# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03494s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0641.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0641, 1326 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7785034 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6029+/-0.000206; mu= 9.8601+/- 0.011 mean_var=152.4383+/-29.414, 0's: 29 Z-trim: 211 B-trim: 48 in 1/66 Lambda= 0.103879 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114149222|sp|Q6ZMQ8.2|LMTK1_HUMAN RecName: Full (1374) 8996 1361.2 0 gi|109119005|ref|XP_001111343.1| PREDICTED: simila (1394) 8285 1254.6 0 gi|169217467|ref|XP_001720798.1| PREDICTED: simila (1012) 6986 1059.8 0 gi|149054993|gb|EDM06810.1| rCG32884, isoform CRA_ (1313) 4947 754.4 1.1e-214 gi|109489490|ref|XP_001075880.1| PREDICTED: simila (1370) 4947 754.4 1.1e-214 gi|2459993|gb|AAB71837.1| apoptosis associated tyr (1317) 4940 753.3 2.3e-214 gi|81912939|sp|Q80YE4.1|LMTK1_MOUSE RecName: Full= (1365) 4940 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(1648) 2165 337.5 4.2e-89 gi|189526196|ref|XP_001920174.1| PREDICTED: simila (1644) 2164 337.4 4.6e-89 gi|47217662|emb|CAG03059.1| unnamed protein produc (1531) 2129 332.1 1.7e-87 gi|189516813|ref|XP_001344052.2| PREDICTED: simila (1255) 2087 325.7 1.1e-85 gi|47219103|emb|CAG00242.1| unnamed protein produc ( 538) 1925 301.1 1.3e-78 gi|119572738|gb|EAW52353.1| hCG1811754 [Homo sapie (1458) 1612 254.6 3.4e-64 gi|117949603|sp|Q96Q04.2|LMTK3_HUMAN RecName: Full (1460) 1612 254.6 3.4e-64 gi|122937267|ref|NP_001073903.1| lemur tyrosine ki (1489) 1612 254.6 3.5e-64 gi|194674819|ref|XP_001789580.1| PREDICTED: simila (1423) 1607 253.9 5.7e-64 gi|134024500|gb|AAI36191.1| LOC100125078 protein [ (1182) 1589 251.1 3.2e-63 gi|81910384|sp|Q5XJV6.1|LMTK3_MOUSE RecName: Full= (1424) 1536 243.2 9e-61 gi|62871645|gb|AAH94377.1| Lmtk3 protein [Mus musc (1424) 1535 243.1 1e-60 gi|149850244|dbj|BAF64834.1| apoptosis-associated (1424) 1533 242.8 1.2e-60 gi|149055865|gb|EDM07296.1| rCG54042, isoform CRA_ (1234) 1516 240.1 6.5e-60 gi|148690950|gb|EDL22897.1| lemur tyrosine kinase (1307) 1510 239.3 1.3e-59 gi|118097709|ref|XP_001232429.1| PREDICTED: simila (1461) 1305 208.6 2.4e-50 gi|47215009|emb|CAG03149.1| unnamed protein produc (1434) 1295 207.1 6.8e-50 gi|114614765|ref|XP_527828.2| PREDICTED: lemur tyr (1474) 1291 206.5 1e-49 gi|114614763|ref|XP_001134909.1| PREDICTED: lemur (1503) 1291 206.5 1.1e-49 gi|168273150|dbj|BAG10414.1| serine/threonine-prot (1454) 1287 205.9 1.6e-49 gi|119597126|gb|EAW76720.1| lemur tyrosine kinase (1454) 1287 205.9 1.6e-49 gi|145559492|sp|Q8IWU2.2|LMTK2_HUMAN RecName: Full (1503) 1287 205.9 1.6e-49 gi|27356940|gb|AAN08717.1| KPI-2 protein [Homo sap (1503) 1287 205.9 1.6e-49 gi|73958123|ref|XP_851196.1| PREDICTED: similar to (1606) 1283 205.4 2.5e-49 gi|148687077|gb|EDL19024.1| mCG122819 [Mus musculu (1468) 1268 203.1 1.1e-48 gi|149850242|dbj|BAF64833.1| apoptosis-associated (1471) 1268 203.1 1.1e-48 gi|74177517|dbj|BAE34627.1| unnamed protein produc ( 632) 1257 201.0 2e-48 gi|118573331|sp|Q3TYD6.2|LMTK2_MOUSE RecName: Full (1471) 1261 202.0 2.4e-48 gi|125813436|ref|XP_693087.2| PREDICTED: hypotheti (1445) 1241 199.0 1.9e-47 gi|189530177|ref|XP_001921503.1| PREDICTED: simila (2727) 1056 171.6 6.4e-39 gi|210126514|gb|EEA74200.1| hypothetical protein B (1703) 1044 169.6 1.6e-38 >>gi|114149222|sp|Q6ZMQ8.2|LMTK1_HUMAN RecName: Full=Ser (1374 aa) initn: 8996 init1: 8996 opt: 8996 Z-score: 7289.6 bits: 1361.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 8996; 99.772% identity (99.924% similar) in 1313 aa overlap (14-1326:62-1374) 10 20 30 40 KIAA06 HQVKVQGCWGRWRWQEFENAEGDEYAADLAQGSPATAAQNGPD ..:::::::::::::::::::::::::::: gi|114 LAVVAVSFSGLFAVIVLMLACLCCKKGGIGFKEFENAEGDEYAADLAQGSPATAAQNGPD 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 KIAA06 VYVLPLTEVSLPMAKQPGRSVQLLKSTDVGRHSLLYLKEIGRGWFGKVFLGEVNSGISSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 VYVLPLTEVSLPMAKQPGRSVQLLKSTDVGRHSLLYLKEIGRGWFGKVFLGEVNSGISSA 100 110 120 130 140 150 110 120 130 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