# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf00524.fasta.huge -Q ../query/KIAA0629.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0629, 1272 aa vs ./tmplib.23663 library 1986233 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2982+/-0.00602; mu= 4.4098+/- 0.408 mean_var=131.0660+/-30.612, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.112029 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1678 ( 1302 res) fh20705 (1302) 259 54.2 1.7e-07 >>KIAA1678 ( 1302 res) fh20705 (1302 aa) initn: 616 init1: 122 opt: 259 Z-score: 226.7 bits: 54.2 E(): 1.7e-07 Smith-Waterman score: 609; 23.094% identity (51.126% similar) in 1377 aa overlap (60-1270:22-1300) 30 40 50 60 70 80 KIAA06 IMEVCQFSYPQTPASPQCGSFDFEDKVVKLYAKDLSESVIQEAFIELSQVDVTFTTKAAV :: .:.:::.:.:::.::: . :. ..:: KIAA16 DHEDTRNALPPRQDGEVTTGKYATNLAESVLQDAFIRLSQSQSTLPQESAV 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 KIAA06 SVSTDNIK----YVSAESVVPSTQ------AVTFSPSFHN---QAIMVTKPVQEYKKEYT :::. . : . ..:: . .:. ::. . : . . : .: . : . 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