# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06640y1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0865.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0865, 1900 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7781390 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8377+/-0.000216; mu= 9.6806+/- 0.012 mean_var=196.2575+/-38.532, 0's: 29 Z-trim: 163 B-trim: 159 in 1/66 Lambda= 0.091551 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114650695|ref|XP_509728.2| PREDICTED: myosin he (2101) 12637 1683.7 0 gi|148921595|gb|AAI46792.1| Myosin XVI [Homo sapie (1858) 12442 1657.8 0 gi|152112422|sp|Q9Y6X6.3|MYO16_HUMAN RecName: Full (1858) 12436 1657.0 0 gi|109121310|ref|XP_001085293.1| PREDICTED: simila (1996) 12125 1616.0 0 gi|73989495|ref|XP_542665.2| PREDICTED: similar to (1519) 7918 1060.2 0 gi|194222041|ref|XP_001916958.1| PREDICTED: simila (1875) 7857 1052.3 0 gi|81868287|sp|Q9ERC1.1|MYO16_RAT RecName: Full=My (1912) 7574 1014.9 0 gi|148886600|sp|Q5DU14.2|MYO16_MOUSE RecName: Full (1919) 7472 1001.4 0 gi|124487113|ref|NP_001074866.1| myosin XVI [Mus m (1877) 7429 995.7 0 gi|194672164|ref|XP_001790685.1| PREDICTED: myosin (1717) 7131 956.3 0 gi|6636340|gb|AAF20150.1|AF209114_1 myosin heavy c (1322) 7058 946.5 0 gi|119629509|gb|EAX09104.1| hCG1811465 [Homo sapie (1034) 7038 943.8 0 gi|149635790|ref|XP_001514343.1| PREDICTED: simila (1881) 6942 931.4 0 gi|118084383|ref|XP_416950.2| PREDICTED: similar t (1902) 6565 881.6 0 gi|57997218|emb|CAD39107.2| hypothetical protein [ ( 935) 6114 821.7 0 gi|55661930|emb|CAH70520.1| novel protein [Homo sa ( 940) 6113 821.5 0 gi|34534881|dbj|BAC87143.1| unnamed protein produc ( 935) 5809 781.4 0 gi|55661931|emb|CAH70521.1| novel protein [Homo sa ( 878) 5620 756.4 2.6e-215 gi|21755006|dbj|BAC04608.1| unnamed protein produc ( 863) 5596 753.2 2.3e-214 gi|194381050|dbj|BAG64093.1| unnamed protein produ ( 857) 5423 730.4 1.8e-207 gi|26349671|dbj|BAC38475.1| unnamed protein produc ( 993) 5342 719.7 3.2e-204 gi|189523288|ref|XP_001920958.1| PREDICTED: simila (1860) 5079 685.3 1.4e-193 gi|194040651|ref|XP_001925002.1| PREDICTED: simila ( 791) 4432 599.4 4.2e-168 gi|149057565|gb|EDM08808.1| myosin heavy chain Myr (1213) 3799 516.0 8.1e-143 gi|169145601|emb|CAQ14200.1| novel protein similar (1470) 3602 490.1 6.2e-135 gi|47226960|emb|CAG05852.1| unnamed protein produc (1713) 3417 465.8 1.6e-127 gi|49117720|gb|AAH72580.1| Myosin XVI [Mus musculu ( 629) 3352 456.7 3.2e-125 gi|148690100|gb|EDL22047.1| mCG142184 [Mus musculu (1248) 2446 337.4 5.2e-89 gi|119629508|gb|EAX09103.1| hCG2011880 [Homo sapie ( 490) 1484 209.8 5.1e-51 gi|169146321|emb|CAQ14804.1| novel protein similar ( 339) 1468 207.5 1.8e-50 gi|198385443|gb|AAX59999.2| myosin 3B variant 2 [M (1261) 1277 183.0 1.6e-42 gi|68159936|gb|AAY86556.1| chitin synthase [Atrina (2286) 1260 181.0 1.1e-41 gi|215505558|gb|EEC15052.1| myosin-IX, putative [I (1837) 1181 170.5 1.3e-38 gi|156222790|gb|EDO43631.1| predicted protein [Nem (1257) 1155 166.8 1.1e-37 gi|7504367|pir||T33079 hypothetical protein F56A6. (1846) 1143 165.5 4.2e-37 gi|108873857|gb|EAT38082.1| myosin iii [Aedes aegy (1462) 1123 162.7 2.3e-36 gi|114669123|ref|XP_001166222.1| PREDICTED: myosin (1967) 1125 163.1 2.3e-36 gi|108873858|gb|EAT38083.1| myosin iii [Aedes aegy (1764) 1123 162.8 2.6e-36 gi|169154048|emb|CAQ14670.1| novel protein similar ( 888) 1110 160.7 5.5e-36 gi|189523244|ref|XP_001920287.1| PREDICTED: myosin (1288) 1110 160.9 6.9e-36 gi|212509312|gb|EEB12738.1| myosin IIIB, putative (1193) 1103 160.0 1.3e-35 gi|210111601|gb|EEA59398.1| hypothetical protein B (1222) 1102 159.8 1.4e-35 gi|109470060|ref|XP_001059499.1| PREDICTED: simila (1303) 1100 159.6 1.7e-35 gi|29123078|gb|AAO65847.1|AF512506_1 class IIIB my (1310) 1092 158.5 3.6e-35 gi|109468272|ref|XP_345367.3| PREDICTED: similar t (1362) 1088 158.0 5.4e-35 gi|109088453|ref|XP_001101244.1| PREDICTED: simila (1630) 1089 158.3 5.5e-35 gi|218511703|sp|Q1EG27.2|MYO3B_MOUSE RecName: Full (1305) 1082 157.2 9.1e-35 gi|162318404|gb|AAI57063.1| Myosin IIIB [synthetic (1333) 1082 157.2 9.2e-35 gi|148695110|gb|EDL27057.1| myosin IIIB [Mus muscu (1821) 1081 157.3 1.2e-34 gi|198385441|gb|AAX59998.2| myosin 3B variant 1 [M (1305) 1077 156.6 1.4e-34 >>gi|114650695|ref|XP_509728.2| PREDICTED: myosin heavy (2101 aa) initn: 12637 init1: 12637 opt: 12637 Z-score: 9026.3 bits: 1683.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 12637; 99.158% identity (99.632% similar) in 1900 aa overlap (1-1900:202-2101) 10 20 30 KIAA08 LRSETFSESRGEISKGCIFLLVGASHPHCG :::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 FYLQESASSAVCVERWGRGRDVSDSERGPELRSETFSESRGEISKGCIFLLVGASHPHCG 180 190 200 210 220 230 40 50 60 70 80 90 KIAA08 CFQLCNVFRSHEMEIDQCLLESLPLGQRQRLVKRMRCEQIKAYYEREKAFQKQEGFLKRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 CFQLCNVFRSHEMEIDQCLLESLPLGQRQRLVKRMRCEQIKAYYEREKAFQKQEGFLKRL 240 250 260 270 280 290 100 110 120 130 140 150 KIAA08 KHAKNPKVHFNLTDMLQDAIIHHNDKEVLRLLKEGADPHTLVSSGGSLLHLCARYDNAFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 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