# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03971.fasta.nr -Q ../query/KIAA0618.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0618, 1052 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7792005 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6171+/-0.000221; mu= 3.4504+/- 0.012 mean_var=216.7484+/-41.483, 0's: 27 Z-trim: 136 B-trim: 136 in 1/66 Lambda= 0.087116 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|205829302|sp|Q96HA1.2|P121A_HUMAN RecName: Full (1249) 6582 841.1 0 gi|205829304|sp|A8CG34.2|P121C_HUMAN RecName: Full (1229) 6382 816.0 0 gi|14250658|gb|AAH08794.1| POM121 membrane glycopr ( 984) 6208 794.0 0 gi|158258533|dbj|BAF85237.1| unnamed protein produ ( 984) 6197 792.6 0 gi|109066269|ref|XP_001110260.1| PREDICTED: nuclea (1225) 6161 788.2 0 gi|109066273|ref|XP_001110084.1| PREDICTED: nuclea (1083) 6160 788.0 0 gi|150378545|ref|NP_001092885.1| POM121 membrane g ( 987) 6044 773.4 0 gi|114614075|ref|XP_001154568.1| PREDICTED: nuclea (1229) 5996 767.5 0 gi|114614073|ref|XP_001154106.1| PREDICTED: nuclea (1052) 5949 761.5 0 gi|114614077|ref|XP_519153.2| PREDICTED: nuclear p ( 987) 5644 723.1 1.7e-205 gi|194375704|dbj|BAG57196.1| unnamed protein produ ( 859) 5226 670.5 1e-189 gi|205829303|sp|A6NF01.2|P121B_HUMAN RecName: Full ( 834) 5100 654.7 5.7e-185 gi|114613893|ref|XP_001144034.1| PREDICTED: nuclea (1049) 4942 634.9 6.4e-179 gi|114613887|ref|XP_001144107.1| PREDICTED: nuclea (1228) 4942 635.0 7.1e-179 gi|114613891|ref|XP_001143439.1| PREDICTED: nuclea (1086) 4936 634.2 1.1e-178 gi|114614079|ref|XP_001154336.1| PREDICTED: nuclea ( 859) 4818 619.2 2.7e-174 gi|194678652|ref|XP_596969.4| PREDICTED: similar t (1216) 4677 601.7 7.4e-169 gi|114613895|ref|XP_001143971.1| PREDICTED: nuclea ( 986) 4585 590.0 2e-165 gi|114613897|ref|XP_001143734.1| PREDICTED: nuclea ( 859) 3786 489.5 3e-135 gi|109066271|ref|XP_001110178.1| PREDICTED: nuclea (1043) 3608 467.3 1.9e-128 gi|10434013|dbj|BAB14097.1| unnamed protein produc ( 523) 3158 410.4 1.3e-111 gi|51316481|sp|Q8K3Z9.2|PO121_MOUSE RecName: Full= (1200) 3115 405.4 9.2e-110 gi|21591727|gb|AAM64199.1|AF516680_1 nuclear pore (1199) 3093 402.6 6.3e-109 gi|1709213|sp|P52591.1|PO121_RAT RecName: Full=Nuc (1199) 3072 400.0 3.9e-108 gi|149063047|gb|EDM13370.1| nuclear pore membrane (1199) 3071 399.8 4.3e-108 gi|119577923|gb|EAW57519.1| hCG1998564, isoform CR ( 405) 2676 349.7 1.8e-93 gi|119577924|gb|EAW57520.1| hCG1998564, isoform CR ( 617) 2661 348.0 8.9e-93 gi|73957770|ref|XP_546930.2| PREDICTED: similar to ( 890) 2555 334.9 1.2e-88 gi|126314514|ref|XP_001379116.1| PREDICTED: simila (1337) 2292 302.0 1.4e-78 gi|194373461|dbj|BAG56826.1| unnamed protein produ ( 375) 2104 277.7 7.6e-72 gi|38014361|gb|AAH01518.2| POM121 protein [Homo sa ( 326) 1928 255.6 3.1e-65 gi|149436865|ref|XP_001514514.1| PREDICTED: simila ( 686) 1808 240.8 1.8e-60 gi|189524475|ref|XP_696713.3| PREDICTED: POM121 me (1201) 1575 211.8 1.7e-51 gi|157888824|dbj|BAF80888.1| nuclear pore membrane ( 398) 1324 179.7 2.6e-42 gi|119577922|gb|EAW57518.1| hCG1998564, isoform CR ( 208) 1267 172.3 2.4e-40 gi|47221399|emb|CAF97317.1| unnamed protein produc ( 715) 1126 155.1 1.2e-34 gi|47221400|emb|CAF97318.1| unnamed protein produc ( 487) 1024 142.1 6.5e-31 gi|118100010|ref|XP_415711.2| PREDICTED: similar t ( 809) 968 135.3 1.2e-28 gi|62422144|gb|AAX82633.1| POM121 [Pongo pygmaeus] ( 143) 897 125.6 1.8e-26 gi|62422142|gb|AAX82632.1| POM121 [Pongo pygmaeus] ( 143) 891 124.8 3.1e-26 gi|62422140|gb|AAX82631.1| POM121 [Gorilla gorilla ( 141) 879 123.3 8.8e-26 gi|62422138|gb|AAX82630.1| POM121 [Gorilla gorilla ( 136) 865 121.5 2.9e-25 gi|62422136|gb|AAX82629.1| POM121 [Pan troglodytes ( 133) 843 118.8 1.9e-24 gi|114614171|ref|XP_001158086.1| PREDICTED: simila ( 159) 819 115.8 1.8e-23 gi|62422134|gb|AAX82628.1| POM121 [Pan troglodytes ( 149) 815 115.3 2.4e-23 gi|109070014|ref|XP_001094164.1| PREDICTED: simila ( 974) 799 114.2 3.4e-22 gi|169168970|ref|XP_001718868.1| PREDICTED: simila ( 971) 789 112.9 8e-22 gi|119623495|gb|EAX03090.1| hCG1647683 [Homo sapie ( 971) 788 112.8 8.8e-22 gi|169168655|ref|XP_001715527.1| PREDICTED: simila (1151) 788 112.9 9.8e-22 gi|74751990|sp|Q96KW2.1|PO122_HUMAN RecName: Full= ( 971) 784 112.3 1.2e-21 >>gi|205829302|sp|Q96HA1.2|P121A_HUMAN RecName: Full=Nuc (1249 aa) initn: 6830 init1: 6582 opt: 6582 Z-score: 4481.5 bits: 841.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 6582; 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