# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01176s2.fasta.huge -Q ../query/KIAA0614.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0614, 3006 aa vs ./tmplib.23663 library 1984499 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1546+/-0.00617; mu= 9.6532+/- 0.419 mean_var=144.4933+/-33.988, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.106697 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 46, opt: 34, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1320 ( 567 res) fh13757 ( 567) 250 51.5 1.1e-06 KIAA0045 ( 2005 res) ha00941 (2005) 214 46.4 0.00013 KIAA1625 ( 859 res) hh15184 ( 859) 204 44.6 0.0002 KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192) 202 44.7 0.00066 KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086) 191 42.7 0.00094 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 189 42.3 0.001 KIAA0317 ( 826 res) hg00276 ( 826) 182 41.2 0.002 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 182 41.3 0.0023 >>KIAA1320 ( 567 res) fh13757 (567 aa) initn: 289 init1: 125 opt: 250 Z-score: 212.2 bits: 51.5 E(): 1.1e-06 Smith-Waterman score: 326; 26.893% identity (54.830% similar) in 383 aa overlap (2621-2998:222-558) 2600 2610 2620 2630 2640 2650 KIAA06 HAAPEITLDPLEIVGGEIRASENSYFCQAARQLASVPSSQLCVKLASGGDPTYAFNIRFT :. : :. :.:: .: . .:: KIAA13 HLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQG------IAVRFH 200 210 220 230 240 2660 2670 2680 2690 2700 KIAA06 GEEVHGTSGSFRHFLWQVCKELQSSSLSLLLLCPS-SAVNKNKGKYILTPSPITYGEEQL ::: : .: :... . .:. . . .:. . .. . :...:. .:. ..: KIAA13 GEEGMG-QGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGTTFQPNSNSYV-NPDHLNY----- 250 260 270 280 290 2710 2720 2730 2740 2750 2760 KIAA06 LHFLGQLLGIAIRADVPLPLDLLPSFWKTLVGEPLDPEQDLQEADILTYNYVKKFESIND ..: ::.::.:. . . . ::.: ..: :.. ::. : .:.:... : : KIAA13 FRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVN-YQDVASIDP---EYAKNLQWILD 300 310 320 330 340 350 2770 2780 2790 2800 2810 2820 KIAA06 ETELEALCAEIASQHLATESPDSPNKPCCRFTYLTMTGEEVELCSRGRHILVAWENKDIY . .. : :.. ...:. .. .: ::: : : :::. .:: : KIAA13 N-DISDLGLELT---FSVETD----------VFGAM--EEVPLKPGGGSILVTQNNKAEY 360 370 380 390 2830 2840 2850 2860 2870 2880 KIAA06 AAAIRSLRL-RELQNVECVTAVRAGLGSIIPLQLLTMLSPLEMELRTCGLPYINLEFLKA . . ::. : .: ..: :. .:: .:. ... :.:: :.: :.. 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KIAA16 --------FGRIL----QHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRF--MRGIEAQFLAL 670 680 690 700 2860 2870 2880 2890 2900 2910 KIAA06 RAGLGSIIPLQLLTMLSPLEMELRTCGLPYINLEFLKAHTMYQVGLMETDQHIEFFWGAL . :.. .:: .:: .. :.:: :: :.:. :..: . . ... ...:: :. KIAA16 QKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHCVADSNI-VRWFWQAV 710 720 730 740 750 760 2920 2930 2940 2950 2960 KIAA06 EMFTQEELCKFIKFACNQERIPFTCPCKDGGPDTAHVPPYPMKIAPPDGTAGS-PDSRYI : : .:. ....:. .. :.:. : .:. . : . : :... . : KIAA16 ETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQ-GFKALQGSTGAAGPRLFTIHLIDANTDNLP----- 770 780 790 800 810 820 2970 2980 2990 3000 KIAA06 RVETCMFMIKLPQYSSLEIMLEKLRCAIHYREDPLSG ...::. : .: : : : . ::: :. KIAA16 KAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE 830 840 850 >>KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192 aa) initn: 140 init1: 96 opt: 202 Z-score: 162.0 bits: 44.7 E(): 0.00066 Smith-Waterman score: 271; 22.745% identity (51.373% similar) in 510 aa overlap (2509-2998:2720-3183) 2480 2490 2500 2510 2520 2530 KIAA06 QYINQLCRHLAITPARLHPHEVYLDPADAADPRVACLLNVPIESLRLRFA-LLQSLNTTL : : . : .. : : : : . ..: KIAA03 DQHAVLVLQPAVEAFFLVHATERESKPPVRDTRESQLAHIKDEPPPLSPAPLTPATPSSL 2690 2700 2710 2720 2730 2740 2540 2550 2560 2570 2580 2590 KIAA06 ETFFLPLVELRQTPMYTHSIAALLKEAKGLI-FYDTKVTVMNRVLNATVQRTADHAAP-E . :: . : : ..: ... .. : .:. ::.:..: .. . :: .: KIAA03 DPFF------SREPSSMHISSSLPPDTQKFLRFAETHRTVLNQILRQSTTHLAD--GPFA 2750 2760 2770 2780 2790 2800 2600 2610 2620 2630 2640 KIAA06 ITLDPLEIVGGEIRASENSYFCQAARQL-ASVPSSQLCVKLASGG------------DPT . .: .... ... .:: : ..: .. . .. :.. .: KIAA03 VLVDYIRVLDFDVK---RKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRRDHVFEDSYRELHRKSPE 2810 2820 2830 2840 2850 2650 2660 2670 2680 2690 KIAA06 YAFN---IRFTGEEVHGTSGSFRHFLWQVCKELQSSSLSLLLLCPSSAVNKNKGKYILTP : : : ::: . ..: .:.. . .:. . .:. :.. :. : ..: KIAA03 EMKNRLYIVFEGEEGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALFRTSPGDRVT-----YTINP 2860 2870 2880 2890 2900 2910 2700 2710 2720 2730 2740 2750 KIAA06 SP-ITYGEEQLLHFLGQLLGIAIRADVPLPLDLLPSFWKTLVGEPLDPEQDLQEADILTY : . .. . ..:.:.... :. . : . ::.: ..:. . :.. : : KIAA03 SSHCNPNHLSYFKFVGRIVAKAVYDNRLLECYFTRSFYKHILGKSVR-YTDMESED---Y 2920 2930 2940 2950 2960 2760 2770 2780 2790 2800 2810 KIAA06 NYVKKFESINDETELEALCAEIASQHLATESPDSPNKPCCRFTYLTMTGEEVELCSRGRH .. . . . :... .: .. : : . . : : .: : . KIAA03 HFYQGLVYLL-ENDVSTLGYDL------TFSTEVQEFGVC---------EVRDLKPNGAN 2970 2980 2990 3000 3010 2820 2830 2840 2850 2860 2870 KIAA06 ILVAWENKDIYAAAIRSLRLRELQNVECVTAVRAGLGSIIPLQLLTMLSPLEMELRTCGL :::. ::: :. . ..:. . ..: :. ::: .:..... :.:: :: KIAA03 ILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQ-LAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELLISGL 3020 3030 3040 3050 3060 3070 2880 2890 2900 2910 2920 2930 KIAA06 PYINLEFLKAHTMYQVGLMETDQHIEFFWGALEMFTQEELCKFIKFACNQERIPFTCPCK : :... ::..: :. .. : :..:: ::. : : . ::..:. . ..:. KIAA03 PTIDIDDLKSNTEYHKYQSNSIQ-IQWFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKVPLQGFAA 3080 3090 3100 3110 3120 3130 2940 2950 2960 2970 2980 2990 KIAA06 DGGPDTAHVPPYPMKIAPPDGTAGSPDSRYIRVETCMFMIKLPQYSSLEIMLEKLRCAIH : . . ..: : : : : ..::. .. :: : :.: . . : ::. 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KIAA00 KADKVT-QLYVPASRHVWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQL--------AV 640 650 660 670 680 2570 2580 2590 2600 2610 2620 KIAA06 LKEAKGLIFYDTKVTVMNRVLNATVQRTADHAAPEITLDPLEIVGGEIRASENSYFCQAA : : .. .. .: ...:.. : : :. : . : .. .: . .: KIAA00 LTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQ--------EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAY 690 700 710 720 730 740 2630 2640 2650 2660 2670 2680 KIAA06 RQLASVPSSQLCVKLASGGDPTYAFNIRFTGEEVHGTSGSFRHFLWQVCKELQSSSLSLL .:. .: .. .. .: . : .: ::.:: .:: .:... KIAA00 DKLSPENEPDLKKRIR-----VHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFL----NELLKSGFN-- 750 760 770 780 2690 2700 2710 2720 2730 KIAA06 LLCPSSAVNKNKGKYILTPSP---ITYGEEQLLH--FLGQLLGIAIRADVPLPLDLLPSF :... :. .. .: :.: . :. : ::...:: :. .. . : . : KIAA00 ---PNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYENMLVELPFAGFF 790 800 810 820 830 840 2740 2750 2760 2770 2780 2790 KIAA06 WKTLVGEPLDPE-QDLQEADILTYNYVKKFESINDETELEALCAEIASQHLATESPDSPN . :.: : . . : : .:. . ..: .:..: .: .... :. KIAA00 LSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGE------- 850 860 870 880 890 2800 2810 2820 2830 2840 2850 KIAA06 KPCCRFTYLTMTGEEVELCSRGRHILVAWENKDIYAAAIRSLRLRELQNVECVTAVRAGL .. ::: :. : :. :. : . . :: . .:. : : :: KIAA00 ------------AQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCL-AFRQGL 900 910 920 930 940 2860 2870 2880 2890 2900 2910 KIAA06 GSIIPLQLLTMLSPLEMELRTCG--LPYINLEFLKAHTMYQVGLMETDQHIEFFWGALEM .... :. : :.. :... : .: :.:: ::. : :. : :. :: ..: KIAA00 ANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVP-ISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEG 950 960 970 980 990 1000 2920 2930 2940 2950 2960 2970 KIAA06 FTQEELCKFIKFACNQERIPFTCPCKDGGPDTAHVPPYPMKIAPPDGTAGSPDSRYIRVE ::.:: :..::. . : :. : . :: . .: :: : . 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