# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj10213.fasta.nr -Q ../query/KIAA0999.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0999, 1371 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7768833 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1408+/-0.000217; mu= 7.5959+/- 0.012 mean_var=176.5339+/-33.673, 0's: 41 Z-trim: 375 B-trim: 184 in 1/67 Lambda= 0.096530 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119907074|ref|XP_582999.3| PREDICTED: similar t (1314) 8385 1181.1 0 gi|194212714|ref|XP_001500846.2| PREDICTED: simila (1251) 8039 1132.9 0 gi|148693729|gb|EDL25676.1| cDNA sequence BC033915 (1235) 4081 581.7 1e-162 gi|51895987|gb|AAH82313.1| BC033915 protein [Mus m ( 643) 3887 554.4 8.8e-155 gi|160333312|ref|NP_081774.3| serine/threonine-pro (1369) 3833 547.2 2.7e-152 gi|126326980|ref|XP_001380863.1| PREDICTED: simila (1414) 3721 531.6 1.4e-147 gi|115502239|sp|Q6P4S6.3|QSK_MOUSE RecName: Full=S (1311) 3563 509.6 5.5e-141 gi|51593589|gb|AAH80688.1| CDNA sequence BC033915 (1311) 3563 509.6 5.5e-141 gi|10433669|dbj|BAB14006.1| unnamed protein produc ( 505) 3470 496.2 2.3e-137 gi|73955104|ref|XP_536563.2| PREDICTED: similar to (1290) 3376 483.6 3.8e-133 gi|148693728|gb|EDL25675.1| cDNA sequence BC033915 (1163) 3365 482.0 1e-132 gi|118101966|ref|XP_417903.2| PREDICTED: similar t (1345) 3222 462.1 1.1e-126 gi|12857215|dbj|BAB30934.1| unnamed protein produc ( 487) 3203 459.0 3.4e-126 gi|183986056|gb|AAI66518.1| Unknown (protein for I ( 552) 3198 458.4 6.1e-126 gi|47213574|emb|CAF95556.1| unnamed protein produc (1252) 3000 431.2 2.1e-117 gi|149566787|ref|XP_001517352.1| PREDICTED: simila (1230) 2747 395.9 8.5e-107 gi|193783772|dbj|BAG53754.1| unnamed protein produ ( 620) 2688 387.4 1.6e-104 gi|149041552|gb|EDL95393.1| rCG57885 [Rattus norve ( 956) 2307 334.6 2e-88 gi|82185347|sp|Q6NSM8.1|QSK_DANRE RecName: Full=Se (1187) 2134 310.6 4.2e-81 gi|33989533|gb|AAH56316.1| Zgc:66101 [Danio rerio] (1189) 2130 310.0 6.1e-81 gi|212512715|gb|EEB15434.1| serine/threonine-prote ( 649) 1739 255.3 9.9e-65 gi|210127023|gb|EEA74707.1| hypothetical protein B (1326) 1726 253.8 5.7e-64 gi|210082367|gb|EEA31089.1| hypothetical protein B ( 328) 1633 240.2 1.7e-60 gi|210127162|gb|EEA74846.1| hypothetical protein B ( 967) 1606 236.9 4.9e-59 gi|198429125|ref|XP_002121936.1| PREDICTED: simila (1424) 1592 235.2 2.5e-58 gi|73955160|ref|XP_546528.2| PREDICTED: similar to ( 993) 1563 231.0 3.2e-57 gi|59798973|sp|Q9H0K1.1|SN1L2_HUMAN RecName: Full= ( 926) 1558 230.2 4.9e-57 gi|158255902|dbj|BAF83922.1| unnamed protein produ ( 926) 1556 230.0 6e-57 gi|126326660|ref|XP_001371323.1| PREDICTED: hypoth ( 920) 1540 227.7 2.8e-56 gi|59798924|sp|Q5REX1.1|SN1L2_PONAB RecName: Full= ( 925) 1538 227.4 3.4e-56 gi|21708021|gb|AAH33915.1| BC033915 protein [Mus m ( 265) 1525 225.1 5e-56 gi|109484684|ref|XP_001071064.1| PREDICTED: simila ( 914) 1530 226.3 7.3e-56 gi|210101319|gb|EEA49386.1| hypothetical protein B ( 575) 1525 225.4 8.6e-56 gi|157169798|gb|AAI52764.1| SNF1-like kinase 2 [sy ( 931) 1526 225.8 1.1e-55 gi|59798961|sp|Q8CFH6.1|SN1L2_MOUSE RecName: Full= ( 931) 1522 225.2 1.6e-55 gi|75858355|gb|ABA28749.1| salt-inducible kinase 2 ( 920) 1519 224.8 2.1e-55 gi|194212673|ref|XP_001500093.2| PREDICTED: SNF1-l ( 927) 1519 224.8 2.1e-55 gi|190617231|gb|EDV32755.1| GF21982 [Drosophila an (1480) 1488 220.7 5.8e-54 gi|156225216|gb|EDO46035.1| predicted protein [Nem ( 334) 1476 218.4 6.7e-54 gi|119907014|ref|XP_588111.3| PREDICTED: similar t ( 906) 1483 219.8 6.7e-54 gi|194109034|gb|EDW31077.1| GL15126 [Drosophila pe (1366) 1478 219.3 1.5e-53 gi|59798975|sp|Q9IA88.1|SN1L2_CHICK RecName: Full= ( 798) 1473 218.3 1.6e-53 gi|198145529|gb|EAL32413.2| GA18086 [Drosophila ps (1445) 1472 218.5 2.7e-53 gi|7290249|gb|AAF45711.1| CG4290 [Drosophila melan (1398) 1469 218.0 3.5e-53 gi|3702106|emb|CAA21125.1| EG:22E5.8 [Drosophila m (1398) 1469 218.0 3.5e-53 gi|156537169|ref|XP_001603970.1| PREDICTED: simila ( 588) 1461 216.5 4.2e-53 gi|190648263|gb|EDV45556.1| GG12656 [Drosophila er (1421) 1461 216.9 7.7e-53 gi|194187846|gb|EDX01430.1| GE16985 [Drosophila ya (1400) 1457 216.3 1.1e-52 gi|148725484|emb|CAN88249.1| novel protein similar ( 842) 1451 215.3 1.4e-52 gi|193892922|gb|EDV91788.1| GH24405 [Drosophila gr (1622) 1451 215.6 2.2e-52 >>gi|119907074|ref|XP_582999.3| PREDICTED: similar to Se (1314 aa) initn: 7139 init1: 6524 opt: 8385 Z-score: 6316.6 bits: 1181.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 8385; 93.014% identity (97.798% similar) in 1317 aa overlap (56-1371:6-1314) 30 40 50 60 70 80 KIAA09 SGASSSSLAWCGLATGALGAGARGIPELRGAAGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPGSP :.:::::::::.:::::::::::::::: : gi|119 MAAAAASGAGGAAGAGAGGAGPAGRLLPPPAPGPP 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA09 AAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIK :::::: :::: :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 AAPAAVPPAAGPPRPPAPASRGPVPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIK 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 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1370 KIAA09 YPSTCITDILLSYKHPEVSFSMEQAGV ::::::::::::::::::::::::::: gi|119 YPSTCITDILLSYKHPEVSFSMEQAGV 1290 1300 1310 >>gi|194212714|ref|XP_001500846.2| PREDICTED: similar to (1251 aa) initn: 7788 init1: 7788 opt: 8039 Z-score: 6056.4 bits: 1132.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 8039; 95.381% identity (98.217% similar) in 1234 aa overlap (139-1371:19-1251) 110 120 130 140 150 160 KIAA09 MPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMK : ::::::::::::::::::::::::::: gi|194 MVTAAATATTTTTMSELYKPLVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMK 10 20 30 40 170 180 190 200 210 220 KIAA09 MLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: gi|194 MLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVAAVYF 50 60 70 80 90 100 230 240 250 260 270 280 KIAA09 CHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|194 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 NGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESSDGEPDQEA 480 490 500 510 520 530 660 670 680 690 700 710 KIAA09 VQSSTYKDSNTLHLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNSSIKQLQQECEQLQK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: gi|148 VQSSTYKDSNTLHLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNSSSIKQLQQECEQLQK 540 550 560 570 580 590 720 730 740 750 760 770 KIAA09 MYGGQIDERTLEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPSPPLQAACENQPALLTH :::::.::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::: gi|148 MYGGQVDERTLEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQ-------------VACENQPALLTH 600 610 620 630 640 780 790 800 810 820 830 KIAA09 QLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQPHGAASSSQFQGLPSRSAIFQQ :::::::::::::::::.:::::::::::::.::::: :::.: ::::::::..::::: gi|148 QLQRLRIQPSSPPPNHPSNHLFRQPSNSPPPVSSAMITSHGATSPSQFQGLPSHGAIFQQ 650 660 670 680 690 700 840 850 860 870 880 890 KIAA09 QPENCSSPPNVALTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLSNMPGTAAGSSGRGISISPSAG :::::: ::.:::::::.:: .::: 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