# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh18956.fasta.huge -Q ../query/KIAA1093.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1093, 1727 aa vs ./tmplib.24314 library 1985778 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4745+/-0.00925; mu= -16.8092+/- 0.623 mean_var=495.2007+/-118.368, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.057635 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1460 ( 1400 res) fh17570 (1400) 1968 179.6 4.4e-45 KIAA1582 ( 1740 res) fj05982s1 (1740) 1058 104.0 3.1e-22 >>KIAA1460 ( 1400 res) fh17570 (1400 aa) initn: 1958 init1: 568 opt: 1968 Z-score: 901.3 bits: 179.6 E(): 4.4e-45 Smith-Waterman score: 2983; 38.889% identity (63.512% similar) in 1458 aa overlap (480-1727:4-1400) 450 460 470 480 490 500 KIAA10 NNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTS :.:.. :: :. : .:....:: :: .: KIAA14 IRVNTNKG-GGVWESGAANSQSTSWGSGNGANS 10 20 30 510 520 530 540 550 KIAA10 GVSQGEWKQP---TGSDELKIGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQKGHP------LPENQGNA- : :. : : ::.. .. ::. :.. .:. .: : : :.::.: KIAA14 GGSRRGWGTPAQNTGTNLPSV-EWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSAT 40 50 60 70 80 90 560 570 580 590 600 610 KIAA10 -----QAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLL :. :....... :. . .::: .. :...:.. ::. : ...::... 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KIAA15 NRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLKPGPQQN--------WASK----- 680 690 700 710 720 830 840 850 860 870 880 KIAA10 PPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDE-EPSGWEEPSPQSI :: . ..::: ..:. ....: .:: :. :: : .::::::: :: KIAA15 -------PQDNNVSNWGGA-----ASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSI 730 740 750 760 890 900 910 KIAA10 SRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKN------------------------------ :::.:::::::::::..:: :.::.::.: KIAA15 RRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETP 770 780 790 800 810 820 920 930 KIAA10 ---------------------SQG-GPAPR----------EPNLPT------------PM :.: : : ::. :. : KIAA15 PPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPP 830 840 850 860 870 880 940 950 960 KIAA10 TSKSA-SD-------------------------SKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEE .: :. .: :::::.::: : : . .::.:: KIAA15 SSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWG-SGGDEMNLSTSQWEDEE 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA10 DGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLK--GGNNDSW-MNPLAKQFSNMGLLS : :::...:: :.:: .:::.. :: .. ..: : ....: :. : ::...::. 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