# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02385.fasta.nr -Q ../query/KIAA0673.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0673, 1215 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7821019 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8100+/-0.000197; mu= 12.2831+/- 0.011 mean_var=108.8944+/-20.672, 0's: 42 Z-trim: 53 B-trim: 114 in 2/64 Lambda= 0.122906 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|27923813|sp|O75161.2|NPHP4_HUMAN RecName: Full= (1426) 8121 1451.9 0 gi|55663581|emb|CAH72673.1| nephronophthisis 4 [Ho (1425) 8091 1446.6 0 gi|187943684|gb|ACD40047.1| nephroretinin 4 [Canis (1429) 6348 1137.5 0 gi|194208120|ref|XP_001497212.2| PREDICTED: nephro (1436) 6332 1134.7 0 gi|123244648|emb|CAM23668.1| nephronophthisis 4 (j (1425) 6322 1132.9 0 gi|27923814|sp|P59240.1|NPHP4_MOUSE RecName: Full= (1425) 6314 1131.5 0 gi|119591913|gb|EAW71507.1| nephronophthisis 4, is (1197) 6276 1124.7 0 gi|149024742|gb|EDL81239.1| rCG31055, isoform CRA_ (1428) 6224 1115.5 0 gi|119591914|gb|EAW71508.1| nephronophthisis 4, is ( 914) 5948 1066.4 0 gi|193784845|dbj|BAG53998.1| unnamed protein produ ( 914) 5943 1065.5 0 gi|119591917|gb|EAW71511.1| nephronophthisis 4, is (1396) 5915 1060.7 0 gi|126329516|ref|XP_001377032.1| PREDICTED: simila (1434) 5413 971.7 0 gi|149634208|ref|XP_001511323.1| PREDICTED: simila (1369) 5098 915.8 0 gi|194674107|ref|XP_001787491.1| PREDICTED: nephro (1333) 4815 865.6 0 gi|148682995|gb|EDL14942.1| nephronophthisis 4 (ju (1355) 4815 865.6 0 gi|22770978|gb|AAN06815.1| nephronophthisis 4 [Mus (1356) 4811 864.9 0 gi|148682994|gb|EDL14941.1| nephronophthisis 4 (ju ( 915) 4793 861.6 0 gi|149024743|gb|EDL81240.1| rCG31055, isoform CRA_ ( 829) 4503 810.1 0 gi|26251987|gb|AAH40520.1| NPHP4 protein [Homo sap ( 911) 4372 786.9 0 gi|79158549|gb|AAI07906.1| Nphp4 protein [Rattus n ( 530) 2716 493.1 1.9e-136 gi|28386274|gb|AAH44732.1| Nphp4 protein [Mus musc ( 379) 2186 399.0 2.9e-108 gi|90078602|dbj|BAE88981.1| unnamed protein produc ( 606) 2033 372.0 5.9e-100 gi|210086187|gb|EEA34616.1| hypothetical protein B (1426) 1982 363.3 5.7e-97 gi|198423365|ref|XP_002122811.1| PREDICTED: simila (1393) 1954 358.4 1.8e-95 gi|210123360|gb|EEA71062.1| hypothetical protein B (1346) 1868 343.1 6.7e-91 gi|190584238|gb|EDV24308.1| hypothetical protein T ( 466) 1434 265.7 4.6e-68 gi|148725198|emb|CAN87787.1| novel protein similar ( 825) 1376 255.7 8.6e-65 gi|148725199|emb|CAN87788.1| novel protein similar ( 519) 1353 251.4 1e-63 gi|189522437|ref|XP_001921566.1| PREDICTED: simila (2026) 1353 251.9 2.8e-63 gi|148725204|emb|CAN88735.1| novel protein similar ( 765) 1346 250.3 3.3e-63 gi|47222789|emb|CAG01756.1| unnamed protein produc ( 958) 1168 218.8 1.2e-53 gi|221127678|ref|XP_002162068.1| PREDICTED: simila ( 455) 1082 203.3 2.8e-49 gi|134024363|gb|AAI35556.1| Nphp4.1 protein [Xenop ( 428) 875 166.6 3e-38 gi|5911990|emb|CAB55906.1| hypothetical protein [H ( 138) 867 164.7 3.5e-38 gi|34534200|dbj|BAC86935.1| unnamed protein produc ( 157) 784 150.0 1e-33 gi|156220939|gb|EDO41800.1| predicted protein [Nem ( 983) 730 141.2 3e-30 gi|115732213|ref|XP_001203849.1| PREDICTED: simila ( 274) 703 135.9 3.3e-29 gi|189522439|ref|XP_001921573.1| PREDICTED: simila ( 809) 438 89.3 9.9e-15 gi|163775893|gb|EDQ89515.1| predicted protein [Mon (1362) 407 84.0 6.5e-13 gi|47196599|emb|CAF87978.1| unnamed protein produc ( 108) 358 74.3 4.4e-11 gi|194399008|gb|ACF60596.1| nephroretinin [Canis l ( 57) 344 71.6 1.6e-10 gi|194399006|gb|ACF60595.1| nephroretinin [Canis l ( 57) 338 70.5 3.2e-10 gi|158277722|gb|EDP03489.1| nephrocystin-4-like pr (1772) 293 63.9 9.5e-07 gi|158590678|gb|EDP29293.1| hypothetical protein B (1242) 287 62.7 1.5e-06 gi|89295716|gb|EAR93704.1| hypothetical protein TT (1693) 282 62.0 3.6e-06 gi|72173847|ref|XP_797126.1| PREDICTED: similar to ( 75) 250 55.0 2e-05 gi|94732964|emb|CAK11182.1| novel protein similar ( 211) 254 56.1 2.5e-05 gi|194399000|gb|ACF60592.1| nephroretinin [Canis l ( 49) 233 51.8 0.00012 gi|194398998|gb|ACF60591.1| nephroretinin [Canis l ( 49) 228 50.9 0.00022 gi|187021168|emb|CAP39750.1| C. briggsae CBR-NPH-4 (1128) 229 52.4 0.0018 >>gi|27923813|sp|O75161.2|NPHP4_HUMAN RecName: Full=Neph (1426 aa) initn: 8121 init1: 8121 opt: 8121 Z-score: 7780.1 bits: 1451.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 8121; 100.000% identity (100.000% similar) in 1215 aa overlap (1-1215:212-1426) 10 20 30 KIAA06 QQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL :::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 NCSLQYTLKPHPALEPAFHLLPENLLVSGLQQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA06 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA06 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA06 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 KIAA06 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQEFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQEFP 490 500 510 520 530 540 340 350 360 370 380 390 KIAA06 LEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 LEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVLL 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 450 KIAA06 QSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 QSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGTS 610 620 630 640 650 660 460 470 480 490 500 510 KIAA06 WPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 WPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQL 670 680 690 700 710 720 520 530 540 550 560 570 KIAA06 RYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 RYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQAS 730 740 750 760 770 780 580 590 600 610 620 630 KIAA06 HELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 HELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCST 790 800 810 820 830 840 640 650 660 670 680 690 KIAA06 LPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 LPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKGP 850 860 870 880 890 900 700 710 720 730 740 750 KIAA06 QDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 QDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRER 910 920 930 940 950 960 760 770 780 790 800 810 KIAA06 TKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 TKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDSQ 970 980 990 1000 1010 1020 820 830 840 850 860 870 KIAA06 EWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 EWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASPG 1030 1040 1050 1060 1070 1080 880 890 900 910 920 930 KIAA06 LSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 LSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPEL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 940 950 960 970 980 990 KIAA06 SFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVASG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 SFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVASG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA06 PSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVRKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 PSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVRKV 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA06 RAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASWLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 RAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASWLV 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA06 CLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSFQV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 CLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSFQV 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1180 1190 1200 1210 KIAA06 GGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 GGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ 1390 1400 1410 1420 >>gi|55663581|emb|CAH72673.1| nephronophthisis 4 [Homo s (1425 aa) initn: 5921 init1: 5921 opt: 8091 Z-score: 7751.3 bits: 1446.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 8091; 99.753% identity (99.918% similar) in 1215 aa overlap (1-1215:212-1425) 10 20 30 KIAA06 QQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL :::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 NCSLQYTLKPHPALEPAFHLLPENLLVSGLQQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA06 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA06 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA06 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 KIAA06 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQEFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: gi|556 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQA-EFP 490 500 510 520 530 540 340 350 360 370 380 390 KIAA06 LEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 LEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVLL 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 450 KIAA06 QSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 QSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGTS 610 620 630 640 650 660 460 470 480 490 500 510 KIAA06 WPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 WPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQL 670 680 690 700 710 720 520 530 540 550 560 570 KIAA06 RYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 RYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQAS 730 740 750 760 770 780 580 590 600 610 620 630 KIAA06 HELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 HELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCST 790 800 810 820 830 840 640 650 660 670 680 690 KIAA06 LPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 LPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKGP 850 860 870 880 890 900 700 710 720 730 740 750 KIAA06 QDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRER ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: gi|556 QDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLVRQSVRTQHLRDLQVIAAYRER 910 920 930 940 950 960 760 770 780 790 800 810 KIAA06 TKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 TKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDSQ 970 980 990 1000 1010 1020 820 830 840 850 860 870 KIAA06 EWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 EWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASPG 1030 1040 1050 1060 1070 1080 880 890 900 910 920 930 KIAA06 LSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 LSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPEL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 940 950 960 970 980 990 KIAA06 SFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVASG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 SFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVASG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA06 PSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVRKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 PSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVRKV 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA06 RAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASWLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 RAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASWLV 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA06 CLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSFQV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 CLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSFQV 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1180 1190 1200 1210 KIAA06 GGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 GGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ 1390 1400 1410 1420 >>gi|187943684|gb|ACD40047.1| nephroretinin 4 [Canis lup (1429 aa) initn: 4189 init1: 4189 opt: 6348 Z-score: 6081.0 bits: 1137.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6348; 77.814% identity (91.290% similar) in 1217 aa overlap (1-1215:215-1429) 10 20 30 KIAA06 QQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL :.::::.:::::.::.:::::::: .: .: gi|187 SCSLQYTLKPHPLLEPVFHLLPQNLLVSGLQHIPGLVPAHGEKGDTLRKPRLQKSVTWYL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA06 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP ::::::::::::::::::::: ..:.:.:: .::::..:::::::: ::::::::::::: gi|187 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELLISDNFREGDSPLDGSTLEILERRLCVGVHNGLGFVQRP 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA06 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE .:::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::::: :::::..:::: gi|187 HVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVGSSSKTSSGNQALVLRSRLRLPEMVHHPAFAIVFQLE 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL :::.::.:::..::::::::..::::.:::::::::::. ::.: :::::::.::::::: gi|187 YVFTSPSGVDSKAASVTSLSSVACMHIVRWAVWNPLLESGSGKVILPLQGGIRPNPSHCL 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA06 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS :::: ::::::::.::::::..:.:::. : :::.:: : .:..::.:::::::::.. gi|187 VYKVTPASMSSEEVQQVESGTVQFHFSLSPEGHLDTPTGLVHSPEAERQPSRKPPTSPAN 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 KIAA06 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQEFP :: :. ::: :.::::::::.:::::::. :. : : . : .:. ::: .: : gi|187 LPALPPQGLAALQDSPVGPGLSLSQLAASPQPTTRSRSATPPPRQPDSSKPPPAQ-EEPP 490 500 510 520 530 540 340 350 360 370 380 390 KIAA06 LEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVLL :. ::::::.:::.:::: .:.:::::::::::.:.:::::.:::::... :::::::: gi|187 SEGRISHLEAQLSQASLVLGASVAEQLQELPFTPVHTPIVVGAQTRSSGSKLSRASMVLL 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 450 KIAA06 QSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGTS :. ::::::::::::::::. :.:: :::::::::::::::.::.:::::::.:::.:. gi|187 QACGFPEILDANKQPAEAVNPTDPVKFNPQKEESDCLQSNEIVLHFLAFSRVSQDCQGAP 610 620 630 640 650 660 460 470 480 490 500 510 KIAA06 WPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQL ::::::::::::::::.:::::::..:::.:. .::.: ..:: ...::. :::.::::: gi|187 WPKTVYFTFQFYRFPPVTTPRLQLIRLDETGRTGSGSLLYLLVLTDKDGSSDAGTPGFQL 670 680 690 700 710 720 520 530 540 550 560 570 KIAA06 RYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQAS .:.: ::::::::.: :..:.:.::::::.::::::::.:::::::::::::::::::. gi|187 KYLVEPGFLKPGEQRWFTHYMAAQTLQIDIWDGDSLLLVGSAAVQMKHLLRQGRPAVQVL 730 740 750 760 770 780 580 590 600 610 620 630 KIAA06 HELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCST ::::::::::::: .:::::. :: ::::::..:::: :::::::::: :::.:: :. gi|187 HELEVVATEYEQD-VVVSGDVTRFGCVKPIGVYTVVKGWLHLTLANVGHVCEQRVRDSSS 790 800 810 820 830 840 640 650 660 670 680 KIAA06 LPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRR-KHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQG-K :::::::::::::: .: ::::.. :. : :.::::::::::: ::::::.:: ..: : gi|187 LPPSRSRVISNDGARHFEGGSLISRGGPRSVKNVVQAQKLADVDRELAAMLFTHMQHGSK 850 860 870 880 890 900 690 700 710 720 730 740 KIAA06 GPQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYR ::: . ::.::.:::::::::::::::. :.:. :.:.: ::..:.:: :::::::::: gi|187 GPQGACREGDAVRRRKLERMRSVRLQESRGELSCWGASMLIQQNIRAQHARDLQVIAAYR 910 920 930 940 950 960 750 760 770 780 790 800 KIAA06 ERTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVD ::::::::.: ::::::: ::.:.:::.::::::.:.::::::::::.:.::::::.: : gi|187 ERTKAESITSALSLAITTMHTIHVTLGTAEFFEFALRNPHNTQHTVTIEVDNPELSIIQD 970 980 990 1000 1010 1020 810 820 830 840 850 860 KIAA06 SQEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQAS ::::: :: :. :::::::::::::::::::..:::.::::.:::.:.::.::::..: : gi|187 SQEWRYFKDATKLHTPVEEDMFHLRGSLAPQIFLRPRETAHIPFKYQTFSVGQLALAQPS 1030 1040 1050 1060 1070 1080 870 880 890 900 910 920 KIAA06 PGLSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHP :..:: :. : ::::.::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::::: gi|187 AELGSEKDTDTGLPQKSSAMPTKHAKVLFRGSGGKPIAVLCLTVETQPHVVDQVFRFYHP 1090 1100 1110 1120 1130 1140 930 940 950 960 970 980 KIAA06 ELSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVA ::.:::::::::::::.:::::: ::.:::.::::::::::::::::: ::::.::::: gi|187 ELTFLKKAIRLPPWHTLPGAPVGRPGEEPPVYVRCSDPNVICETQNVGPREPRDVFLKVA 1150 1160 1170 1180 1190 1200 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 SGPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVR :::::: .:::: .:.::::::: : ::::::::::::::::.:: ::::::::::.::: gi|187 SGPSPESRDFFVAVYADRWLATPIQIWQVYLHSLQRVDVSCVTGQRTRLSLVLRGTRTVR 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 KVRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASW .:.:::::::::::::::::::::.::::::::::: ::::::.:::::::: ::::::: gi|187 RVQAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPHGVQDLHVGVRPRRAGSRFIHLNLVDVDYHQLVASW 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 LVCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSF :::: :: ::::::::: ::::.:.:.::::::::::::.::.::.::::.::.:::::: gi|187 LVCLSCRPPLISKAFEITLAAGKGRGANKRITYTNPYPSQRTYHLYSDHPDLLQFREDSF 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 QVGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ :.:::::::::: ::: : ::::::::::::::::::::::::.:: gi|187 QIGGGETYTIGLWFAPRQSPGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVVYQ 1390 1400 1410 1420 >>gi|194208120|ref|XP_001497212.2| PREDICTED: nephronoph (1436 aa) initn: 6198 init1: 3214 opt: 6332 Z-score: 6065.7 bits: 1134.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 6332; 78.204% identity (90.204% similar) in 1225 aa overlap (1-1215:215-1436) 10 20 30 KIAA06 QQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL ::::::::::::.::::::::::: .: .: gi|194 SCSLQYTLRPHPLLEPAFHLLPENLLVSGLQQIPGLLPAHGETGDALRKPRLQKSVTWYL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA06 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP ::::::::::::::::::::: ..:::::: .: :::.:::::::: ::::::::::::: gi|194 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELLISDHFQEGASPQDGGTLEILERRLCVGVHNGLGFVQRP 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA06 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE :::::.:::.::::::::::::: ::::.:::.::::::::::::::: :::::..:::: gi|194 QVVVLLPEMEVALTRSASFSRKVGSSSKASSGNQALVLRSRLRLPEMVRHPAFAIVFQLE 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL :::.::.::::::::.::::.:::::.::::.:::.:::.:::::::::::::::::: : gi|194 YVFNSPSGVDGNAASLTSLSSLACMHLVRWAIWNPVLEASSGRVTLPLQGGIQPNPSHRL 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 KIAA06 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSL---GSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTS ::::: ::::::: : . . .: . : .: .. :: :: ::. : gi|194 VYKVPPASMSSEENGQPLAMSRVLQEVVQRRGEREAVEQGTE-VSVRAVEE--SGCFLLE 430 440 450 460 470 480 270 280 290 300 310 320 KIAA06 PSSPPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQ :::.:.:..:..::.::::::::.:::::::. .:. : .:. ::. : :::: gi|194 NVSPPVPLPQALTTPQDSPVGPGLSLSQLAASPQPQAQRRSATRSSSQRLGSEPSLAQAQ 490 500 510 520 530 540 330 340 350 360 370 380 KIAA06 EFPLEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASM :.::.. :::::::::::: :: :.::::.::::::.:::..::.:::::...:::::. gi|194 ELPLQGRISHLEADLSQTSSVLAMSVAEQLRELPFTPVHAPVIVGAQTRSSGSKPSRASL 550 560 570 580 590 600 390 400 410 420 430 440 KIAA06 VLLQSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCR ::::::::::::::::::::::. ..:: :.:::::::::::::.::::::::::.: gi|194 VLLQSSGFPEILDANKQPAEAVNPADPVKFSPQKEESDCLQSNEIVLQFLAFSRVSQGRW 610 620 630 640 650 660 450 460 470 480 490 500 KIAA06 GTSWPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPG : ::::: ::::::::::.::::::::.:: .:. : : :.:.:: . .::..:::::: gi|194 GLPWPKTVRFTFQFYRFPPTTTPRLQLVELDGTGKTSLGPLSHLLVLIEKDGSYDAGSPG 670 680 690 700 710 720 510 520 530 540 550 560 KIAA06 FQLRYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAV :::.:.: ::::::::.: :..:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: gi|194 FQLKYLVDPGFLKPGEQRWFTHYLAVQTLQIDVWDGDSLLLVGSAAVQMKHLLRQGRPAV 730 740 750 760 770 780 570 580 590 600 610 620 KIAA06 QASHELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRG :.::::::::::::::.::::::. ::: :::::::.::::::::::::::. :::.:: gi|194 QVSHELEVVATEYEQDTMVVSGDVTGFGSVKPIGVHTVVKGRLHLTLANVGRLCEQRVRD 790 800 810 820 830 840 630 640 650 660 670 680 KIAA06 CSTLPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRR------KHVVQAQKLADVDSELAAMLL :: ::::::::::::::::: ::::: :. :: :.::::::::::::::::.:. gi|194 CSLLPPSRSRVISNDGASRFEGGSLLMRGGPRREWREPVKNVVQAQKLADVDSELAALLF 850 860 870 880 890 900 690 700 710 720 730 740 KIAA06 THARQG-KGPQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRD ::..:: :::. ..::.::.:::::::::::::::.:..:: ::: ::::::.::.:: gi|194 THTQQGHKGPRGAGREGDAVRRRKLERMRSVRLQESGAELGGPRTSVAAQQSVRAQHMRD 910 920 930 940 950 960 750 760 770 780 790 800 KIAA06 LQVIAAYRERTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDN ::::::::::::::::.: :::.::: :::.::::.::::::.:.:::: :::::.:.:: gi|194 LQVIAAYRERTKAESITSALSLSITTWHTLYATLGTAEFFEFALRNPHNMQHTVTIEMDN 970 980 990 1000 1010 1020 810 820 830 840 850 860 KIAA06 PELSVIVDSQEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAG ::::.:.:::::: :: ::.::::::::::::.:.:::::.:::.::::.:::.:.::.: gi|194 PELSLILDSQEWRYFKEAANLHTPVEEDMFHLQGGLAPQLFLRPRETAHIPFKYQTFSVG 1030 1040 1050 1060 1070 1080 870 880 890 900 910 920 KIAA06 QLAMVQASPGLSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVD : : :.: : .::: :: :: :::..::::::::::::::::::::::::: :::::: gi|194 QPASSQVSAELRSEKGADAESPLKSSTMPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVEPQPHVVD 1090 1100 1110 1120 1130 1140 930 940 950 960 970 980 KIAA06 QVFRFYHPELSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEP ::::::::::.:::::::::::::.:::::: :::::.:::::::::.::::.:::::: gi|194 QVFRFYHPELTFLKKAIRLPPWHTLPGAPVGRPGEDPPIHVRCSDPNVVCETQDVGPGEP 1150 1160 1170 1180 1190 1200 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 RDIFLKVASGPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLV ::.::::::::::: ::::: ::.::::::: : :::.::::::::::::.:: :::::: gi|194 RDVFLKVASGPSPESKDFFVTIYADRWLATPIQIWQVHLHSLQRVDVSCVTGQRTRLSLV 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 LRGTQTVRKVRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVD :::::.::.::::::::::: :::::::::::.:::::::.::: ::::::::::::::: gi|194 LRGTQAVRNVRAFTSHPQELTTDPKGVFVLPPHGVQDLHVSVRPCRAGSRFVHLNLVDVD 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 CHQLVASWLVCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPEL ::::::::::: :: ::::::::: ::::.:::.:::::::::::::::.::::::::: gi|194 YHQLVASWLVCLSCRTPLISKAFEITLAAGDGKGANKRITYTNPYPSRRTYHLHSDHPEL 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 LRFREDSFQVGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ :.:.::::::.:::::::::.::::::.::::.:::::::::::::.:::::.:: gi|194 LQFKEDSFQVAGGETYTIGLRFAPSQRAGEEEVLIYINDHEDKNEETFCVKVVYQ 1390 1400 1410 1420 1430 >>gi|123244648|emb|CAM23668.1| nephronophthisis 4 (juven (1425 aa) initn: 6066 init1: 4783 opt: 6322 Z-score: 6056.1 bits: 1132.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 6322; 77.650% identity (90.715% similar) in 1217 aa overlap (1-1215:215-1425) 10 20 30 KIAA06 QQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL :::::::: ::..::::::::.::: : :: gi|123 NCSLQYTLKPHPPLEPAFHLLPENLLVSGFQQIPGLLPPHGDTGDALRKPRFQKPTTWHL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA06 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP ::::::::::::::::::..: ..: .:: : ::.:.::.:::::.: ::::::::::: gi|123 DDLFFTLYPSLEKFEEELVQLLISD--REGVGLLDSGTLEVLERRLHVCVHNGLGFVQRP 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA06 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE ::::::::::::::::::::::. .:::.:::.:::::::.:::::::.:::::..:::: gi|123 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKISASSKNSSGNQALVLRSHLRLPEMVSHPAFAIVFQLE 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL :::.::.:.::.:.: ::.:..::::::::::::: ::. :.::::::::.: :::.:: gi|123 YVFNSPSGADGGASSPTSISSVACMHMVRWAVWNPDLEVGPGKVTLPLQGGVQQNPSRCL 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA06 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS :::::::::::::::::::::..:::::.: :.::: ..::.: :: ::: :.:::. gi|123 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTIQFQFSLSS----DGPTEHANGPRVGRRSSRKMPASPSG 430 440 450 460 470 280 290 300 310 320 KIAA06 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQA--SPAQAQE :::. : ::: :.::::::::.:::.::: ::. . ..: : : .::. .: : gi|123 TPAPAARDLAATQDSPVGPGLSLSQLTASPLSPALQSSSKPPLQPPDSSQSPEGPQLQAE 480 490 500 510 520 530 330 340 350 360 370 380 KIAA06 FPLEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMV ::. .::::::::: . . : .:.::::::::::::::::.::::: .: :::.:: gi|123 SVLESRVSHLEADLSQPASLQGTPAVEHLQELPFTPLHAPIVVGAQTRSSRSQLSRAAMV 540 550 560 570 580 590 390 400 410 420 430 440 KIAA06 LLQSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRG :::::::::::::..::.:::. .:: :::::::::::..::.:::::::::.:::: : gi|123 LLQSSGFPEILDASQQPVEAVNPIDPVRFNPQKEESDCLRGNEIVLQFLAFSRAAQDCPG 600 610 620 630 640 650 450 460 470 480 490 500 KIAA06 TSWPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGF : ::.::::::::::::: ::::::::.:: .:. .::.:.:::::...::.:::::::. gi|123 TPWPQTVYFTFQFYRFPPETTPRLQLVKLDGTGKSGSGSLSHILVPINKDGSFDAGSPGL 660 670 680 690 700 710 510 520 530 540 550 560 KIAA06 QLRYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQ :::::: ::::::::.: ::.:::.::::.::::::::::::::.::::::::::::::: gi|123 QLRYMVDPGFLKPGEQRWFAHYLAAQTLQVDVWDGDSLLLIGSAGVQMKHLLRQGRPAVQ 720 730 740 750 760 770 570 580 590 600 610 620 KIAA06 ASHELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGC .:::::::::::::. :.::::. ::: :::::::.::::::::::::::: :: ..:: gi|123 VSHELEVVATEYEQEMMAVSGDVAGFGSVKPIGVHTVVKGRLHLTLANVGHACEPRARGS 780 790 800 810 820 830 630 640 650 660 670 680 KIAA06 STLPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGK . ::::::::::::::: ::::::: :. .::.:::::.:::::::::::::::.: :. gi|123 NLLPPSRSRVISNDGASFFSGGSLLIPGGPKRKRVVQAQRLADVDSELAAMLLTHTRAGQ 840 850 860 870 880 890 690 700 710 720 730 740 KIAA06 GPQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYR ::: ...:.::...::::::: ::::::::: : :.:::.:::.:: :::::: ::: gi|123 GPQAAGQEADAVHKRKLERMRLVRLQEAGGDSDSRRISLLAQHSVRAQHSRDLQVIDAYR 900 910 920 930 940 950 750 760 770 780 790 800 KIAA06 ERTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVD :::::::::..:: ::::.:::.::::.::::::.:::::::::::..:::.::::.:.: gi|123 ERTKAESIAGVLSQAITTHHTLYATLGTAEFFEFALKNPHNTQHTVAIEIDSPELSIILD 960 970 980 990 1000 1010 810 820 830 840 850 860 KIAA06 SQEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQAS ::::: :: :.:::::.:::::::::::::::::::.::::.:.::::::.: :: .:: gi|123 SQEWRYFKEATGLHTPLEEDMFHLRGSLAPQLYLRPRETAHIPLKFQSFSVGPLAPTQAP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 870 880 890 900 910 920 KIAA06 PGLSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHP . .:: .. :: ::.::::::::::. :. ::::::::: :::::::::::::: gi|123 AEVITEKDAESGPLWKCSAMPTKHAKVLFRVETGQLIAVLCLTVEPQPHVVDQVFRFYHP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 930 940 950 960 970 980 KIAA06 ELSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVA ::.:::::::::::::.::::::: ::::::::::::::::::.::::::::::.::::: gi|123 ELTFLKKAIRLPPWHTLPGAPVGMPGEDPPVHVRCSDPNVICEAQNVGPGEPRDVFLKVA 1140 1150 1160 1170 1180 1190 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 SGPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVR ::::::::::::.::.:::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 SGPSPEIKDFFVVIYADRWLAVPVQTWQVCLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVR 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 KVRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASW :::::::::::::::: :::::::.::::::::::: :::::::::::::.: ::::::: gi|123 KVRAFTSHPQELKTDPAGVFVLPPHGVQDLHVGVRPRRAGSRFVHLNLVDIDYHQLVASW 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 LVCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSF :::: :::::::::::: .:::. ::.:::::::::::::::..::::.::::::.:::: gi|123 LVCLSCRQPLISKAFEITMAAGDEKGTNKRITYTNPYPSRRTYRLHSDRPELLRFKEDSF 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 QVGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ ::.:::::::::.: :: .:.::::::::::::::::.:::::.:: gi|123 QVAGGETYTIGLRFLPSGSAGQEEILIYINDHEDKNEETFCVKVLYQ 1380 1390 1400 1410 1420 >>gi|27923814|sp|P59240.1|NPHP4_MOUSE RecName: Full=Neph (1425 aa) initn: 6058 init1: 4775 opt: 6314 Z-score: 6048.4 bits: 1131.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6314; 77.568% identity (90.633% similar) in 1217 aa overlap (1-1215:215-1425) 10 20 30 KIAA06 QQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL :::::::: ::..::::::::.::: : :: gi|279 NCSLQYTLKPHPPLEPAFHLLPENLLVSGFQQIPGLLPPHGDTGDALRKPRFQKPTTWHL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA06 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP ::::::::::::::::::..: ..: .:: : ::.:.::.:::::.: ::::::::::: gi|279 DDLFFTLYPSLEKFEEELVQLLISD--REGVGLLDSGTLEVLERRLHVCVHNGLGFVQRP 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA06 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE ::::::::::::::::::::::. .:::.:::.:::::::.:::::::.:::::..:::: gi|279 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKISASSKNSSGNQALVLRSHLRLPEMVSHPAFAIVFQLE 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL :::.::.:.::.:.: ::.:..::::::::::::: ::. :.::::::::.: :::.:: gi|279 YVFNSPSGADGGASSPTSISSVACMHMVRWAVWNPDLEVGPGKVTLPLQGGVQQNPSRCL 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA06 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS :::::::::::::::::::::..:::::.: :.::: ..::.: :: ::: :.:::. gi|279 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTIQFQFSLSS----DGPTEHANGPRVGRRSSRKMPASPSG 430 440 450 460 470 280 290 300 310 320 KIAA06 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQA--SPAQAQE :::. : ::: :.::::::::.:::.::: ::. . ..: : : .::. .: : gi|279 TPAPAARDLAATQDSPVGPGLSLSQLTASPLSPALQSSSKPPLQPPDSSQSPEGPQLQAE 480 490 500 510 520 530 330 340 350 360 370 380 KIAA06 FPLEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMV ::. .::::::::: . . : .:.::::::::::::::::.::::: .: :::.:: gi|279 SVLESRVSHLEADLSQPASLQGTPAVEHLQELPFTPLHAPIVVGAQTRSSRSQLSRAAMV 540 550 560 570 580 590 390 400 410 420 430 440 KIAA06 LLQSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRG :::::::::::::..::.:::. .:: :::::::::::..::.:::::::::.:::: : gi|279 LLQSSGFPEILDASQQPVEAVNPIDPVRFNPQKEESDCLRGNEIVLQFLAFSRAAQDCPG 600 610 620 630 640 650 450 460 470 480 490 500 KIAA06 TSWPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGF : ::.::::::::::::: ::::::::.:: .:. .::.:.:::::...::.:::::::. gi|279 TPWPQTVYFTFQFYRFPPETTPRLQLVKLDGTGKSGSGSLSHILVPINKDGSFDAGSPGL 660 670 680 690 700 710 510 520 530 540 550 560 KIAA06 QLRYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQ :::::: ::::::::.: ::.:::.::::.::::::::::::::.::::::::::::::: gi|279 QLRYMVDPGFLKPGEQRWFAHYLAAQTLQVDVWDGDSLLLIGSAGVQMKHLLRQGRPAVQ 720 730 740 750 760 770 570 580 590 600 610 620 KIAA06 ASHELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGC .:::::::::::::. :.::::. ::: :::::::.::::::::::::::: :: ..:: gi|279 VSHELEVVATEYEQEMMAVSGDVAGFGSVKPIGVHTVVKGRLHLTLANVGHACEPRARGS 780 790 800 810 820 830 630 640 650 660 670 680 KIAA06 STLPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGK . ::::::::::::::: ::::::: :. .::.:::::.:::::::::::::::.: :. gi|279 NLLPPSRSRVISNDGASFFSGGSLLIPGGPKRKRVVQAQRLADVDSELAAMLLTHTRAGQ 840 850 860 870 880 890 690 700 710 720 730 740 KIAA06 GPQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYR ::: ...:.::...::::::: ::::::::: :.:::.:::.:: :::::: ::: gi|279 GPQAAGQEADAVHKRKLERMRLVRLQEAGGDSDSXRISLLAQHSVRAQHSRDLQVIDAYR 900 910 920 930 940 950 750 760 770 780 790 800 KIAA06 ERTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVD :::::::::..:: ::::.:::.::::.::::::.:::::::::::..:::.::::.:.: gi|279 ERTKAESIAGVLSQAITTHHTLYATLGTAEFFEFALKNPHNTQHTVAIEIDSPELSIILD 960 970 980 990 1000 1010 810 820 830 840 850 860 KIAA06 SQEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQAS ::::: :: :.:::::.:::::::::::::::::::.::::.:.::::::.: :: .:: gi|279 SQEWRYFKEATGLHTPLEEDMFHLRGSLAPQLYLRPRETAHIPLKFQSFSVGPLAPTQAP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 870 880 890 900 910 920 KIAA06 PGLSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHP . .:: .. :: ::.::::::::::. :. ::::::::: :::::::::::::: gi|279 AEVITEKDAESGPLWKCSAMPTKHAKVLFRVETGQLIAVLCLTVEPQPHVVDQVFRFYHP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 930 940 950 960 970 980 KIAA06 ELSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVA ::.:::::::::::::.::::::: ::::::::::::::::::.::::::::::.::::: gi|279 ELTFLKKAIRLPPWHTLPGAPVGMPGEDPPVHVRCSDPNVICEAQNVGPGEPRDVFLKVA 1140 1150 1160 1170 1180 1190 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 SGPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVR ::::::::::::.::.:::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::::::::: gi|279 SGPSPEIKDFFVVIYADRWLAVPVQTWQVCLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVR 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 KVRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASW :::::::::::::::: :::::::.::::::::::: :::::::::::::.: ::::::: gi|279 KVRAFTSHPQELKTDPAGVFVLPPHGVQDLHVGVRPRRAGSRFVHLNLVDIDYHQLVASW 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 LVCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSF :::: :::::::::::: .:::. ::.:::::::::::::::..::::.::::::.:::: gi|279 LVCLSCRQPLISKAFEITMAAGDEKGTNKRITYTNPYPSRRTYRLHSDRPELLRFKEDSF 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 QVGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ ::.:::::::::.: :: .:.::::::::::::::::.:::::.:: gi|279 QVAGGETYTIGLRFLPSGSAGQEEILIYINDHEDKNEETFCVKVLYQ 1380 1390 1400 1410 1420 >>gi|119591913|gb|EAW71507.1| nephronophthisis 4, isofor (1197 aa) initn: 6276 init1: 6276 opt: 6276 Z-score: 6013.0 bits: 1124.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 6276; 100.000% identity (100.000% similar) in 947 aa overlap (1-947:243-1189) 10 20 30 KIAA06 QQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL :::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 NCSLQYTLKPHPALEPAFHLLPENLLVSGLQQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL 220 230 240 250 260 270 40 50 60 70 80 90 KIAA06 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP 280 290 300 310 320 330 100 110 120 130 140 150 KIAA06 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE 340 350 360 370 380 390 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL 400 410 420 430 440 450 220 230 240 250 260 270 KIAA06 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS 460 470 480 490 500 510 280 290 300 310 320 330 KIAA06 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQEFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQEFP 520 530 540 550 560 570 340 350 360 370 380 390 KIAA06 LEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 LEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVLL 580 590 600 610 620 630 400 410 420 430 440 450 KIAA06 QSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 QSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGTS 640 650 660 670 680 690 460 470 480 490 500 510 KIAA06 WPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 WPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQL 700 710 720 730 740 750 520 530 540 550 560 570 KIAA06 RYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 RYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQAS 760 770 780 790 800 810 580 590 600 610 620 630 KIAA06 HELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 HELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCST 820 830 840 850 860 870 640 650 660 670 680 690 KIAA06 LPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 LPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKGP 880 890 900 910 920 930 700 710 720 730 740 750 KIAA06 QDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 QDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRER 940 950 960 970 980 990 760 770 780 790 800 810 KIAA06 TKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 TKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDSQ 1000 1010 1020 1030 1040 1050 820 830 840 850 860 870 KIAA06 EWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 EWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASPG 1060 1070 1080 1090 1100 1110 880 890 900 910 920 930 KIAA06 LSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 LSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPEL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 940 950 960 970 980 990 KIAA06 SFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVASG ::::::::::::::::: gi|119 SFLKKAIRLPPWHTFPGRCSGGNAW 1180 1190 >>gi|149024742|gb|EDL81239.1| rCG31055, isoform CRA_a [R (1428 aa) initn: 6035 init1: 4670 opt: 6224 Z-score: 5962.2 bits: 1115.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6224; 76.765% identity (90.312% similar) in 1218 aa overlap (1-1215:215-1428) 10 20 30 KIAA06 QQIPGLLPAHGESGDALRKPRLQKPITGHL :::::::: ::..::::::::.::: : :: gi|149 NCSLQYTLKPHPPLEPAFHLLPENFLISGLQQIPGLLPPHGDTGDALRKPRFQKPTTLHL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA06 DDLFFTLYPSLEKFEEELLELHVQDHFQEGCGPLDGGALEILERRLRVGVHNGLGFVQRP ::::::::::::::::::..: ..:::.:: : ::.:.::.:::::.: ::::::::.:: gi|149 DDLFFTLYPSLEKFEEELVQLLISDHFREGVGLLDSGTLEVLERRLHVCVHNGLGFVHRP 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA06 QVVVLVPEMDVALTRSASFSRKVVSSSKTSSGSQALVLRSRLRLPEMVGHPAFAVIFQLE ::::::::::..:::::::::....:::.:::.:::::::.:::::::.::.::..:::: gi|149 QVVVLVPEMDMTLTRSASFSRRITASSKSSSGNQALVLRSHLRLPEMVNHPSFAIVFQLE 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YVFSSPAGVDGNAASVTSLSNLACMHMVRWAVWNPLLEADSGRVTLPLQGGIQPNPSHCL :::.::.:.::.:.: ::::.:::::::::::::: ::: :.::::::::.: :::.:: gi|149 YVFNSPSGADGSASSSTSLSSLACMHMVRWAVWNPDLEAGPGKVTLPLQGGVQHNPSRCL 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA06 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTLRFQFSLGSEEHLDAPTEPVSGPKVERRPSRKPPTSPSS :::::::::::::::::::::..:.:::.: :: :: ..::.. :: .:: ::::. gi|149 VYKVPSASMSSEEVKQVESGTIQFHFSLSS----DALTEHANGPRAGRRSTRKALTSPSG 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 KIAA06 PPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQA--SPAQAQE :: . : ::: :.::::::::.:::::::.: ... .: : :::. .: gi|149 TPALAARDLAAIQDSPVGPGLSLSQLAASPQSLASQRSFKPPPQPLDGSQSPEGPQLQAG 490 500 510 520 530 540 330 340 350 360 370 380 KIAA06 FPLEAGISHLEADLSQTSLVLE-TSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASM ::. :::::::::: . .. : .:.::::::::::::::::.::::: .: :::.: gi|149 SVLESRISHLEADLSQPPFSVQGTPTVEHLQELPFTPLHAPIVVGAQTRSSRSQLSRAAM 550 560 570 580 590 600 390 400 410 420 430 440 KIAA06 VLLQSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCR :::::::::::::: .::.:::. .:: ::::::::::: .::.:::::::::.:::: gi|149 VLLQSSGFPEILDARQQPVEAVNPMDPVRFNPQKEESDCLLGNEIVLQFLAFSRAAQDCP 610 620 630 640 650 660 450 460 470 480 490 500 KIAA06 GTSWPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPG :. ::.::::::::::::: ::::::::.::..:. .:..:.:::: ...::.::::::: gi|149 GAPWPQTVYFTFQFYRFPPETTPRLQLVKLDRTGKNGSASLSHILVHINKDGSFDAGSPG 670 680 690 700 710 720 510 520 530 540 550 560 KIAA06 FQLRYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAV ::::::: ::::::::.: ::.:::.::::.::::::::::::::..::::::::::::: gi|149 FQLRYMVDPGFLKPGEQRWFAQYLAAQTLQVDVWDGDSLLLIGSAGIQMKHLLRQGRPAV 730 740 750 760 770 780 570 580 590 600 610 620 KIAA06 QASHELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRG :.:::::::::::::. ::::::. ::: :::::::.::::::::::::::: :: ..:: gi|149 QVSHELEVVATEYEQEMMVVSGDVAGFGSVKPIGVHTVVKGRLHLTLANVGHECEPRARG 790 800 810 820 830 840 630 640 650 660 670 680 KIAA06 CSTLPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQG ..:::::::::::.::: ::::::: :. .::.:::::::::::::::::::::.: : gi|149 SNALPPSRSRVISNNGASFFSGGSLLIPGGPKRKRVVQAQKLADVDSELAAMLLTHTRAG 850 860 870 880 890 900 690 700 710 720 730 740 KIAA06 KGPQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAY .::: :..:.::..:::::::: ::::::::: : ::::..:::.:: :::::: :: gi|149 QGPQAVGQEADAVHRRKLERMRLVRLQEAGGDSDSRRISVLARHSVRAQHSRDLQVIDAY 910 920 930 940 950 960 750 760 770 780 790 800 KIAA06 RERTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIV :::::::.:::.:: ::::.:::.::::.::::::.:::::::::::..:::.::::.:. gi|149 RERTKAENIASVLSQAITTHHTLYATLGTAEFFEFALKNPHNTQHTVAIEIDSPELSIIL 970 980 990 1000 1010 1020 810 820 830 840 850 860 KIAA06 DSQEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQA :::::: :: :.:: ::.:::::::::::::::::::.::::.:::::.::.: : .:: gi|149 DSQEWRYFKEATGLLTPLEEDMFHLRGSLAPQLYLRPRETAHIPFKFQNFSVGPPAPTQA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 870 880 890 900 910 920 KIAA06 SPGLSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYH . .:: .. :: ::.::::::::::. :. ::::::::: ::::::::::::: gi|149 PAEVISEKDAESGPHWKCSAMPTKHAKVLFRVETGQLIAVLCLTVEPQPHVVDQVFRFYH 1090 1100 1110 1120 1130 1140 930 940 950 960 970 980 KIAA06 PELSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKV :::.:::::::::::::.::::::: ::::::::::::::::::.:::: :::::.:::: gi|149 PELTFLKKAIRLPPWHTLPGAPVGMPGEDPPVHVRCSDPNVICEAQNVGLGEPRDVFLKV 1150 1160 1170 1180 1190 1200 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 ASGPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTV :::::::::::::.::.:::::.:.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: gi|149 ASGPSPEIKDFFVVIYADRWLAVPVQTWQVCLHSLQRVDVSCVAGQMTRLSLVLRGTQTV 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 RKVRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVAS ::::::::::::::::: :::::::.::::::::::: ::::::.:::::::: :::::: gi|149 RKVRAFTSHPQELKTDPAGVFVLPPHGVQDLHVGVRPRRAGSRFIHLNLVDVDYHQLVAS 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 WLVCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDS ::::: :::::::::::: .:::::::.:::::::::::::::..::::.:.::.:.::: gi|149 WLVCLSCRQPLISKAFEITMAAGEGKGANKRITYTNPYPSRRTYRLHSDRPDLLHFKEDS 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 FQVGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ :::.:::::::::.: :: .:.:::::::::..:::::.:::::.:: gi|149 FQVAGGETYTIGLRFLPSGSAGQEEILIYINDQDDKNEETFCVKVLYQ 1390 1400 1410 1420 >>gi|119591914|gb|EAW71508.1| nephronophthisis 4, isofor (914 aa) initn: 5939 init1: 5939 opt: 5948 Z-score: 5700.2 bits: 1066.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 5948; 97.817% identity (98.581% similar) in 916 aa overlap (300-1215:3-914) 270 280 290 300 310 320 KIAA06 SPPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQEF ::: . . .. :: :.. : . ::: gi|119 MHPRSLS--VAPKWSGGLP-GNHPRPLR-QEF 10 20 330 340 350 360 370 380 KIAA06 PLEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 PLEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVL 30 40 50 60 70 80 390 400 410 420 430 440 KIAA06 LQSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 LQSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGT 90 100 110 120 130 140 450 460 470 480 490 500 KIAA06 SWPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 SWPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQ 150 160 170 180 190 200 510 520 530 540 550 560 KIAA06 LRYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 LRYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQA 210 220 230 240 250 260 570 580 590 600 610 620 KIAA06 SHELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 SHELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCS 270 280 290 300 310 320 630 640 650 660 670 680 KIAA06 TLPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 TLPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKG 330 340 350 360 370 380 690 700 710 720 730 740 KIAA06 PQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 PQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRE 390 400 410 420 430 440 750 760 770 780 790 800 KIAA06 RTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 RTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDS 450 460 470 480 490 500 810 820 830 840 850 860 KIAA06 QEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 QEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASP 510 520 530 540 550 560 870 880 890 900 910 920 KIAA06 GLSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 GLSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPE 570 580 590 600 610 620 930 940 950 960 970 980 KIAA06 LSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 LSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVAS 630 640 650 660 670 680 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 GPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 GPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVRK 690 700 710 720 730 740 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 VRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASWL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 VRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASWL 750 760 770 780 790 800 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 VCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 VCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSFQ 810 820 830 840 850 860 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 VGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 VGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ 870 880 890 900 910 >>gi|193784845|dbj|BAG53998.1| unnamed protein product [ (914 aa) initn: 5934 init1: 5934 opt: 5943 Z-score: 5695.4 bits: 1065.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5943; 97.707% identity (98.581% similar) in 916 aa overlap (300-1215:3-914) 270 280 290 300 310 320 KIAA06 SPPAPVPRVLAAPQNSPVGPGLSISQLAASPRSPTQHCLARPTSQLPHGSQASPAQAQEF ::: . . .. :: :.. : . ::: gi|193 MHPRSLS--VAPKWSGGLP-GNHPRPLR-QEF 10 20 330 340 350 360 370 380 KIAA06 PLEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 PLEAGISHLEADLSQTSLVLETSIAEQLQELPFTPLHAPIVVGTQTRSSAGQPSRASMVL 30 40 50 60 70 80 390 400 410 420 430 440 KIAA06 LQSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 LQSSGFPEILDANKQPAEAVSATEPVTFNPQKEESDCLQSNEMVLQFLAFSRVAQDCRGT 90 100 110 120 130 140 450 460 470 480 490 500 KIAA06 SWPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 SWPKTVYFTFQFYRFPPATTPRLQLVQLDEAGQPSSGALTHILVPVSRDGTFDAGSPGFQ 150 160 170 180 190 200 510 520 530 540 550 560 KIAA06 LRYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 LRYMVGPGFLKPGERRCFARYLAVQTLQIDVWDGDSLLLIGSAAVQMKHLLRQGRPAVQA 210 220 230 240 250 260 570 580 590 600 610 620 KIAA06 SHELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 SHELEVVATEYEQDNMVVSGDMLGFGRVKPIGVHSVVKGRLHLTLANVGHPCEQKVRGCS 270 280 290 300 310 320 630 640 650 660 670 680 KIAA06 TLPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 TLPPSRSRVISNDGASRFSGGSLLTTGSSRRKHVVQAQKLADVDSELAAMLLTHARQGKG 330 340 350 360 370 380 690 700 710 720 730 740 KIAA06 PQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 PQDVSRESDATRRRKLERMRSVRLQEAGGDLGRRGTSVLAQQSVRTQHLRDLQVIAAYRE 390 400 410 420 430 440 750 760 770 780 790 800 KIAA06 RTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 RTKAESIASLLSLAITTEHTLHATLGVAEFFEFVLKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVIVDS 450 460 470 480 490 500 810 820 830 840 850 860 KIAA06 QEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 QEWRDFKGAAGLHTPVEEDMFHLRGSLAPQLYLRPHETAHVPFKFQSFSAGQLAMVQASP 510 520 530 540 550 560 870 880 890 900 910 920 KIAA06 GLSNEKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPE ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 GLSNKKGMDAVSPWKSSAVPTKHAKVLFRASGGKPIAVLCLTVELQPHVVDQVFRFYHPE 570 580 590 600 610 620 930 940 950 960 970 980 KIAA06 LSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 LSFLKKAIRLPPWHTFPGAPVGMLGEDPPVHVRCSDPNVICETQNVGPGEPRDIFLKVAS 630 640 650 660 670 680 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 GPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 GPSPEIKDFFVIIYSDRWLATPTQTWQVYLHSLQRVDVSCVAGQLTRLSLVLRGTQTVRK 690 700 710 720 730 740 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 VRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASWL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 VRAFTSHPQELKTDPKGVFVLPPRGVQDLHVGVRPLRAGSRFVHLNLVDVDCHQLVASWL 750 760 770 780 790 800 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 VCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 VCLCCRQPLISKAFEIMLAAGEGKGVNKRITYTNPYPSRRTFHLHSDHPELLRFREDSFQ 810 820 830 840 850 860 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 VGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 VGGGETYTIGLQFAPSQRVGEEEILIYINDHEDKNEEAFCVKVIYQ 870 880 890 900 910 1215 residues in 1 query sequences 2693465022 residues in 7827732 library sequences Tcomplib [34.26] (8 proc) start: Thu Mar 5 13:51:27 2009 done: Thu Mar 5 13:55:06 2009 Total Scan time: 1816.440 Total Display time: 1.120 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]