# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06136.fasta.nr -Q ../query/KIAA0853.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0853, 967 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7800690 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4579+/-0.000211; mu= 8.1326+/- 0.012 mean_var=166.4548+/-31.494, 0's: 36 Z-trim: 151 B-trim: 196 in 2/63 Lambda= 0.099409 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|68052314|sp|Q5T200.1|ZC3HD_HUMAN RecName: Full= (1668) 6366 926.4 0 gi|109120663|ref|XP_001097211.1| PREDICTED: zinc f (1696) 6273 913.1 0 gi|52545594|emb|CAB66679.2| hypothetical protein [ (1267) 5635 821.4 0 gi|122889118|emb|CAM13064.1| zinc finger CCCH-type (1564) 5629 820.7 0 gi|193786707|dbj|BAG52030.1| unnamed protein produ ( 624) 4095 600.2 9.9e-169 gi|61742810|ref|NP_080359.2| RIKEN cDNA 3110050K21 (1729) 3686 542.1 8.7e-151 gi|109502725|ref|XP_001072035.1| PREDICTED: simila (1727) 3657 537.9 1.5e-149 gi|109501760|ref|XP_224295.4| PREDICTED: similar t (1728) 3650 536.9 3.1e-149 gi|149635930|ref|XP_001514344.1| PREDICTED: simila (1592) 3345 493.1 4.3e-136 gi|126337731|ref|XP_001370189.1| PREDICTED: simila (1589) 3328 490.7 2.3e-135 gi|149049968|gb|EDM02292.1| rCG37038 [Rattus norve ( 558) 3109 458.7 3.4e-126 gi|109502566|ref|XP_001064314.1| PREDICTED: simila ( 594) 3074 453.7 1.2e-124 gi|109501796|ref|XP_573801.2| PREDICTED: similar t ( 539) 3071 453.3 1.5e-124 gi|23271723|gb|AAH23707.1| Zc3h13 protein [Mus mus ( 451) 2697 399.5 1.8e-108 gi|76631359|ref|XP_612879.2| PREDICTED: zinc finge (1652) 2626 390.0 4.9e-105 gi|194040628|ref|XP_001927376.1| PREDICTED: simila (1588) 2589 384.7 1.9e-103 gi|148703883|gb|EDL35830.1| mCG119432 [Mus musculu ( 932) 2429 361.5 1.1e-96 gi|169153845|emb|CAQ15405.1| novel protein (zgc:66 (1759) 1986 298.3 2.2e-77 gi|21732311|emb|CAD38544.1| hypothetical protein [ ( 796) 1786 269.2 5.6e-69 gi|193786004|dbj|BAG50980.1| unnamed protein produ ( 253) 1653 249.5 1.5e-63 gi|74140656|dbj|BAB27448.3| unnamed protein produc ( 260) 1410 214.7 4.7e-53 gi|47226837|emb|CAG06679.1| unnamed protein produc ( 933) 1138 176.3 5.9e-41 gi|156230497|gb|AAI51944.1| LOC560041 protein [Dan ( 320) 1073 166.4 1.9e-38 gi|54038076|gb|AAH84352.1| LOC495149 protein [Xeno (1029) 1031 161.0 2.6e-36 gi|210120814|gb|EEA68530.1| hypothetical protein B (1736) 831 132.6 1.6e-27 gi|210084913|gb|EEA33411.1| hypothetical protein B (1706) 777 124.9 3.3e-25 gi|194040630|ref|XP_001927438.1| PREDICTED: hypoth ( 193) 691 111.4 4.3e-22 gi|149456961|ref|XP_001519800.1| PREDICTED: hypoth ( 178) 656 106.3 1.3e-20 gi|170946301|emb|CAP73102.1| unnamed protein produ ( 871) 643 105.3 1.3e-19 gi|88179101|gb|EAQ86569.1| hypothetical protein CH ( 888) 634 104.0 3.3e-19 gi|165988479|gb|EAL61962.2| putative THO2 protein (2110) 582 97.0 1e-16 gi|124425464|emb|CAK90250.1| unnamed protein produ ( 842) 553 92.4 9.9e-16 gi|194189676|gb|EDX03252.1| GD23040 [Drosophila si ( 783) 532 89.3 7.7e-15 gi|156224464|gb|EDO45290.1| predicted protein [Nem (1520) 534 90.0 9.6e-15 gi|74209075|dbj|BAE24941.1| unnamed protein produc ( 634) 521 87.6 2e-14 gi|194123384|gb|EDW45427.1| GM16758 [Drosophila se ( 437) 517 86.9 2.3e-14 gi|149025083|gb|EDL81450.1| rCG20774, isoform CRA_ ( 836) 521 87.8 2.4e-14 gi|148670793|gb|EDL02740.1| mCG4942, isoform CRA_b ( 838) 521 87.8 2.4e-14 gi|187956932|gb|AAI58105.1| Rbm25 protein [Mus mus ( 841) 521 87.8 2.4e-14 gi|221502126|gb|EEE27870.1| glycine-rich RNA-bindi ( 763) 520 87.6 2.5e-14 gi|157340749|emb|CAO47554.1| unnamed protein produ ( 971) 521 87.9 2.6e-14 gi|126282381|ref|XP_001368262.1| PREDICTED: simila ( 840) 515 86.9 4.3e-14 gi|190661660|gb|EDV58852.1| GG10289 [Drosophila er ( 956) 512 86.6 6.4e-14 gi|73963505|ref|XP_867651.1| PREDICTED: similar to ( 708) 510 86.1 6.4e-14 gi|193787712|dbj|BAG52915.1| unnamed protein produ ( 638) 509 85.9 6.6e-14 gi|114653782|ref|XP_510044.2| PREDICTED: hypotheti ( 706) 509 86.0 7e-14 gi|109084214|ref|XP_001086291.1| PREDICTED: simila ( 706) 509 86.0 7e-14 gi|73963519|ref|XP_867717.1| PREDICTED: similar to ( 708) 509 86.0 7.1e-14 gi|4050087|gb|AAC97961.1| S164 [Homo sapiens] ( 735) 509 86.0 7.2e-14 gi|68068009|sp|P49756.2|RBM25_HUMAN RecName: Full= ( 784) 509 86.0 7.5e-14 >>gi|68052314|sp|Q5T200.1|ZC3HD_HUMAN RecName: Full=Zinc (1668 aa) initn: 6366 init1: 6366 opt: 6366 Z-score: 4940.8 bits: 926.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 6366; 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