# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03305.fasta.nr -Q ../query/KIAA0637.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0637, 1175 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825791 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5913+/-0.000189; mu= 12.7209+/- 0.011 mean_var=84.3882+/-16.375, 0's: 46 Z-trim: 51 B-trim: 261 in 2/65 Lambda= 0.139615 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|20532299|sp|O75132.1|ZBED4_HUMAN RecName: Full= (1171) 7803 1582.4 0 gi|6572299|emb|CAB62924.1| zinc finger, BED-type c (1171) 7802 1582.2 0 gi|108742046|gb|AAI17671.1| Zinc finger, BED-type (1171) 7797 1581.2 0 gi|109094591|ref|XP_001111467.1| PREDICTED: zinc f (1171) 7669 1555.4 0 gi|194226986|ref|XP_001914855.1| PREDICTED: zinc f (1174) 6885 1397.5 0 gi|149234328|ref|XP_001480230.1| PREDICTED: simila (1169) 6566 1333.2 0 gi|198278471|ref|NP_001128272.1| zinc finger, BED- (1170) 6551 1330.2 0 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gi|26355459|dbj|BAC41160.1| unnamed protein produc ( 554) 618 134.9 1.2e-28 gi|194673946|ref|XP_001790011.1| PREDICTED: simila ( 980) 599 131.3 2.7e-27 gi|221121172|ref|XP_002161906.1| PREDICTED: simila (1401) 591 129.8 1.1e-26 gi|221120023|ref|XP_002154729.1| PREDICTED: simila ( 582) 584 128.1 1.5e-26 gi|221112673|ref|XP_002158345.1| PREDICTED: simila ( 505) 569 125.0 1.1e-25 gi|221117098|ref|XP_002157487.1| PREDICTED: simila ( 558) 529 117.0 3e-23 gi|221110563|ref|XP_002156144.1| PREDICTED: simila ( 505) 522 115.6 7.5e-23 gi|72085963|ref|XP_792872.1| PREDICTED: similar to ( 652) 509 113.0 5.6e-22 gi|15929151|gb|AAH15030.1| ZBED1 protein [Homo sap ( 694) 505 112.3 1e-21 gi|41018380|sp|O96006.1|ZBED1_HUMAN RecName: Full= ( 694) 503 111.9 1.4e-21 gi|198142512|gb|EDY71248.1| GA25633 [Drosophila ps ( 534) 498 110.8 2.2e-21 gi|193909039|gb|EDW07906.1| GI16010 [Drosophila mo ( 485) 485 108.1 1.3e-20 gi|73978963|ref|XP_539906.2| PREDICTED: similar to (1043) 489 109.2 1.3e-20 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