# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06532.fasta.huge -Q ../query/KIAA0862.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0862, 584 aa vs ./tmplib.23663 library 1986921 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8154+/-0.00472; mu= 4.0315+/- 0.320 mean_var=135.5347+/-33.301, 0's: 0 Z-trim: 30 B-trim: 106 in 1/39 Lambda= 0.110166 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 516 94.1 9.4e-20 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 502 91.8 3.9e-19 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 467 86.2 1.7e-17 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 425 79.5 1.9e-15 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 414 77.6 4.3e-15 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 378 72.0 2.8e-13 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 320 62.6 1.3e-10 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 309 60.8 3.8e-10 KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 ( 793) 296 58.8 1.8e-09 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 252 51.8 2.2e-07 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 230 48.2 2e-06 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 226 47.7 4.5e-06 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 222 47.0 5.5e-06 KIAA1194 ( 575 res) fg00908 ( 575) 204 44.1 3.7e-05 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 199 43.4 7.6e-05 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 195 42.7 9.8e-05 KIAA0012 ( 789 res) ha00413 ( 789) 196 42.9 0.00011 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 195 42.8 0.00012 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 191 42.4 0.00031 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 187 41.6 0.00035 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 189 42.1 0.0004 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 180 40.4 0.00063 KIAA0975 ( 1528 res) hj06890 (1528) 184 41.3 0.00069 KIAA1674 ( 538 res) fg03838 ( 538) 174 39.3 0.00095 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 169 38.4 0.0014 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 167 38.3 0.0025 KIAA1898 ( 1013 res) fk06427 (1013) 162 37.6 0.0057 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 161 37.4 0.0063 >>KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630 aa) initn: 885 init1: 465 opt: 516 Z-score: 446.5 bits: 94.1 E(): 9.4e-20 Smith-Waterman score: 644; 33.590% identity (64.359% similar) in 390 aa overlap (171-559:12-374) 150 160 170 180 190 KIAA08 PAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLD-SLTTL .... .: :: .:. .: .:: . :: : KIAA01 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEEL 10 20 30 40 200 210 220 230 240 250 KIAA08 YLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQLEHLPKEI : :.. . : . : .: :.. .:.:..:: :.... .:. :::..:.. ..:. : KIAA01 LLDANQLRELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESI 50 60 70 80 90 100 260 270 280 290 300 310 KIAA08 GNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENN : . :.. : : ::: . .: ::..:.: :.:.: .... . : :.:..: KIAA01 KFCKALEIADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELREN 110 120 130 140 150 160 320 330 340 350 360 370 KIAA08 NISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSR ...:: :: : ::::..: :. : ... : . .. .: KIAA01 LLKSLPASL-SFLVKLEQLDLGGNDLEVLP-----------------DTLGALP------ 170 180 190 380 390 400 410 420 430 KIAA08 AKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLL : .: . :::..:: ..:. .: :... :.: ..: ...::: : :.::.::: KIAA01 --NLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLL 200 210 220 230 240 250 440 450 460 470 480 490 KIAA08 KKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLT ..:: :.:.:..: : ...:.: . . :. ..:..:.::.: : .:::..:.::.:: KIAA01 RRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENLLMALPRSLGKLTKLT 260 270 280 290 300 310 500 510 520 530 540 550 KIAA08 HLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKLSIMSIENCPLSHLP .:.. .: : :: ::: : : : :: : :: ::: ..: .... . :. :: KIAA01 NLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDN-RLAVLPPELAHTTELHVLDVAGNRLQSLP 320 330 340 350 360 370 560 570 580 KIAA08 PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV KIAA01 FALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQPPLSLEDAGQQGSLS 380 390 400 410 420 430 >>KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371 aa) initn: 427 init1: 427 opt: 502 Z-score: 435.5 bits: 91.8 E(): 3.9e-19 Smith-Waterman score: 624; 29.659% identity (58.517% similar) in 499 aa overlap (96-584:11-460) 70 80 90 100 110 120 KIAA08 VAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCR-----EENSMRLDLSKRSIHILPSS : :: ::. :: :. :.. .:. 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KIAA12 LHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQK 360 370 380 390 400 410 540 550 560 570 580 KIAA08 ALCSKLSIMSIENCPLSHLPP----QIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV :. . : . : . . : .... . :: .. . : ::.: KIAA12 ETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDER 420 430 440 450 460 470 KIAA12 EAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDV 480 490 500 510 520 530 >>KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258 aa) initn: 345 init1: 229 opt: 467 Z-score: 405.9 bits: 86.2 E(): 1.7e-17 Smith-Waterman score: 467; 27.479% identity (57.851% similar) in 484 aa overlap (99-562:182-650) 70 80 90 100 110 120 KIAA08 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT : .:.. : . ..:::: .. .. 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KIAA09 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV 390 400 410 420 430 440 370 380 390 400 410 420 KIAA08 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED ... ::.. . .: : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . . KIAA09 DLRDNRLTDLD---LSSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 KIAA08 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT : . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.: KIAA09 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG 500 510 520 530 540 550 490 500 510 520 530 KIAA08 NNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE--------EIGTLENLEELYLNDNPNLH .:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:. 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KIAA06 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAK 660 670 680 690 700 710 450 460 470 480 490 500 KIAA08 LRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLL :..:.:.:: :::...:. : . .. .. .: . ..:. . .: .. . :. : : KIAA06 LEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNEL 720 730 740 750 760 510 520 530 540 550 560 KIAA08 TH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGG .. :::.. .:.:: :. :: : KIAA06 SEVTLPENLP--PKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWS 770 780 790 800 810 820 >>KIAA0231 ( 823 res) fk16230 (823 aa) initn: 547 init1: 230 opt: 414 Z-score: 362.8 bits: 77.6 E(): 4.3e-15 Smith-Waterman score: 414; 27.363% identity (62.935% similar) in 402 aa overlap (172-559:415-809) 150 160 170 180 190 200 KIAA08 AEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHN-KLREIPSVVYRLDSLTTLY ::....: .. .... : . . .. . KIAA02 DFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVK-NAQDKIE 390 400 410 420 430 440 210 220 230 240 250 KIAA08 LRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQL--EHLPKE :.. .. . .. .:... .::.. .::. ...: :: : : :..: .: : KIAA02 LHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDH-PAL 450 460 470 480 490 500 260 270 280 290 300 310 KIAA08 IGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLA--KCSALEEL-N .. : :. .:. .: . .:..:..: : ..:..:. . ....: : KIAA02 AFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKEL---YLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKN 510 520 530 540 550 320 330 340 350 360 370 KIAA08 LEN----NNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINK :.. ...: .:. . . : .:..:.: . .: ... ... .. ::.. ... KIAA02 LRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLER 560 570 580 590 600 610 380 390 400 410 420 KIAA08 IPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSL :: .::: . : .:....:.: .. ..: .. :.: :... :: ....: .: KIAA02 IPHSIFSLNN-LHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNL 620 630 640 650 660 670 430 440 450 460 470 480 KIAA08 EVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLP : : :..: ...:: : ::. ::: :.: .:.:: ::..:: ...:::.. :: KIAA02 EQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLP 680 690 700 710 720 730 490 500 510 520 530 540 KIAA08 RGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKL--SI :. . .: : ::.: : .: ..: : :: .: : : :..:: :: :..: . KIAA02 DGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGN-YLETLPPELEGCQSLKRNC 740 750 760 770 780 790 550 560 570 580 KIAA08 MSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV . .:. :. :: KIAA02 LIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC 800 810 820 >>KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073 aa) initn: 287 init1: 119 opt: 378 Z-score: 330.4 bits: 72.0 E(): 2.8e-13 Smith-Waterman score: 381; 27.228% identity (57.178% similar) in 404 aa overlap (141-527:52-449) 120 130 140 150 160 KIAA08 KRSIHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLA---LSENSLTSLPDSL :: .: . :. . : : .: : KIAA08 LGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPLLDCSRRKLPAPSWRALSGLL 30 40 50 60 70 80 170 180 190 200 210 220 KIAA08 DNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIREN .::. ::.: . .. . ..: . . .:..: . . :....::. .: KIAA08 P--PDTAILDFSHNRLSNW-NISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTSNITLLSLVHN 90 100 110 120 130 230 240 250 260 270 280 KIAA08 KIKQLPAEIGELC-NLITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLP-DTIGNL : .. :. .. : .::.. : . .. :. :.:..:.. : . :: KIAA08 IIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNL 140 150 160 170 180 190 290 300 310 320 330 340 KIAA08 SS-LSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNC :: : . : ::.: :: .. : :. :.:. : :. . ...: .: :: . :: KIAA08 SSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNG 200 210 220 230 240 250 350 360 370 380 390 400 KIAA08 FQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWT .. :. .... :..::: .... : . ..:..: ...: . . : .: KIAA08 ISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPD--AWE 260 270 280 290 300 310 410 420 430 440 450 KIAA08 ---SMVELNLATNQLTKIPEDV-SGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGN-LRKLRELDLEE . ::.:. ::::.. :.. :: :: : :..: . .. :. : .:. :::.. KIAA08 FCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRN 320 330 340 350 360 370 460 470 480 490 500 510 KIAA08 NKL----ESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRG--IGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE :.. :. . .: : .: ::.: .::. .. . :: : .: :: :..: . . : KIAA08 NEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIG-LESLEHLDLNNNAIMSIQE 380 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 KIAA08 EIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQF . . .:.:: :: KIAA08 NAFSQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDL 440 450 460 470 480 490 >>KIAA1437 ( 811 res) hk07206 (811 aa) initn: 632 init1: 301 opt: 320 Z-score: 282.2 bits: 62.6 E(): 1.3e-10 Smith-Waterman score: 466; 28.908% identity (60.385% similar) in 467 aa overlap (104-562:356-799) 80 90 100 110 120 130 KIAA08 IKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLTELY-- :.: . : .: . ... . .: . : KIAA14 YISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREESSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDP 330 340 350 360 370 380 140 150 160 170 180 190 KIAA08 LYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALS-ENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVV :::... . .::. .: : :. : .: .: . : . . . :.:. : ::..: KIAA14 LYSKRFAVFLSEVSE-NKLRQLNLNNEWTLDKLRQRLTKNAQDK-LELHLFMLSGIPDTV 390 400 410 420 430 440 200 210 220 230 240 KIAA08 YRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIK-QLPAEIGELCNLITLDVAH . : : .: :.. .:. .: .:. :. : . .. : . :: :: .: . KIAA14 FDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKF 450 460 470 480 490 500 250 260 270 280 290 300 KIAA08 NQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCS ......: : . . .: : ::::. . :: .... : : . KIAA14 TDIKEIPLWIYSLKTLEELHLT-----------GNLSAENN---RYIVIDGL-RELKR-- 510 520 530 540 310 320 330 340 350 360 KIAA08 ALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRI :. : :..: .: ::. . . :.:..:.. . .: ... ...... :.. . . KIAA14 -LKVLRLKSN-LSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDL 550 560 570 580 590 600 370 380 390 400 410 420 KIAA08 NKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLV ..:: .::: . :.....:::.: .. ..: .. :.: :... :: ....:. KIAA14 ERIPHSIFSLHN-LQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLT 610 620 630 640 650 660 430 440 450 460 470 480 KIAA08 SLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTT .:: : :. : ..:.: : :::: ::: .:.: :: .:. :..::.:..: :.. : KIAA14 NLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRIET 670 680 690 700 710 720 490 500 510 520 530 540 KIAA08 LPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCS--KL :: . . .: : ::.:.: :: ..: : :: .. : : :. ::.::. : : KIAA14 LPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGN-RLECLPVELGECPLLKR 730 740 750 760 770 780 550 560 570 580 KIAA08 SIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV : . .:. .. :::.. KIAA14 SGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA 790 800 810 >>KIAA1469 ( 662 res) fj01881 (662 aa) initn: 188 init1: 113 opt: 309 Z-score: 273.9 bits: 60.8 E(): 3.8e-10 Smith-Waterman score: 309; 27.124% identity (60.131% similar) in 306 aa overlap (190-483:21-318) 160 170 180 190 200 210 KIAA08 LTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKL .. . . :.:. .... :. .. . KIAA14 RKLPCIKTSTLLTMISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRC 10 20 30 40 50 220 230 240 250 260 270 KIAA08 SMLSIRENK--IKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQLEH--LPKEIGNCTQITNLDLQHNEL . : : . ..:. : : . :: . .::... .:... : .. . : :: : KIAA14 DAGFIYCNDRFLTSIPTGIPE--DATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL 60 70 80 90 100 280 290 300 310 320 330 KIAA08 LDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPR-SLAKCSALEELNLENNNIS--TLPESLLSSL ..: .. . ...: :. : . .: ::.: ::::.:..:..: .. :. . . KIAA14 DEFPTNLPKY--VKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDS 110 120 130 140 150 160 340 350 360 370 380 390 KIAA08 VKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQ : : :.:: .. : : : :: : .. :::. : .. :..: . : KIAA14 NYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPR---TIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNL 170 180 190 200 210 220 400 410 420 430 440 KIAA08 LTSLPLD---FGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLP-HGLGN :.. : : . ....::.:. :.:: : .. : ..:. : :..: ....: .... KIAA14 LNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPG-TNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSY 230 240 250 260 270 280 450 460 470 480 490 500 KIAA08 LRKLRELDLEENKLESLPNEI-AYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL ::.: .::. .:.: .::. : : .. .:.: :: KIAA14 LRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNV 290 300 310 320 330 340 510 520 530 540 550 560 KIAA08 LTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGP KIAA14 RGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQP 350 360 370 380 390 400 >>KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 (793 aa) initn: 439 init1: 159 opt: 296 Z-score: 261.7 bits: 58.8 E(): 1.8e-09 Smith-Waterman score: 313; 35.079% identity (65.445% similar) in 191 aa overlap (387-577:168-355) 360 370 380 390 400 410 KIAA08 STIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQL ... :.:. .:... ..:. ::: : . KIAA10 SGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCI 140 150 160 170 180 190 420 430 440 450 460 470 KIAA08 TKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQ ::: . .: : : :: : :. :: : .: :. : .::: :::.::. ::.:. 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KIAA04 IISLGLYSQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPE--GVTVLYLHNNQINNA 70 80 90 100 110 120 260 270 280 290 300 310 KIAA08 -LPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSR-LGLRYNRLSAIPRS-LAKCSAL .: :. : .. .. : :.: ..: :: . : : :. : ...: :. ::. : KIAA04 GFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFP---MNLPKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKL 130 140 150 160 170 180 320 330 340 350 360 KIAA08 EELNLENNNISTL--PESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRI :::.:..:.:::. .. . ..:. : :..: .. ::: : ... : ...::: KIAA04 EELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQE---LRVDENRI 190 200 210 220 230 370 380 390 400 410 420 KIAA08 NKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTW---TSMVELNLATNQLTKIPEDVSGL : :. : .: . : ::. . ::. :.. :.... :.:.. : :. : KIAA04 AVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPG- 240 250 260 270 280 290 430 440 450 460 470 480 KIAA08 VSLEVLILSNNLLKKLP-HGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEI-AYLKDLQKLVLTNNQ . : : :..: ....: ...:::::..::. .:.:. : . . :..:..:. :: KIAA04 THLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNNP 300 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 540 KIAA08 LTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSK KIAA04 WFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPLFT 360 370 380 390 400 410 584 residues in 1 query sequences 1986921 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:19:08 2008 done: Thu Dec 18 15:19:09 2008 Total Scan time: 0.490 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]