# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06832.fasta.nr -Q ../query/KIAA0971.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0971, 665 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827195 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0274+/-0.000182; mu= 12.0859+/- 0.010 mean_var=67.7207+/-13.183, 0's: 33 Z-trim: 37 B-trim: 28 in 1/64 Lambda= 0.155852 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|193786079|dbj|BAG50930.1| unnamed protein produ ( 710) 4148 942.2 0 gi|75041373|sp|Q5R776.1|FAKD2_PONAB RecName: Full= ( 693) 3867 879.0 0 gi|90075444|dbj|BAE87402.1| unnamed protein produc ( 694) 3660 832.5 0 gi|67969917|dbj|BAE01306.1| unnamed protein produc ( 624) 3652 830.6 0 gi|148667775|gb|EDL00192.1| FAST kinase domains 2, ( 762) 2751 628.1 3.3e-177 gi|151555734|gb|AAI49141.1| MGC151610 protein [Bos ( 688) 2750 627.9 3.5e-177 gi|81902593|sp|Q922E6.2|FAKD2_MOUSE RecName: Full= ( 689) 2711 619.1 1.5e-174 gi|74201585|dbj|BAE28423.1| unnamed protein produc ( 689) 2708 618.4 2.5e-174 gi|74150426|dbj|BAE32254.1| unnamed protein produc ( 689) 2705 617.7 3.9e-174 gi|74147747|dbj|BAE38740.1| unnamed protein produc ( 689) 2696 615.7 1.6e-173 gi|149045996|gb|EDL98889.1| similar to RIKEN cDNA ( 689) 2659 607.4 5.1e-171 gi|194222522|ref|XP_001498563.2| PREDICTED: FAST k ( 605) 2490 569.4 1.3e-159 gi|74005644|ref|XP_536043.2| PREDICTED: hypothetic ( 817) 2480 567.2 7.6e-159 gi|81883051|sp|Q5M7V7.1|FAKD2_RAT RecName: Full=FA ( 679) 1299 301.6 5.7e-79 gi|7022493|dbj|BAA91617.1| unnamed protein product ( 258) 1179 274.3 3.5e-71 gi|189514305|ref|XP_692810.3| PREDICTED: similar t ( 652) 998 233.9 1.3e-58 gi|220675953|emb|CAX14434.1| novel protein [Danio ( 568) 993 232.7 2.6e-58 gi|149632986|ref|XP_001508062.1| PREDICTED: hypoth ( 376) 911 214.2 6.6e-53 gi|47226843|emb|CAG06685.1| unnamed protein produc ( 433) 518 125.9 2.9e-26 gi|124053394|sp|Q7YS91.2|TBRG4_PIG RecName: Full=P ( 632) 273 70.9 1.5e-09 gi|31074212|gb|AAP37947.1| cell cycle progression ( 605) 272 70.7 1.7e-09 gi|31074402|gb|AAP37946.1| cell cycle progression ( 632) 272 70.7 1.8e-09 gi|50732175|ref|XP_418515.1| PREDICTED: similar to ( 639) 272 70.7 1.8e-09 gi|122140244|sp|Q3SZK4|TBRG4_BOVIN Protein TBRG4 ( ( 632) 266 69.3 4.5e-09 gi|114613222|ref|XP_001150252.1| PREDICTED: cell c ( 577) 265 69.1 4.9e-09 gi|114613218|ref|XP_001150776.1| PREDICTED: cell c ( 623) 265 69.1 5.2e-09 gi|114613224|ref|XP_001150329.1| PREDICTED: cell c ( 631) 265 69.1 5.2e-09 gi|49523233|gb|AAH75328.1| MGC89011 protein [Xenop ( 531) 264 68.8 5.3e-09 gi|124053395|sp|Q6DJ55.2|TBRG4_XENTR RecName: Full ( 633) 264 68.9 6.1e-09 gi|109066616|ref|XP_001086983.1| PREDICTED: simila ( 631) 263 68.6 7.1e-09 gi|119581457|gb|EAW61053.1| transforming growth fa ( 577) 262 68.4 7.8e-09 gi|74731072|sp|Q969Z0.1|TBRG4_HUMAN RecName: Full= ( 631) 262 68.4 8.3e-09 gi|21739306|emb|CAD38700.1| hypothetical protein [ ( 631) 262 68.4 8.3e-09 gi|194390890|dbj|BAG62204.1| unnamed protein produ ( 642) 262 68.4 8.5e-09 gi|82186733|sp|Q6PA48.1|TBRG4_XENLA RecName: Full= ( 633) 258 67.5 1.6e-08 gi|149704825|ref|XP_001497489.1| PREDICTED: simila ( 632) 257 67.3 1.8e-08 gi|114613228|ref|XP_001150125.1| PREDICTED: cell c ( 542) 251 65.9 4.1e-08 gi|114613220|ref|XP_527735.2| PREDICTED: cell cycl ( 607) 251 65.9 4.5e-08 gi|38114761|gb|AAH02732.2| TBRG4 protein [Homo sap ( 495) 248 65.2 6.1e-08 gi|81883171|sp|Q5M9G9.1|TBRG4_RAT RecName: Full=Pr ( 629) 235 62.3 5.6e-07 gi|74177819|dbj|BAE38999.1| unnamed protein produc ( 600) 228 60.8 1.6e-06 gi|193787280|dbj|BAG52486.1| unnamed protein produ ( 456) 223 59.5 2.8e-06 gi|114613236|ref|XP_001150006.1| PREDICTED: cell c ( 456) 223 59.5 2.8e-06 gi|193785660|dbj|BAG51095.1| unnamed protein produ ( 456) 220 58.9 4.5e-06 gi|81879710|sp|Q91YM4.1|TBRG4_MOUSE RecName: Full= ( 630) 220 59.0 5.8e-06 gi|148669288|gb|EDL01235.1| mCG21397, isoform CRA_ ( 644) 220 59.0 5.9e-06 gi|149047701|gb|EDM00371.1| rCG36048, isoform CRA_ ( 536) 217 58.2 8.2e-06 gi|149261777|ref|XP_001475770.1| PREDICTED: simila ( 535) 213 57.3 1.5e-05 gi|149047700|gb|EDM00370.1| rCG36048, isoform CRA_ ( 437) 210 56.6 2.1e-05 gi|26378342|dbj|BAC25392.1| unnamed protein produc ( 111) 201 54.2 2.9e-05 >>gi|193786079|dbj|BAG50930.1| unnamed protein product [ (710 aa) initn: 4177 init1: 4148 opt: 4148 Z-score: 5035.8 bits: 942.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 4148; 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