# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04726.fasta.huge -Q ../query/KIAA0763.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0763, 843 aa vs ./tmplib.23663 library 1986662 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1534+/-0.00694; mu= -0.1500+/- 0.470 mean_var=196.3316+/-47.547, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.091533 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555) 1691 236.6 1.6e-62 KIAA1110 ( 740 res) hh04831b(revised) ( 740) 1335 189.3 1.3e-48 KIAA0248 ( 1880 res) ha02775s1 (1880) 459 73.9 1.8e-13 KIAA0942 ( 537 res) hh04979s1 ( 537) 310 53.8 5.8e-08 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 306 53.5 1.4e-07 >>KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555 aa) initn: 2492 init1: 1406 opt: 1691 Z-score: 1214.2 bits: 236.6 E(): 1.6e-62 Smith-Waterman score: 3248; 62.486% identity (79.402% similar) in 869 aa overlap (1-829:401-1234) 10 20 30 KIAA07 VEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQM :::::::::: ...:.::::::::::::.: KIAA05 ALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRM 380 390 400 410 420 430 40 50 60 70 80 KIAA07 NKNFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHS-SYFEGKQVSVTNDGSQLGAL :::::::::: ::.::::::.::::::::::: ::... .::::: .:. ..:.. :: KIAA05 NKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASL-DEGAMAGAR 440 450 460 470 480 90 100 110 120 130 140 KIAA07 VS------P---ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNC : :: . .: . :..:.. ::::::.::.::::::::::.:::: KIAA05 SHRLERGLPYGGSCGGGIDGGG-SSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNC 490 500 510 520 530 540 150 160 170 180 190 KIAA07 R-SLHTEEAPALDAARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLS . : : :. . :... : . : ..:.::. ::.:. .: . 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KIAA11 EDLKESIAEVTELEQIRIEWELEKQQGTKTLSFKPCGAQGDPQSKQGSPTAKREAALRER 530 540 550 560 570 580 800 810 820 830 840 KIAA07 YASG--EGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQPFEPLQPSVLCS : . : .. :..: .. . ...:: .:. . : :: : KIAA11 PAESTVEVSIHNRLQTSQHNSGLGAERGAPVPPPDLQPSPPRQQTPPLPPPPPTPPGTLV 590 600 610 620 630 640 KIAA11 QCQQIVKVIVLDKPCLARMEPLLSQALSCYTSSSSDSCGSTPLGGPGSPVKVTHQPPLPP 650 660 670 680 690 700 >>KIAA0248 ( 1880 res) ha02775s1 (1880 aa) initn: 449 init1: 151 opt: 459 Z-score: 333.8 bits: 73.9 E(): 1.8e-13 Smith-Waterman score: 459; 37.745% identity (71.078% similar) in 204 aa overlap (404-604:720-917) 380 390 400 410 420 430 KIAA07 SLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGF-- .:. : . ::.::.::.:.: :.:. KIAA02 DSGADKKFARKPPRFSCLLPDPRELIEIKNKKKLLITGTEQFNQKPKKGIQFLQEKGLLT 690 700 710 720 730 740 440 450 460 470 480 490 KIAA07 VPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKF .: . ::..: . :...:::::...:. : :.:. :. ..:. ..:::::: . KIAA02 IPMDNTEVAQWLRENPRLDKKMIGEFVSDRK---NIDLLESFVSTFSFQGLRLDEALRLY 750 760 770 780 790 800 500 510 520 530 540 550 KIAA07 QAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNV .:. ::: ..::.:::..:. :: . : : :. : ::.:.:.::::... :: KIAA02 LEAFRLPGEAPVIQRLLEAFTERWMNCNGS---PFANSDACFSLAYAVIMLNTDQHNHNV 810 820 830 840 850 860 560 570 580 590 600 610 KIAA07 KPERK-MKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIV . . : ::.: :::.::. :.:. ...: .:. :...:. :.... :.. KIAA02 RKQNAPMTLEEFRKNLKGVNGGKDFEQDILEDMYHAIKNEEIVMPEEQTGLVRENYVWNV 870 880 890 900 910 920 620 630 640 650 660 670 KIAA07 GKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKI KIAA02 LLHRGATPEGIFLRVPTASYDLDLFTMTWGPTIAALSYVFDKSLEETIIQKAISGFRKCA 930 940 950 960 970 980 >>KIAA0942 ( 537 res) hh04979s1 (537 aa) initn: 292 init1: 133 opt: 310 Z-score: 234.8 bits: 53.8 E(): 5.8e-08 Smith-Waterman score: 310; 30.808% identity (64.646% similar) in 198 aa overlap (439-630:78-269) 410 420 430 440 450 460 KIAA07 RIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRD .:. : : ..:. ... :: ....:.. KIAA09 SEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEAAKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLG-KNNEFSKL 50 60 70 80 90 100 470 480 490 500 510 520 KIAA07 VLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRN : . . .::. : ::..:: : . . ::.:. ::.. ::.:: ::: .. . 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KIAA20 EADSAIESQPSSEGPPGTAYPPAPRPGPLPGPHPSLGSGNEDEDDDEAGGEEDVDDEVFE 380 390 400 410 420 430 240 250 260 270 280 290 KIAA07 TSCRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSER--GSLKRQSAYERSLGGQ .: . :. :. . : :: . : .:. ..: : : . ... ::.. KIAA20 ASEGARPG-SRMPLKSPVPFLPGTS--PSADGPDSFSCVFEAILESHRAKGTSYTSLASL 440 450 460 470 480 490 300 310 320 330 340 KIAA07 QGSPKHGPHSGAPK---SLPREEPELRPRPPRPLDSHLA-INGSANRQSKSESDYSD-GD .. . :: . .: :: . : :: :: : . :: .. ... .: ... ... :. KIAA20 EALASPGP-TQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAP--APLAPLEPDSGTSSAADGPWTQRGE 500 510 520 530 540 550 350 360 370 380 390 400 KIAA07 NDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLR--EQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRH .. .. .. . : :.::: :... .. .. :: :.. KIAA20 EEEAEARAKLAPGREPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDSDSELDSTE------ 560 570 580 590 600 410 420 430 440 450 460 KIAA07 YRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVG--VAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQF :..: : . : : .. .:. : . :. . ... :: ....: KIAA20 -RLAL---------GSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLG-KNNDF 610 620 630 640 650 470 480 490 500 510 520 KIAA07 NRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQ .. : . . :. : ::.::: : .. ..::.:. ::.. ::::: ::: . KIAA20 SKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQCNP---EA 660 670 680 690 700 710 530 540 550 560 570 580 KIAA07 FRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYE . . : :. :..:::::... :. ..: ::: ::.:..:: :.:::.: ..: KIAA20 LSSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIG--KRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYS 720 730 740 750 760 590 600 610 620 630 KIAA07 RIRKRELKTNEDH------VSQVQ----KVEKLIVGKKPIGS-----LHPGLGCVLSLPH :....:. :. .:.. :: : : : . :: : : : .. : KIAA20 SIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELADPNPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAV-YKH 770 780 790 800 810 820 640 650 660 670 680 KIAA07 RRLVCYCRLFEVPDPNK-PQ-KLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYS-FRQSFS :: .. :: : :. : : .. . .: . .: . : : .... . .....: KIAA20 GALVR--KVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKGMILYLQKEEYKPGKALSETELKNAIS 830 840 850 860 870 880 690 700 710 720 730 740 KIAA07 LY-GMQVLLFENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQE .. .. . . . :. . : . :: .:.. :.::. .. ... . : . KIAA20 IHHALATRASDYSKRPHVFYLRT----ADWRVFL-FQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSA 890 900 910 920 930 940 750 760 770 780 790 800 KIAA07 MEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSL . . . .:: :: . . .. : ... . :. : .:..: : KIAA20 PP---FPAAVSSQKKFSRPLLPSAAT-----------RLSQEEQVRTHEA-KLKAMASEL 950 960 970 980 810 820 830 840 KIAA07 RDLSEA--GKRGRRSSAGSLESNVEFQPFEPLQPSVLCS :. : ::.:: . : ... . :: KIAA20 REHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDAVEAALA 990 1000 1010 1020 1030 1040 843 residues in 1 query sequences 1986662 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:15:05 2008 done: Thu Dec 18 15:15:05 2008 Total Scan time: 0.610 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]