# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk03719s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1016.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1016, 793 aa vs ./tmplib.24314 library 1986712 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0670+/-0.00769; mu= 8.2555+/- 0.523 mean_var=238.5025+/-56.717, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.083048 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1495 ( 502 res) fj08986 ( 502) 631 88.8 1.5e-18 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 296 48.7 2e-06 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 299 49.6 2.6e-06 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 276 47.0 1.9e-05 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 256 44.1 6.8e-05 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 231 41.4 0.0007 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 217 39.5 0.0017 >>KIAA1495 ( 502 res) fj08986 (502 aa) initn: 990 init1: 556 opt: 631 Z-score: 424.8 bits: 88.8 E(): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 993; 41.036% identity (63.944% similar) in 502 aa overlap (315-752:1-491) 290 300 310 320 330 340 KIAA10 RNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG .:.:....:::..:.::::: :::::: :: KIAA14 VCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG 10 20 30 350 360 370 380 390 KIAA10 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN ::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.:::: KIAA14 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN 40 50 60 70 80 90 400 410 420 430 440 450 KIAA10 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD :.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: : KIAA14 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D 100 110 120 130 140 460 470 480 490 500 510 KIAA10 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ .. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ... 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KIAA12 -LKHIVNHDDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSL 590 600 610 620 630 640 580 590 600 610 620 630 KIAA10 QSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTNSTAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIR ....: .:: .. . . . : .:: .:.:. .: : .. . :: . :: KIAA12 SDEVTHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSL------CSPVKQTH-IDINSKIR 650 660 670 680 690 640 650 660 670 680 690 KIAA10 RKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVP .. :.. . . : : : ..:. ..:.. .: : .:: KIAA12 QEDENFNSLLQNGDILNSSTEEKFKAHDKKDFNLPEYDLNVEERLVLIEKSVDSTATADD 700 710 720 730 740 750 700 710 720 730 740 750 KIAA10 SPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEK KIAA12 THKLDHINMNLNKLITNDTFQPEIMERSKTQDIVLGTSFLSINSKEETEHLENGNKYPNL 760 770 780 790 800 810 >>KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630 aa) initn: 438 init1: 154 opt: 276 Z-score: 189.5 bits: 47.0 E(): 1.9e-05 Smith-Waterman score: 308; 30.962% identity (60.669% similar) in 239 aa overlap (126-362:49-284) 100 110 120 130 140 150 KIAA10 HHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLNRGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTA : : . . . : :.:: .....: . 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