# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk07361.fasta.huge -Q ../query/KIAA0878.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0878, 687 aa vs ./tmplib.23663 library 1986818 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0398+/-0.00526; mu= 17.2198+/- 0.358 mean_var=131.7194+/-31.037, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.111750 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0740 ( 696 res) hk03989s1 ( 696) 370 71.3 3.5e-13 KIAA0717 ( 751 res) fh19258 ( 751) 352 68.4 2.7e-12 KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 172 39.4 0.0014 KIAA1784 ( 1167 res) fh08226 (1167) 171 39.5 0.0021 KIAA1490 ( 749 res) fj08103 ( 749) 165 38.3 0.0032 KIAA1417 ( 1379 res) fh14782 (1379) 161 38.0 0.0071 KIAA1129 ( 625 res) hg04330 ( 625) 156 36.7 0.0079 >>KIAA0740 ( 696 res) hk03989s1 (696 aa) initn: 431 init1: 159 opt: 370 Z-score: 328.6 bits: 71.3 E(): 3.5e-13 Smith-Waterman score: 465; 24.059% identity (52.700% similar) in 611 aa overlap (151-681:82-671) 130 140 150 160 170 180 KIAA08 NAASTVARPVFTEYQASAFGNVKLVVHDCPVWDIFDSDWYTSRNLIGGADIIVIKYNVND .:: : . : : .:..:. ... . 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KIAA07 ARPIKPNEILPPEKGREVAKELGIPYYETSVVAQFGIKDVFDNAIRAALISRRHLQFWKS 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 KIAA08 SEKMKKRKMSNSFHGIRPPQLEQPEKMPVLKAEASHYNSDLNNLLFCCQCVDVVFYNPDL . .: . .. . ::. : . :. : . .:: :.::.. . KIAA07 HLRNVQRPLLQA--PFLPPK--PPPPIIVVPDPPSSSEECPAHLLEDPLCADVILVLQER 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 KIAA08 KKVVEAHKIVLCAVSHVFMLLFNVK---------------SPTDIQDSSIIRTTQDLFAI .. :::: : . : :. :: . : : : : . . KIAA07 VRIF-AHKIYLSTSSSKFYDLFLMDLSEGELGGPSEPGGTHPEDHQGHSDQHHHHHHHHH 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 KIAA08 NRDTAFPGASH-------ESSGNPP--LRVIVKDALFCSCLSDIL----RFI--YSGAFQ .:: . .:: :..:. : ::. ..:... . . : : . .: :: KIAA07 GRDFLLRAASFDVCESVDEAGGSGPAGLRASTSDGILRGNGTGYLPGRGRVLSSWSRAFV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 KIAA08 --WEELEED----------------------IRKKLK------------DSGDVSNVIEK ::. :: .: :: : .... : KIAA07 SIQEEMAEDPLTYKSRLMVVVKMDSSIQPGPFRAVLKYLYTGELDENERDLMHIAHIAEL 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 KIAA08 VKCILKTPGKINCLRNCKTYQARKPLWFY---NTSLKFFLNKPMLADVVFEIQGTTVPAH .. . : : : .. . :. .. .: : : ..::.: .. :. :: KIAA07 LEVFDLRMMVANILNNEAFMNQEITKAFHVRRTNRVKECLAKGTFSDVTFILDDGTISAH 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 KIAA08 RAILVARCEVMAAMFNGNYMEAKSVLIPVYGVSKETFLSFLEYLYTDSCCPAGIFQAMCL . .:.. :. :::::.: ..:... . .:: . . :::::: . .. : : KIAA07 KPLLISSCDWMAAMFGGPFVESSTREVVFPYTSKSCMRAVLEYLYTGMFTSSPDLDDMKL 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 KIAA08 LICAEMYQVSRLQHICELFIITQLQSMPSRELASMNLDIVDLLKKAKFHHSDCLSTWLLH .: :. . .: . : . .: :. .. ..... :.. .:. :.:: . :. : :: KIAA07 IILANRLCLPHLVALTEQYTVTGLMEA-TQMMVDIDGDVLVFLELAQFHCAYQLADWCLH 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 KIAA08 FIATNYLIFSQK-P-EFQDLSVEERSFVEKHRWPSNMYLKQLAEYRKYIHSRKCRCLVM : ::: .: : ... .: :.. . :::::: :::. .:.. .:: : KIAA07 HICTNYNNVCRKFPRDMKAMSPENQEYFEKHRWPPVWYLKEEDHYQR---ARKEREKEDY 660 670 680 690 700 710 KIAA07 LHLKRQPKRRWLFWNSPSSPSSSAASSSSPSSSSAVV 720 730 740 750 >>KIAA1687 ( 728 res) fh26020 (728 aa) initn: 137 init1: 137 opt: 172 Z-score: 155.9 bits: 39.4 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 172; 31.092% identity (59.664% similar) in 119 aa overlap (489-602:185-295) 460 470 480 490 500 510 KIAA08 KTPGKINCLRNCKTYQARKPLWFYNTSLKFFLNKPMLADVVFEIQGTTVPAHRAILVARC .:.. .: ::.. .:::: .: : KIAA16 QHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVS 160 170 180 190 200 210 520 530 540 550 560 570 KIAA08 EVMAAMFNGNYMEAKSVLIPVYGVSKETFLSFLEYLYTDSCCPAGIFQ-----AMCLLIC . .::::... .:::. . . ::. ... :...: :: :..: :: KIAA16 DYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYT------GVLQLKEDTIESLLAA 220 230 240 250 260 580 590 600 610 620 630 KIAA08 AEMYQVSRLQHICELFIITQLQSMPSRELASMNLDIVDLLKKAKFHHSDCLSTWLLHFIA : . :.... .: :.: ::. :: : KIAA16 ACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLH--PSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIK 270 280 290 300 310 320 >>KIAA1784 ( 1167 res) fh08226 (1167 aa) initn: 128 init1: 56 opt: 171 Z-score: 153.0 bits: 39.5 E(): 0.0021 Smith-Waterman score: 171; 28.497% identity (56.995% similar) in 193 aa overlap (490-674:18-202) 460 470 480 490 500 510 KIAA08 TPGKINCLRNCKTYQARKPLWFYNTSLKFFLNKPMLADVVFEIQ-GTTVPAHRAILVARC .:.: :.:: :. . : .. ::. .: ::: KIAA17 GRTSLSLGLLVADFGAMVNNPHLSDVQFQTDSGEVLYAHKFVLYARC 10 20 30 40 520 530 540 550 560 570 KIAA08 EVMAAMFNGNYMEA--KSVL---IPVYGVSKETFLSFLEYLYT-DSCCPAGIFQAMCLLI .. . :.. . : .:: . . :: :. .::.:::: :. : :. . . : KIAA17 PLLIQYVNNEGFSAVEDGVLTQRVLLGDVSTEAARTFLHYLYTADTGLPPGLSSELSSL- 50 60 70 80 90 100 580 590 600 610 620 630 KIAA08 CAEMYQVSRLQHICELF-IITQLQSMPSRELASMNLDIVDLLKKAKFHHSDCLSTWLLHF :. . ::.: :.:: : :. .. : .: . : . ..:. . : : . KIAA17 -AHRFGVSELVHLCEQVPIATDSEGKPWEEKEAENCE-----SRAENFQELLRSMWADEE 110 120 130 140 150 160 640 650 660 670 680 KIAA08 IATNYLIFSQKPEFQDLSVEERSFVEKHRWPSNMYLKQLAEYRKYIHSRKCRCLVM .. :. :. : .. .:.: . : ... ... : : : : KIAA17 EEAETLLKSKDHEEDQENVNEAEMEEIYEFAATQR-KLLQEERAAGAGEDADWLEGGSPV 170 180 190 200 210 KIAA17 SGQLLAGVQVQKQWDKVEEMEPLEPGRDEAATTWEKMGQCALPPPQGQHSGARGAEAPEQ 220 230 240 250 260 270 >>KIAA1490 ( 749 res) fj08103 (749 aa) initn: 135 init1: 135 opt: 165 Z-score: 149.7 bits: 38.3 E(): 0.0032 Smith-Waterman score: 165; 22.167% identity (54.187% similar) in 203 aa overlap (486-687:203-397) 460 470 480 490 500 510 KIAA08 CILKTPGKINCLRNCKTYQARKPLWFYNTSLKFFLNKPMLADVVFEIQGTTVPAHRAILV .. .:.. .: ::.. . . .:::: .: KIAA14 HSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLS 180 190 200 210 220 230 520 530 540 550 560 570 KIAA08 ARCEVMAAMFNGNYMEAKSVLIPVYGVSKETFLSFLEYLYTDSCCPAGIFQAMCLLICAE . . .::::... :::. : . :.. ... ..... :: .: :: : KIAA14 SVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYT-GCLELKEDTIENLLAAAC 240 250 260 270 280 290 580 590 600 610 620 630 KIAA08 MYQVSRLQHICELFIITQLQSMPSRELASMNL-DIVDLLKKAKFHHSDCLSTWLLHFIAT . :. .. ..: :.. :. :: :. . : .. : :: . . ... : . KIAA14 LLQLPQVVEVCCHFLMKLLH--PSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMEN-IMEVIRN 300 310 320 330 340 640 650 660 670 680 KIAA08 NYLIFSQKPEFQDLSVEERSFVEKHRWPSNMYLKQLAEYRKYIHSRKCRCLVM . ... :.. : . . : .. .. : . :: . .: : : KIAA14 QEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEE----TIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRL 350 360 370 380 390 400 KIAA14 PLLPPQILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYA 410 420 430 440 450 460 >>KIAA1417 ( 1379 res) fh14782 (1379 aa) initn: 139 init1: 110 opt: 161 Z-score: 143.5 bits: 38.0 E(): 0.0071 Smith-Waterman score: 161; 26.415% identity (60.377% similar) in 159 aa overlap (483-633:778-931) 460 470 480 490 500 KIAA08 KVKCILKTPGKINCLRNCKTYQARKPLWFYNTSLKFFLNKP---MLADVVFE-IQGTTVP ::. :. :.. .: ::... ..: : KIAA14 TVAKKFDFSNLSSRLDGVRFENEKINVIAKNTGNKLKLSQKKCSFLCDVTMKSVDGKEFP 750 760 770 780 790 800 510 520 530 540 550 560 KIAA08 AHRAILVARCEVMAAMFNGNYMEAKSVLIPVYGVSKETFLSFLEYLYTDSCCPAGIFQA- :. .: :: : . .:......::.: . . .. . .:.::::: : KIAA14 CHKCVLCARLEYFHSMLSSSWIEASSCAALEMPIHSDILKVILDYLYTDEAVVIKESQNV 810 820 830 840 850 860 570 580 590 600 610 620 KIAA08 --MC-LLICAEMYQVSRLQHICELFIITQLQSMPSRELASMNLDIVDLLKKAKFHHSDCL .: .:. :.. ..::..:::. . .: . . :.: :... . . ... : :: KIAA14 DFICSVLVVADQLLITRLKEICEVALTEKL----TLKNAAMLLEFAAMYSAKQLKLS-CL 870 880 890 900 910 920 630 640 650 660 670 680 KIAA08 STWLLHFIATNYLIFSQKPEFQDLSVEERSFVEKHRWPSNMYLKQLAEYRKYIHSRKCRC . :.. : KIAA14 QFIGLNMAALLEARSLDVLSDGVLKDLSEFYRKMIPAMDRRVITPYQDGPDISYLEVEDG 930 940 950 960 970 980 >>KIAA1129 ( 625 res) hg04330 (625 aa) initn: 131 init1: 131 opt: 156 Z-score: 142.7 bits: 36.7 E(): 0.0079 Smith-Waterman score: 156; 24.000% identity (57.500% similar) in 200 aa overlap (491-677:83-277) 470 480 490 500 510 520 KIAA08 PGKINCLRNCKTYQARKPLWFYNTSLKFFLNKPMLADVVFEIQGTTVPAHRAILVARCEV .: .: ::.. . . . :::..:.: KIAA11 QAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPY 60 70 80 90 100 110 530 540 550 560 570 580 KIAA08 MAAMFNGNYMEAKSVLIPVYGVSKETFLSFLEYLYTDSCCPAGIFQAMCLLICAEMYQVS . :::.:.. :.:. : . :. .:. ....:.:: . . ... :: : . :. 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