# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh04016s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0932.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0932, 1078 aa vs ./tmplib.23663 library 1986427 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0794+/-0.00544; mu= 23.4483+/- 0.370 mean_var=111.2323+/-26.657, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 19 in 2/38 Lambda= 0.121607 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1890 ( 1048 res) fk02692 (1048) 354 74.0 1.3e-13 KIAA1894 ( 2977 res) ff08107 (2977) 271 60.2 5.1e-09 KIAA0927 ( 1001 res) hg03734 (1001) 209 48.5 5.6e-06 KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640) 201 47.4 1.9e-05 KIAA0817 ( 2785 res) hg01392s2 (2785) 196 46.9 4.5e-05 KIAA1776 ( 2816 res) fh11044s3 (2816) 172 42.7 0.00084 KIAA0816 ( 1950 res) af09475 (1950) 166 41.4 0.0015 KIAA1983 ( 418 res) fk09737(revised) ( 418) 151 37.7 0.0042 >>KIAA1890 ( 1048 res) fk02692 (1048 aa) initn: 462 init1: 191 opt: 354 Z-score: 336.5 bits: 74.0 E(): 1.3e-13 Smith-Waterman score: 773; 25.296% identity (50.473% similar) in 846 aa overlap (397-1067:122-945) 370 380 390 400 410 420 KIAA09 NTFSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPA-CGETLQDTTGNF :. : . . : .: : :: ... . :.. 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