# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/af09475.fasta.huge -Q ../query/KIAA0816.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0816, 1950 aa vs ./tmplib.23663 library 1985555 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7671+/-0.00625; mu= 21.6570+/- 0.426 mean_var=133.0922+/-30.488, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 31 in 1/39 Lambda= 0.111173 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 473 89.0 8.3e-18 KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640) 399 77.3 3.5e-14 KIAA1776 ( 2816 res) fh11044s3 (2816) 324 65.6 1.9e-10 KIAA1780 ( 1192 res) pf01012 (1192) 294 60.2 3.5e-09 KIAA1781 ( 974 res) fg06971(revised) ( 974) 259 54.5 1.5e-07 KIAA1127 ( 2144 res) bf00005 (2144) 231 50.5 5.2e-06 KIAA0817 ( 2785 res) hg01392s2 (2785) 171 41.1 0.0047 KIAA0932 ( 1078 res) hh04016s1 (1078) 166 39.6 0.005 >>KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322 aa) initn: 672 init1: 237 opt: 473 Z-score: 411.5 bits: 89.0 E(): 8.3e-18 Smith-Waterman score: 776; 37.101% identity (57.971% similar) in 345 aa overlap (54-393:203-523) 30 40 50 60 70 80 KIAA08 TLRGLLRRAVRREPAGPRASGAGGTMRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHF--- :.:: :. : . :: : : ::. : KIAA20 TCPPTCHEQHPEPGWHCQVVACVEGCFCPEGTLLHGGA-CLEP-ASCP-CEWGRNSFPPG 180 190 200 210 220 90 100 110 120 130 KIAA08 TCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCILPTCSPLDFHC-DNGKCIRRSWVCD . . :.::: .::.: :: : : .: ..:.:. . : .::.:. ..:.:: KIAA20 SVLQKDCGNCTCQEGQWHCGGD---GGHCEE---LVPACAEGEALCQENGHCVPHGWLCD 230 240 250 260 270 280 140 150 160 170 180 190 KIAA08 GDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDK ...:: : :::. : : : .. :..:.:. :: ..::::..:: : . 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KIAA08 TNNPGGYECGCYAGYRLSADGCGCEDVDECASSRGGCEHHCTNLAGSFQCSCEAGYRLHE 470 480 490 500 510 520 480 490 500 510 520 530 KIAA08 DRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVT :::.:. : ::.. . ... . . ::: KIAA08 DRRGCSPL-EEPMVDLDGELPFVRPLPHIAVLQDELPQLFQDDDVGADEEEAELRGEHTL 530 540 550 560 570 580 >>KIAA1776 ( 2816 res) fh11044s3 (2816 aa) initn: 653 init1: 181 opt: 324 Z-score: 279.3 bits: 65.6 E(): 1.9e-10 Smith-Waterman score: 495; 27.027% identity (47.523% similar) in 444 aa overlap (75-481:1082-1491) 50 60 70 80 90 100 KIAA08 AGGTMRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDND :.:. . : : :: ....:. KIAA17 VNTPGSFECECFPGYESGFMLMKNCMDVDECARDPLLCR---GGTCTNTDGSYKCQCPPG 1060 1070 1080 1090 1100 110 120 130 140 150 160 KIAA08 CGDHSDEDGCI-LPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRE-CEE-D . .: . :: : : .:.:. : .: . :. : :. : . . KIAA17 HELTAKGTACEDIDECSLSDGLCPHGQCVN----VIGAFQCSCHAGFQSTPDRQGCVDIN 1110 1120 1130 1140 1150 1160 170 180 190 200 210 KIAA08 EFPCQNGYCIRSLWHCDGDN--DCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDT : ::: : . .:. .::.. . . : : :.: . .: .. . .. .: . KIAA17 ECRVQNGGCDVHCINTEGSYRCSCGQGYSLMPDGRACADVD-ECEENPRVCDQGHCTNMP 1170 1180 1190 1200 1210 1220 220 230 240 250 KIAA08 D-----CKDG----SDEENCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILD----IYHCD------- : :: : ..: : . :.:. : .: : . ::. KIAA17 GGHRCLCYDGFMATPDMRTC---VDVDECDLNPHICLHGDCENTKGSFVCHCQLGYMVRK 1230 1240 1250 1260 1270 1280 260 270 280 290 300 310 KIAA08 GDDDCGDWSDESD-----CSSHQPCRS--GEFMCDSGLCINAGWRCDGDADCDDQSDERN : :.: :: . :.:: : . : : : :. :: :: .: : :: KIAA17 GATGCSD-VDECEVGGHNCDSHASCLNIPGSFSCR---CL-PGWVGDG-FECHDL-DE-- 1290 1300 1310 1320 1330 320 330 340 350 360 KIAA08 CTTSMCTAEQFRCHS-GRCVRL--SWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQCALDQFLCWN : ... :: : :. . :.:: .. : .: ::. .:: . :: : KIAA17 -----CISQEHRCSPRGDCLNVPGSYRCTCRQGFA--GDGFFCEDRD--ECAENVDLCDN 1340 1350 1360 1370 1380 370 380 390 400 410 420 KIAA08 GRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCA-QKCQMVRGAVQCTC :.:.. : : . .: .. : ..: .: :: .:. . : .: : KIAA17 GQCLNA----PGGYRCECEMGFDPTEDHRACQDVDECAQGNL-CAFGSCENLPGMFRCIC 1390 1400 1410 1420 1430 430 440 450 460 470 480 KIAA08 HTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQG-CTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKALGPE . ::.: . : .: :.::::. : .: : :. :.. : : .:: :. .: KIAA17 NGGYELDRGGGNCTDINECADPVNCINGVCINTPGSYLCSCPQDFELNPSGVGCVDTRAG 1440 1450 1460 1470 1480 1490 490 500 510 520 530 540 KIAA08 PVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNG KIAA17 NCFLETHDRGDSGISCSAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCELCPMANTTEYRTLCPGGE 1500 1510 1520 1530 1540 1550 >>KIAA1780 ( 1192 res) pf01012 (1192 aa) initn: 148 init1: 66 opt: 294 Z-score: 256.8 bits: 60.2 E(): 3.5e-09 Smith-Waterman score: 352; 26.305% identity (44.779% similar) in 498 aa overlap (66-472:154-615) 40 50 60 70 80 90 KIAA08 EPAGPRASGAGGTMRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPA : :.:: : : : . : : :. KIAA17 HRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCI--APNTCQCEPG 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 KIAA08 QW-------QCDGDN---DCGDHSD-EDGCILPTCSPLD--FHCDNGKCIRRSWVCDGDN : ::::. : .. . ..: . :.:. :: : :.: : .. KIAA17 -WGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGAL---CNPITGACHCAAG---FRGWRC--ED 190 200 210 220 230 150 160 170 180 190 KIAA08 DCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDC-----GDNSDEQCDMRKCS ::. . .:: : :. :::: : :. : : .. : : . KIAA17 RCEQGTYGNDCHQR-CQ-----CQNGATCD---HVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHG 240 250 260 270 280 200 210 220 230 240 KIAA08 DK-EFRC---SDGSCIAEHWYCDGDTDCKDG----SDEENCPSAVPAPPCNLEEFQCAYG . : :: . : : : . :. .: .: . :: . . :. .: :: : KIAA17 PQCEQRCPCQNGGVC---H-HVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCS-QECQCHNG 290 300 310 320 330 250 260 270 280 290 KIAA08 -RC--ILDIYHCD----GD---DDC--GDW----SDESDCSSHQPCR--SGEFMCDSGLC : ::. :. :.: : . .. .: . : :: .:..:. KIAA17 GTCDAATGQCHCSPGYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGF- 340 350 360 370 380 390 300 310 320 330 340 KIAA08 INAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSM-CTAEQFR-CH--SGRCV-RLSWR---CDGEDDC :: ::.. : . .: : :. . :: ::.:. . .: :. . : KIAA17 --AGERCEARL-CPEGLYGIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCN--ETC 400 410 420 430 440 450 350 360 370 380 KIAA08 ADNSDEENCENTGSPQCALDQFLC--WNGRCI---GQRKL-CN--------GVN---DCG . . : :.. : : . : : .:.: : . . :. :.: :: KIAA17 SPGFYGEACQQICSCQNGAD---CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCG 460 470 480 490 500 390 400 410 420 KIAA08 DNSDE--SP-QQNCRPRTGEE--NCNVN--NG----GCAQKCQMVRGAV------QCTCH ..: :: . .: ..: . .:.. .: :: :: . :.. ::: KIAA17 CKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGVDCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCA 510 520 530 540 550 560 430 440 450 460 470 480 KIAA08 TGYRLTEDGHTCQDVN---ECAEEGYCSQ--GCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKAL :.: . ::: . .:::. ::. :: . : .: : :. KIAA17 PGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAERCDCSHADGCHPTTG--HCRCLPGWSGVHCDSVCAEG 570 580 590 600 610 620 490 500 510 520 530 540 KIAA08 GPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRAN KIAA17 RWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGICECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSS 630 640 650 660 670 680 >>KIAA1781 ( 974 res) fg06971(revised) (974 aa) initn: 139 init1: 93 opt: 259 Z-score: 227.3 bits: 54.5 E(): 1.5e-07 Smith-Waterman score: 323; 25.047% identity (44.256% similar) in 531 aa overlap (2-466:55-548) 10 20 30 KIAA08 GGGPRATCGARRPPCTRDA-SPSGTLRGLLR ::: . : : : .: . : . KIAA17 SSAPGTALCTEECVHGRCVSPDTCHCEPGWGGPDCSSG-----CDSDHWGPHCSNRCQCQ 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 KIAA08 RAVRREPAGPRASGAGGTMRRQWGALLLGALLCA---HGLASSPECACGRSHFTCAVSAL .. .: :.: : : ::: :: . . : : : .: : KIAA17 NGALCNPITGACVCAAGF--RGWRC----EELCAPGTHGKGCQLPCQC-RHGASCDPRA- 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 KIAA08 GECTCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCILPTCSPLDFHCDNG-KCIRRSWVCDGDNDCED ::: : :. .. : : : : : : :.:: : . . : KIAA17 GECLCAPGYTGVYCEELCPPGSHGAHCEL-RC-P----CQNGGTCHHITGECACPPGWTG 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 KIAA08 DSDEQDCPP----RECEEDEFPCQNG-YC--IRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMR----K : ::: ..: .: ::..: : . . :: . . :: .:.: . . KIAA17 AVCAQPCPPGTFGQNCSQD-CPCHHGGQCDHVTGQCHCTA-GYMGDRCQEECPFGSFGFQ 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 KIAA08 CSDKEFRCSDGS-CIAEHWYCDGDTDCKDGSDEEN-CPSAVPAPPCNL-------EEFQC ::.. : .:. : :. . : .: :: .. .: :.: . ..: KIAA17 CSQR-CDCHNGGQCSPTTGACECEPGYKGPRCQERLCPEGLHGPGCTLPCPCDADNTISC 250 260 270 280 290 300 250 260 270 280 290 KIAA08 --AYGRCILDI----YHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDS--GLCINA---- . : : . .::. . : ..: :. :..: : : : : : KIAA17 HPVTGACTCQPGWSGHHCNESCPVGYYGD--GCQLPCTCQNGA-DCHSITGGCTCAPGFM 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 KIAA08 GWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQF-RCH--SGRCV-RLSWR-CDGEDDCADNSDE : : ..: . ::. :.:. .. : .: :. . .:. : : ... KIAA17 GEVCA--VSCAAGTYGPNCS-SICSCNNGGTCSPVDGSCTCKEGWQGLDCTLPCPSGTWG 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 KIAA08 ENCENTGSPQCALDQFLC--WNGRC------IGQR-KL-CN----GVNDCGDNSDESPQQ ::... . :: . : .: : .:. .: : :.: :... : : . KIAA17 LNCNESCT--CA-NGAACSPIDGSCSCTPGWLGDTCELPCPDGTFGLN-CSEHCDCSHAD 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 KIAA08 NCRPRTGEENCNVNNGG--CAQKCQMVR-G---AVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAE .: : ::. : .. : : . : : : .:.:.:..: . . .: ::: KIAA17 GCDPVTGHCCCLAGWTGIRCDSTCPPGRWGPNCSVSCSCENGGSCSPEDGSC----ECAP 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 500 KIAA08 EGY----CSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHR :. :.. : . . : KIAA17 -GFRGPLCQRICPPGFYGHGCAQPCPLCVHSSRPCHHISGICECLPGFSGALCNQVCAGG 530 540 550 560 570 580 >>KIAA1127 ( 2144 res) bf00005 (2144 aa) initn: 250 init1: 74 opt: 231 Z-score: 199.8 bits: 50.5 E(): 5.2e-06 Smith-Waterman score: 252; 25.084% identity (49.164% similar) in 299 aa overlap (195-478:2-253) 170 180 190 200 210 220 KIAA08 CQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYC-DGDTDCKD .:. .: : :: . : : ::. :. KIAA11 AECDVPMNQCIDPSC-GGHGSCIDGNCVCSA 10 20 30 230 240 250 260 270 KIAA08 GSDEENCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDI----YHCD-GDDDCGDWSDESDCSSHQP : :.: . : . :. :.:. . .:. . .: : .::.: KIAA11 GYKGEHCEEVDCLDPTCSSHGVCVNGECLCSPGWGGLNCELARVQCPD-----QCSGH-- 40 50 60 70 80 280 290 300 310 320 330 KIAA08 CRSGEFMCDSGLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHS-GRCVRLSWRC : .. :.::: .:: . .:.. .:... : . : :. . :: KIAA11 ---GTYLPDTGLC-----------SCDPNWMGPDCSVEVCSVD---CGTHGVCIGGACRC 90 100 110 120 340 350 360 370 380 390 KIAA08 DGEDDCADNSDEENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDC--GDNSDESPQQ . : . :.. :. :.: ... : .:.: :. :: . : : .. . . KIAA11 E-EGWTGAACDQRVCH----PRC-IEHGTCKDGKC-ECREGWNG-EHCTIGRQTAGTETD 130 140 150 160 170 400 410 420 430 440 KIAA08 NCRPRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNE--CAE---- .: : . :: .:: .: . ... ::.:.::.: : :. . : ::. 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