# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bf00159.fasta.huge -Q ../query/KIAA0931.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0931, 1258 aa vs ./tmplib.23663 library 1986247 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3986+/-0.00625; mu= 16.8836+/- 0.425 mean_var=166.9683+/-40.553, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 133 in 1/39 Lambda= 0.099256 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 2002 300.2 1.5e-81 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 467 79.9 1.4e-15 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 374 67.2 2.4e-11 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 295 55.8 5.6e-08 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 240 47.6 1e-05 KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 ( 793) 231 46.3 2.4e-05 KIAA1194 ( 575 res) fg00908 ( 575) 210 43.0 0.00016 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 203 42.0 0.00031 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 202 42.1 0.00043 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 201 42.2 0.00056 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 188 40.1 0.0018 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 176 38.4 0.0056 >>KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369 aa) initn: 2843 init1: 1096 opt: 2002 Z-score: 1556.1 bits: 300.2 E(): 1.5e-81 Smith-Waterman score: 4064; 51.399% identity (75.300% similar) in 1251 aa overlap (86-1250:122-1350) 60 70 80 90 100 110 KIAA09 SSSSSSSDLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSR .::.::::. .:::: :.:::: ::: . 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KIAA08 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT 70 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 KIAA09 R-RQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVS--QRISTVDLSCYSLEEVP . :: ..: :.. :.. ::: . . .. ... .:: .:.:.: KIAA08 ELYLYSNKLQSLPAEVGCL-VNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIP 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 KIAA09 EHLFYSQDITYLNLRHNFMQ-LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL .. ...: : :: : . .:. . ..:.:. :.. .::. .: . :. .: KIAA08 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKD-----IKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNL 190 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 KIAA09 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIP :... : .. ::..::: .. .: :. : : ::. .:::..:: ::. .: .: :: KIAA08 ITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP 250 260 270 280 290 300 390 400 410 420 430 440 KIAA09 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV . : . :... . .: . .: ..:. . ... . : : .. . . . . : . KIAA08 RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSL 310 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 KIAA09 DLRDNRLTDLDL---SSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N ... ::.. . . : : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . . KIAA08 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED 370 380 390 400 410 420 500 510 520 530 540 550 KIAA09 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG : . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.: KIAA08 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT 430 440 450 460 470 480 560 570 580 590 600 610 KIAA09 HNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGN-KLK .:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:. 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KIAA12 YLDANQIE-ELP---KQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEF 60 70 80 90 100 340 350 360 370 380 390 KIAA09 PSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVV : .: : : . . : .. ::. ...: .:..: .. . .: . .:: :. . KIAA12 PENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILE 110 120 130 140 150 160 400 410 420 430 440 450 KIAA09 MAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLD-- . : :..: ..::.......:: :.. : : : :: . . . . :::: . KIAA12 LRENQLKMLP-KTMNRLTQLERLDLGSNEF-TEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGF 170 180 190 200 210 220 460 470 480 490 500 510 KIAA09 LSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFS----LRTLYASSNRLTAVNVYPVPSL--LTFLDL ..:: .: : ..:.. :.. :.: :. : ::: : . . :: .: : . KIAA12 IGSLKQLTYLDVSKNNI-EMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLP-ETIGSLKNITTLKI 230 240 250 260 270 280 520 530 540 550 560 570 KIAA09 SRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEH ..: : .:: ..: :: :.: . .: : . .:: . ::..:.:: . KIAA12 DENQLMYLPDSIGGLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGS 290 300 310 320 330 340 580 590 600 610 620 630 KIAA09 IP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHT . :: :. : : ::. ... ...:. .::: :.::..: .... ..: . KIAA12 WKNITVLFLHSNKLETLPE--------EMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTA 350 360 370 380 390 640 650 660 670 680 690 KIAA09 LVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKT . .: KIAA12 MWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRK 400 410 420 430 440 450 >>KIAA0644 ( 887 res) hj03618 (887 aa) initn: 162 init1: 70 opt: 240 Z-score: 194.3 bits: 47.6 E(): 1e-05 Smith-Waterman score: 264; 27.778% identity (55.556% similar) in 378 aa overlap (321-681:107-435) 300 310 320 330 340 KIAA09 PGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLP--SQIGNLLN :. . .: . :.. .: :.. . . KIAA06 MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHD 80 90 100 110 120 130 350 360 370 380 390 400 KIAA09 LQTLCLDGNFLTTLPE-ELGNLQQLSSLGISFNNFSQI-PEVYEKLTMLDRVVMAGNCLE . : : :::.:.. .. : :: : ...:.. .. :...:::. :... ...: :. KIAA06 VLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQ 140 150 160 170 180 190 410 420 430 440 450 460 KIAA09 VLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL---TDLDLSSLCS .: :.: . ... . :... . ..:: . .... : : : : .. : . KIAA06 ALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGN 200 210 220 230 240 250 470 480 490 500 510 520 KIAA09 LEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWA : :: :..: : ..: :. ..: ::.:: : :. :. KIAA06 LLYLHLESNRIRFLGKNAF------AQLGKLR------------FLNLSANELQ--PSLR 260 270 280 290 530 540 550 560 570 580 KIAA09 CEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNL-PTLVEHIP-LEVLDLQH : : .:.: :::: .:. : .:.: : . .:.: : .:.:. KIAA06 HAA-------------TFAPLRSLSSL-----ILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRG 300 310 320 330 590 600 610 620 630 KIAA09 NALTRL-PDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVA---HSNN : ::.: :..... :: :.:: : ::.:. .::.. . ::.: : .:. KIAA06 NQLTHLAPEAFWG--------LEALRELRLEGNRLSQLPTAL--LEPLHSLEALDLSGNE 340 350 360 370 380 640 650 660 670 680 690 KIAA09 IS-IFPEIL-QLPQIQFVDLSCNDLTEIL--IPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDI .: . : . .: ... ..: : :. . : : :: : ::: :: KIAA06 LSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPA-LYRLDLDGNGWTCDCRLRGLK 390 400 410 420 430 440 700 710 720 730 740 750 KIAA09 FSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGM KIAA06 RWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLTADRRRQP 450 460 470 480 490 500 >>KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 (793 aa) initn: 460 init1: 166 opt: 231 Z-score: 187.8 bits: 46.3 E(): 2.4e-05 Smith-Waterman score: 260; 32.370% identity (62.428% similar) in 173 aa overlap (510-681:168-331) 480 490 500 510 520 530 KIAA09 SGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLL :::.: : :: :. ..:.:.. .: . KIAA10 SGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCI 140 150 160 170 180 190 540 550 560 570 580 590 KIAA09 TEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKL .: :.. : : :..:... ::. . .::.:: ..: : ::. .. KIAA10 RVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPE--------EI 200 210 220 230 240 600 610 620 630 640 650 KIAA09 NKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFP-EILQLPQIQFVDLSCN ..:.:: ::..: :.. ..: :.. : :. : .. : ....: :...:: ..: :.::: KIAA10 GQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKF-DFSCN 250 260 270 280 290 300 660 670 680 690 700 710 KIAA09 DLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTF . : : :: : : .: KIAA10 KVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLH 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1194 ( 575 res) fg00908 (575 aa) initn: 196 init1: 165 opt: 210 Z-score: 172.9 bits: 43.0 E(): 0.00016 Smith-Waterman score: 215; 30.968% identity (70.323% similar) in 155 aa overlap (250-391:6-160) 220 230 240 250 260 270 KIAA09 SAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLS--CYSLEEV----PEHLF-- :.: :..:: :. :. :.... KIAA11 QRCEWSSRSSSLDLLLLCMPKEKYEPPDPRRMYTI 10 20 30 280 290 300 310 320 KIAA09 YSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTL----YKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLT .:.. . . . .. .:: : . .: .....: .:.:: :.:. .: . .. .:. KIAA11 MSSEEAANGKKSHWAELEISGKVRSLSASLWSLTHLTALHLSDNSLSRIPSDIAKLHNLV 40 50 60 70 80 90 330 340 350 360 370 380 KIAA09 ELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQ-IP :.:: : ...::...::...:. : :..:.: .:: :::.: ::..::.. : ..: : KIAA11 YLDLSSNKIRSLPAELGNMVSLRELHLNNNLLRVLPFELGKLFQLQTLGLKGNPLTQDIL 100 110 120 130 140 150 390 400 410 420 430 440 KIAA09 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV ..:.. KIAA11 NLYQEPDGTRRLLNYLLDNLSGTAKRITTEQPPPRSWIMLQEPDRTRPTALFSVMCYNVL 160 170 180 190 200 210 >>KIAA0416 ( 529 res) hh00236 (529 aa) initn: 157 init1: 80 opt: 203 Z-score: 167.8 bits: 42.0 E(): 0.00031 Smith-Waterman score: 241; 25.080% identity (58.521% similar) in 311 aa overlap (281-569:11-309) 260 270 280 290 300 KIAA09 QRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGG---LDTLYKFSQLKGLN ::. .... : : : ..: .:.. . KIAA04 QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKM- 10 20 30 310 320 330 340 350 360 KIAA09 LSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCN--GFHDLPSQI--GNLLNLQTLCLDGNFLTTLP : .. : :: .: . :. :::..:. :.: : : : .: : KIAA04 LPALGMACPPKCRCE-----KLLFYCDSQGFHSVPNATDKGSL----GLSLRHNHITELE 40 50 60 70 80 90 370 380 390 400 410 420 KIAA09 -EELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPE-VYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKH .......::. : .. :..: . : ... : : ......: . : ..... .... KIAA04 RDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQN 100 110 120 130 140 150 430 440 450 460 470 KIAA09 VDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSL--C-SLEQLHCGRNQLRELT .:: .:.:... : . : ... . ::.: : . . . : ::: : . :.:: :. KIAA04 LDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLA 160 170 180 190 200 210 480 490 500 510 520 KIAA09 LSGFS----LRTLYASSNRLTAVNVYP---VPSLLT-FLDLSR-NLLECVPDWACEAKKI .::. :: :. :.:: .: . :: : ::. .. . : : .:. . KIAA04 RNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWT--WGTL 220 230 240 250 260 530 540 550 560 570 580 KIAA09 EVLDVSYNLLTEVPVRILSSL-SLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLP : ::.. : . . . .. .. .:. :.. .:....: . . KIAA04 EKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWEC 270 280 290 300 310 320 590 600 610 620 630 640 KIAA09 DTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLP KIAA04 SARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLCWNLSTTVTVMATTYR 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1437 ( 811 res) hk07206 (811 aa) initn: 345 init1: 171 opt: 202 Z-score: 165.3 bits: 42.1 E(): 0.00043 Smith-Waterman score: 288; 24.755% identity (56.373% similar) in 408 aa overlap (297-695:421-793) 270 280 290 300 310 320 KIAA09 PEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL : : .: : :.: :. .: . .. : KIAA14 FAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQRLTKNAQDK-LELHLFMLSGIPDTVFDLVEL 400 410 420 430 440 330 340 350 360 370 380 KIAA09 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQ-LSSLGISFNNFSQI :.: .: .:..: .:. : : . :. :.. : .: :.:.....: KIAA14 EVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEI 450 460 470 480 490 500 390 400 410 420 430 440 KIAA09 PEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGV----LNRMNHIKHVDLRMNHLKT-MVIENLEGN : .: :... ..:: : . : .....: . :. : : .:. .. . KIAA14 PLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVH 510 520 530 540 550 560 450 460 470 480 490 KIAA09 KHITHVDLRDNRLTDLD-LSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNV . .. . ..: :. :... .: .:. : .:... : :::..: . : :. KIAA14 LQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEID--LKDNNL 570 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 550 KIAA09 YPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGH . ...: : : : :. : :: .. .:..: . .:..:.:.. KIAA14 KTIEEIISFQHLHR--LTCLKLW-------------YNHIAYIPIQIGNLTNLERLYLNR 630 640 650 660 670 560 570 580 590 600 610 KIAA09 NHVQNLPTLVEHI-PLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLKTI :.....:: . . :. :::.:: :: :: .. :..:..: ...:...:. KIAA14 NKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLP--------ADIGLLQNLQNLAITANRIETL 680 690 700 710 720 620 630 640 650 660 670 KIAA09 PTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFP-EILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLD : . .:..:..: .: .. .: .. .: .. ..: : : : ::. : . KIAA14 PPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRL------ECLPVELGECP 730 740 750 760 770 680 690 700 710 720 730 KIAA09 LTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSA : ..::.:. :.:. KIAA14 LLKRSGLVVEE---DLFNTLPPEVKERLWRADKEQA 780 790 800 810 >>KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073 aa) initn: 99 init1: 59 opt: 201 Z-score: 163.3 bits: 42.2 E(): 0.00056 Smith-Waterman score: 265; 25.918% identity (55.076% similar) in 463 aa overlap (306-742:88-535) 280 290 300 310 320 330 KIAA09 ITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNG :..:::.:. . : : : .:: :.... : KIAA08 RIPLLDCSRRKLPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNISL-ESQTLQEVKMNYNE 60 70 80 90 100 110 340 350 360 370 380 390 KIAA09 FHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTL-PEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTM . ..: :. : : :.. . . : : :: .: : .:.: . KIAA08 LTEIPYFGEPTSNITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQ 120 130 140 150 160 170 400 410 420 430 440 450 KIAA09 LDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNH-IKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNR- : . ...: . .:. : .. .. . : : :.. .:. .. :. ..:. :: KIAA08 LKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRM-SMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRI 180 190 200 210 220 230 460 470 480 490 500 KIAA09 -----LTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFS-LRTLYASSNRLTAVN---VYPVP :: :.:: ::.. . : ..:.. .. :.. .. : : :: :: .: . KIAA08 KIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGL- 240 250 260 270 280 290 510 520 530 540 550 KIAA09 SLLTFLDLSRNLLECV-PD-WA-CEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSL-RKLMLGH .: : .:.: .: . :: : : ... ::.::: ::.. . .::: ..: :: KIAA08 RMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFC--QRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGD 300 310 320 330 340 350 560 570 580 590 600 610 KIAA09 NHVQNLPTLVEHI--PLEVLDLQHNALT-RLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLK :.: .. : .. :..:::..: .. . :. :.:. :..: . : :.::..: KIAA08 NRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDA--SEAFAGLTSLTK---LILQGNQIK 360 370 380 390 400 620 630 640 650 660 670 KIAA09 TIPT-TIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQ- .: .. . . :. : ..: : . : . : .. .: : . .: : :: KIAA08 SITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQEN-AFSQTHLKELILNT-SSLLCDCHLKWLLQW 410 420 430 440 450 460 680 690 700 710 720 730 KIAA09 --DLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHG--LAEMAGQR : .. ..:. : . .. . :..: : . . :. . . .: . . :. KIAA08 LVDNNFQHSVNVSCAHP--EWLAGQSILNVDLKDF-VCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMN 470 480 490 500 510 520 740 750 760 770 780 KIAA09 NKL-CVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMA : :... . :: KIAA08 VTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTD 530 540 550 560 570 580 1258 residues in 1 query sequences 1986247 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:21:55 2008 done: Thu Dec 18 15:21:56 2008 Total Scan time: 0.760 Total Display time: 0.340 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]