# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05006.fasta.nr -Q ../query/KIAA0768.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0768, 872 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824805 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0926+/-0.000183; mu= 13.7144+/- 0.010 mean_var=75.6976+/-14.805, 0's: 41 Z-trim: 61 B-trim: 11 in 1/64 Lambda= 0.147412 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|47116772|sp|Q9HAR2.2|LPHN3_HUMAN RecName: Full= (1447) 5759 1235.1 0 gi|114594577|ref|XP_001135082.1| PREDICTED: latrop (1421) 5740 1231.0 0 gi|74203037|dbj|BAE26219.1| unnamed protein produc ( 857) 5302 1137.7 0 gi|149035159|gb|EDL89863.1| latrophilin 3, isoform (1456) 5291 1135.5 0 gi|3695135|gb|AAC62660.1| CL3AA [Rattus norvegicus (1459) 5291 1135.5 0 gi|149035158|gb|EDL89862.1| latrophilin 3, isoform (1524) 5291 1135.6 0 gi|3695141|gb|AAC62663.1| CL3BA [Rattus norvegicus (1527) 5291 1135.6 0 gi|189514645|ref|XP_689120.3| PREDICTED: si:ch211- (1473) 3826 824.0 0 gi|119625935|gb|EAX05530.1| latrophilin 3, isoform (1271) 3697 796.5 0 gi|119625930|gb|EAX05525.1| latrophilin 3, isoform (1500) 3695 796.1 0 gi|119625931|gb|EAX05526.1| latrophilin 3, isoform (1228) 3691 795.2 0 gi|37748723|gb|AAH58992.1| Lphn3 protein [Mus musc ( 994) 3680 792.8 0 gi|149035154|gb|EDL89858.1| latrophilin 3, isoform (1270) 3672 791.2 0 gi|3695139|gb|AAC62662.1| CL3AC [Rattus norvegicus (1273) 3672 791.2 0 gi|149035153|gb|EDL89857.1| latrophilin 3, isoform (1338) 3672 791.2 0 gi|3695145|gb|AAC62665.1| CL3BC [Rattus norvegicus (1341) 3672 791.2 0 gi|4164057|gb|AAD05323.1| latrophilin 3 splice var (1274) 3669 790.5 0 gi|4164069|gb|AAD05329.1| latrophilin 3 splice var (1342) 3669 790.6 0 gi|149035156|gb|EDL89860.1| latrophilin 3, isoform (1227) 3666 789.9 0 gi|3695137|gb|AAC62661.1| CL3AB [Rattus norvegicus (1230) 3666 789.9 0 gi|4164053|gb|AAD05321.1| latrophilin 3 splice var (1503) 3667 790.2 0 gi|4164065|gb|AAD05327.1| latrophilin 3 splice var (1571) 3667 790.2 0 gi|149035155|gb|EDL89859.1| latrophilin 3, isoform (1295) 3666 789.9 0 gi|3695143|gb|AAC62664.1| CL3BB [Rattus norvegicus (1298) 3666 789.9 0 gi|4164055|gb|AAD05322.1| latrophilin 3 splice var (1231) 3663 789.3 0 gi|4164067|gb|AAD05328.1| latrophilin 3 splice var (1299) 3663 789.3 0 gi|157885933|emb|CAP09316.1| novel protein similar (1098) 3368 726.5 1.5e-206 gi|221042824|dbj|BAH13089.1| unnamed protein produ ( 493) 3286 708.8 1.5e-201 gi|119626745|gb|EAX06340.1| latrophilin 2, isoform (1337) 3080 665.3 4.8e-188 gi|5880494|gb|AAD54677.1|AF104939_1 lectomedin-1 g (1403) 3080 665.3 5e-188 gi|114557337|ref|XP_001170301.1| PREDICTED: latrop (1403) 3080 665.3 5e-188 gi|4164021|gb|AAD05305.1| latrophilin 2 splice var (1341) 3070 663.2 2.1e-187 gi|4164037|gb|AAD05313.1| latrophilin 2 splice var (1407) 3070 663.2 2.2e-187 gi|194211172|ref|XP_001497658.2| PREDICTED: simila (1348) 3065 662.1 4.4e-187 gi|73959729|ref|XP_853567.1| PREDICTED: similar to (1403) 3052 659.4 3.1e-186 gi|119626737|gb|EAX06332.1| latrophilin 2, isoform (1350) 2931 633.6 1.7e-178 gi|55663706|emb|CAH71345.1| latrophilin 2 [Homo sa (1416) 2931 633.6 1.8e-178 gi|4164029|gb|AAD05309.1| latrophilin 2 splice var (1354) 2921 631.5 7.4e-178 gi|4164045|gb|AAD05317.1| latrophilin 2 splice var (1420) 2921 631.5 7.7e-178 gi|149026216|gb|EDL82459.1| latrophilin 2, isoform (1419) 2868 620.2 1.9e-174 gi|3695125|gb|AAC62655.1| CL2AB [Rattus norvegicus (1420) 2868 620.2 1.9e-174 gi|189524961|ref|XP_689067.3| PREDICTED: wu:fb72a0 (1416) 2817 609.4 3.5e-171 gi|119625932|gb|EAX05527.1| latrophilin 3, isoform (1280) 2815 608.9 4.3e-171 gi|119625933|gb|EAX05528.1| latrophilin 3, isoform (1237) 2814 608.7 4.9e-171 gi|11037016|gb|AAG27462.1|AF307080_1 lectomedin-3 (1240) 2814 608.7 4.9e-171 gi|163792198|ref|NP_056051.2| latrophilin 3 precur (1469) 2814 608.8 5.6e-171 gi|119625934|gb|EAX05529.1| latrophilin 3, isoform (1509) 2814 608.8 5.7e-171 gi|109074708|ref|XP_001101643.1| PREDICTED: latrop (1505) 2808 607.5 1.4e-170 gi|114594579|ref|XP_001134988.1| PREDICTED: latrop ( 840) 2805 606.6 1.4e-170 gi|74181247|dbj|BAE27870.1| unnamed protein produc (1298) 2797 605.1 6.2e-170 >>gi|47116772|sp|Q9HAR2.2|LPHN3_HUMAN RecName: Full=Latr (1447 aa) initn: 5759 init1: 5759 opt: 5759 Z-score: 6610.8 bits: 1235.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 5759; 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