# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj10213.fasta.huge -Q ../query/KIAA0999.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0999, 1371 aa vs ./tmplib.23663 library 1986134 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9134+/-0.00979; mu= 4.9584+/- 0.663 mean_var=398.6543+/-93.556, 0's: 0 Z-trim: 45 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.064236 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 1581 161.5 6.3e-40 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 1252 130.9 7.8e-31 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 921 100.2 1.4e-21 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 912 99.5 2.7e-21 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 898 98.1 5.9e-21 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 897 98.0 6.4e-21 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 784 87.4 8.7e-18 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 622 72.4 2.7e-13 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 595 70.1 1.8e-12 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 566 67.1 9.2e-12 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 522 63.6 2.6e-10 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 427 54.2 6.5e-08 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 423 53.9 9.3e-08 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 430 55.5 1.4e-07 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 416 53.4 1.7e-07 KIAA0135 ( 1351 res) ha01203s1 (1351) 421 54.3 1.8e-07 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 403 52.5 5e-07 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 399 52.2 6.9e-07 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 384 50.9 2e-06 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 379 50.2 2.3e-06 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 384 51.1 2.5e-06 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 357 48.1 9.1e-06 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 347 47.3 1.9e-05 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 343 46.9 2.3e-05 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 347 47.6 2.4e-05 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 331 45.6 4.4e-05 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 319 44.8 0.00012 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 316 44.3 0.00013 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 300 42.4 0.00022 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 285 41.6 0.0011 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 285 41.8 0.0012 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 271 40.5 0.0029 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 272 40.7 0.0033 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 267 40.0 0.0034 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 255 38.4 0.0049 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 257 39.0 0.0061 KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 ( 489) 248 37.6 0.0066 >>KIAA0781 ( 950 res) hk09678 (950 aa) initn: 1389 init1: 1321 opt: 1581 Z-score: 808.7 bits: 161.5 E(): 6.3e-40 Smith-Waterman score: 1649; 36.701% identity (58.969% similar) in 970 aa overlap (78-999:8-926) 50 60 70 80 90 100 KIAA09 RGIPELRGAAGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRG :: : : :..:. . : .:: KIAA07 KPSRAANPPARPRSCPPCLAAGPSMVMADGPRHLQRG 10 20 30 110 120 130 140 150 160 KIAA09 PMPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIM :. :.:.:.:. :.::::::::: . : .::..::::::::.::: ::.::.:::::: KIAA07 PV--RVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVNLEKIYREVQIM 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 KIAA09 KMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVY ::: :::::.:::::::. :.:::::::..:::::.:. :::. :.:::::: ::..:: KIAA07 KMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGRLNESEARRKFWQILSAVD 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 KIAA09 FCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGK .:: :.:::::::::::::: :.:::::::::.:.: :.:: ::::::::::::.:::. 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KIAA07 Y---CKEPPRSLEQQLQEHRLQQKRLFLQKQSQLQAYFNQMQIAESSYPQPSQQLPLPRQ 730 740 750 760 770 780 850 860 870 880 890 900 KIAA09 QQPAQSQQVTIQVQEPVDMLSNMPGTAAGSSGRGISISPSAGQMQMQHRTNLMATLSYGH . : :::. : .. . . . :: . .. :: .:.: .. : .: : KIAA07 ETPPPSQQAP-----PFSLTQPLSPVLEPSSEQ-MQYSPFLSQYQEMQLQPLPST--SGP 790 800 810 820 830 910 920 930 940 950 960 KIAA09 R---PLSKQLSADSAEAHSLNVNRFSPANYDQAHLHPHLFSDQSRGSPSSYSPSTGVGFS : :: ::. .. : : : :: :. ::. ::. . KIAA07 RAAPPLPTQLQQQQPPPPPPP----PPPRQPGAAPAPLQFSYQTCELPSAASPAPDYP-T 840 850 860 870 880 970 980 990 1000 1010 KIAA09 PTQALKVPPLDQF----PTFP--PSAHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYTRHQQVPHIL : : : .: : : :. .. : : ::.. KIAA07 PCQ-YPVDGAQQSDLTGPDCPRSPGLQEAPSSYDPLALSELPGLFDCEMLDAVDPQHNGY 890 900 910 920 930 940 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA09 QGLLSPRHSLTGHSDIRLPPTEFAQLIKRQQQQRQQQQQQQQQQEYQELFRHMNQGDAGS KIAA07 VLVN 950 >>KIAA1860 ( 689 res) fh18358 (689 aa) initn: 1264 init1: 1209 opt: 1252 Z-score: 645.4 bits: 130.9 E(): 7.8e-31 Smith-Waterman score: 1252; 52.243% identity (74.670% similar) in 379 aa overlap (54-432:5-368) 30 40 50 60 70 80 KIAA09 LLSGASSSSLAWCGLATGALGAGARGIPELRGAAGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPG : . . :. .. : :. .:: . KIAA18 KMSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGR-------S 10 20 90 100 110 120 130 140 KIAA09 SPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVA : .:. : . : . :: ..: :.. ::::::::: :: : :..: .:: KIAA18 SDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVA 30 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 KIAA09 IKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDH :::::::::. .:.:.::::.::: : ::.:..:..:.:::. .::: ::::.::.::. KIAA18 IKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDY 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 KIAA09 LVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLF ::.:::: ::::: ::.:::.::..:: .::::::::::::::::. ::::::::::: : KIAA18 LVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEF 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 KIAA09 TPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRA : :. : :.::::::::::::.::.::::.::::::::.::.:: :.::::: .:..:: KIAA18 TLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRE 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 KIAA09 RVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAEC ::: ::.:.::.:::.:: ..:..:::.: :: ..::: : ::...: .. KIAA18 RVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPE 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 KIAA09 QQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLR ... . .... .: :: .:. .:: :. :.. .: : :: KIAA18 EDFGDTKRIE--------VMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDRG 330 340 350 360 370 450 460 470 480 490 500 KIAA09 LGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEE KIAA18 APGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQRRHSDFCGPSPAPLHPKRS 380 390 400 410 420 430 >>KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 (766 aa) initn: 766 init1: 417 opt: 921 Z-score: 479.1 bits: 100.2 E(): 1.4e-21 Smith-Waterman score: 921; 38.035% identity (69.521% similar) in 397 aa overlap (114-501:15-407) 90 100 110 120 130 140 KIAA09 SPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVA : :..:.:.:.:.::::: : :. : ::: KIAA00 SMAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVA 10 20 30 40 150 160 170 180 190 200 KIAA09 IKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDH .:.::::.:: ..:.::. ::.. ::.:.:::.:..:. .::. : ..::..::. KIAA00 VKVIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDY 50 60 70 80 90 100 210 220 230 240 250 260 KIAA09 LVAHGR-MAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLL-DANLNIKIADFGFSN .. : . . : :.. : ::: :. .:: ..:::::: ::... . . .:..:::::: KIAA00 IMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSN 110 120 130 140 150 160 270 280 290 300 310 320 KIAA09 LFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNL : ::. : : ::: :.:::.. : :::.: ::::::::.:..:::: ::. .. .. KIAA00 KFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSET 170 180 190 200 210 220 330 340 350 360 370 KIAA09 RARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADP--NFDRL . ... :. .: .: ::. :: .:: ::..: :.:.: .: :.. : .: ... KIAA00 LTMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIP 230 240 250 260 270 280 380 390 400 410 420 430 KIAA09 IAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDR---H .. ..:.::.. . ... :: :.. :.. ...:... :.: .: : :: .: . KIAA00 LVSYKNLSEEEHNSIIQRMVL---GDIA-DRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILRE 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 490 KIAA09 KRHKTLRL-GALPSMPRALAFQA-PVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTL :..: .. .: :: .: :. :..:.. : ..: . :.. :..: KIAA00 KQEKEIQTRSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVL 350 360 370 380 390 400 500 510 520 530 540 550 KIAA09 NLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVMEDLQKLLPGFPGVNPQAPFLQVAP : ..: KIAA00 NGHRSKGLCDSAKKDDLPELAGPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPM 410 420 430 440 450 460 >>KIAA1477 ( 870 res) fj04927 (870 aa) initn: 943 init1: 886 opt: 912 Z-score: 474.1 bits: 99.5 E(): 2.7e-21 Smith-Waterman score: 1116; 51.714% identity (72.857% similar) in 350 aa overlap (91-432:141-458) 70 80 90 100 110 KIAA09 GAAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPA------RIG ..:. .. : : :. . . .:: KIAA14 HKMSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIG 120 130 140 150 160 170 120 130 140 150 160 170 KIAA09 YYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPH :....:::::::: :: : :..: .::.::::::::. .:.:.::::.:::.: ::. KIAA14 NYRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPN 180 190 200 210 220 230 180 190 200 210 220 230 KIAA09 IIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNI : ::.::.::::::: ::::: ::.:::.:: .:: . : KIAA14 I----------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYI 240 250 260 240 250 260 270 280 290 KIAA09 VHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKV :::::::::::::...::::::::::: :: :. : :.::::::::::::.::.::::.: KIAA14 VHRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEV 270 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 KIAA09 DIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNK :.:::::.::.:: :.:::::..:..:: ::: ::.::::.:::.::.:....:::.: : KIAA14 DVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIK 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 KIAA09 RLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDV--LLAMEDMGLDKEQ : :.::: : .::..: : ..:: . :: .:. . : ::. ... KIAA14 RGSLEQIMKDRWMNVGH----------EEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDE 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 470 KIAA09 TLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMN ..: .. ::. : : :: KIAA14 INDALINQKYDEVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLK 440 450 460 470 480 490 >>KIAA0537 ( 698 res) hg03925 (698 aa) initn: 765 init1: 670 opt: 898 Z-score: 468.0 bits: 98.1 E(): 5.9e-21 Smith-Waterman score: 898; 37.530% identity (67.554% similar) in 413 aa overlap (68-469:40-444) 40 50 60 70 80 90 KIAA09 LATGALGAGARGIPELRGAAGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPP---PAPGSPAAPAAVSPA :.:.:.. : ::::: .: . : KIAA05 AASLGGDPDIPALCPVLPSVARLAPRLDMEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATA 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 KIAA09 AGQPRPPAPASRGPMPARIGY-YEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQL- : .:: : ..: . . ::...:.:::... :::::. . :::: : : .. KIAA05 ALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQETLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIK 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 KIAA09 DEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAE ::... .: ::..::. : ::::: .:.:.:.. : .. :::: ::..:.. . :..: KIAA05 DEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSE 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 KIAA09 KEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTW .:.:. :.:::.::..:: ..:::::: ::.::: : ::::::::.:::. ..:.:. KIAA05 RETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTF 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 KIAA09 CGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRI :::: ::.::. .:. : ::.:: :.:::.::.:: :..:::: .:: .. ::..: KIAA05 CGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYRE 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 KIAA09 PFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQV : . .. . ::: ::...:..: ..:.: .: :.. : . . .:. :.. .. KIAA05 PT-QPSDARGLIRWMLMVNPDRRATIEDIANHWWVNWG-----YKSSVCDCDALHDSES- 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 KIAA09 DPLNEDVL-LAMEDMGL--DKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLG---A :: .. .. :: : : ...: . . .. . . :... . . : KIAA05 -PLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAKPTTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDA 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 KIAA09 LPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSP .: : :. . : .: ..... KIAA05 VPESPSKLSSKRPKGILKKRSNSEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPS 430 440 450 460 470 480 >>KIAA1811 ( 715 res) ha06731 (715 aa) initn: 976 init1: 815 opt: 897 Z-score: 467.4 bits: 98.0 E(): 6.4e-21 Smith-Waterman score: 934; 36.292% identity (62.722% similar) in 507 aa overlap (146-636:1-477) 120 130 140 150 160 170 KIAA09 YEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHI :... .:.: : :. ::. :.:.. :::. KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHV 10 20 30 180 190 200 210 220 230 KIAA09 IRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIV ..:..:.:.....::: :..::::.::.:: .::.. ::::. :.:::.:. ::: .: KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSIC 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 KIAA09 HRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVD ::::: :::::: . ::.:::::...: . .::.: :::: :: ::...:..::: ..: KIAA18 HRDLKPENLLLDEKNNIRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDGRRAD 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 KIAA09 IWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKR .:: ::.:..:. :::::: ..:..: .: : :..: :. .:. :.: :. ..:.:: KIAA18 MWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEPEKR 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 KIAA09 LSMEQICKHKWMKLG--DADPNFD----RLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGL- ::.::: :: :. : . :: .. : .: ..: . ..:: ::: .: ..: KIAA18 LSLEQIQKHPWYLGGKHEPDPCLEPAPGRRVAM-RSLPSNGELDP---DVLESMASLGCF 220 230 240 250 260 410 420 430 440 450 460 KIAA09 -DKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQA :.:. . :::. .. . :: :: ::..:. . . :: :: :. ... KIAA18 RDRERLHRELRSEEENQEKMIYYLLLDRKERYPSCEDQDLP--PRN-----DVDPPRKRV 270 280 290 300 310 470 480 490 500 510 520 KIAA09 GTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRT . : . . :: . .: .:.. .: : :: : : : .:. :. KIAA18 DSPM---LSRHGKRRPERKSME---VLSI-TDAGGGGSPVPTRRALEMAQHS-----QRS 320 330 340 350 360 530 540 550 560 570 580 KIAA09 EVMEDLQKLLPGFPGVNPQAPFLQVAPNVNFMHNLL----PM---QNLQPTGQLEYKEQS . . . : . : .:..: .. .:. . . : :.: : KIAA18 RSVSGASTGLSSSPLSSPRSPVFSFSPEPGAGDEARGGGSPTSKTQTLPSRGPRGGGAGE 370 380 390 400 410 420 590 600 610 620 630 KIAA09 LLQPPTLQLLNGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAV-PAVTPVDE ::. . :: : :.::. ::. :. ::. :: : ::.. : .: KIAA18 QPPPPSARSTPLPGPPGSPRSSGGT--PLHSP--LHTPRA-SP--TGTPGTTPPPSPGGG 430 440 450 460 470 480 640 650 660 670 680 690 KIAA09 ESSDGEPDQEAVQSSTYKDSNTLHLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNSSIK KIAA18 VGGAAWRSRLNSIRNSFLGSPRFHRRKMQVPTAEEMSSLTPESSPELAKRSWFGNFISLD 490 500 510 520 530 540 >>KIAA0175 ( 656 res) ha02337 (656 aa) initn: 779 init1: 335 opt: 784 Z-score: 411.2 bits: 87.4 E(): 8.7e-18 Smith-Waterman score: 803; 40.541% identity (67.568% similar) in 333 aa overlap (115-444:15-337) 90 100 110 120 130 140 KIAA09 PAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAI :::. .::: :.:: :: : :..: ::: KIAA01 TCKRTMKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAI 10 20 30 40 150 160 170 180 190 200 KIAA09 KIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHL ::.::. : . : .: :.. .: : : :: .::.:.:: :..: :: :::.::.. KIAA01 KIMDKNTLGSD-LPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYI 50 60 70 80 90 100 210 220 230 240 250 260 KIAA09 VAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFT ... :..:.:.: :.:::.:: . : .. .::::: ::::.: ..:. :::. KIAA01 ISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPK 110 120 130 140 150 160 270 280 290 300 310 320 KIAA09 PGQ--LLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLR .. :.: ::: ::::::..:: : : ..:.::.:..::::.:: :::: .... : KIAA01 GNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALY 170 180 190 200 210 220 330 340 350 360 370 380 KIAA09 ARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAE ... ::. .: ..: :...:: .::.::.::... .: :. : :. .: KIAA01 KKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIM---QDYNYP---VE 230 240 250 260 270 390 400 410 420 430 440 KIAA09 CQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSD-AYDHYSAIYSLLCDRHKRHKT :. . :..: . . ...::...: : ::: .: : :: .. : : KIAA01 WQS---KNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKP 280 290 300 310 320 330 450 460 470 480 490 500 KIAA09 LRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEG .:: KIAA01 VRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDVTASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPR 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) (608 aa) initn: 454 init1: 216 opt: 622 Z-score: 330.4 bits: 72.4 E(): 2.7e-13 Smith-Waterman score: 622; 35.625% identity (64.062% similar) in 320 aa overlap (99-397:293-593) 70 80 90 100 110 120 KIAA09 GAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARI------GYYEIDRTI .: :..: : : : .:: :.: KIAA17 PCMSGGRRMTLRDDQPAKLEKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVI 270 280 290 300 310 320 130 140 150 160 170 180 KIAA09 GKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLD-EENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQV : :::::::. : :. :.:::::..: .:.. . :. :.. : ::.:..:..: KIAA17 GDGNFAVVKECRHRETRQAYAMKIIDKSRLKGKEDM--VDSEILIIQSLSHPNIVKLHEV 330 340 350 360 370 380 190 200 210 220 230 240 KIAA09 METERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKA .::. :::. ::..::..:: .. .. : .: . .. :. : ..::::::: KIAA17 YETDMEIYLILEYVQGGDLFDAIIESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKP 390 400 410 420 430 440 250 260 270 280 290 KIAA09 ENLLL----DANLNIKIADFGFS-NLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDI ::::. : . ..:.::::.. .. : . : ::.: :.:::.. : : : .::. KIAA17 ENLLVQRNEDKSTTLKLADFGLAKHVVRP---IFTVCGTPTYVAPEILSEKGY-GLEVDM 450 460 470 480 490 300 310 320 330 340 KIAA09 WSLGVVLYVLVCGALPF-----DGSTLQNLRARVLSGKFRI--PFF--MSTECEHLIRHM :. ::.::.:.:: :: : . : :. . :.:.. :.. .: . :. .. KIAA17 WAAGVILYILLCGFPPFRSPERDQDELFNI---IQLGHFEFLPPYWDNISDAAKDLVSRL 500 510 520 530 540 550 350 360 370 380 390 400 KIAA09 LVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMG ::.::.:: . .:. .: :.. . .. . .:...::.: .: KIAA17 LVVDPKKRYTAHQVLQHPWIETA----------GKTNTVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRV 560 570 580 590 600 410 420 430 440 450 460 KIAA09 LDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQA KIAA17 VEQVS >>KIAA0369 ( 794 res) hh00177 (794 aa) initn: 385 init1: 216 opt: 595 Z-score: 315.7 bits: 70.1 E(): 1.8e-12 Smith-Waterman score: 603; 31.463% identity (61.220% similar) in 410 aa overlap (51-425:366-767) 30 40 50 60 70 KIAA09 SVSLLSGASSSSLAWCGLATGALGAGARGIPELRGAAGAGGAAGAGTGGAG---PAGRLL : :. . :. .. :: :. : . KIAA03 LDESECRVVKSTSYTKIASSSRRSTTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKS 340 350 360 370 380 390 80 90 100 110 KIAA09 PPPAPGSPAA----------PAAVSPAAGQPRPPAPASRGP----------MPARIG-YY : :.: ::.. ...: :. . . :: .:: : : KIAA03 PSPSPTSPGSLRKQRSSQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERY 400 410 420 430 440 450 120 130 140 150 160 170 KIAA09 EIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQL-DEENLKKIFREVQIMKMLCHPHI .. :::: :::::::. .. : . :.::: :.. .:.. : ::.:.. . ::.: KIAA03 KVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHM--IQNEVSILRRVKHPNI 460 470 480 490 500 510 180 190 200 210 220 230 KIAA09 IRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIV . : . :.. .::: : ..::..:: ... ....:..: . ....:. . : ::: KIAA03 VLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIV 520 530 540 550 560 570 240 250 260 270 280 290 KIAA09 HRDLKAENLLL----DANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDG :::.: ::::. :.. ..:..:::.... . : : : ::.: :.:::.. : : KIAA03 HRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATI-VDGPLY-TVCGTPTYVAPEIIAETGY-G 580 590 600 610 620 630 300 310 320 330 340 KIAA09 PKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGS--TLQNLRARVLSGK--FRIPFF--MSTECEHLIR :::::. ::. :.:.:: :: :: . : ..: :. : :.. .: ..:: KIAA03 LKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELIT 640 650 660 670 680 690 350 360 370 380 390 400 KIAA09 HMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMED ::..: ..:.: :. .: :.. :. :. .. .. ..:.. .. : ... .. KIAA03 MMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVN-DDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSV 700 710 720 730 740 410 420 430 440 450 460 KIAA09 MGLDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAE ..::. :.. :: . :.: KIAA03 IALDHGFTIK--RSGSLDYYQQPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM 750 760 770 780 790 >>KIAA0968 ( 527 res) hj06483 (527 aa) initn: 499 init1: 329 opt: 566 Z-score: 303.0 bits: 67.1 E(): 9.2e-12 Smith-Waterman score: 572; 32.047% identity (61.721% similar) in 337 aa overlap (42-367:2-320) 20 30 40 50 60 70 KIAA09 RASAVAAVPSVSLLSGASSSSLAWCGLATGALGAGARGIPELRGAAGAGGAAGAGTGGAG : :.... . :..:: :: . :... 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KIAA09 ILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAE 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 KIAA09 ICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSD :: :. KIAA09 ALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKS 320 330 340 350 360 370 1371 residues in 1 query sequences 1986134 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:24:43 2008 done: Thu Dec 18 15:24:44 2008 Total Scan time: 0.810 Total Display time: 0.280 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]