# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03618.fasta.nr -Q ../query/KIAA0644.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0644, 887 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7807099 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7617+/-0.000199; mu= 12.0286+/- 0.011 mean_var=107.5873+/-20.799, 0's: 30 Z-trim: 148 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.123650 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|76880480|ref|NP_055632.2| hypothetical protein ( 811) 5490 990.6 0 gi|109067028|ref|XP_001088293.1| PREDICTED: simila ( 811) 5283 953.7 0 gi|26341944|dbj|BAC34634.1| unnamed protein produc ( 739) 4387 793.8 0 gi|126341798|ref|XP_001381576.1| PREDICTED: hypoth ( 812) 4121 746.4 1.2e-212 gi|73976539|ref|XP_539495.2| PREDICTED: similar to ( 915) 3545 643.7 1.1e-181 gi|194375734|dbj|BAG57211.1| unnamed protein produ ( 369) 2069 380.0 1e-102 gi|47229422|emb|CAF99410.1| unnamed protein produc ( 818) 1500 278.8 6.5e-72 gi|94482750|gb|ABF22370.1| hypothetical protein LO ( 816) 1395 260.1 2.8e-66 gi|109053944|ref|XP_001095878.1| PREDICTED: carbox ( 545) 666 129.9 3e-27 gi|210090992|gb|EEA39254.1| hypothetical protein B ( 634) 635 124.4 1.5e-25 gi|169642247|gb|AAI60859.1| Unknown (protein for I ( 543) 628 123.1 3.3e-25 gi|210105168|gb|EEA53182.1| hypothetical protein B (1200) 631 124.0 4e-25 gi|149020006|gb|EDL78154.1| rCG36501 [Rattus norve ( 565) 620 121.7 9e-25 gi|151556892|gb|AAI49123.1| CPN2 protein [Bos taur ( 548) 616 121.0 1.4e-24 gi|210107996|gb|EEA55913.1| hypothetical protein B ( 907) 614 120.8 2.7e-24 gi|210103014|gb|EEA51055.1| hypothetical protein B ( 530) 608 119.5 3.8e-24 gi|194223850|ref|XP_001493756.2| PREDICTED: simila ( 631) 608 119.6 4.3e-24 gi|210112205|gb|EEA59984.1| hypothetical protein B (1448) 599 118.4 2.4e-23 gi|52782751|sp|Q9DBB9.2|CPN2_MOUSE RecName: Full=C ( 547) 592 116.7 2.8e-23 gi|19388017|gb|AAH25836.1| Cpn2 protein [Mus muscu ( 562) 592 116.7 2.9e-23 gi|12836704|dbj|BAB23775.1| unnamed protein produc ( 570) 592 116.7 2.9e-23 gi|148665304|gb|EDK97720.1| carboxypeptidase N, po ( 574) 592 116.7 2.9e-23 gi|210130150|gb|EEA77822.1| hypothetical protein B ( 461) 590 116.3 3.2e-23 gi|90823112|gb|ABE01082.1| insulin-like growth fac ( 611) 588 116.0 5e-23 gi|210105169|gb|EEA53183.1| hypothetical protein B (2123) 591 117.1 8.4e-23 gi|210114080|gb|EEA61842.1| hypothetical protein B (1504) 578 114.6 3.3e-22 gi|164691033|dbj|BAF98699.1| unnamed protein produ ( 605) 554 110.0 3.3e-21 gi|194222704|ref|XP_001500619.2| PREDICTED: simila (1219) 553 110.1 6.2e-21 gi|118095118|ref|XP_422710.2| PREDICTED: hypotheti ( 840) 550 109.4 6.9e-21 gi|126335486|ref|XP_001365302.1| PREDICTED: simila ( 782) 541 107.8 2e-20 gi|51980481|gb|AAH81550.1| Cpn2 protein [Mus muscu ( 413) 532 105.9 3.8e-20 gi|543801|sp|P35859.1|ALS_RAT RecName: Full=Insuli ( 603) 533 106.2 4.4e-20 gi|118098220|ref|XP_425222.2| PREDICTED: similar t ( 574) 531 105.8 5.5e-20 gi|114660353|ref|XP_001172738.1| PREDICTED: insuli ( 551) 530 105.6 6e-20 gi|73959574|ref|XP_547189.2| PREDICTED: similar to ( 676) 531 105.9 6.2e-20 gi|194222706|ref|XP_001916561.1| PREDICTED: glycop ( 570) 526 104.9 1e-19 gi|47225715|emb|CAG08058.1| unnamed protein produc ( 486) 525 104.7 1e-19 gi|210103114|gb|EEA51154.1| hypothetical protein B ( 995) 528 105.5 1.2e-19 gi|3093474|gb|AAC15252.1| insulin-like growth fact ( 603) 522 104.3 1.7e-19 gi|149052066|gb|EDM03883.1| insulin-like growth fa ( 603) 522 104.3 1.7e-19 gi|149052067|gb|EDM03884.1| insulin-like growth fa ( 603) 522 104.3 1.7e-19 gi|210115762|gb|EEA63511.1| hypothetical protein B ( 429) 520 103.8 1.7e-19 gi|210124045|gb|EEA71743.1| hypothetical protein B ( 668) 521 104.1 2.1e-19 gi|210116963|gb|EEA64704.1| hypothetical protein B ( 754) 521 104.2 2.3e-19 gi|210090905|gb|EEA39170.1| hypothetical protein B (1058) 522 104.5 2.6e-19 gi|19344010|gb|AAH25681.1| Insulin-like growth fac ( 605) 516 103.2 3.6e-19 gi|189053762|dbj|BAG36014.1| unnamed protein produ ( 605) 516 103.2 3.6e-19 gi|118095114|ref|XP_001232026.1| PREDICTED: simila ( 495) 514 102.7 4e-19 gi|210123267|gb|EEA70969.1| hypothetical protein B ( 717) 516 103.3 4.1e-19 gi|12836483|dbj|BAB23677.1| unnamed protein produc ( 603) 514 102.8 4.7e-19 >>gi|76880480|ref|NP_055632.2| hypothetical protein LOC9 (811 aa) initn: 5490 init1: 5490 opt: 5490 Z-score: 5294.1 bits: 990.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5490; 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