: 355; 25.000% identity (59.770% similar) in 348 aa overlap (221-553:1108-1439) 200 210 220 230 240 KIAA11 DLHSSSHHYSHPGGGGEQLAINELISDGSVVCAE-ALWDHVTMDDQELGFKAGDVIEVMD :: :..:... ...::.:. :..:.::. KIAA12 GKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMN 1080 1090 1100 1110 1120 1130 250 260 270 280 290 300 KIAA11 ATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMR . .:: :.. : ::...:.. ...: :... :. .... .. : KIAA12 KDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSD-PSQQWC-------ADLQTLDTMQPIERKR 1140 1150 1160 1170 1180 310 320 330 340 350 360 KIAA11 TNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMF-SEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFV . :.:...::. :. :. . : : : : . : .: .. :: : ... . .. KIAA12 QGYIHELIQTEERYMADLQLVVE--VFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLL 1190 1200 1210 1220 1230 1240 370 380 390 400 410 420 KIAA11 KALE--QRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLT-KLSKYVYF :::. .. . :. .. .: . . . .: : ..:. . :. . :.. : . . . : KIAA12 KALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEF 1250 1260 1270 1280 1290 1300 430 440 450 460 470 480 KIAA11 FEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNV .. . . :..::: :.:.: .::: . .:. : .: : .... ::. ... KIAA12 LKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEEL 1310 1320 1330 1340 1350 1360 490 500 510 520 530 KIAA11 AQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEG--EDLLVRS-------SELIYSGELTRVTQP . .:: :. :: :.. :. .. :: :.:. : .:..::.: . KIAA12 CSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQC-EGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYK---- 1370 1380 1390 1400 1410 1420 540 550 560 570 580 590 KIAA11 QAKSQQRMF-FLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKN .::.... :::. :. KIAA12 -TKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKL 1430 1440 1450 1460 1470 1480 >>KIAA0294 ( 1405 res) hf00223s1 (1405 aa) initn: 141 init1: 141 opt: 274 Z-score: 230.9 bits: 54.2 E(): 9.6e-08 Smith-Waterman score: 274; 24.719% identity (60.674% similar) in 267 aa overlap (300-555:449-711) 270 280 290 300 310 320 KIAA11 SFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRD :. :... .: ... ....:..:. :. KIAA02 QDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKR 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 KIAA11 ICEGYVRQCRK-RADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGAC : : : . . . ..::..:.:.: ...: .:.. : :: .: . : . .: KIAA02 ILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVS-EWDSVEMIGDV 480 490 500 510 520 530 390 400 410 420 430 440 KIAA11 FLEHQADFQI---YSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMID--ISLDGF :. . .. :::: :: .: . :.. : .: . :.: . :. .: .. KIAA02 FVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKK-TCATKPA-FLEFLKQEQEASPDRTTLYSL 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 490 500 KIAA11 LLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIA .. :.:.. .. : : ..:: : : : .. :: ....:. .::::: .. .. KIAA02 MMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEVK 600 610 620 630 640 650 510 520 530 540 550 KIAA11 QWQSSIEDWEGEDLLVRSSE-LIYSGELTRVTQPQ----AKSQQRMFFLFDHQLIYCKKD : ..:.. . :: .:. :: : .. ... . .:...: :... ....: KIAA02 QIAKAINERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLN-DVLMCATV 660 670 680 690 700 710 560 570 580 590 600 610 KIAA11 LLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQK KIAA02 SSRPSHDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAK 720 730 740 750 760 770 >>KIAA1362 ( 699 res) fj02381 (699 aa) initn: 166 init1: 122 opt: 258 Z-score: 220.9 bits: 51.3 E(): 3.5e-07 Smith-Waterman score: 268; 22.454% identity (56.919% similar) in 383 aa overlap (263-631:158-516) 240 250 260 270 280 290 KIAA11 DDQELGFKAGDVIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNS : : .:.. .. ..:: ::. ... KIAA13 PYEAPDGQLQLGPRHQHSSSGASQEEQNDLGLGDLPSDEEEIINSSDE---DDVSSESSK 130 140 150 160 170 180 300 310 320 330 340 KIAA11 GAEDGGAEAQSSKDQMRTNV---INEILSTER---DYIKHL----RDICEGYVRQCRKRA : : . :. . :...: .::.:.:. : .: : :: :: : KIAA13 GEPDPLEDKQDEDNGMKSKVHHIAKEIMSSEKVFVDVLKLLHIDFRDAVAHASRQLGK-- 190 200 210 220 230 240 350 360 370 380 390 400 KIAA11 DMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNR--ERPHLSELGACFLEHQADFQIYS .. .. : :. . ..:. .. ..: ::.:. . :. ..... :... ...:: KIAA13 PVIEDRILNQILYYLPQLYELNRDLLKELEERMLHWTEQQRIADI---FVKKGPYLKMYS 250 260 270 280 290 410 420 430 440 450 KIAA11 EYCNNHPNACVELSRLTKLSK-YVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLA : .. . . :.. : . .. . .. ...: .:: :::.: .: : :. KIAA13 TYIKEFDKNIALLDEQCKKNPGFAAVVREFEMSPCCANLALKHYLLKPVQRIPQYRLLLT 300 310 320 330 340 350 460 470 480 490 500 510 KIAA11 ELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLV . :: . :..:.. :: .. .::. :. .. .:..:. : : :. .:. .: KIAA13 DYLKNLIEDAGDYRDTQDALAVVIEVANHANDTMKQGDNFQKLMQIQYSL---NGHHEIV 360 370 380 390 400 410 520 530 540 550 560 570 KIAA11 RSSELIYS-GELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEV . .... . : : .... : ::::::. :.: .. . .. :.. :..: KIAA13 QPGRVFLKEGILMKLSRKVM--QPRMFFLFNDALLYTTP--VQSGMYKLNNMLSLAGMKV 420 430 440 450 460 470 580 590 600 610 620 630 KIAA11 VDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQET . . . .: .... .. : .: . . ....::.:..: :. KIAA13 -------RKPTQEAYQNELKIE--SVERSFILSASSATERDEWLEAISRAIEEYAKKRIT 480 490 500 510 520 640 650 660 670 680 690 KIAA11 GFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKGRRTAAPPPRLPGPYPADIIPFSEPQSQAS KIAA13 FCPSRSLDEADSENKEEVSPLGSKAPIWIPDTRATMCMICTSEFTLTWRRHHCRACGKIV 530 540 550 560 570 580 >>KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609 aa) initn: 272 init1: 130 opt: 250 Z-score: 210.5 bits: 50.6 E(): 1.3e-06 Smith-Waterman score: 250; 26.899% identity (55.063% similar) in 316 aa overlap (268-565:570-878) 240 250 260 270 280 290 KIAA11 GFKAGDVIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDG :... : . :. : :. . : KIAA03 AHPTLQAPSLEDVTKQYMLNLHSGEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPT 540 550 560 570 580 590 300 310 320 330 340 350 KIAA11 GAEAQSSKDQ--MRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRAD--MFSEEQLRTI : :: : :: .: .:.::..:.. :: . .::.. .. . . . . : KIAA03 PASKCCSKPQVDMRKHVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEI 600 610 620 630 640 650 360 370 380 390 400 KIAA11 FGNIEDIYRCQKAFVKALEQ-RFNRERPHLSE-LGACFLEH-QADF--QIYSEYCNNHPN : .: .. . .. : ::: : . : .. .:: ... . : .::: : .: : KIAA03 FDQIPELLEHHEQF---LEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLN 660 670 680 690 700 710 410 420 430 440 450 460 KIAA11 ACVELSRLTKLSK--YVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTH : . :..: .. .. :.: .: . .:. ... :::.: .: : . .:::.: KIAA03 AK-DAVRVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQ-ALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTP 720 730 740 750 760 770 470 480 490 500 510 520 KIAA11 PQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIE-DWEG-EDLLVRSSEL .: : . : . .:.::. ::. : :. .. :. . :: :: ::: . .. KIAA03 EDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRF 780 790 800 810 820 830 530 540 550 560 570 KIAA11 IYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYC-----KKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVV . . . .: .:... .:.. : :: : :. :::. . KIAA03 LRQEMVIEVKAIGGKKDRSLFLFTD--LIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASK 840 850 860 870 880 890 580 590 600 610 620 630 KIAA11 DLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETG KIAA03 YKMLWKLPLEDADIIKGASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDD 900 910 920 930 940 950 >>KIAA1010 ( 1315 res) hj05262(revised) (1315 aa) initn: 232 init1: 149 opt: 241 Z-score: 203.9 bits: 49.1 E(): 3e-06 Smith-Waterman score: 270; 29.565% identity (60.000% similar) in 230 aa overlap (294-511:505-721) 270 280 290 300 310 320 KIAA11 EGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQM---RTNVINEILSTE : .:.. :.. ...: :..::.:.:.:: KIAA10 FCESNIESLNMELQQLREMTLLSSQSSSLVAPSGSVSAENPEQRMLEKRAKVIEELLQTE 480 490 500 510 520 530 330 340 350 360 370 380 KIAA11 RDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRERP ::::. : ..: . ..:.. . ... .:::.. . . .: .. ::: KIAA10 RDYIRDL-EMCIERIMVPMQQAQV-PNIDFEGLFGNMQMVIKVSKQLLAALEIS------ 540 550 560 570 580 390 400 410 420 430 KIAA11 HLSELGACFLEHQADFQ-IYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYV-YFFEACRLLQKMID- . .: :: :. ... :. ::.:: .: . : : : .. .. :... . KIAA10 --DAVGPVFLGHRDELEGTYKIYCQNHDEAIALLEIYEKDEKIQKHLQDSLADLKSLYNE 590 600 610 620 630 640 440 450 460 470 480 490 KIAA11 ------ISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINE :.: .::. :::.. .::: : :::. : .: : . :. :.:.. ::: KIAA10 WGCTNYINLGSFLIKPVQRVMRYPLLLMELLNSTPESHPDKVPLTNAVLAVKEINVNINE 650 660 670 680 690 700 500 510 520 530 540 550 KIAA11 RKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQ ::: : . ..... :: KIAA10 YKRRK---DLVLKYRKGDEDSLMEKISKLNIHSIIKKSNRVSSHLKHLTGFAPQIKDEVF 710 720 730 740 750 760 694 residues in 1 query sequences 1986811 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:09:37 2008 done: Thu Dec 18 15:09:37 2008 Total Scan time: 0.530 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]